- •1.Предмет биохимии. Биохимия в системе естественных наук. Роль биохимии в развитии медицины.
- •2.Аминокислоты. Структура. Явление стереоизомерии. Классификации аминокислот.
- •Ионные формы аминокислот
- •Классификация По радикалу
- •По функциональным группам
- •По классам аминоацил-тРнк-синтетаз
- •По путям биосинтеза
- •По способности организма синтезировать из предшественников
- •По характеру катаболизма у животных
- •3.Аминокислоты. Свойства аминокислот, их поведение в растворе. Методы определения аминокислот.
- •4.Биосинтез аминокислот. Заменимые и незаменимые аминокислоты.
- •5.Непротеиногенные аминокислоты. Производные аминокислот.
- •Соли аминокислот
- •Эфиры аминокислот
- •Азометины
- •6.Катаболизм аминокислот.
- •1. Механизм реакции
- •2. Органоспецифичные аминотрансферазы ант и act
- •3. Биологическое значение трансаминирования
- •4. Диагностическое значение определения аминотрансфераз в клинической практике
- •1. Окислительное дезаминирование
- •2. Непрямое дезаминирование (трансдезаминирование)
- •3. Неокислительное дезамитровате
- •7.Структура и биологические функции пептидов и белков. Классификации белков.
- •8.Первичная структура белков.
- •9.Вторичная структура белков. Структурирующие факторы (силы). Явления денатурации и ренатурации белков.
- •10.Третичная и четвертичная структура белков. Структурирующие факторы (силы). Глобулярные и фибриллярные белки.
- •11.Расщепление белков в желудочно-кишечном тракте. Протеазы. Проферменты, их биологическая роль.
- •12.Катаболизм белков. Убиквитин-зависимая и убиквитин-независимая деградация белков. Цикл мочевины. Мочевая кислота.
- •13.Ферменты. Принципы классификации и номенклатуры. Структура и биологическая роль.
- •14.Активные центры ферментов. Основные представления о механизме ферментативных реакций. Обратимость ферментативных реакций.
- •15. Регуляция активности ферментов. Аллостерические ферменты. Активаторы и ингибиторы ферментов. Принцип обратной связи. Регуляция активности ферментов
- •16.Кинетика ферментативных реакций. Зависимость Михаэлиса-Ментен. График обратных величин Лайнуивера-Берка и его практическое применение.
- •20.Структура моносахаридов. Альдозы и кетозы. Стереоизомеры. Эпимеры. Номенклатура. Моносахариды или простые сахара
- •Стереоизомерия моносахаридов
- •21.Циклические формы моносахаридов. Пиранозы и фуранозы. Стереоизомеры циклических форм моносахаридов. Конформация циклических форм. Пиранозные и фуранозные кольцевые структуры моносахаридов
- •Аномерия
- •22.Структура и свойства олигосахаридов. Их биологическая роль. Олигосахариды
- •23.Структура и свойства полисахаридов. Их биологическая роль. Полисахариды
- •Гомополисахариды
- •24.Гликопротеины, гликозаминогликаны, протеогликаны. Структура и биологическая роль. Гликопротеины и протеогликаны
- •Гликопротеины
- •Общий обзор
- •Локализация
- •Результат
- •29.Окисление пировиноградной кислоты. Функционирование пируватдегидрогеназного комплекса. Роль коферментов. Регуляция процесса.
- •31. Цикл лимонной кислоты. Биологическая роль. Ферментное обеспечение. Энергетический выход. Образование nadh, fadh2 и gtp в цикле лимонной кислоты. Регуляция цикла
- •Глиоксилатный путь катаболизма углеводов. Ферментное обеспечение. Биологическая роль.
- •Окисление внемитохондриального nadh. Челночные системы митохондрий.
- •Пентозомонофосфатный путь катаболизма углеводов. Ферментное обеспечение. Биологическая роль.
- •Глюконеогенез. Биосинтез гликогена из пировиноградной кислоты. Ключевые стадии. Ферментное обеспечение. Регуляция глюконеогенеза.
- •Биосинтез гликогена. Ферментное обеспечение процесса. Реципрокная регуляция гликоген-синтазы и гликоген-фосфорилазы.
- •Регуляция расщепления и синтеза гликогена также взаимосвязана
- •Общие свойства, классификация и номенклатура липидов. Жирные кислоты. Строение и свойства нейтральных жиров. Воска.
- •Строение и свойства фосфоглицеридов.
- •Сфинголипиды. Строение и биологическая роль.
- •41) Строение и св-ва стероидов. Холестерол и его эфиры. Соединения липидов с друг. Биомолекулами. Липопротеины.
- •42) Образование мицелл, монослоёв, бислоёв и липосом фосфолипидами. Их роль. Структура, св-ва и функционирование биологических мембран.
- •47) Биосинтез насыщенных жк. Стр-ра синтазной с-мы для жк. Биосинтез пальмитиновой к-ты.
- •48) Биосинтез ненасыщенных жк. Незаменимые жк. Регуляция биосинтеза жк.
- •49) Биосинтез моно-, ди-, триацилглицеролов.
- •50) Метаболизм глицерофосфолипидов.
- •53. Строение нуклеиновых кислот. Пуриновые и пиримидиновые основания. Углеводные компоненты нуклеиновых кислот.
- •54. Нуклеотиды и их биологическая роль. Структура и функции атф.
- •55. Биосинтез пуриновых нуклеотидов
- •Образование дифосфатов и трифосфатов пуриновых нуклеозидов
- •Синтез пуриновых дезоксирибонуклеотидов
- •56. Пути регенерации и деградации пуринов. Пути регенерации пуриновых нуклеотидов
- •57. Биосинтез пиримидиновых нуклеотидов. Регуляция
- •Далее следуют реакции образования нуклеозидди- и трифосфатов, дезоксирибо-нуклеотидов, а также других типов нуклеотидов – цитидиновых и тимидиновых.
- •Регуляция биосинтеза пиримидинов
- •58. Пути регенерации и деградации пиримидиновых нуклеотидов. Регенерация пиримидиновых нуклеотидов
- •Деградация пиримидиновых нуклеотидов
- •59. Классификация нуклеиновых кислот. Первичная и вторичная структура днк. Значение двуспирального строения днк. Принцип комплиментарности.
- •61.Экспрессия генов
- •62. Оперон
- •63. Регуляция экспрессии генома у эукариот осуществляется на нескольких уровнях:
- •66. Новосинтезированным белкам надо "созреть"
- •70. Жирорастворимые витамины, их биологическая роль.
- •71. Водорастворимые витамины, их биологическая роль.
- •72.Биологическая роль микроэлементов: железа, меди, цинка, кобальта, марганца, йода. Биологическая роль макроэлементов: натрия, калия, кальция, магния, фосфора, серы, хлора.
- •Биогенные элементы
- •67. Фотосинтетический аппарат. Хлорофиллы, каратиноиды и другие пигменты. Световая стадия фотосинтеза. Фотофосфорилирование.
- •68. Темновая стадия фотосинтеза. Цикл Кальвина. Общее уравнение фотосинтеза. Затраты атр и nadph.
- •69.Механизм реализации фотосинтетического пути Хэтча-Слэка (с4). Его биологическая роль. Фотодыхание.
- •73.Биохимические основы адаптации.
- •74.Биотрансформация вредных (токсических) веществ в экосистемах.
- •75.Пути метаболизма ксенобиотиков в организме
- •76. Функционирование микросомальной системы окисления
- •1. Основные ферменты микросомальных
- •2. Функционирование цитохрома р450
- •3. Свойства системы микросомального
- •Широкая субстратная специфичность. Изоформы р450
- •77.Реакции конъюгации в печени.
- •78.Биохимические основы защиты клеток от повреждающих воздействий
- •79. Антиоксидантная система.
47) Биосинтез насыщенных жк. Стр-ра синтазной с-мы для жк. Биосинтез пальмитиновой к-ты.
Рассмотрим некоторые важные особенности пути биосинтеза жирных кислот.
1. Синтез происходит в цитозоле в отличие от распада, который протекает в митохондриальном матриксе.
2. Промежуточные продукты синтеза жирных кислот ковалентно связаны с сульфгидрильными группами ацилпереносящего белка (АПБ), тогда как промежуточные продукты расщепления жирных кислот связаны с коферментом А.
3. Многие ферменты синтеза жирных кислот у высших организмов организованы в мультиферментный комплекс, называемый синтетазой жирных кислот. В противоположность им ферменты, катализирующие расщепление жирных кислот, повидимому, не склонны к ассоциации.
4. Растущая цепь жирной кислоты удлиняется путем последовательного присоединения двухуглеродных компонентов, происходящих из ацетил-СоА. Активированным донором двухуглеродных компонентов на стадии элонгации служит малонил-АПБ. Реакция элонгации запускается высвобождением СО2.
5. Роль восстановителя при синтезе жирной кислоты выполняет NАDРН.
6. В реакциях также участвует Мn2+.
7. Элонгация под действием комплекса синтетазы жирных кислот останавливается на этапе образования палъмитата (С16). Дальнейшая элонгация и введение двойных связей осуществляются другими ферментными системами.
Синтез жирных кислот начинается с карбоксилирования ацетил-СоА в малонил-СоА. Эта необратимая реакция представляет собою решающий этап в синтезе жирных кислот.
Синтез малонил-СоА катализируется ацетил-СоА-карбоксилазой и осуществляется за счет энергии АТР. Источником СО2 для карбоксилирования ацетил-СоА является бикарбонат.
Биотин-фермент + АТР + НСО3- ↔ СО2~Биотин-фермент + АDР + Pi,
СО2~Биотин-фермент + Ацетил-СоА ↔ Молонил-СоА + Биотин-фермент.
Синтез жирных кислот
Ферментная система, катализирующая синтез насыщенных длинноцепочечных жирных кислот из ацетил-СоА, малонил-СоА и NADРН, называется синтетазой жирных кислот.
Имеются два типа синтазных комплексов. У бактерий, растений и низших форм животных, таких, как эвглена, все индивидуальные ферменты синтазной системы находятся в виде автономных полипептидов. Ацильные радикалы (субстрат) связаны с одним из них, получившим название ацилпереносящии белок (АПБ). У дрожжей, млекопитающих и птиц синтазная система представляет собой полиферментный комплекс, который нельзя разделить на компоненты, не нарушив его активности. В данном случае АПБ является частью этого комплекса. Как АПБ бактерий, так и АПБ полиферментного комплекса содержат витамин пантотеновую кислоту в виде 4'-фосфопантетеина
В синтазной системе АПБ выполняет роль СоА. Синтазный комплекс, катализирующий образование жирных кислот, является димером
У животных мономеры идентичны и образованы одной полипептидной цепью, включающей 6 ферментов, катализирующих биосинтез жирных кислот, и АПБ с реакционноспособной SН-группой, принадлежащей 4'-фосфопантетеину. В непосредственной близости от этой группы расположена другая сульфгидрильная группа, принадлежащая остатку цистеина, входящего в состав 3-кетоацил-синтазы (конденсирующего фермента), которая входит в состав другого мономера. Поскольку для проявления синтазной активности необходимо участие обеих сульфгидрильных групп, синтазный комплекс активен только в виде димера.
Причем, в одном димерном синтазном комплексе имеются 2 активных центра, функционирующие независимо друг от друга, в результате одновременно образуются 2 молекулы пальмитиновой кислоты.
На первом этапе процесса инициирующая молекула ацетил-СоА при участии трансацилазы взаимодействует с –SН-группой цистеина. Mалонил-СоА под действием того же фермента (трансацилазы) взаимодействует с соседней –SН-группой, принадлежащей 4'-фосфопантетеину, локализованному в АПБ другого мономера. В результате этой реакции образуется ацетил(ацил)малонил-фермент. 3-Кетоацил-синтаза катализирует взаимодействие ацетильной группы фермента с метиленовой группой малонила и высвобождение СО2, в результате образуется 3-кетоацил-фермент (ацетоацетил-фермент); при этом освобождается сульфгидрильная группа цистеина, ранее занятая ацетильной группой. Декарбоксилирование позволяет реакции пройти до конца и является движущей силой биосинтеза. 3-Кетоацильная группа восстанавливается, затем дегидратируется и вновь восстанавливается, в результате образуется соответствующий насыщенный ацил-S-фермент. Эти реакции сходны с соответствующими реакциями β-окисления; отличие заключается, в частности, в том, что при биосинтезе образуется D(–)-изомер 3-гидроксикислоты, а не L(+)-изомер, кроме того, NАDРН, а не NАDН является донором водорода в реакциях восстановления. Далее новая молекула малонил-СоА взаимодействует с –SН-группой фосфопантетеина, при этом насыщенный ацильный остаток перемещается на свободную –SН-группу цистеина. Цикл реакций повторяется еще 6 раз, и каждый новый остаток малоната встраивается в углеродную цепь, до тех пор пока не образуется насыщенный 16-углеродный ацил-радикал (пальмитоил). Последний высвобождается из полиферментного комплекса под действием шестого фермента, входящего в состав комплекса, – тиоэстеразы (деацилазы). Свободная пальмитиновая кислота, прежде чем вступить в другой метаболический путь, должна перейти в активную форму ацил-СоА-производного. Затем активированный пальмитат обычно подвергается эстерификации с образованием ацилглицеролов.
Длинна синтезируемого ацильного фрагмента зависит от специфичности тиоэстеразы данной ткани. Например, в молочной железе имеется особая тиоэстераза, специфичная к ацильным остаткам С8-, С10- или С12-жирных кислот, входящих в состав липидов молока.
Объединение всех ферментов рассматриваемого метаболического пути в единый полиферментный комплекс обеспечивает его высокую эффективность и устраняет конкуренцию других процессов, в результате достигается эффект компартментации данного пути в клетке без участия дополнительных барьеров проницаемости.
Привидем суммарную реакцию биосинтеза пальмитиновой кислоты из ацетил-СоА и малонил-СоА:
Ацетил-СоА + 7Малонил-СоА + 14NАDРН + 7Н+ → Пальмитат + 7СО2 +
+ 14NАDР+ + 8СоА + 6Н2О.
При этом использовано следующее уравнение для синтеза малонил-СоА:
7Ацетил-СоА + 7СО2 + 7АТР → 7Малонил-СоА + 7АDР + 7Рi + 7Н+.
Отсюда выводим итоговую стехиометрию синтеза пальмитата:
8Ацетил-СоА + 7АТР + 14NАDРН → Пальмитат + 14NАDР+ + 8СоА +
+ 6Н2О + 7АDР + 7Рi.
Таким образом, из молекулы ацетил-СоА, выступающей в качестве затравки, образуются 15-й и 16-й углеродные атомы пальмитиновой кислоты. Присоединение всех последующих двухуглеродных фрагментов происходит за счет малонил-СоА-производного. В печени и молочной железе млекопитающих в качестве затравки может служить бутирил-СоА. Если в качестве затравки выступает пропионил-СоА, то синтезируются длинноцепочечные жирные кислоты с нечетным числом атомов углерода. Такие жирные кислоты характерны в первую очередь для жвачных животных, у которых пропионовая кислота образуется в рубце под действием микроорганизмов.
