- •1.Предмет биохимии. Биохимия в системе естественных наук. Роль биохимии в развитии медицины.
- •2.Аминокислоты. Структура. Явление стереоизомерии. Классификации аминокислот.
- •Ионные формы аминокислот
- •Классификация По радикалу
- •По функциональным группам
- •По классам аминоацил-тРнк-синтетаз
- •По путям биосинтеза
- •По способности организма синтезировать из предшественников
- •По характеру катаболизма у животных
- •3.Аминокислоты. Свойства аминокислот, их поведение в растворе. Методы определения аминокислот.
- •4.Биосинтез аминокислот. Заменимые и незаменимые аминокислоты.
- •5.Непротеиногенные аминокислоты. Производные аминокислот.
- •Соли аминокислот
- •Эфиры аминокислот
- •Азометины
- •6.Катаболизм аминокислот.
- •1. Механизм реакции
- •2. Органоспецифичные аминотрансферазы ант и act
- •3. Биологическое значение трансаминирования
- •4. Диагностическое значение определения аминотрансфераз в клинической практике
- •1. Окислительное дезаминирование
- •2. Непрямое дезаминирование (трансдезаминирование)
- •3. Неокислительное дезамитровате
- •7.Структура и биологические функции пептидов и белков. Классификации белков.
- •8.Первичная структура белков.
- •9.Вторичная структура белков. Структурирующие факторы (силы). Явления денатурации и ренатурации белков.
- •10.Третичная и четвертичная структура белков. Структурирующие факторы (силы). Глобулярные и фибриллярные белки.
- •11.Расщепление белков в желудочно-кишечном тракте. Протеазы. Проферменты, их биологическая роль.
- •12.Катаболизм белков. Убиквитин-зависимая и убиквитин-независимая деградация белков. Цикл мочевины. Мочевая кислота.
- •13.Ферменты. Принципы классификации и номенклатуры. Структура и биологическая роль.
- •14.Активные центры ферментов. Основные представления о механизме ферментативных реакций. Обратимость ферментативных реакций.
- •15. Регуляция активности ферментов. Аллостерические ферменты. Активаторы и ингибиторы ферментов. Принцип обратной связи. Регуляция активности ферментов
- •16.Кинетика ферментативных реакций. Зависимость Михаэлиса-Ментен. График обратных величин Лайнуивера-Берка и его практическое применение.
- •20.Структура моносахаридов. Альдозы и кетозы. Стереоизомеры. Эпимеры. Номенклатура. Моносахариды или простые сахара
- •Стереоизомерия моносахаридов
- •21.Циклические формы моносахаридов. Пиранозы и фуранозы. Стереоизомеры циклических форм моносахаридов. Конформация циклических форм. Пиранозные и фуранозные кольцевые структуры моносахаридов
- •Аномерия
- •22.Структура и свойства олигосахаридов. Их биологическая роль. Олигосахариды
- •23.Структура и свойства полисахаридов. Их биологическая роль. Полисахариды
- •Гомополисахариды
- •24.Гликопротеины, гликозаминогликаны, протеогликаны. Структура и биологическая роль. Гликопротеины и протеогликаны
- •Гликопротеины
- •Общий обзор
- •Локализация
- •Результат
- •29.Окисление пировиноградной кислоты. Функционирование пируватдегидрогеназного комплекса. Роль коферментов. Регуляция процесса.
- •31. Цикл лимонной кислоты. Биологическая роль. Ферментное обеспечение. Энергетический выход. Образование nadh, fadh2 и gtp в цикле лимонной кислоты. Регуляция цикла
- •Глиоксилатный путь катаболизма углеводов. Ферментное обеспечение. Биологическая роль.
- •Окисление внемитохондриального nadh. Челночные системы митохондрий.
- •Пентозомонофосфатный путь катаболизма углеводов. Ферментное обеспечение. Биологическая роль.
- •Глюконеогенез. Биосинтез гликогена из пировиноградной кислоты. Ключевые стадии. Ферментное обеспечение. Регуляция глюконеогенеза.
- •Биосинтез гликогена. Ферментное обеспечение процесса. Реципрокная регуляция гликоген-синтазы и гликоген-фосфорилазы.
- •Регуляция расщепления и синтеза гликогена также взаимосвязана
- •Общие свойства, классификация и номенклатура липидов. Жирные кислоты. Строение и свойства нейтральных жиров. Воска.
- •Строение и свойства фосфоглицеридов.
- •Сфинголипиды. Строение и биологическая роль.
- •41) Строение и св-ва стероидов. Холестерол и его эфиры. Соединения липидов с друг. Биомолекулами. Липопротеины.
- •42) Образование мицелл, монослоёв, бислоёв и липосом фосфолипидами. Их роль. Структура, св-ва и функционирование биологических мембран.
- •47) Биосинтез насыщенных жк. Стр-ра синтазной с-мы для жк. Биосинтез пальмитиновой к-ты.
- •48) Биосинтез ненасыщенных жк. Незаменимые жк. Регуляция биосинтеза жк.
- •49) Биосинтез моно-, ди-, триацилглицеролов.
- •50) Метаболизм глицерофосфолипидов.
- •53. Строение нуклеиновых кислот. Пуриновые и пиримидиновые основания. Углеводные компоненты нуклеиновых кислот.
- •54. Нуклеотиды и их биологическая роль. Структура и функции атф.
- •55. Биосинтез пуриновых нуклеотидов
- •Образование дифосфатов и трифосфатов пуриновых нуклеозидов
- •Синтез пуриновых дезоксирибонуклеотидов
- •56. Пути регенерации и деградации пуринов. Пути регенерации пуриновых нуклеотидов
- •57. Биосинтез пиримидиновых нуклеотидов. Регуляция
- •Далее следуют реакции образования нуклеозидди- и трифосфатов, дезоксирибо-нуклеотидов, а также других типов нуклеотидов – цитидиновых и тимидиновых.
- •Регуляция биосинтеза пиримидинов
- •58. Пути регенерации и деградации пиримидиновых нуклеотидов. Регенерация пиримидиновых нуклеотидов
- •Деградация пиримидиновых нуклеотидов
- •59. Классификация нуклеиновых кислот. Первичная и вторичная структура днк. Значение двуспирального строения днк. Принцип комплиментарности.
- •61.Экспрессия генов
- •62. Оперон
- •63. Регуляция экспрессии генома у эукариот осуществляется на нескольких уровнях:
- •66. Новосинтезированным белкам надо "созреть"
- •70. Жирорастворимые витамины, их биологическая роль.
- •71. Водорастворимые витамины, их биологическая роль.
- •72.Биологическая роль микроэлементов: железа, меди, цинка, кобальта, марганца, йода. Биологическая роль макроэлементов: натрия, калия, кальция, магния, фосфора, серы, хлора.
- •Биогенные элементы
- •67. Фотосинтетический аппарат. Хлорофиллы, каратиноиды и другие пигменты. Световая стадия фотосинтеза. Фотофосфорилирование.
- •68. Темновая стадия фотосинтеза. Цикл Кальвина. Общее уравнение фотосинтеза. Затраты атр и nadph.
- •69.Механизм реализации фотосинтетического пути Хэтча-Слэка (с4). Его биологическая роль. Фотодыхание.
- •73.Биохимические основы адаптации.
- •74.Биотрансформация вредных (токсических) веществ в экосистемах.
- •75.Пути метаболизма ксенобиотиков в организме
- •76. Функционирование микросомальной системы окисления
- •1. Основные ферменты микросомальных
- •2. Функционирование цитохрома р450
- •3. Свойства системы микросомального
- •Широкая субстратная специфичность. Изоформы р450
- •77.Реакции конъюгации в печени.
- •78.Биохимические основы защиты клеток от повреждающих воздействий
- •79. Антиоксидантная система.
50) Метаболизм глицерофосфолипидов.
В тканях происходит постоянное обновление глицерофосфолипидов. Но в отличие от других молекул (например, белков) последние способны к частичному обновлению, то есть к обновлению какой-то части фосфолипида, таким образом в данном случае мы наблюдаем 2 процесса:
Обновление глицерофосфолипидов.
Синтез глицерофосфолипидов.
Обновление
Обновление основано на наличии в клетке специфических ферментов фосфолипаз, способных гидролизовать эфирные связи в липиде. Причем каждый вид фосфолипаз обладает строгой специфичностью к определенному участку глицерофосфолипида.
Важнейшие – это фосфолипазы А1, А2, С и D.
Фосфолипаза А1 осуществляет гидролиз эфирной связи в положении 1, то есть от 1-ого положения фосфолипида отщепляется свободная жирная кислота.
Фосфолипаза А2 – работает сходным образом, но во втором положении.
Фосфолипаза С – работает в третьем положении, то есть отщепляет фосфо-рилированное азотистое основание в третьем положении липида.
Фосфолипаза D отщепляет азотистое основание с образованием фосфатидата.
После гидролиза какого-либо из участков липида возможен его ресинтез заново.
Распад
Однако данные ферменты принимают участие и в полном распаде глицерофосфолипидов.
Рассмотрим это на примере лецитина.
Сначала на фосфатидилхолин действует фосфолипаза А2. Мы получаем лизолецитин (то есть – без ацильной группы во втором положении).
Затем под действием лизофосфолипазы отщепляется вторая ацильная группа. Получаем глицеролфосфохолин.
После этого специфическая гидролаза отщепляет холин от данного соединения.
Таким образом, мы получаем глицерол-3-фосфат и основание (холин).
Синтез
Глицерофосфолипиды образуются либо из фосфатидата (например, фосфатидилинозитол), либо из 1,2-диацилглицерола (например, фосфатидилхолин и фосфатидилэтаноламин).
Фосфатидилинозитол
При синтезе фосфатидилинозитола цитидинтрифосфат (СТР) взаимодействует с фосфатидатом с образованием цитидиндифосфатдиацилглицерола (СТР-диацилглицерола), который при участии фермента СТР-диацилглицерол-инозитолтрансферазы реагирует с инозитолом, в результате чего образуется фосфатидилинозитол.
Фосфатидилхолин и фосфатидилэтаноламин
В процессе биосинтеза фосфатидилхолина и фосфатидилэтаноламина (лецитина и кефалина) холин и этаноламин должны сначала перейти в активную форму. На первой стадии в результате реакции с АТР образуется соответствующий монофосфат (фосфохолин или фосфоэтаноламин), который затем реагирует с СТР, с образованием либо цитидиндифосфохолина (СТР-холин), либо цитидиндифосфоэтаноламина (СТР-этаноламин).
В такой активной форме холин или этаноламин вступает в реакцию с 1,2-диацилглицеролом. Эти фосфорилированные основания (фосфохолин или фосфоэтаноламин) переносятся на диацилглицерол и образуется либо фосфатидилхолин, либо фосфатидилэтаноламин.
Фосфатидилсерин
Фосфатидилсерин синтезируется путем прямого взаимодействия фосфатидилэтаноламина и серина. Происходит реакция замещения азотистого основания на остаток аминокислоты.
В свою очередь фосфатидилсерин может декарбоксилироваться с образованием фосфатидилэтаноламина.
Дополнительный альтернативный путь синтеза фосфатидилхолина существует в печени. Здесь фосфатидилхолин синтезируется из фосфатидилэтаноламина путем последовательного метилирования остатка этаноламина с участием S-аденозилметионина в качестве донора метальных групп.
Кардиолипин
Присутствующий в митохондриях фосфолипид кардиолипин (дифосфатидилглицерол) образуется из фосфатидилглицерола, который в свою очередь синтезируется из СТР-диацилглицерола и глицерол-3-фосфата.
51. Биосинтез холестерола и других стероидов.
Биосинтез холестерина — образование в живом организме органического спирта холестерина стероидной природы. Синтез холестерина происходит в клетках печени (50 %), кишечнике и коже. В клетке он идёт в гладком эндоплазматическом ретикулуме и цитозоле. Биосинтез холестерина служит основой синтеза других стероидных соединений. Начальные этапы синтеза являются общими с этапами синтеза других изопреноидов.
В настоящее время установлена следующая цепь биосинтеза холестерина, включающая в себя несколько ступеней. (Образование промежуточных соединений этого пути может происходить и другими способами).
Превращение трёх молекул активного ацетата в пятиуглеродный мевалонат. Cинтез мевалоната протекает в три этапа.
Образование ацетоацетил-КоА из двух молекул ацетил-КоА с помощью тиолазного фермента ацетоацетилтрансферазы. Реакция обратима. Происходит в цитозоле.
Образование β-гидрокси-β-метилглутарил-КоА из ацетоацетил-коА с третьей молекулой ацетил-КоА с помощью гидроксиметилглутарил-КоА-синтазы (ГМГ-КоА-синтазы). Реакция также обратима. Происходит в цитозоле.
Образование мевалоната восстановлением ГМГ и отщеплением HS-KoA с помощью НАДФ-зависимой гидроксиметилглутарил-КоА-редуктазы (ГМГ-КоА-редуктаза). Происходит в гЭПР. Это первая практически необратимая реакция в цепи биосинтеза холестерина, а также она лимитирует скорость биосинтеза холестерина. Отмечены суточные колебания синтеза этого фермента. Активность его увеличивается при введении инсулина и тиреоидных гормонов, снижается при голодании, введении глюкагона, глюкокортикоидов.
Превращение мевалоната в активный изопреноид — изопентенилпирофосфат.
1, 2. Вначале мевалоновая кислота дважды фосфорилируется с помощью АТФ: до 5-фосфомевалоната, а затем до 5-пирофосфомевалоната.
3. 5-пирофосфомевалонат фосфорилируется по 3 атому углерода, образуя нестабильный промежуточный продукт — 3-фосфо-5-пирофосфомевалонат.
4. Последний декарбоксилируется и дефосфорилируется, образуется изопентенилпирофосфат.
Образование тридцатиуглеродного изопреноида сквалена из шести молекул изопентенилдифосфата.
Изопентенилпирофосфат изомеризуется в диметилаллилпирофосфат.
Конденсация изопентенилпирофосфата (С5) с диметилаллилпирофосфатом (С5) и образование геранилпирофосфата (С10). При этом высвобождается молекула пирофосфата.
Конденсация изопентенилпирофосфата (С5) с геранилпирофосфатом (С10). Образуется фарнезилпирофосфат (С15) и высвобождается ещё одна молекула пирофосфата.
Конденсация двух молекул фарнезилпирофосфата (С15) «голова-к-голове» и образование сквалена (С30). Реакция проходит с затратой НАДФН, и высвобождаются две молекулы пирофосфата. Молекулы фарнезилпирофосфата конденсируются концами, несущими пирофосфатные группы. Сначала отщепляется одна пирофосфатная группа и образуется промежуточный прескваленпирофосфат. Он, в свою очередь, восстанавливается с помощью НАДФН. Второй пирофосфат уходит. Образуется сквален.
Циклизация сквалена в ланостерин.
Под действием скваленэпоксидазы образуется эпоксид сквалена.
2. Затем эпоксид сквалена циклизуется в ланостерин. При этом метильная группа у С14 переносится на С13, а метильная группа у С8 — на С14.
Последующее превращение ланостерина в холестерин.
Ланостерин превращается в мембранах гладкого эндоплазматического ретикулума в холестерин.
Метильная группа при С14 окисляется, и образуется 14-десметилланостерин.
Затем удаляются ещё два метила при С4, и образуется зимостерол.
3. Далее двойная связь C8=С9 перемещается в положение С8=С7 и образуется Δ7,24-холестадиенол.
Двойная связь далее перемещается в положение С5=С6,образуется десмостерол.
После чего в боковой цепи восстанавливается двойная связь, и образуется холестерин.
Стероидогенез — биологический процесс, при котором стероиды образуются из холестерина и превращаются в другие стероиды. Пути стероидогенеза отличаются у различных видов.
Продукты стероидогенеза включают: Андрогены , Тестостерон , Эстрогены и Прогестерон , Кортикоиды , Кортизол , Альдостерон.
52. Биосинтез сфинголипидов и глицерофосфолипидов.
Синтез сфинголипидов
Сфингомиелины – фосфолипиды, в состав которых входят ЖК, фосфатная группа, холин и сфингозин. Сфингозин синтезируется в ЭПР. Аминокислота серин, активированная пиридоксальфосфатом, вступает в реакцию с пальмитоил-соА. Полученное соединение 2 раза вступает в реакцию ОВР с образованием сфингозина.
Церамид образуется при взаимодействии сфингозина и ацил-соА.
Сфингомиелин образуется в результате реакции церамида с СТР-холином или фосфатидилхолином.
Синтез гликолипидов
Гликосфинголипиды – гликолипиды, в состав которых входит церамид и один или несколько остатков сахара.
