
Основы наноелектроники / Основы наноэлектроники / ИДЗ / Книги и монографии / Нанотехнологии без тайн (Уильямс), 2010, c.362
.pdf
ГЛАВА 5 Биология
Наблюдение за биологическими структурами и процессами
Успех наблюдения за биологическими структурами и процесса |
|
ми в основном зависит от умелого приготовления исследуемых об |
|
разцов. Чем лучше лабораторное оборудование и чище образец, тем |
|
больше вероятность точного определения его структуры, химическо |
|
го состава и свойств. Часто студентам не удается добиться хороших |
|
результатов даже с помощью того же оборудования и тех же ме |
|
тодов, которыми пользуются их более опытные наставники. Опыт |
|
и тщательность в мелочах играют большую роль! Иногда простое |
|
изменение процедуры, например перенос только что полученного об |
|
разца в холодильник в другой конец лаборатории вместо мгновенно |
|
го помещения его в контейнер со льдом, может значительно снизить |
|
качество полученных результатов. |
|
Маститым ученым необходим весь их опыт, чтобы получить |
|
наилучшие результаты. При этом они стремятся использовать |
|
именно те специфические свойства исследуемого объекта, которые |
|
позволят получить наибольший объем информации о нем. Напри |
|
мер, если образец способен флуоресцировать, то для наблюдения |
|
за ним следует анализировать флуоресценцию, а если образец яв |
|
ляется хорошим проводником, измерять его электрические свой |
|
ства. |
|
РЕНТГЕНОВСКАЯ КРИСТАЛЛОГРАФИЯ |
|
Рентгеновская кристаллография позволяет получить наиболее |
|
подробную информацию об атомной структуре исследуемого объек |
|
та. С помощью методов рентгеновской кристаллографии можно до |
|
бывать сведения о конфигурации электронов и трехмерном распре |
|
делении их плотности. |
|
Для этого сначала пытаются вырастить чистый кристалл на основе |
|
исследуемой молекулы. Затем его помещают в рентгеновскую уста |
|
новку и освещают пучком рентгеновского излучения. Пучок диф |
|
рагирует (отклоняется) на структуре молекулы, а дифракционная |
|
картина фиксируется детектором и анализируется компьютером. На |
|
основе полученной информации воссоздается карта распределения |
|
электронной плотности. Например, таким образом можно опреде |
|
лить типы связей и расположение азотистых оснований в молекуле |
|
ДНК, как показано на рис. 5.4. |
|
Действительно, расположение атомов можно определять с точ |
|
ностью до доли ангстрема (около 10–8 см). В зависимости от спосо |
103 |

ЧАСТЬ II «Мокрые» (органические) приложения
ба создания (выращивания) кристалла в нем могут быть некоторые структурные отличия.
Рис. 5.4. С помощью методов рентгеновской кристаллографии можно определять расположение азотистых оснований в молекуле ДНК
ЭЛЕКТРОННАЯ МИКРОСКОПИЯ
В главе 4 уже упоминалось об использовании электронной микро скопии для определения общей структуры биологических молекул. Электронные микроскопы обладают разрешением около 2 нм и по зволяют наблюдать за общим видом сложных биологических струк
тур, но не за отдельными атомами. СЭМ и ПЭМ используются для изучения общей структуры сложных биологических молекул.
|
Результаты, полученные с помощью методов электронной микро |
|
скопии и рентгеновской кристаллографии, используют для компью |
|
терного моделирования и анализа атомарной структуры крупных |
|
сложных молекул. |
|
НАБЛЮДЕНИЕ ЗА ОДНОСЛОЙНЫМИ УГЛЕРОДНЫМИ НАНОТРУБКАМИ |
|
Группа исследователей под руководством профессора Брюса |
|
Вайсмана (Bruce Weisman) и Ребекки Дрезек (Rebekkah Drezek) из |
104 |
Центра исследования нанотехнологий в биологии и охраны окру |

ГЛАВА 5 Биология
жающей среды (Center for Biological and Environment Quality — CBEN) Университета Райс (США) ищет новые способы получения,
очистки и анализа биологических наночастиц.
В своей работе они используют однослойные углеродные нано |
|
трубки, которые упрощают процесс наблюдения за некоторыми био |
|
логическими процессами. Работа осложняется большими технически |
|
ми трудностями, связанными с тем, что получаемые нанотрубки име |
|
ют разные размеры, форму и ориентацию. Ученым нужно проверить |
|
и отфильтровать только нанотрубки, которые годятся для их целей. |
|
Они впервые стали использовать спектральный анализ нанотрубок |
|
в биологических целях. Для этого были собраны данные о 33 разных |
|
типах полупроводящих нанотрубок. Располагая такими сведениями, |
|
ученые смогли использовать их для эффективного создания и вы |
|
борки именно тех нанотрубок, которые больше всего подходят для |
|
их целей. |
|
Спектроскопия (спектральный анализ) — это наука, которая изучает взаимодей- |
|
ствие излучения с разной длиной волны и вещества. Объектом исследования при |
|
этом является спектр излучения, то есть распределение интенсивности излучения |
|
в зависимости от длины волны. |
|
Одна из наиболее важных целей новых наномасштабных иссле |
|
дований в биологии — поиск «иголки в стоге сена». Точнее говоря, |
|
ученых часто интересует, в каком именно месте происходят измене |
|
ния, например повреждение белка, и каковы следствия такого по |
|
вреждения в разных клетках и биологических системах. На рисун |
|
ке 5.5 показана типичная схема определения повреждения на разных |
|
стадиях этого процесса. |
|
Упомянутые выше исследователи из CBEN придумали способ |
|
наблюдения за макрофагами мышей (клетками, которые способны |
|
захватывать и переваривать другие клетки) с помощью нанотрубок. |
|
Они заметили, что в режиме in vitro нанотрубки никак не влияют на |
|
функции макрофагов мыши, но они хорошо видны благодаря флуо |
|
ресценции. Таким образом, флуоресценция однослойных углерод |
|
ных нанотрубок позволяет использовать эти нанотрубки в качестве |
|
маркеров и агентов для наблюдения за поведением биологических |
|
объектов. |
|
Режим in vivo означает внутри живого организма, а режим in vitro — вне живого |
|
организма, например в пробирке. |
105 |

ЧАСТЬ II «Мокрые» (органические) приложения
106
Рис. 5.5. Нанотехнологии могут помочь в ранней диагностике повреждения клеток и возникновения заболевания

ГЛАВА 5 Биология
Биологические наносенсоры
Биологические наносенсоры используются в различных областях, |
|
для разных приложений, включая здравоохранение, мониторинг и |
|
защиту окружающей среды, фармацевтику, гастрономию, космети |
|
ку, химию, защиту от биологического терроризма и управление био |
|
логическими процессами. |
|
Они предназначены для обнаружения специализированных био |
|
логических сигналов, которые обычно порождаются цифровым элек |
|
трическим сигналом, связанным с особым биологическим или хими |
|
ческим объектом. Использование новых научных методов, например |
|
микро и нанопроизводства, а также успехи электроники позволили |
|
ученым создать улучшенные биомедицинские сенсоры. Применение |
|
этих сенсоров способствовало развитию новых технологий в меди |
|
цинской и фармацевтической промышленности, а также новых мето |
|
дов защиты окружающей среды. Например, сейчас разрабатываются |
|
наномасштабные сенсоры глюкозы, которые способны зафиксиро |
|
вать наличие сахарного диабета. |
|
Биологические наносенсоры дают ученым возможность избира |
|
тельно идентифицировать очень низкие концентрации токсичных |
|
соединений в промышленной продукции, химических материалах, |
|
воздухе, воде, почве, биологических системах (например, в бактери |
|
ях, клетках и вирусах) и т. д. Комбинируя специфические биологи |
|
ческие маркеры (например красители) с методами оптического детек |
|
тирования и высокопроизводительными компьютерными системами, |
|
ученые научились создавать биологические наносенсоры для поиска |
|
и дифференциации сложных соединений. |
|
Большинство биологических наносенсоров работает по принципу |
|
измерения взаимодействия изучаемого образца с неким реагентом с |
|
образованием нового продукта реакции. Эта реакция улавливается |
|
сенсором, который преобразует ее в электрический сигнал. Данный |
|
сигнал отображается или записывается с помощью компьютера. Ре |
|
акции в биологических процессах могут регистрироваться преоб |
|
разователем несколькими разными способами, перечисленными в |
|
табл. 5.1. Конкретный тип сенсора определяется специфическими |
|
биологическими процессами. |
|
Ниже перечислены наиболее важные параметры биологических |
|
наносенсоров: |
|
способность изолировать специфический биологический фак |
|
тор с небольшой степенью вмешательства других факторов; |
107 |
|

ЧАСТЬ II «Мокрые» (органические) приложения
малое время отклика;
биологическая совместимость;
сверхмалые (нано) размеры;
сверхвысокая чувствительность;
сверхвысокая точность;
прочность;
низкая стоимость для большого количества разных тестов на
одном исследуемом образце.
Таблица 5.1. Физические принципы, лежащие в основе некоторых типов биологических сенсоров
Метод преобразования |
Тип биологического сенсора |
|
|
Излучение или поглощение тепла |
Калориметрический |
|
|
Изменения распределения заряда |
Потенциометрический |
|
|
Движение электронов в реакциях окисления |
Амперометрический |
или восстановления |
|
|
|
Излучение или поглощение света |
Оптический |
|
|
Деформация или напряжение |
Пьезоэлектрический |
|
|
На пути внедрения биологических наносенсоров в лабораториях и больницах ученым придется преодолеть несколько препятствий.
Биологические наносенсоры должны быть адаптированы к текущим
клиническим методам и интегрированы в них. Кроме того, потре буется создать новые биоинженерные технологии и усовершенство ванную электронику. Например, количество попыток использования
биологического сенсора может ограничиваться по мере накопления
белков на биологически активных поверхностях.
Более того, для достижения высокой чувствительности, избира тельности, стабильности и совместимости разных материалов потре
буется согласовать их электрические и биологические интерфейсы.
|
ПОВЕРХНОСТНОЕ НАТЯЖЕНИЕ, ВЯЗКОСТЬ И ЗАРЯД |
|
На наноскопическом и молекулярном уровне базовые свойства |
|
жидких субстанций очень сильно отличаются от базовых свойств |
|
твердых тел. Эта особенность имеет большое значение для биоло |
|
гических наноматериалов. Дело в том, что взаимодействие атомов и |
|
молекул в значительной мере определяется их ближайшим окруже |
|
нием. Для успешной работы некоторых биологических наносенсоров |
108 |
необходимо учитывать их локальное окружение. |

ГЛАВА 5 Биология
ПОВЕРХНОСТНОЕ НАТЯЖЕНИЕ
У непосвященных этот термин может ассоциироваться с напря женной обстановкой во время корпоративных совещаний или светских
приемов с участием политических соперников. В научном контексте поверхностное натяжение встречается всякий раз, когда мы видим
капли дождя на листьях растений или натертых кремом башмаках.
Поверхностное натяжение возникает, когда молекулы жидкости стремятся собраться вместе для уменьшения своей поверхности и общей энергии.
Поверхностное натяжение представляет собой результат стремле ния нескольких молекул жидкости уменьшить затраты своей энергии за счет минимизации площади свободной поверхности (рис. 5.6).
Рис. 5.6. Поверхностное натяжение воды может проявляться в виде заметной силы
Если поразмыслить, то можно понять, что люди порой ведут себя |
|
так же. Представьте себе нескольких людей, которые морозной зимой |
|
вышли из теплого дома. Все они сразу же поглубже натянут свои го |
|
ловные уборы, спрячут руки в карманы или наденут перчатки, чтобы |
|
уменьшить затраты общей энергии (на обогрев) за счет минимизации |
|
площади свободной поверхности (открытой всем ветрам кожи). |
|
Исследователи, которые работают с жидкостями на молекуляр |
|
ном уровне, учитывают поверхностное натяжение. Микроструйная |
|
и наноструйная техника основана на изучении потоков сверхмалых |
|
количеств жидкости. Для успешной работы биологических наносен |
|
соров и других медицинских наносистем ученым и инженерам необ |
|
ходимо находить способы доставки мельчайших образцов жидкости, |
|
например капелек крови, к детекторам. На наномасштабном уровне |
|
перемещать жидкости очень сложно именно из за влияния поверх |
|
ностного натяжения. |
109 |

ЧАСТЬ II «Мокрые» (органические) приложения
ВЯЗКОСТЬ
Наверняка вам доводилось слышать выражение «туман густой, как чечевичная похлебка». Термин вязкий используется для харак
теристики именно такого плотного состояния жидкости, когда она
сопротивляется любому перемешиванию или перемещению в ней.
Прекрасным примером очень вязкой жидкости является обычный мед, жирная сметана или приготовленный дедушкой кетчуп.
Если для кулинарии вязкость не представляет проблемы, то для нанотехнологий она создает дополнительные трудности. При про
ектировании и создании наносенсоров ученым и инженерам всегда
приходится учитывать вязкость исследуемых образцов.
Вязкость связана еще с одним свойством жидкости — ламинар ным течением. С ламинарным течением мы сталкиваемся всякий раз, когда, например, проливаем молоко из стакана. Пролитое мо
локо не задерживается в одном месте, а плавно растекается по всей
свободной площади.
Ламинарное течение — это спокойное непрерывное течение отдельных молекул жидкости в определенном направлении.
Характер течения жидкости и вязкость имеют огромное значение при проектировании микроскопических каналов для взятия образцов и перемещения их к сенсорам. Ведь ученые и инженеры стремятся
избежать закупоривания этих каналов.
ЭЛЕКТРИЧЕСКАЯ КИНЕТИКА
Для исключения проблем с вязкостью и ламинарным течением жидкостей в наномасштабе используется электричество. Для пере
мещения молекул жидкости в заданном направлении исследователи применяют электрические свойства жидкостей.
|
Электрическая кинетика, или электрокинетика, — это управляемый перенос элек- |
|
трического заряда по сверхмалому каналу для перемещения молекул в заданном |
|
направлении. |
|
Электрокинетика используется в лаборатории несколькими спосо |
|
бами. В одном из них вдоль канала посылается электрический заряд, |
|
который увлекает за собой отдельные молекулы. Этот метод назы |
|
вается электрофорезом. Объекты маркеры (например белки) иссле |
110 |
дуемого образца помещаются на одном конце субстанции геля, через |

ГЛАВА 5 Биология |
|
которую пропускается электрический ток. В зависимости от размера |
|
и других характеристик молекул они начинают перемещаться с раз |
|
ной скоростью к противоположному концу. Затем ученые сравнивают |
|
положение отдельных маркеров и делают выводы о составе образца. |
|
В электрическом осмосе (или электроосмосе), как и в электро |
|
форезе, используется электрический ток, который пропускается че |
|
рез жидкость в канале. Молекулы реагируют друг с другом и об |
|
разуют стенки электрических зарядов, которые перемещаются вдоль |
|
канала с разной скоростью. |
|
Биологи уже давно используют электрофорез и электроосмос для |
|
анализа крупных (миллиметровых) биологических образцов. Теперь |
|
они имеют возможность использовать более совершенные и тонкие |
|
технологии на молекулярном уровне. |
|
ЖИДКОСТНАЯ ЭЛЕКТРОСИЛОВАЯ МИКРОСКОПИЯ |
|
Доктор Джейсон Хафнер (Jason Hafner) из CBEN открыл способ |
|
измерения зарядов в наномасштабе, который можно использовать в |
|
биологических наносенсорах. С помощью так называемой жидкост |
|
ной электросиловой микроскопии, или ЖЭСМ (fluid electrical force |
|
microscopy — FEFM), он научился измерять крошечные заряды на |
|
одной молекуле. ЖЭСМ была использована для разных биологиче |
|
ских систем, включая липиды (жиры) биологических мембран. Со |
|
трудники лаборатории Хафнера использовали ЖЭСМ для наблю |
|
дения за скоплениями жиров в мембранах, находящихся в жидкой |
|
и гелевой фазе. |
|
БИОЛОГИЧЕСКИЕ СЕНСОРЫ И МАРКЕРЫ |
|
Еще одно достижение ученых в области создания биологических |
|
наносенсоров относится к стоматологии. Как известно, слюна очища |
|
ет полость рта и предохраняет зубы от разрушения. Согласно мнению |
|
ученых из Школы стоматологии при Университете штата Калифор |
|
ния (США), слюна также действует как индикатор общего здоровья |
|
человека. Дело в том, что слюна содержит много белков, гормонов, |
|
антител и других молекулярных субстанций. По мнению профессора |
|
Дэвида Вонга (David Wong), большим достоинством диагностическо |
|
го тестирования слюны является то, что этот метод неинвазивный, то |
|
есть не требует хирургического вмешательства. Пробу слюны можно |
|
взять довольно легко без какого либо риска, стресса или потенциаль |
|
ной возможности заражения, в отличие от тестов, связанных с кро |
|
вью. Кроме того, здесь не нужно никого протыкать иголками. |
111 |

ЧАСТЬ II «Мокрые» (органические) приложения
Вонг с коллегами использовали биологические наносенсоры для измерения содержания в слюне четырех связанных с раком моле
кул РНК (рибонуклеиновой кислоты). Им удалось с точностью 91% определить совершенно здоровых людей и больных раком ротовой полости. Обладая такими точными методами, вскоре любой дантист
сможет мгновенно и легко определить наличие ракового заболевания
на основе анализа слюны.
По мнению Вонга, в будущем на основе анализа биологических
маркеров в слюне можно будет разработать методики ранней диагно стики других видов заболеваний, например рака молочной железы, яичников и поджелудочной железы, болезни Альцгеймера, СПИДа, сахарного диабета и остеопороза.
Возможность выполнять высокоточный анализ биологических
мембран превращает биологические наносенсоры в еще один мощ ный инструмент ученых и инженеров.
БИОЛОГИЧЕСКИЕ ЧИПЫ
В ДНК сенсоре односпиральная молекула ДНК может исполь зоваться для поиска дополнительной последовательности нуклеоти дов среди смеси других односпиральных молекул ДНК. В настоящее
время на основе этого эффекта создаются новые биологические на
носенсоры.
ДНК чип, или биологический чип (биочип), основан на несколь ких коротких молекулах ДНК, которые прикреплены к поверхности. Эти упорядоченные молекулы ДНК позволяют ученым одновремен но анализировать тысячи генов. Биочип является важным инстру ментом исследования поведения генов, биологических маркеров и
последовательностей нуклеотидов в биологическом образце. Исполь зуя результаты, полученные с помощью биочипов, генетики и меди
ки смогут разработать профилактические меры для предотвращения многих заболеваний.
Важность исследования, создания и внедрения новых наносенсо
ров более подробно рассматривается в главе 9.
Влияние на биологический мир
|
Нанотехнологии позволяют получить ответы на вопросы, которы |
|
ми задавались ученые в течение многих столетий. |
|
Биологические нанотехнологии дают возможность исследовать |
112 |
внутренний мир органов и отдельных клеток, предупреждать смер |