- •1 Методы статистического анализа медицинских данных
- •2 Оценка различий между группами
- •2.1. Количественные признаки.
- •2.1.1. Нормальное распределение
- •2.1.2. Ненормальное распределение
- •2.2 Порядковые признаки.
- •2.3.Качественные признаки.
- •2.4 Анализ зависимостей между признаками
- •3 Современное программное обеспечение для статистической обработки биомедицинских исследований
- •4 Краткие сведения о системе Statistica 6
- •5 Методические рекомендации к выполнению практических заданий
- •5.1 Лабораторная работа № 1. Исследование эффективности прививок
- •Далее рассмотрим графические представления таблиц сопряженности.
- •5.2 Лабораторная работа № 2. Создание рандомизированной выборки при организации медико-биологических исследований
- •Рандомизация
- •Подмножество
- •Случайный выбор
- •Вкладка Простой выбор
- •Вкладка Стратифицированный
- •Рассмотрим некоторые опции вкладки Параметры:
- •5.3 Лабораторная работа № 3. Сравнение выживаемости в двух и более группах
- •5.4. Лабораторная работа № 4. Проверка распределения на нормальность
- •Самостоятельная работа
- •5.5. Лабораторная работа № 5. Сравнение выборок
- •Список рекомендованной литературы
- •Приложение а
Далее рассмотрим графические представления таблиц сопряженности.
Построим 3-х мерную гистограмму частот. Для этого выберем пункт меню Графика – 3М последовательные графики – Гистограммы двух переменных (рис.12, 13):
Рисунок 12
Рисунок 13
В появившемся окне 3М Гистограммы двух переменных выберите переменные, как показано ниже (рис.14) и нажмите ОК – ОК:
Рисунок 14
Получим гистограмму частот. Это 3-х мерная гистограмма частот (рис.15):
Рисунок 15
Построим Категоризованные гистограммы. Для этого выберем пункт меню Категоризованные графики – Гистограммы (рис.16, 17):
Рисунок 16
Рисунок 17
В появившемся окне 2М Категоризованные гистограммы выберите переменные, как показано ниже (рис.18) и нажмите ОК – ОК:
Рисунок 18
Получим следующие категоризованные гистограммы (рис.19):
Рисунок 19
Каждый из этих графиков по-своему удобен и полезен. Во втором, категоризованном графике, как вы видите, все обследуемые разбиты на две категории (группы): ПРИВИВКА - нет, ПРИВИВКА – да. Из графика видно, что число заболевших в группе, несделавших прививки, больше числа заболевших в группе, сделавших прививки. Если прививка не сделана, то число незаболевших – 1, а число заболевших – 3. Если прививка сделана, то число незаболевших – 4, число заболевших – 2.
5.2 Лабораторная работа № 2. Создание рандомизированной выборки при организации медико-биологических исследований
Краткие теоретические сведения.
Обязательным условием хорошо спланированного экспериментального исследования является проведение рандомизации. Дословный перевод английского "random" означает "сделанный или выбранный наугад, случайный, беспорядочный". По некоторым данным, на сегодняшний день около 20% статей, публикуемых в ведущих медицинских журналах мира, содержат результаты рандомизированных исследований. Под рандомизацией понимают процедуру, обеспечивающую случайное распределение больных в экспериментальную и контрольную группы. Следует особо подчеркнуть, что рандомизацию проводят уже после того, как больной включен в испытание в соответствии с протоколом клинического исследования. Специалисты, занимающиеся этой проблемой, подчеркивают, что случайное, или рандомизированное, разделение не является синонимом беспорядочного, при котором процесс разделения не поддается математическому описанию. Рандомизация считается плохо организованной при разделении больных на группы по номеру истории болезни, страхового полиса или дате рождения. Лучше всего пользоваться таблицей случайных чисел, методом конвертов или путем централизованного компьютерного распределения вариантов лечения. К сожалению, упоминание о процессе рандомизации не означает правильного ее проведения. Очень часто в статьях не указывается способ рандомизации, что ставит под сомнение хорошую организацию исследования.
Некоторые исследователи предпочитают перед началом испытания распределить пациентов по подгруппам с одинаковым прогнозом и только потом рандомизировать их отдельно в каждой подгруппе (стратификационная рандомизация). Корректность стратификационной рандомизации признается далеко не всеми.
Пример выполнения
Имеются данные о пациентах, поступивших в больницу для трансплантации сердца. Данные содержатся в файле Heart.sta и имеют вид:
Рисунок 20
Первые три столбца в этой таблице есть даты трансплантации сердца (в следующей последовательности: месяц-день-год), 4, 5 и 6 столбцы – даты, когда соответствующий пациент либо умер, либо был изъят из наблюдения (иными словами, цензурирован, например, с пациентом была утрачена связь).
Переменная Цензурировано – Censored является индикатором цензурирования с кодом, который показывает, является соответствующее наблюдение завершенным или цензурированным (0-завершенно, т.е. пациент умер; 1-цензурированное). Переменная Age – возраст пациента, Antigen – показатель несовместимости антигенов, Mismatch – степень несовместимости тканей.
Переменная Hospital представляет собой фиктивную группирующую переменную, которая показывает, к какой из трех больниц относится пациент.
