- •Спецглавы микробиологии
- •Содержание
- •Общие представления об обмене веществ у микроорганизмов. Понятия анаболизма, катаболизма и метаболизма.
- •1.1 Питание микробов
- •1.2 Роль отдельных химических элементов и факторов роста в клеточном обмене
- •2. Механизмы метаболизма у микробов
- •3.Дыхание и брожение у микроорганизмов
- •3.1 Механизмы дыхательного процесса
- •3.2 Типы дыхания микроорганизмов
- •3.2.2 Анаэробное дыхание микроорганизмов.
- •3.3 Брожение
- •3.4 Гликолиз
- •4. Фотосинтез
- •5. Метаногенез
- •6. Роль ферментов в обмене веществ у микроорганизмов
- •6.1 Обшая характеристика ферментов
- •6.2 Свойства ферментов
- •6.3 Классификация ферментов
- •Лекция №1.2
- •1.1 Взаимосвязь конструктивного и энергетического обмена
- •1.2 Участие отдельных химических элементов в конструктивном метаболизме
- •1.3 Углеродные соединения, используемые в реакциях биосинтеза
- •1.4 Пировиноградная кислота - ключевой метаболит катаболических и анаболических (синтетических) процессов
- •2. Синтез структурных компонентов микробной клетки
- •2.1 Компонентный состав бактериальной клетки
- •2.2 Биосинтез аминокислот и белков
- •2.3 Биосинтез нуклеотидов и нуклеиновых кислот
- •2.4 Биосинтез олиго- и полисахаридов
- •2. 5 Биосинтез жиров и липидов
- •3. Пути метаболизма, приводящие к образованию макроэргов
- •3.1 Энергетические ресурсы микробной клетки
- •3.2 Общая характеристика энергетических процессов
- •4. Характеристика высокоэнергетических соединений
- •5. Роль высокоэнергетических соединений в клеточном метаболизме
- •5.1 Специализированное применение двух универсальных форм энергии
- •5.2 Роль других соединений с богатыми энергией связями
- •5.3 Роль пиридиновых нуклеотидов в метаболизме
- •5.3 Энергетические затраты микробной клетки
- •5.4 Консервирование энергии в микробной клетке
- •Лекция №1.3 Тема: «Дыхание, брожение и фотосинтез микроорганизмов. Методы исследования обмена веществ у микроорганизмов»
- •1.2 Типы дыхания микроорганизмов
- •2 Механизм дыхательного процесса. Внутриклеточная локализация, строение и физиологическая функция электронтранспортных цепей
- •2.1 Локализация и состав компонентов электрон-траспортной (дыхательной) цепи
- •2.2 Строение и физиологические функции компонентов электронтранспортной цепи
- •2.3 Окислительно-восстановительные потенциалы
- •3. Определение и природа брожения
- •4. Сбраживаемые и несбраживаемые соединения, их роль в природном балансе
- •5. Типы брожения у микроорганизмов
- •5.1 Гомоферментативное молочнокислое брожение
- •5.2 Нетипичное (гетероферментативное) молочнокислое брожение.
- •5.3 Спиртовое брожение
- •6. Спектральный состав солнечного света
- •6.1 Спектральный состав солнечного света
- •6.2 Механизм биологического поглощения света
- •7. Фотосинтез и фотосинтезирующие микроорганизмы
- •7.1 Определение и природа фотосинтеза
- •7.2 Фотосинтезирующие прокариоты
- •7.3 Фотосинтезирующий аппарат микроорганизмов
- •7.3.1 Компоненты системы улавливания световой энергии, состоящей из поглощающих свет пигментов
- •7.3.2 Фотохимические реакционные центры и цепь переноса электронов
- •7.4 Механизмы фотофосфорилирования
- •Особенности конструктивного метаболизма у фотосинтезирующих бактерий (биосинтетические процессы)
- •Лекция 2.1 Тема: «Синэкология микроорганизмов. Экологические связи микробов (симбиоз, кооперация, комменсализм, конкуренция, паразитизм, хищничество)»
- •Лекция 2.2 Тема: «Действие факторов внешней среды на микроорганизмы (аутэкология)»
- •Лекция 2.3
- •Лекция №3.1 Тема: «Микроорганизмы как агенты, вызывающие геохимические изменения. Участие микроорганизмов в круговоротах углерода и кислорода»
- •2.Микроорганизмы как агенты, вызывающие геохимические изменения.
- •3.Круговорот углерода и кислорода.
- •1. Основные понятия и представления биогеохимии
- •1.1 Живая материя
- •1.2 Биосфера
- •1.3 Биогеохимические процессы
- •1.4 Биогеохимические круговороты
- •1.5 Цикличность биогеохимических процессов
- •2. Микроорганизмы как агенты, вызывающие геохимические изменения
- •2.1 Исторические аспекты
- •2.2 Общая картина циклических превращений химических элементов в биосфере
- •2.3 Распространение микроорганизмов в пространстве
- •2.4 Метаболический потенциал микроорганизмов
- •2.5 Метаболическое разнообразие и гибкость микроорганизмов
- •3. Круговорот углерода и кислорода
- •3.1 Общие положения и расчёты
- •3.2 Процессы минерализации: образование двуокиси углерода
- •3.3 Изъятие углеводорода из круговорота в виде неорганических отложений
- •3.4 Изъятие углерода из круговорота за счёт образования органических отложений
- •3.5 Микроорганизмы, участвующие в круговороте углерода и кислорода
- •Лекция №3.2 Тема: «Участие микроорганизмов в синтезе и разложении природных веществ. Микроорганизмы- продуценты, консументы и редуценты»
- •1. Жизнедеятельность микробов в природе
- •2. Участие микроорганизмов в синтезе и разложении природных веществ
- •2.1 Синтез природных веществ
- •2.2 Разложение природных веществ
- •2.2.1 Разложение целлюлозы
- •Разложение целлюлозы в анаэробных условиях
- •2.2.2 Разложение ксилана (гемицеллюлозы)
- •2.2.3 Разложение крахмала и других глюканов
- •2.2.4 Разложение фруктанов и маннанов
- •2.2.5 Разложение пектинов
- •2.2.6 Разложение агара
- •2.2.7 Разложение хитина
- •2.2.8 Разложение лигнина
- •2.2.9 Разложение углеводородов
- •2.2.10 Разложение метана
- •2.2.11 Разложение белков
- •3. Микроорганизмы-продуценты,-консументы и -редуценты
- •3.1 Типы взаимоотношений микробов в биоценозах
- •3,2 Микроорганизмы как симбиотические партнеры
- •3.2.1 Мутуалистичесний симбиоз
- •Комменсализм
- •3.2.3 Антагонистический симбиоз
- •3.2.4 Метабиоз и сателлизм
- •3.2.5 Антагонизм
- •Лекция №3.3 Тема: «Роль микроорганизмов в круговоротах азота, серы, фосфора, железа. Значение микроорганизмов в геологической истории Земли и улучшении плодородия почв»
- •1. Роль микроорганизмов в круговороте азота
- •1.1 Общие положения
- •1.2 Фиксация азота
- •1.3 Превращения органического азота и образование аммиака
- •1.4 Нитрификация (превращение аммиака в нитратные соединения)
- •1.5 Денитрификация
- •2. Круговорот серы
- •2.1 Общие положения
- •2.2 Ассимиляция сульфата
- •2.3 Превращения органических соединений серы и образование сероводорода
- •2.4 Прямое образование сероводорода из сульфата
- •2.5 Окисление сероводорода и серы
- •3. Круговорот фосфора
- •4. Превращение соединений железа.
- •5. Роль микроорганизмов в геологической истории Земли
- •5.1 Круговорот веществ на протяжении геологической истории Земли
- •5.2 Микроорганизмы и геологическая история земли
- •5.2.1 Отложения железа
- •5.2.2 Отложения карбоната кальция
- •5.2.3 Отложения серы
- •5.3 Микроорганизмы и эволюция атмосферы
- •5.4 Прокариоты и биогеохимические циклы
- •6. Роль микроорганизмов в улучшении плодородия почв
- •6.1 Биогеохимия образования почвы и её характеристика
- •6.1.1 Органическое вещество педосферы
- •6.2 Микрофлора почвы
- •6.3 Трансформация органического вещества в почве.
4. Сбраживаемые и несбраживаемые соединения, их роль в природном балансе
Слайд №26. Круг органических соединений, которые могут сбраживаться, довольно широк. Это углеводы, спирты,органические кислоты, аминокислоты, пурины, пиримидины. Поскольку брожение протекает без участия молекулярного кислорода, все окислительно-восстановительные превращения субстрата происходят за счет его "внутренних" возможностей. То есть, химическое вещество может быть подвергнуто сбраживанию, если оно содержит неполностью окисленные (или восстановленные) углеродные атомы то есть имеется возможность для окислительно-восстановительных преобразований между молекулами (или внутри одного вида молекул). В процессе брожения, как правило, происходит расщепление углеродного скелета молекулы субстрата. В результате одна часть продуктов брожения будет более восстановленной, другая — более окисленной по сравнению с субстратом. Таким образом, процесс брожения связан с перестройками органических молекул субстрата, в результате которых на окислительных этапах процесса высвобождается часть свободной энергии, заключенной в молекуле субстрата, и происходит ее запасание в молекулах АТФ.
Слайд №27. Большинство природных соединений, состоящих из углерода, водорода, кислорода и (или) азота, поддается сбраживанию. Предпосылкой для этого является возможность частичного окисления субстрата в результате внутримолекулярного расщепления, сопровождающегося выделением энергии (экзэргоническая реакция). Сбраживаются, например, полисахариды, гексозы, пентозы, тетрозы, многоатомные спирты, органические кислоты (в том числе сахарные кислоты, глюконат, малат, тартрат и т.д.), аминокислоты (за исключением ароматических, лишь условно поддающихся сбраживанию), пурины и пиримидины.
Микроорганизмы, осуществляющие брожение, играют важную роль в природном круговороте веществ. Большая часть целлюлозы, поедаемой растительноядными животными, выводится в непереваренном виде. Когда этот, содержащий целлюлозу, детрит попадает в анаэробные слои почвы или слои донных осадков водоемов, целлюлозу сбраживают разлагающие ее клостридии и некоторые другие строго анаэробные бактерии. При этом образуются названные выше продукты брожения, в том числе почти всегда молекулярный водород. Водород образуется в начале анаэробной пищевой цепи, главные продукты которой метан и (или) сероводород.
Наряду с соединениями, которые сбраживаются в анаэробных условиях, есть вещества, неспособные сбраживаться. Таковы насыщенные алифатические и ароматические углеводороды, стероиды, каротиноиды, терпены, порфирины. В аэробных условиях все эти вещества поддаются расщеплению и полностью окисляются, но в анаэробных условиях они очень стабильны.
Слайд №28. Стабильность их может быть обусловлена двумя причинами. Во-первых, большинство названных соединений содержит только атомы углерода и водорода; при внутримолекулярном расщеплении таких веществ энергия не выделяется. Во-вторых, насыщенные углеводороды и полиизопреноиды могут окисляться только в присутствии молекулярного кислорода; первичное воздействие на них катализируется в этом случае оксигеназой. Именно благодаря высокой стабильности углеводородов в анаэробных условиях они так долго сохраняются в нефтяных месторождениях. Начиная с эпохи образования нефти и по сей день микроорганизмы не приобрели способность сбраживать парафин.