- •Тема 1.1. Структурная организация белков. Этапы формирования нативной
- •Тема 1.2. Основы функционирования белков. Лекарства как лиганды, влияющие на функцию белков
- •Тема 1.3. Денатурация белков и возможность их спонтанной ренативации
- •Тема 1.4. Особенности строения и функционирования олигомерных белков на примере гемоглобина
- •2. Формирование пространственных структур и функционирование миоглобина.
- •Тема 1.5. Поддержание нативной конформации белков в условиях клетки
- •1. Молекулярные шапероны и их роль в предотвращении денатурации белков.
- •Тема 1.6. Многообразие белков. Семейства белков на примере иммуноглобулинов
- •Тема 1.7. Физико-химические свойства белков и методы их разделения
- •Тема 2.1. Свойства ферментов как белковых
- •2. Для ферментов характерны:
- •Тема 2.2. Активный центр: специфичность действия ферментов
- •Тема 2.3. Механизм действия ферментов
- •Тема 2.4. Кофакторы и коферменты
- •Тема 2.5. Классификация и номенклатура
- •Тема 2.6. Основы кинетики ферментативного
- •Тема 2.7. Ингибиторы активности ферментов
- •Тема 2.8. Регуляция активности ферментов
- •Тема 2.9. Применение ферментов в медицине
- •Тема 2.10. Энзимопатии
- •Тема 3.1. Строение и функции днк и рнк
- •Тема 3.2. Биосинтез днк (репликация)
- •I. Формирование репликативной вилки.
- •II. Синтез новых цепей днк.
- •III. Исключение праймеров. Завершение формирования отстающей цепи
- •II. Синтез новых цепей днк
- •III. Исключение праймеров. Завершение формирования отстающей цепи днк
- •Тема 3.3. Репарация ошибок и повреждений днк
- •Тема 3.4. Биосинтез рнк (транскрипция). Посттранскрипционные модификации рнк
- •Тема 3.5. Трансляция как механизм перевода генетической информации в фенотипические
- •Тема 3.6. Ингибиторы матричных биосинтезов: лекарственные препараты, яды и бактериальные токсины
- •Тема 3.7. Механизмы адаптивной регуляции активности генов у прокариотов и эукариотов
- •Тема 3.8. Механизмы, обеспечивающие разнообразие белков у эукариотов
- •Тема 3.9. Механизмы генетической изменчивости: эволюционная изменчивость, полиморфизм белков. Наследственные болезни
- •Тема 3.10. Использование рекомбинантных днк
- •Тема 4.1. Общая характеристика мембран.
- •Тема 4.2. Транспорт веществ через мембраны
- •3. Перенос макромолекул и частиц с участием мембран - эндоцитоз и экзоцитоз.
- •Тема 4.3. Трансмембранная передача сигналов
- •Тема 5.1. Взаимосвязь обмена веществ и энергии
- •Тема 5.2. Тканевое дыхание
- •Тема 5.3. Митохондриальная цепь переноса электронов
- •1. Перенос электронов на кислород происходит при участии системы переносчиков, локализованных во внутренней мембране митохондрий и образующих цепь переноса электронов (цпэ) (рис. 5.6).
- •Тема 5.4. Сопряжение тканевого дыхания и синтеза атф
- •4. Таким образом, трансформация энергии в организме проходит следующие этапы.
- •Тема 5.5. Дыхательный контроль
- •Тема 5.6. Разобщение дыхания и синтеза атф
- •Тема 5.7. Терморегуляторная функция дыхания
- •Тема 5.8. Ингибиторы дыхания
- •Тема 5.9. Заключительный этап катаболизма пищевых веществ. Специфические и общий пути
- •1. Первая реакция опк - реакция окислительного декарбоксилирования пирувата описывается следующим суммарным уравнением (рис. 5.14).
- •2. Ацетил-КоА, образовавшийся в реакции, катализируемой пдк, далее вступает в цитратный цикл (рис. 5.16).
- •Тема 5.10. Анаболические функции общего пути катаболизма (опк)
- •1. Метаболиты опк служат предшественниками в синтезе ряда веществ в организме: аминокислот, глюкозы, жирных кислот и других соединений (рис. 5.19).
- •2. Убыль метаболитов цитратного цикла восполняется с помощью анаплеротических («пополняющих») реакций, главной из которых является реакция карбоксилирования пирувата.
- •Тема 5.11. Регуляция энергетического обмена
- •Тема 5.12. Гипоэнергетические состояния
- •Тема 6.1. Основные углеводы пищи. Строение,
- •1. Основным источником углеводов организма являются углеводы пищи, к которым относится крахмал. Кроме того, в пище содержатся глюкоза, фруктоза, сахароза и лактоза.
- •Тема 6.2. Трансмембранный перенос глюкозы и других моносахаридов из кишечника в кровь и из крови в клетки тканей. Пути превращения
- •Тема 6.3. Синтез гликогена (гликогеногенез), мобилизация гликогена (гликогенолиз). Регуляция процессов
- •5. Регуляция метаболизма гликогена в печени.
- •Тема 6.4. Нарушения переваривания и всасывания углеводов, синтеза и распада гликогена
- •1. Причинами нарушений переваривания углеводов могут быть:
- •Тема 6.5. Катаболизм глюкозы: аэробный и анаэробный гликолиз. Аэробный распад глюкозы до со2 и н2о
- •2. В аэробном и анаэробном гликолизе можно выделить два этапа.
- •Тема 6.6. Биологическое значение катаболизма глюкозы. Регуляция процесса
- •3. Анаболическое значение катаболизма глюкозы.
- •4. Регуляция катаболизма глюкозы в скелетных мышцах. Основное значение гликолиза - синтез атф, поэтому его скорость должна коррелировать с затратами энергии в организме.
- •Тема 6.7. Пентозофосфатный путь превращения
- •Тема 6.8. Синтез глюкозы (глюконеогенез)
- •2. Большинство реакций гликолиза и глюконеогенеза являются обратимыми и катализируются одними и теми же ферментами (рис. 6.20). Четыре реакции глюконеогенеза необратимы.
- •4. Существенное влияние на глюконеогенез оказывает этанол. Метаболизм этанола на 90% происходит в печени.
- •Тема 6.9. Регуляция гликолиза и глюконеогенеза
- •1. Переключение метаболизма печени с гликолиза на глюконеогенез и наоборот происходит при помощи:
- •Тема 6.10. Регуляция содержания глюкозы в крови, гиперглюкоземия
- •Тема 7.1. Коллаген
- •Тема 7.2. Эластин
- •Тема 7.3. Гетерополисахариды межклеточного
- •Тема 7.4. Неколлагеновые структурные белки межклеточного матрикса
- •Тема 7.5. Структурная организация межклеточного матрикса (суставной хрящ, базальные мембраны, субэпителиальные слои)
- •Тема 10.1. Биосинтез и катаболизм пуриновых рибонуклеотидов. Заболевания, связанные с нарушением их метаболизма
- •3. Синтез нуклеозиддифосфатов (ндф) и нуклеозидтрифосфатов (нтф) происходит при участии атф и ферментов нуклеозидмонофосфат- илинуклеозиддифосфаткиназ (нмф- и ндф-киназы соответственно) (рис. 10.3).
- •4. Регуляция процесса. Амф, гмф, имф, ди- и трифосфаты адениловых и гуаниловых нуклеотидов ингибируют ключевые реакции своего синтезааллостерически по механизму отрицательной обратной связи.
- •2. Регуляция процесса. Активность ферментов синтеза пиримидиновых нуклеотидов регулируется аллостерически по механизму отрицательной обратной связи конечными продуктами умф и цтф:
- •Тема 10.3. Биосинтез дезоксирибонуклеотидов.
- •3. Синтез дТмф из дУмф катализирует тимидилатсинтаза с участием n5n10- метилен н4-фолата, за счет которого:
- •4. Количество ферментов рнРазы и тимидилатсинтазы регулируется на
- •5. Небольшое количество дезоксирибонуклеотидов может образовываться по «запасному» пути в реакциях, катализируемых тимидинкиназой и дезоксицитидинкиназой:
- •Тема 10.4. Механизмы действия противовирусных и противоопухолевых препаратов на ферменты синтеза рибо- и дезоксирибонуклеотидов
- •Тема 8.1. Строение и функции основных липидов организма человека
- •Тема 8. 2. Переваривание и всасывание жиров. Ресинтез жиров в клетках слизистой оболочки
- •Тема 8.3. Хиломикроны - транспортная форма экзогенных жиров
- •Тема 8.4. Биосинтез высших жирных кислот и его регуляция
- •2. Первая реакция синтеза жирных кислот - это превращение ацетил-КоА в малонил-КоА:
- •3. Последующие реакции синтеза жирных кислот катализируются ферментным комплексом - синтазой жирных кислот или пальмитатсинтазой. Конечным продуктом синтеза является пальмитиновая кислота.
- •5. Регуляция синтеза жирных кислот.
- •Тема 8.5. Биосинтез жиров в печени и жировой ткани. Регуляция синтеза жиров
- •3. В печени жирные кислоты, необходимые для синтеза жиров, синтезируются в основном из продуктов катаболизма глюкозы. Далее синтез жиров идет через образование фосфатидной кислоты (рис. 8.13).
- •5. Запасание жиров в жировой ткани - так называемое депонирование жиров - происходит в абсорбтивный период, когда увеличивается соотношение инсулин - глюкагон.
- •Тема 8.6. Ожирение
- •2. Первичное ожирение развивается в результате алиментарного дисбаланса - избыточной калорийности питания по сравнению с расходами энергии.
- •Тема 8.7. Мобилизация жира. Гормональная
- •2. Мобилизация жира происходит в основном под действием гормонов глюкагона и адреналина и представляет собой гидролиз жира в адипоцитах до жирных кислот и глицерола ферментом - гормончувствительной
- •Тема 8.8. Β-окисление высших жирных кислот - источник энергии для синтеза атф. Регуляция I -окисления
- •4. Регуляция β-окисления. Скорость процесса β-окисления зависит от ряда факторов:
- •Тема 8.9. Кетоновые тела: синтез и катаболизм.
- •1. К кетоновым телам относят три вещества: β-гидроксибутират, ацетоацетат и ацетон.
- •Тема 8.10. Производные полиеновых кислот - эйкозаноиды: строение, биосинтез и биологическое действие
- •6. Ингибиторами синтеза эйкозаноидов являются:
- •7. Роль эйкозаноидов в регуляции свертывания крови. В норме свертывающая и противосвертывающая системы крови пребывают в состоянии равновесия, при котором кровь находится в жидком состоянии,
- •Тема 8.11. Холестерол, биологические функции. Поступление с пищей и транспорт кровью экзогенного холестерола
- •Тема 8.12. Биосинтез холестерола и его регуляция
- •Тема 8.13. Биосинтез желчных кислот и их роль
- •Тема 8.14. Роль липопротеинов в транспорте
- •Тема 8.15. Типы дислипопротеинемий. Биохимические основы патогенеза и лечения
- •Тема 9.1. Роль белков в питании. Азотистый баланс
- •Тема 9.2. Переваривание белков в желудке и кишечнике, всасывание аминокислот
- •Тема 9.3. Трансаминирование и дезаминирование аминокислот
- •Тема 9.4. Обмен аммиака: источники, превращение в тканях
- •Тема 9.5. Орнитиновый цикл и его биологическая роль
- •Тема 9.6. Гипераммониемия и ее причины
- •Тема 9.7. Пути использования безазотистых остатков аминокислот
- •Тема 9.8. Биосинтез заменимых аминокислот
- •Тема 9.9. Обмен серина и глицина.
- •Тема 9.10. Обмен метионина. Реакции трансметилирования
- •Тема 9.11. Обмен фенилаланина, тирозина и гистидина в разных тканях
- •Тема 9.12. Заболевания, связанные с нарушением обмена фенилаланина и тирозина
- •Тема 9.13. Биогенные амины: синтез, инактивация, биологическая роль
- •Тема 11.1. Роль гомонов в регуляции метаболизма
- •Тема 11.2. Механизмы передачи гормональных сигналов в клетки
- •Тема 11.3. Строение и биосинтез гормонов
- •Тема 11.4. Регуляция обмена основных энергоносителей при нормальном ритме
- •Тема 11.5. Изменения метаболизма при гипо- и гиперсекреции гормонов
- •Тема 11.6. Изменения гормонального статуса и метаболизма при голодании и физической работе
- •Тема 11.7. Изменения гормонального статуса и метаболизма при сахарном диабете
- •Тема 11.8. Регуляция водно-солевого обмена
- •Тема 11.9. Регуляция обмена кальция и фосфатов. Строение, синтез и механизм действия паратгормона, кальцитриола и кальцитонина
- •Тема 12.1. Механизмы обезвреживания токсических веществ
- •Тема 12.2. Обезвреживание продуктов катаболизма аминокислот в кишечнике
- •Тема 12.3. Биотрансформация лекарств
- •Тема 12.4. Метаболизм и обезвреживание
- •Тема 12.5. Химический канцерогенез
- •Тема 13.1. Синтез гема и его регуляция
- •Тема 13.2. Обмен железа
- •Тема 13.3. Катаболизм гема
- •Тема 14.1. Метаболизм эритроцитов
- •Тема 14.2. Особенности метаболизма фагоцитирующих клеток
- •Тема 14.3. Основные биохимические механизмы
- •Тема 14.4. Основные свойства белковых фракций крови и значение их определения для диагностики заболеваний
2. Убыль метаболитов цитратного цикла восполняется с помощью анаплеротических («пополняющих») реакций, главной из которых является реакция карбоксилирования пирувата.
Рис.
5.19. Использование метаболитов ОПК в
синтезе различных соединений:
1, 2, 3 - заменимых аминокислот; 4, 5, 6 - глюкозы; 7 - жирных кислот; 8 - гема
3. Метаболиты цитратного цикла не только используются как субстраты для синтеза АТФ и углеродного скелета ряда соединений, но и являются донорами водорода для образования восстановленных коферментов, участвующих в реакциях синтеза жирных кислот, стероидов и других веществ.
|
Например, малат, образовавшийся в ЦТК, может поступать из митохондрий в цитозоль клетки. В цитозоле находится NADP-зависимая дегидрогеназа (малик фермент), катализирующая реакцию окислительного декарбоксилирования малата (рис. 5.20).
Рис.
5.20. Реакция, катализируемая малик
ферментом
Эта реакция служит одним из важнейших, хотя не единственным источником NADPH, который образуется также в окислительных реакциях пентозофосфатного пути окисления глюкозы (модуль 6).
Тема 5.11. Регуляция энергетического обмена
1. Синтез АТФ в клетке регулируется потребностью в энергии, что достигается согласованной регуляцией скоростей реакций ЦПЭ и ОПК.Основными сигналами о состоянии энергетического обмена служат уровень АТФ и АДФ, NAD+ и NADH Общий фонд этих метаболитов в клетке относительно
постоянен. Таким образом, если увеличивается потребление АТФ и его концентрация снижается, концентрация АДФ возрастает. Подобно этому снижение концентрации NADH сопровождается повышением концентрации NAD+, что приводит к увеличению скорости реакций, катализируемых NAD-зависимыми ферментами, и к увеличению скорости общего пути катаболизма в целом (рис. 5.21).
2. Увеличение концентрации АДФ при повышении физиологической активности ускоряет окисление NADFI в ЦПЭ (дыхательный контроль) и приводит к увеличению скорости синтеза АТФ.
Рис.
5.21. Регуляция общего пути катаболизма.
Скорость ОПК регулируется на уровне четырех регуляторных реакций, катализируемых: 1-пируватдегидрогеназным комплексом; 2-цитратсинтазой; 3-изоцитратдегидрогеназой; 4-а-кетоглутаратдегидрогеназным комплексом
3. Кроме того, АДФ аллостерически активирует некоторые ферменты ОПК
(пируватдегидрогеназный комплекс, изоцитратдегидрогеназу). Такая согласованная регуляция ЦПЭ и ОПК приводит к тому, что вместо использованных молекул АТФ синтезируется адекватное количество новых; чем больше использовано АТФ, тем больше его синтезируется.
|
4. Скорость ОПК регулируется на уровне четырех регуляторных реакций, катализируемых:
• пируватдегидрогеназным комплексом;
• цитратсинтазой;
• изоцитратдегидрогеназой (самая медленная реакция цитратного цикла);
• α-кетоглутаратдегидрогеназным комплексом.
5. Регуляция пируватдегидрогеназного комплекса (рис. 5.22).
Рис.
5.22. Регуляция пируватдегидрогеназного
комплекса.
В составе ПДК содержатся две регуляторные субъединицы - киназа и фосфатаза. В результате фосфорилирования под действием киназы ПДК переходит в неактивную форму, при дефосфорилировании фосфатазой - активируется. Киназа и фосфатаза, в свою очередь, регулируются аллостерически. Киназа ПДК аллостерически активируется NADH, ацетил-КоА и АТФ и ингибируется пируватом, AДФ, HS-KoA, Ca2. Фосфатаза активируется Са2+
В составе ПДК содержатся две регуляторные субъединицы - киназа и фосфатаза. В результате фосфорилирования под действием киназы ПДК переходит в неактивную форму, при дефосфорилировании фосфатазой - активируется. Киназа и фосфатаза, в свою очередь, регулируются аллостерически. Киназа ПДК аллостерически активируется NADH, ацетил-КоА и АТФ и ингибируется пируватом, AДФ, HS-KoA, Ca2+. В абсорбтивный период глюкоза поступает в клетки и распадается с образованием пирувата. Высокая концентрация пирувата влияет на активность ПДК двумя способами:
- поддерживает ПДК в дефосфорилированной активной форме, так как пируват наиболее сильный ингибитор киназы ПДК;
- пируват аллостерически активирует дефосфорилированную активную форму ПДК, действуя согласованно с другими активаторами - субстратами реакций - NAD+ и HS-KoA. В результате создаются условия для образования ацетил-КоА из глюкозы. В печени ацетил-КоА используется для синтеза жирных кислот.
|
• В адипоцитах под влиянием инсулина увеличивается концентрация Са2+ в митохондриях, что активирует фосфатазу пируватдегидрогеназного комплекса и переводит его в активное дефосфорилированное состояние. В результате создаются условия для превращений: пируват - ацетил-КоА - жирные кислоты - жиры (основная форма запасания энергии в организме).
• Регуляция ионами Са2+ особенно важна в мышцах. Потенциал действия увеличивает концентрацию Са2+ в митохондриях, что одновременно ингибирует киназу и активирует фосфатазу; это быстро переводит ПДК в активную дефосфорилированную форму. Одновременно Са2+ активирует регуляторные ферменты ЦТК и ацетил-КоА быстро окисляется, обеспечивая синтез АТФ для мышц.
• Цитратсинтаза не является аллостерическим ферментом. Активность фермента регулируется, главным образом, концентрациями оксалоацетата - субстрата фермента и цитрата - продукта реакции (см. рис. 5.21). Когда отношение NADH-NAD+ снижается, ускоряется превращение малата в оксалоацетат и увеличивается скорость образования цитрата; при повышении концентрации цитрата скорость его синтеза соответственно снижается.
• Изоцитратдегидрогеназа - самый медленный фермент ЦТК. Фермент аллостерически активируется АДФ и Са2+. Кроме того, активность изоцитратдегидрогеназы зависит от величины отношения NADH-NAD+, как у всех NAD-зависимых дегидрогеназ (см. рис. 5.21).
• α-Кетоглутаратдегидрогеназный комплекс по структуре и функциям сходен с ПДК. В его состав входят 3 ферментных комплекса: α-кетоглутаратдекарбоксилаза, дигидролипоилтранссукцинилаза и дигидролипоилдегидрогеназа. Набор коферментов аналогичен таковому в ПДК. Однако в отличие от ПДК в этом комплексе отсутствуют регуляторные протомеры. Активность фермента зависит от концентраций АТФ и АДФ, NAD+ и NADH, ингибируется сукцинил-КоА и активируется Са2+ (рис. 5.21).
|
