- •1.Предмет биохимии. Биохимия в системе естественных наук. Роль биохимии в развитии медицины.
- •2.Аминокислоты. Структура. Явление стереоизомерии. Классификации аминокислот.
- •Ионные формы аминокислот
- •Классификация По радикалу
- •По функциональным группам
- •По классам аминоацил-тРнк-синтетаз
- •По путям биосинтеза
- •По способности организма синтезировать из предшественников
- •По характеру катаболизма у животных
- •3.Аминокислоты. Свойства аминокислот, их поведение в растворе. Методы определения аминокислот.
- •4.Биосинтез аминокислот. Заменимые и незаменимые аминокислоты.
- •5.Непротеиногенные аминокислоты. Производные аминокислот.
- •Соли аминокислот
- •Эфиры аминокислот
- •Азометины
- •6.Катаболизм аминокислот.
- •1. Механизм реакции
- •2. Органоспецифичные аминотрансферазы ант и act
- •3. Биологическое значение трансаминирования
- •4. Диагностическое значение определения аминотрансфераз в клинической практике
- •1. Окислительное дезаминирование
- •2. Непрямое дезаминирование (трансдезаминирование)
- •3. Неокислительное дезамитровате
- •7.Структура и биологические функции пептидов и белков. Классификации белков.
- •8.Первичная структура белков.
- •9.Вторичная структура белков. Структурирующие факторы (силы). Явления денатурации и ренатурации белков.
- •10.Третичная и четвертичная структура белков. Структурирующие факторы (силы). Глобулярные и фибриллярные белки.
- •11.Расщепление белков в желудочно-кишечном тракте. Протеазы. Проферменты, их биологическая роль.
- •12.Катаболизм белков. Убиквитин-зависимая и убиквитин-независимая деградация белков. Цикл мочевины. Мочевая кислота.
- •13.Ферменты. Принципы классификации и номенклатуры. Структура и биологическая роль.
- •14.Активные центры ферментов. Основные представления о механизме ферментативных реакций. Обратимость ферментативных реакций.
- •15. Регуляция активности ферментов. Аллостерические ферменты. Активаторы и ингибиторы ферментов. Принцип обратной связи. Регуляция активности ферментов
- •16.Кинетика ферментативных реакций. Зависимость Михаэлиса-Ментен. График обратных величин Лайнуивера-Берка и его практическое применение.
- •20.Структура моносахаридов. Альдозы и кетозы. Стереоизомеры. Эпимеры. Номенклатура. Моносахариды или простые сахара
- •Стереоизомерия моносахаридов
- •21.Циклические формы моносахаридов. Пиранозы и фуранозы. Стереоизомеры циклических форм моносахаридов. Конформация циклических форм. Пиранозные и фуранозные кольцевые структуры моносахаридов
- •Аномерия
- •22.Структура и свойства олигосахаридов. Их биологическая роль. Олигосахариды
- •23.Структура и свойства полисахаридов. Их биологическая роль. Полисахариды
- •Гомополисахариды
- •24.Гликопротеины, гликозаминогликаны, протеогликаны. Структура и биологическая роль. Гликопротеины и протеогликаны
- •Гликопротеины
- •Общий обзор
- •Локализация
- •Результат
- •29.Окисление пировиноградной кислоты. Функционирование пируватдегидрогеназного комплекса. Роль коферментов. Регуляция процесса.
- •31. Цикл лимонной кислоты. Биологическая роль. Ферментное обеспечение. Энергетический выход. Образование nadh, fadh2 и gtp в цикле лимонной кислоты. Регуляция цикла
- •Глиоксилатный путь катаболизма углеводов. Ферментное обеспечение. Биологическая роль.
- •Окисление внемитохондриального nadh. Челночные системы митохондрий.
- •Пентозомонофосфатный путь катаболизма углеводов. Ферментное обеспечение. Биологическая роль.
- •Глюконеогенез. Биосинтез гликогена из пировиноградной кислоты. Ключевые стадии. Ферментное обеспечение. Регуляция глюконеогенеза.
- •Биосинтез гликогена. Ферментное обеспечение процесса. Реципрокная регуляция гликоген-синтазы и гликоген-фосфорилазы.
- •Регуляция расщепления и синтеза гликогена также взаимосвязана
- •Общие свойства, классификация и номенклатура липидов. Жирные кислоты. Строение и свойства нейтральных жиров. Воска.
- •Строение и свойства фосфоглицеридов.
- •Сфинголипиды. Строение и биологическая роль.
- •41) Строение и св-ва стероидов. Холестерол и его эфиры. Соединения липидов с друг. Биомолекулами. Липопротеины.
- •42) Образование мицелл, монослоёв, бислоёв и липосом фосфолипидами. Их роль. Структура, св-ва и функционирование биологических мембран.
- •47) Биосинтез насыщенных жк. Стр-ра синтазной с-мы для жк. Биосинтез пальмитиновой к-ты.
- •48) Биосинтез ненасыщенных жк. Незаменимые жк. Регуляция биосинтеза жк.
- •49) Биосинтез моно-, ди-, триацилглицеролов.
- •50) Метаболизм глицерофосфолипидов.
- •53. Строение нуклеиновых кислот. Пуриновые и пиримидиновые основания. Углеводные компоненты нуклеиновых кислот.
- •54. Нуклеотиды и их биологическая роль. Структура и функции атф.
- •55. Биосинтез пуриновых нуклеотидов
- •Образование дифосфатов и трифосфатов пуриновых нуклеозидов
- •Синтез пуриновых дезоксирибонуклеотидов
- •56. Пути регенерации и деградации пуринов. Пути регенерации пуриновых нуклеотидов
- •57. Биосинтез пиримидиновых нуклеотидов. Регуляция
- •Далее следуют реакции образования нуклеозидди- и трифосфатов, дезоксирибо-нуклеотидов, а также других типов нуклеотидов – цитидиновых и тимидиновых.
- •Регуляция биосинтеза пиримидинов
- •58. Пути регенерации и деградации пиримидиновых нуклеотидов. Регенерация пиримидиновых нуклеотидов
- •Деградация пиримидиновых нуклеотидов
- •59. Классификация нуклеиновых кислот. Первичная и вторичная структура днк. Значение двуспирального строения днк. Принцип комплиментарности.
- •61.Экспрессия генов
- •62. Оперон
- •63. Регуляция экспрессии генома у эукариот осуществляется на нескольких уровнях:
- •66. Новосинтезированным белкам надо "созреть"
- •70. Жирорастворимые витамины, их биологическая роль.
- •71. Водорастворимые витамины, их биологическая роль.
- •72.Биологическая роль микроэлементов: железа, меди, цинка, кобальта, марганца, йода. Биологическая роль макроэлементов: натрия, калия, кальция, магния, фосфора, серы, хлора.
- •Биогенные элементы
- •67. Фотосинтетический аппарат. Хлорофиллы, каратиноиды и другие пигменты. Световая стадия фотосинтеза. Фотофосфорилирование.
- •68. Темновая стадия фотосинтеза. Цикл Кальвина. Общее уравнение фотосинтеза. Затраты атр и nadph.
- •69.Механизм реализации фотосинтетического пути Хэтча-Слэка (с4). Его биологическая роль. Фотодыхание.
- •73.Биохимические основы адаптации.
- •74.Биотрансформация вредных (токсических) веществ в экосистемах.
- •75.Пути метаболизма ксенобиотиков в организме
- •76. Функционирование микросомальной системы окисления
- •1. Основные ферменты микросомальных
- •2. Функционирование цитохрома р450
- •3. Свойства системы микросомального
- •Широкая субстратная специфичность. Изоформы р450
- •77.Реакции конъюгации в печени.
- •78.Биохимические основы защиты клеток от повреждающих воздействий
- •79. Антиоксидантная система.
55. Биосинтез пуриновых нуклеотидов
У человека и других млекопитающих пуриновые нуклеотиды синтезируются главным образом для обеспечения потребностей организма в мономерных предшественниках нуклеиновых кислот, а также в, соединениях, выполняющих ряд другие функций (начало лекции). У некоторых позвоночных (птицы, земноводные, рептилии) синтез пуриновых нуклеотидов несет дополнительную функцию – является частью механизма, с помощью которого выводятся излишки азота в виде мочевой кислоты; такие организмы называют урикотелическими. Организмы, у которых конечным продуктом азотистого обмена является мочевина (как у человека), называют уреотелическими. Поскольку урикотелические организмы удаляют «излишки» азота в виде мочевой кислоты, синтез пуриновых нуклеотидов у них идет более интенсивно, чем у уреотелических.
На рисунке изображена формула пурина и показано происхождение каждого из атомов. Данная информация получена в процессе радиоизотопных исследований, проведенных на птицах, крысах и человеке.
Здесь глицин дает атомы С-4, С-5 и N-7; атом N-1 происходит из аспартата. Атомы N-3 и N-9 происходят из амидогруппы боковой цепи глутамина. Активированные производные тетрагидрофолата поставляют С-2 и С-8, тогда как СО2 служит источником С-6.
Первая стадия – образование 5-фосфорибозил-1-пирофосфата (ФРПФ). Эта реакция не уникальна для биосинтеза пуриновых нуклеотидов. ФРПФ служит также предшественником в синтезе пиримидиновых нуклеотидов, аминокислот гистидина и триптофана, а так же необходим для синтеза коферментов NAD и NADP. ФРПФ синтезируется из АТР и рибозо-5’-фосфата, который в свою очередь образуется в реакциях пентозофосфатного пути.
Вторая стадия – является важнейшим этапом синтеза пуриновых нуклеотидов de novo – под действием фермента ФРПФ-глутамил-амидотрансферазы амидогруппа боковой цепи глутамина замещает пирофосфатную группу, присоединенную к С-1 ФРПФ. В результате образуются глутамат и 5-фосфорибозиламин. (при этом -конфигурация С-1 переходит в и формируется N-9 пурина)
Третья стадия – 5-фосфорибозиламин вступает в реакцию с глицином – аминогруппа реагирует с карбокси-группой аминокислоты с образованием амидной связи. Таким образом, мы получаем атомы пурина С-4, С-5 и N-7.
Четвертая стадия – атом азота N-7 формилируется (присоединяется альдегидная группа) под действием N5,N10-метенилтетрагидрофолата. В результате этой реакции поступающий одно-
углеродный фрагмент занимает положение С-8 в формирующемся пуриновом основании.
Тетрагидрофолат
Тетрагидрофолат (тетрагидроптероилглутамат) – многоцелевой переносчик одно-углеродных фрагментов. Он состоит из трех структурных единиц: замещенного птеридина, n-аминобензоата и глутамата. Млекопитающие не способны синтезировать кольца птеридина. Они получают птеридин с пищей или от микроорганизмов кишечной флоры.
Одноуглеродный фрагмент, переносимый тетрагидрофолатом, связывается с атомом азота N5 или N10 илис обоими. Этот момент может иметь три степени окисления. Наиболее восстановленная форма – метильная группа, промежуточная – метиленновая. Наиболее окисленные формы – метенильная, формильная или формимино-группа. (фрагмент СО2, то есть с максимальной степенью окисления, переносится биотином)
Пятая стадия – в ней снова участвует глутамин, как донор амидной группы. Данная группа замещает кето-группу у атома С-4 и присоединенный атом азота займет в молекуле пурина положение N-3.
Шестая стадия - замыкании имидазольного кольца. Полученный промежуточный продукт содержит полное пятичленное кольцо пуринового остова.
Теперь начинается образование второго – то есть шестичленного кольца.
Седьмая стадия – карбоксилирование атома С-5, то есть присоединение к нему карбокси-группы, источником которой служит СО2, образующийся в процессе дыхания. Мы получаем атом пурина С-6.
Восьмая и девятая стадии – образование атома азота в положении 1. Он происходит из -аминогруппы аспартата. Сначала карбокси-группа, полученная в прошлой реакции, реагирует с -аминогруппой аспартата. В этой реакции затрачивается энергия АТР. Мы получаем амидную группу с присоединенным к ней органическим фрагментом – сукцинильной группировкой. В следующей реакции данная сукцинильная группа удаляется в виде фумарата. Остается свободным атом пурина N-1.
Десятая стадия – здесь атом N-3, образовавшийся в стадии 5, формилируется (присоединяется альдегидная группа) под действием N10-формилтетрагидрофолата (донора атома углерода). В результате образуется атом С-2.
Одиннадцатая стадия – замыкание шестичленного кольца. В результате образуется первый пуриновый нуклеотид – инозинмонофосфат (инозиновая кмслота, IМР).
Образование АМР и GМР из IMP
АМР из IMP образуется вследствие реакции замещения кето-группы в 6-ом положении пурина на амино-группу с использованием амино-группы аспартата. Промежуточной стадией является образование аденилосукцината. Данная реакция протекает с участием GТР. Сукцинильная группировка затем удаляется в виде фумарата. Образуется АМР.
GМР из IMP также образуется в две реакции. В 1-ой - при участии NAD и Н2О происходит окисление IMP с образованием ХМР (ксантинмонофосфата). Затем ХМР аминируется амидо-группой глутамина. Данная реакция протекает с участием GТР (перекрестная регуляция!).
