- •1.Предмет биохимии. Биохимия в системе естественных наук. Роль биохимии в развитии медицины.
- •2.Аминокислоты. Структура. Явление стереоизомерии. Классификации аминокислот.
- •Ионные формы аминокислот
- •Классификация По радикалу
- •По функциональным группам
- •По классам аминоацил-тРнк-синтетаз
- •По путям биосинтеза
- •По способности организма синтезировать из предшественников
- •По характеру катаболизма у животных
- •3.Аминокислоты. Свойства аминокислот, их поведение в растворе. Методы определения аминокислот.
- •4.Биосинтез аминокислот. Заменимые и незаменимые аминокислоты.
- •5.Непротеиногенные аминокислоты. Производные аминокислот.
- •Соли аминокислот
- •Эфиры аминокислот
- •Азометины
- •6.Катаболизм аминокислот.
- •1. Механизм реакции
- •2. Органоспецифичные аминотрансферазы ант и act
- •3. Биологическое значение трансаминирования
- •4. Диагностическое значение определения аминотрансфераз в клинической практике
- •1. Окислительное дезаминирование
- •2. Непрямое дезаминирование (трансдезаминирование)
- •3. Неокислительное дезамитровате
- •7.Структура и биологические функции пептидов и белков. Классификации белков.
- •8.Первичная структура белков.
- •9.Вторичная структура белков. Структурирующие факторы (силы). Явления денатурации и ренатурации белков.
- •10.Третичная и четвертичная структура белков. Структурирующие факторы (силы). Глобулярные и фибриллярные белки.
- •11.Расщепление белков в желудочно-кишечном тракте. Протеазы. Проферменты, их биологическая роль.
- •12.Катаболизм белков. Убиквитин-зависимая и убиквитин-независимая деградация белков. Цикл мочевины. Мочевая кислота.
- •13.Ферменты. Принципы классификации и номенклатуры. Структура и биологическая роль.
- •14.Активные центры ферментов. Основные представления о механизме ферментативных реакций. Обратимость ферментативных реакций.
- •15. Регуляция активности ферментов. Аллостерические ферменты. Активаторы и ингибиторы ферментов. Принцип обратной связи. Регуляция активности ферментов
- •16.Кинетика ферментативных реакций. Зависимость Михаэлиса-Ментен. График обратных величин Лайнуивера-Берка и его практическое применение.
- •20.Структура моносахаридов. Альдозы и кетозы. Стереоизомеры. Эпимеры. Номенклатура. Моносахариды или простые сахара
- •Стереоизомерия моносахаридов
- •21.Циклические формы моносахаридов. Пиранозы и фуранозы. Стереоизомеры циклических форм моносахаридов. Конформация циклических форм. Пиранозные и фуранозные кольцевые структуры моносахаридов
- •Аномерия
- •22.Структура и свойства олигосахаридов. Их биологическая роль. Олигосахариды
- •23.Структура и свойства полисахаридов. Их биологическая роль. Полисахариды
- •Гомополисахариды
- •24.Гликопротеины, гликозаминогликаны, протеогликаны. Структура и биологическая роль. Гликопротеины и протеогликаны
- •Гликопротеины
- •Общий обзор
- •Локализация
- •Результат
- •29.Окисление пировиноградной кислоты. Функционирование пируватдегидрогеназного комплекса. Роль коферментов. Регуляция процесса.
- •31. Цикл лимонной кислоты. Биологическая роль. Ферментное обеспечение. Энергетический выход. Образование nadh, fadh2 и gtp в цикле лимонной кислоты. Регуляция цикла
- •Глиоксилатный путь катаболизма углеводов. Ферментное обеспечение. Биологическая роль.
- •Окисление внемитохондриального nadh. Челночные системы митохондрий.
- •Пентозомонофосфатный путь катаболизма углеводов. Ферментное обеспечение. Биологическая роль.
- •Глюконеогенез. Биосинтез гликогена из пировиноградной кислоты. Ключевые стадии. Ферментное обеспечение. Регуляция глюконеогенеза.
- •Биосинтез гликогена. Ферментное обеспечение процесса. Реципрокная регуляция гликоген-синтазы и гликоген-фосфорилазы.
- •Регуляция расщепления и синтеза гликогена также взаимосвязана
- •Общие свойства, классификация и номенклатура липидов. Жирные кислоты. Строение и свойства нейтральных жиров. Воска.
- •Строение и свойства фосфоглицеридов.
- •Сфинголипиды. Строение и биологическая роль.
- •41) Строение и св-ва стероидов. Холестерол и его эфиры. Соединения липидов с друг. Биомолекулами. Липопротеины.
- •42) Образование мицелл, монослоёв, бислоёв и липосом фосфолипидами. Их роль. Структура, св-ва и функционирование биологических мембран.
- •47) Биосинтез насыщенных жк. Стр-ра синтазной с-мы для жк. Биосинтез пальмитиновой к-ты.
- •48) Биосинтез ненасыщенных жк. Незаменимые жк. Регуляция биосинтеза жк.
- •49) Биосинтез моно-, ди-, триацилглицеролов.
- •50) Метаболизм глицерофосфолипидов.
- •53. Строение нуклеиновых кислот. Пуриновые и пиримидиновые основания. Углеводные компоненты нуклеиновых кислот.
- •54. Нуклеотиды и их биологическая роль. Структура и функции атф.
- •55. Биосинтез пуриновых нуклеотидов
- •Образование дифосфатов и трифосфатов пуриновых нуклеозидов
- •Синтез пуриновых дезоксирибонуклеотидов
- •56. Пути регенерации и деградации пуринов. Пути регенерации пуриновых нуклеотидов
- •57. Биосинтез пиримидиновых нуклеотидов. Регуляция
- •Далее следуют реакции образования нуклеозидди- и трифосфатов, дезоксирибо-нуклеотидов, а также других типов нуклеотидов – цитидиновых и тимидиновых.
- •Регуляция биосинтеза пиримидинов
- •58. Пути регенерации и деградации пиримидиновых нуклеотидов. Регенерация пиримидиновых нуклеотидов
- •Деградация пиримидиновых нуклеотидов
- •59. Классификация нуклеиновых кислот. Первичная и вторичная структура днк. Значение двуспирального строения днк. Принцип комплиментарности.
- •61.Экспрессия генов
- •62. Оперон
- •63. Регуляция экспрессии генома у эукариот осуществляется на нескольких уровнях:
- •66. Новосинтезированным белкам надо "созреть"
- •70. Жирорастворимые витамины, их биологическая роль.
- •71. Водорастворимые витамины, их биологическая роль.
- •72.Биологическая роль микроэлементов: железа, меди, цинка, кобальта, марганца, йода. Биологическая роль макроэлементов: натрия, калия, кальция, магния, фосфора, серы, хлора.
- •Биогенные элементы
- •67. Фотосинтетический аппарат. Хлорофиллы, каратиноиды и другие пигменты. Световая стадия фотосинтеза. Фотофосфорилирование.
- •68. Темновая стадия фотосинтеза. Цикл Кальвина. Общее уравнение фотосинтеза. Затраты атр и nadph.
- •69.Механизм реализации фотосинтетического пути Хэтча-Слэка (с4). Его биологическая роль. Фотодыхание.
- •73.Биохимические основы адаптации.
- •74.Биотрансформация вредных (токсических) веществ в экосистемах.
- •75.Пути метаболизма ксенобиотиков в организме
- •76. Функционирование микросомальной системы окисления
- •1. Основные ферменты микросомальных
- •2. Функционирование цитохрома р450
- •3. Свойства системы микросомального
- •Широкая субстратная специфичность. Изоформы р450
- •77.Реакции конъюгации в печени.
- •78.Биохимические основы защиты клеток от повреждающих воздействий
- •79. Антиоксидантная система.
20.Структура моносахаридов. Альдозы и кетозы. Стереоизомеры. Эпимеры. Номенклатура. Моносахариды или простые сахара
Моносахариды или монозы – бесцветные, твердые кристаллические вещества, хорошо растворимые в воде. Основу моносахаридов составляет неразветвленная цепочка атомов углерода, соединенных между собой одинарными связями. Один из атомов углерода связан двойной связью с атомом кислорода и образует карбонильную группу; ко всем остальным атомам углерода присоединены гидроксильные группы. По расположению карбонильной группы в цепи углеродных атомов моносахариды делят на альдозы (карбонильная группа находится в конце углеродной цепи) и кетозы (карбонильная группа находится в любом другом положении). Простейшей альдозой является глицеральдегид, а простейшая кетоза представлена дигидроксиацетоном. С другой стороны, моносахариды, которые не способны гидролизоваться до более простых форм, могут быть построены из трех, четырех, пяти, шести и более атомов углерода. Следовательно, по числу атомов углерода моносахариды делят на триозы, тетрозы, пентозы, гексозы и т.д. Таким образом, в соответствии с приведенными выше принципами классификации моноз, простые сахара могут существовать в виде альдотриоз, альдопентоз, альдогексоз или кетотриоз, кетопентоз, кетогексоз и т. д. (см. таблицу в «Приложении 1»). Наиболее известными природными представителями моносахаридов являются: глицеральдегид, дигидроксиацетон, рибоза, дезоксирибоза, арабиноза, глюкоза, галактоза, фруктоза и др.
При написании структуры моноз часто пользуются проекционными формулами Фишера (см. таблицу в «Приложении 1»). Существует несколько простых правил, которыми руководствуются для отображения этих проекционных формул:
Цепочку углеродных атомов моноз записывают вертикально.
Сверху располагают старшую функциональную группу, которая в составе моноз представлена либо альдегидной группой, либо кето-группой.
По горизонтали записывают атомы водорода и группы, содержащие гетероатомы (в нашем случае – гидроксильные группы).
Стереоизомерия моносахаридов
Способность ряда органических соединений вращать плоскость поляризации поляризованного света вправо или влево называют оптической активностью. Исходя из сказанного выше, следует, что органические вещества могут существовать в виде правовращающих и левовращающих изомеров. Такие изомеры получили название стереоизомеров, а само явление стереоизомерии. В основе более строгой системы классификации и обозначения стереоизомеров лежит не вращение плоскости поляризации света, а абсолютная конфигурация молекулы стереоизомера, т.е. взаимное расположение четырех обязательно разных замещающих групп, находящихся в вершинах тетраэдра, вокруг локализованного в центре атома углерода, который получил название асимметрического атома углерода или хирального центра. Хиральные или, как их еще называют, оптически активные атомы углерода обозначают в структурных формулах звездочками [*] (рис. 7.1).
а)
б)
Таким образом, под термином стереоизомерия следует понимать различную пространственную конфигурацию заместителей у соединений, имеющих одну и ту же структурную формулу и обладающих одинаковыми химическими свойствами. Такой вид изомерии называют также зеркальной изомерией. Наглядным примером зеркальной изомерии могут служить правая и левая ладони руки. Ниже приведены структурные формулы стереоизомеров глицеринового альдегида и глюкозы.
На рис.7.1 видно, что в молекуле глицеринового альдегида присутствует только один асимметрический атом углерода. При этом возможно существование только двух стереоизомеров, которые обозначаются как D- и L-изомеры, соответственно. Если у асимметрического атома углерода в проекционной формуле глицеринового альдегида ОН-группа располагается справа, такой изомер называют D-стереоизомером, а если ОН-группа расположена слева –L-стереоизомером.
В случае тетроз, пентоз, гексоз и других моноз, которые обладают двумя и более асимметрическими атомами углерода, принадлежность стереоизомера к D- или L-ряду определяют по расположению ОН-группы у предпоследнего атома углерода в цепи – он же является последним асимметрическим атомом. Например, для глюкозы оценивают ориентацию ОН-группы у 5-ого атома углерода. Абсолютно зеркальные стереоизомеры называют энантиомерами или антиподами.
Пары же стереоизомеров характеризующиеся одинаковым пространственным расположением заместителей у одних асимметрических атомов углерода и взаимно противоположным у других (рис. 7.2), называются диастереоизомерами, а само явление носит название диастереоизомерии. Например, L-глюкоза и D-глюкоза являются энантиомерами, а D-глюкоза, D-галактоза и D-манноза являются диастереоизомерами.
Стереоизомеры не отличаются по своим химическим свойствам, но отличаются по биологическому действию (биологической активности). Большая часть моносахаридов в организме млекопитающих относится к D-ряду – именно к этой конфигурации специфичны ферменты, ответственные за их метаболизм. В частности D-глюкоза воспринимается как сладкое вещество, благодаря способности взаимодействовать с вкусовыми рецепторами языка, в то время как L-глюкоза безвкусна, поскольку ее конфигурация не воспринимается вкусовыми рецепторами.
Смеси D- и L-стереоизомеров называют рацемическими смесями, или рацематом. Такие DL-смеси лишены способности поворачивать плоскость поляризации пучка плоскополяризованного света.
