- •1.Предмет биохимии. Биохимия в системе естественных наук. Роль биохимии в развитии медицины.
- •2.Аминокислоты. Структура. Явление стереоизомерии. Классификации аминокислот.
- •Ионные формы аминокислот
- •Классификация По радикалу
- •По функциональным группам
- •По классам аминоацил-тРнк-синтетаз
- •По путям биосинтеза
- •По способности организма синтезировать из предшественников
- •По характеру катаболизма у животных
- •3.Аминокислоты. Свойства аминокислот, их поведение в растворе. Методы определения аминокислот.
- •4.Биосинтез аминокислот. Заменимые и незаменимые аминокислоты.
- •5.Непротеиногенные аминокислоты. Производные аминокислот.
- •Соли аминокислот
- •Эфиры аминокислот
- •Азометины
- •6.Катаболизм аминокислот.
- •1. Механизм реакции
- •2. Органоспецифичные аминотрансферазы ант и act
- •3. Биологическое значение трансаминирования
- •4. Диагностическое значение определения аминотрансфераз в клинической практике
- •1. Окислительное дезаминирование
- •2. Непрямое дезаминирование (трансдезаминирование)
- •3. Неокислительное дезамитровате
- •7.Структура и биологические функции пептидов и белков. Классификации белков.
- •8.Первичная структура белков.
- •9.Вторичная структура белков. Структурирующие факторы (силы). Явления денатурации и ренатурации белков.
- •10.Третичная и четвертичная структура белков. Структурирующие факторы (силы). Глобулярные и фибриллярные белки.
- •11.Расщепление белков в желудочно-кишечном тракте. Протеазы. Проферменты, их биологическая роль.
- •12.Катаболизм белков. Убиквитин-зависимая и убиквитин-независимая деградация белков. Цикл мочевины. Мочевая кислота.
- •13.Ферменты. Принципы классификации и номенклатуры. Структура и биологическая роль.
- •14.Активные центры ферментов. Основные представления о механизме ферментативных реакций. Обратимость ферментативных реакций.
- •15. Регуляция активности ферментов. Аллостерические ферменты. Активаторы и ингибиторы ферментов. Принцип обратной связи. Регуляция активности ферментов
- •16.Кинетика ферментативных реакций. Зависимость Михаэлиса-Ментен. График обратных величин Лайнуивера-Берка и его практическое применение.
- •20.Структура моносахаридов. Альдозы и кетозы. Стереоизомеры. Эпимеры. Номенклатура. Моносахариды или простые сахара
- •Стереоизомерия моносахаридов
- •21.Циклические формы моносахаридов. Пиранозы и фуранозы. Стереоизомеры циклических форм моносахаридов. Конформация циклических форм. Пиранозные и фуранозные кольцевые структуры моносахаридов
- •Аномерия
- •22.Структура и свойства олигосахаридов. Их биологическая роль. Олигосахариды
- •23.Структура и свойства полисахаридов. Их биологическая роль. Полисахариды
- •Гомополисахариды
- •24.Гликопротеины, гликозаминогликаны, протеогликаны. Структура и биологическая роль. Гликопротеины и протеогликаны
- •Гликопротеины
- •Общий обзор
- •Локализация
- •Результат
- •29.Окисление пировиноградной кислоты. Функционирование пируватдегидрогеназного комплекса. Роль коферментов. Регуляция процесса.
- •31. Цикл лимонной кислоты. Биологическая роль. Ферментное обеспечение. Энергетический выход. Образование nadh, fadh2 и gtp в цикле лимонной кислоты. Регуляция цикла
- •Глиоксилатный путь катаболизма углеводов. Ферментное обеспечение. Биологическая роль.
- •Окисление внемитохондриального nadh. Челночные системы митохондрий.
- •Пентозомонофосфатный путь катаболизма углеводов. Ферментное обеспечение. Биологическая роль.
- •Глюконеогенез. Биосинтез гликогена из пировиноградной кислоты. Ключевые стадии. Ферментное обеспечение. Регуляция глюконеогенеза.
- •Биосинтез гликогена. Ферментное обеспечение процесса. Реципрокная регуляция гликоген-синтазы и гликоген-фосфорилазы.
- •Регуляция расщепления и синтеза гликогена также взаимосвязана
- •Общие свойства, классификация и номенклатура липидов. Жирные кислоты. Строение и свойства нейтральных жиров. Воска.
- •Строение и свойства фосфоглицеридов.
- •Сфинголипиды. Строение и биологическая роль.
- •41) Строение и св-ва стероидов. Холестерол и его эфиры. Соединения липидов с друг. Биомолекулами. Липопротеины.
- •42) Образование мицелл, монослоёв, бислоёв и липосом фосфолипидами. Их роль. Структура, св-ва и функционирование биологических мембран.
- •47) Биосинтез насыщенных жк. Стр-ра синтазной с-мы для жк. Биосинтез пальмитиновой к-ты.
- •48) Биосинтез ненасыщенных жк. Незаменимые жк. Регуляция биосинтеза жк.
- •49) Биосинтез моно-, ди-, триацилглицеролов.
- •50) Метаболизм глицерофосфолипидов.
- •53. Строение нуклеиновых кислот. Пуриновые и пиримидиновые основания. Углеводные компоненты нуклеиновых кислот.
- •54. Нуклеотиды и их биологическая роль. Структура и функции атф.
- •55. Биосинтез пуриновых нуклеотидов
- •Образование дифосфатов и трифосфатов пуриновых нуклеозидов
- •Синтез пуриновых дезоксирибонуклеотидов
- •56. Пути регенерации и деградации пуринов. Пути регенерации пуриновых нуклеотидов
- •57. Биосинтез пиримидиновых нуклеотидов. Регуляция
- •Далее следуют реакции образования нуклеозидди- и трифосфатов, дезоксирибо-нуклеотидов, а также других типов нуклеотидов – цитидиновых и тимидиновых.
- •Регуляция биосинтеза пиримидинов
- •58. Пути регенерации и деградации пиримидиновых нуклеотидов. Регенерация пиримидиновых нуклеотидов
- •Деградация пиримидиновых нуклеотидов
- •59. Классификация нуклеиновых кислот. Первичная и вторичная структура днк. Значение двуспирального строения днк. Принцип комплиментарности.
- •61.Экспрессия генов
- •62. Оперон
- •63. Регуляция экспрессии генома у эукариот осуществляется на нескольких уровнях:
- •66. Новосинтезированным белкам надо "созреть"
- •70. Жирорастворимые витамины, их биологическая роль.
- •71. Водорастворимые витамины, их биологическая роль.
- •72.Биологическая роль микроэлементов: железа, меди, цинка, кобальта, марганца, йода. Биологическая роль макроэлементов: натрия, калия, кальция, магния, фосфора, серы, хлора.
- •Биогенные элементы
- •67. Фотосинтетический аппарат. Хлорофиллы, каратиноиды и другие пигменты. Световая стадия фотосинтеза. Фотофосфорилирование.
- •68. Темновая стадия фотосинтеза. Цикл Кальвина. Общее уравнение фотосинтеза. Затраты атр и nadph.
- •69.Механизм реализации фотосинтетического пути Хэтча-Слэка (с4). Его биологическая роль. Фотодыхание.
- •73.Биохимические основы адаптации.
- •74.Биотрансформация вредных (токсических) веществ в экосистемах.
- •75.Пути метаболизма ксенобиотиков в организме
- •76. Функционирование микросомальной системы окисления
- •1. Основные ферменты микросомальных
- •2. Функционирование цитохрома р450
- •3. Свойства системы микросомального
- •Широкая субстратная специфичность. Изоформы р450
- •77.Реакции конъюгации в печени.
- •78.Биохимические основы защиты клеток от повреждающих воздействий
- •79. Антиоксидантная система.
57. Биосинтез пиримидиновых нуклеотидов. Регуляция
Биосинтез пиримидинов несколько отличается от биосинтеза пуринов. Главное отличие состоит в том, что синтез пуринов осуществляется на основе молекулы рибозофосфата (ФРПФ) как базовой, а при синтезе пиримидинов сахар присоединяется только после полного сформирования пиримидинового кольца (реакция: оротовая кислота + ФРПФ ОМР + PPi). Между тем, оба пути имеют ряд общих предшественников: ФРПФ, глутамин, СО2 и аспартат. Также для обоих синтезов важно присутствие производных тетрагидрофолата как доноров атомов углерода (в данном случае в качестве донора метильных групп).
Реакция 1 При взаимодействии глутамина, СО2 и АТР образуется фосфорилированная форма карбамоила – карбамоилфосфат. Реакция катализируется карбамоилфосфатсинтазой.
H2N–COOH – карбамоил
H2N–CO-O-РО32- - карбамоилфосфат
Реакция 2 Карбамоилфосфат конденсируется с аспартатом с образованием карбамоил-аспартата. Катализируется аспартаттранскарбамоилазой.
Реакция 3 Данная молекула замыкается в кольцевую (при этом высвобождается Н2О). Получаем соединение дигидрооротат – первый циклический предшественник пиримидинов.
Реакция 4 При дегидрировании дигидрооротата в положениях кольца С5-С6 (нумерация ведется в соответствии с принятой у пиримидинов) получаем оротат (оротовую кислоту).
Реакция 5 К оротату присоединяется остаток рибозофосфата от ФРПФ (фосфорибозил-пирофосфата). В результате образуется оротодинмонофосфат (ОМР) и высвобождается пирофосфат. Последний затем разлагается неорганической пирофосфатазой (PPi 2Pi), смещая этим весь процесс вправо.
Реакция 6 Происходит декарбоксилирование оротата в ОМР с образованием уридинмонофосфата (UMP) – первого истинного пиримидинового нуклеотида.
Далее следуют реакции образования нуклеозидди- и трифосфатов, дезоксирибо-нуклеотидов, а также других типов нуклеотидов – цитидиновых и тимидиновых.
Образование нуклеозидди- и трифосфатов происходит под действием, соответственно, нуклеозидмонофосфаткиназы и нуклеозиддифосфаткиназы (сходно с пуриновыми нуклеотидами).
Восстановление рибонуклеотидов до 2`-дезоксирибонуклеотидов также осуществляется на уровне нуклеозиддифосфатов и аналогично таковому у пуринов.
Образование цитидинтрифосфатов (СТР) происходит из уридинтрифосфатов (UTP) в результате реакции аминирования в положении 4 пиримидинового кольца. Реакция идет с участием глутамина и АТР.
Тимидинмонофосфат (2`-дезоксирибоТМР, dTMP) образуется из 2`-дезоксирибоUМР (dUMP) в результате реакции метилирования по 5 положению пиримидинового кольца. Донором метильной группы в данной реакции выступает N5,N10-метилентетрагидрофолат, который переходит в тетрагидрофолат.
Регуляция биосинтеза пиримидинов
Решающий этап в данном метаболическом пути – образование карбамоиласпартата. Фермент катализирующий эту реакцию, аспартаттранскарбамоилаза, ингибируется одним из конечных продуктов данного пути – СМР. Еще один регуляторный элемент – карбамоилфосфат-синтетаза. Она ингибируется другим конечным продуктом – UMP, а также пуриновыми нуклеотидами, но в то же время активируется ФРПФ.
В целом, скорости синтеза пиримидиновых и пуриновых нуклеотидов контролируются взаимосвязанно. Например, ФРПФ-синтаза, катализирующая образования общего предшествен-ника обоих этих групп нуклеотидов, ингибируется по принципу обратной связи как пуриновыми, так и пиримидиновыми нуклеотидами.
