- •1.Предмет биохимии. Биохимия в системе естественных наук. Роль биохимии в развитии медицины.
- •2.Аминокислоты. Структура. Явление стереоизомерии. Классификации аминокислот.
- •Ионные формы аминокислот
- •Классификация По радикалу
- •По функциональным группам
- •По классам аминоацил-тРнк-синтетаз
- •По путям биосинтеза
- •По способности организма синтезировать из предшественников
- •По характеру катаболизма у животных
- •3.Аминокислоты. Свойства аминокислот, их поведение в растворе. Методы определения аминокислот.
- •4.Биосинтез аминокислот. Заменимые и незаменимые аминокислоты.
- •5.Непротеиногенные аминокислоты. Производные аминокислот.
- •Соли аминокислот
- •Эфиры аминокислот
- •Азометины
- •6.Катаболизм аминокислот.
- •1. Механизм реакции
- •2. Органоспецифичные аминотрансферазы ант и act
- •3. Биологическое значение трансаминирования
- •4. Диагностическое значение определения аминотрансфераз в клинической практике
- •1. Окислительное дезаминирование
- •2. Непрямое дезаминирование (трансдезаминирование)
- •3. Неокислительное дезамитровате
- •7.Структура и биологические функции пептидов и белков. Классификации белков.
- •8.Первичная структура белков.
- •9.Вторичная структура белков. Структурирующие факторы (силы). Явления денатурации и ренатурации белков.
- •10.Третичная и четвертичная структура белков. Структурирующие факторы (силы). Глобулярные и фибриллярные белки.
- •11.Расщепление белков в желудочно-кишечном тракте. Протеазы. Проферменты, их биологическая роль.
- •12.Катаболизм белков. Убиквитин-зависимая и убиквитин-независимая деградация белков. Цикл мочевины. Мочевая кислота.
- •13.Ферменты. Принципы классификации и номенклатуры. Структура и биологическая роль.
- •14.Активные центры ферментов. Основные представления о механизме ферментативных реакций. Обратимость ферментативных реакций.
- •15. Регуляция активности ферментов. Аллостерические ферменты. Активаторы и ингибиторы ферментов. Принцип обратной связи. Регуляция активности ферментов
- •16.Кинетика ферментативных реакций. Зависимость Михаэлиса-Ментен. График обратных величин Лайнуивера-Берка и его практическое применение.
- •20.Структура моносахаридов. Альдозы и кетозы. Стереоизомеры. Эпимеры. Номенклатура. Моносахариды или простые сахара
- •Стереоизомерия моносахаридов
- •21.Циклические формы моносахаридов. Пиранозы и фуранозы. Стереоизомеры циклических форм моносахаридов. Конформация циклических форм. Пиранозные и фуранозные кольцевые структуры моносахаридов
- •Аномерия
- •22.Структура и свойства олигосахаридов. Их биологическая роль. Олигосахариды
- •23.Структура и свойства полисахаридов. Их биологическая роль. Полисахариды
- •Гомополисахариды
- •24.Гликопротеины, гликозаминогликаны, протеогликаны. Структура и биологическая роль. Гликопротеины и протеогликаны
- •Гликопротеины
- •Общий обзор
- •Локализация
- •Результат
- •29.Окисление пировиноградной кислоты. Функционирование пируватдегидрогеназного комплекса. Роль коферментов. Регуляция процесса.
- •31. Цикл лимонной кислоты. Биологическая роль. Ферментное обеспечение. Энергетический выход. Образование nadh, fadh2 и gtp в цикле лимонной кислоты. Регуляция цикла
- •Глиоксилатный путь катаболизма углеводов. Ферментное обеспечение. Биологическая роль.
- •Окисление внемитохондриального nadh. Челночные системы митохондрий.
- •Пентозомонофосфатный путь катаболизма углеводов. Ферментное обеспечение. Биологическая роль.
- •Глюконеогенез. Биосинтез гликогена из пировиноградной кислоты. Ключевые стадии. Ферментное обеспечение. Регуляция глюконеогенеза.
- •Биосинтез гликогена. Ферментное обеспечение процесса. Реципрокная регуляция гликоген-синтазы и гликоген-фосфорилазы.
- •Регуляция расщепления и синтеза гликогена также взаимосвязана
- •Общие свойства, классификация и номенклатура липидов. Жирные кислоты. Строение и свойства нейтральных жиров. Воска.
- •Строение и свойства фосфоглицеридов.
- •Сфинголипиды. Строение и биологическая роль.
- •41) Строение и св-ва стероидов. Холестерол и его эфиры. Соединения липидов с друг. Биомолекулами. Липопротеины.
- •42) Образование мицелл, монослоёв, бислоёв и липосом фосфолипидами. Их роль. Структура, св-ва и функционирование биологических мембран.
- •47) Биосинтез насыщенных жк. Стр-ра синтазной с-мы для жк. Биосинтез пальмитиновой к-ты.
- •48) Биосинтез ненасыщенных жк. Незаменимые жк. Регуляция биосинтеза жк.
- •49) Биосинтез моно-, ди-, триацилглицеролов.
- •50) Метаболизм глицерофосфолипидов.
- •53. Строение нуклеиновых кислот. Пуриновые и пиримидиновые основания. Углеводные компоненты нуклеиновых кислот.
- •54. Нуклеотиды и их биологическая роль. Структура и функции атф.
- •55. Биосинтез пуриновых нуклеотидов
- •Образование дифосфатов и трифосфатов пуриновых нуклеозидов
- •Синтез пуриновых дезоксирибонуклеотидов
- •56. Пути регенерации и деградации пуринов. Пути регенерации пуриновых нуклеотидов
- •57. Биосинтез пиримидиновых нуклеотидов. Регуляция
- •Далее следуют реакции образования нуклеозидди- и трифосфатов, дезоксирибо-нуклеотидов, а также других типов нуклеотидов – цитидиновых и тимидиновых.
- •Регуляция биосинтеза пиримидинов
- •58. Пути регенерации и деградации пиримидиновых нуклеотидов. Регенерация пиримидиновых нуклеотидов
- •Деградация пиримидиновых нуклеотидов
- •59. Классификация нуклеиновых кислот. Первичная и вторичная структура днк. Значение двуспирального строения днк. Принцип комплиментарности.
- •61.Экспрессия генов
- •62. Оперон
- •63. Регуляция экспрессии генома у эукариот осуществляется на нескольких уровнях:
- •66. Новосинтезированным белкам надо "созреть"
- •70. Жирорастворимые витамины, их биологическая роль.
- •71. Водорастворимые витамины, их биологическая роль.
- •72.Биологическая роль микроэлементов: железа, меди, цинка, кобальта, марганца, йода. Биологическая роль макроэлементов: натрия, калия, кальция, магния, фосфора, серы, хлора.
- •Биогенные элементы
- •67. Фотосинтетический аппарат. Хлорофиллы, каратиноиды и другие пигменты. Световая стадия фотосинтеза. Фотофосфорилирование.
- •68. Темновая стадия фотосинтеза. Цикл Кальвина. Общее уравнение фотосинтеза. Затраты атр и nadph.
- •69.Механизм реализации фотосинтетического пути Хэтча-Слэка (с4). Его биологическая роль. Фотодыхание.
- •73.Биохимические основы адаптации.
- •74.Биотрансформация вредных (токсических) веществ в экосистемах.
- •75.Пути метаболизма ксенобиотиков в организме
- •76. Функционирование микросомальной системы окисления
- •1. Основные ферменты микросомальных
- •2. Функционирование цитохрома р450
- •3. Свойства системы микросомального
- •Широкая субстратная специфичность. Изоформы р450
- •77.Реакции конъюгации в печени.
- •78.Биохимические основы защиты клеток от повреждающих воздействий
- •79. Антиоксидантная система.
10.Третичная и четвертичная структура белков. Структурирующие факторы (силы). Глобулярные и фибриллярные белки.
Третичная структура белковой молекулы описывает полную трехмерную архитектуру белка, в том числе и простетической группы, если она имеется. Др. словами, она характеризуется определённой пространственной ориентацией полипептидной цепи или способом укладки вторичных структур в компактную структуру определённого объёма. Стабилизация тр. Стр-ры белка кроме ковалентных связей ( пептидных и дисульфидных) обеспечивается: *электростатическими силами притяжения между боковыми цепями с противоположно заряженными ионными группами (ион-ионные взаимодействия); * водородными связями м-ду группами, не участвующими в образовании пептидной связи, например, м-ду остатками тирозина и глутаминовой кислоты; * водородными связями пептидных группировок спиральных структур типа складчатого листа; Гидрофобными взаимодействиями м-ду неполярными боковыми радикалами аланина, лейцина и др неполярных АК; * Взаимодействиями в простетической группе, напр, м-ду ионом металла и различными R-группами.
Образование и функционирование тр. Структуры белка обеспечивают слабые взаимодействия м-ду боковыми радикалами полипептидных цепей, и этих сил взаимодействий достаточно для защиты белков от действия повреждающих факторов внутри клетки. Однако, для белков- ферментов ЖКТ, инсулина и др гормонов в крови необходимы доп. Силы для защиты от более жесткой внеклеточной среды. Такая защита достигается образованием ковалентных дисульфидных связей м-ду пространственно сближенными остатками цистеина. Дисульфидные связи весьма эффективно стабилизируют структуру белка, они не разраваются при умеренном нагревании, и белки, содержащие эти связи, во многих случаях отличаются термостойкостью. В зависимости от укладки полипептидной цепи молекулы белков бывают глобулярные (шароподобные) и фибриллярные (нитеподобные). Две или несколько а- спирали могут закручиваться одна вокруг другой, как тяжи в канате. А-Спирализованная суперспираль содержится в кератине шерсти.ю волос, перьев, ногтей, когтей, рогов, эпидермисе кожи, миозине и тропомиозине мышц, фибрине в сгустках крови. Из фибриллярных белков наиболее изучен коллаген. Четвертичная структура белка. Белки, состоящие из нескольких полипептидных цепей, соединённых нековалентными связями, характеризуются четв. Структурой. Она характеризуется способом укладки отдельных полипептидных цепей, обладающих одинаковыми или разными первичными, втор, третичными уровнями структурной организации, в функционально активный комплекс. Белки такого типа называют олигомерными, мультимерными или субъединичными комплексами. Состав и стехиометрия этих белков обычно постоянны. Строгое объединение субъединиц происходит благодаря наличию на их поверхности комплементарных участков для «узнавания» друг друга. В природе чаще встречаются димеры, тетрамеры и гексамеры, хотя известны и олигомеры с большим числом субъединиц. Гомогенные олигомеры состоят из одинаковых субъединиц, а гетерогенные – из разных. Стабилизация четвертичной структуры поддерживается за счёт электростатических, водородных связей и годрофобных взаимодействий м-жу боковыми цепями, расположенными вблизи поверхности каждого протомера. Наиболее полно изучена четв стр-ра гемоглобина, молекула которго имеет почти правильную глобулярную форму диаметром 0,55 нм. 4 цепи (2а и 2в) гемоглобина расположены в виде тетраэдра. У каждой субъединицы в углублении на наружной стороне молекулы содержится гем. Расстояние м-ду двумя ближайшими атомами железа составляет 0. 25 нм. Каждая а-цепь связана тесно с двумя в-цепями, в то время как м-ду двумя а- или в-сцбъединицами связь незначительна. Для многих белков с четв. Структурой хар-но явление кооперативности. Свойство это тесно связано с явлением аллостеризма. Субъединицы связаны м-ду собой, и белки обладают конформационной лабильностью. Первоначальное связывание лиганда с одной субъединицей вызывает изменение конформации последующих субъединиц и всей молекулы белка. Конформационные изменения, произошедшие в других субъединицах, облегчают связывание следующего лиганда, что вызывает новые конформац-е изменения в белке и ускорение связывания очередного лиганда и так далее.
