- •Н.Ф. Клещев., н.В. Решетняк, н.М. Мартынюк Биоорганическая химия. Практикум
- •Центрифуги
- •1. Общая характеристика органических соединений.
- •Валентные состояния атома углерода
- •Концепция электронных смещений
- •Получение цис - и транс - бутен-2-овой кислот
- •2. Химические свойства органических соединений
- •Зависимость кислотности от гетероатома.
- •Влияние углеводородного радикала и присутствующих в нем заместителей
- •Влияние растворителя.
- •Основные свойства органических соединений. Π-основания и n-основания.
- •Теория Льюиса.
- •Механизм радикального замещения в общем виде
- •Определение степени окисления атомов в органических веществах
- •Окисление и восстановление органических веществ
- •3. Биологически важные органические соединения
- •3.1 Полифункциональные соединения в процессах жизенедеятельности
- •3.1.1 Общая характеристика.
- •3.1.2. Реакционная способность и специфические реакции многоатомных спиртов и фенолов
- •3.1.3 Реакционная способность и специфические реакции дикарбоновых кислот
- •3.1.5. Функциональные производные угольной кислоты
- •3.2.1 Общая характеристика
- •3.3. Реакционная способность и специфические свойства биологически важныхгетерофункциональных соединений
- •3.3.1. Аминоспирты
- •3.3.3. Гидрокси- и аминокислоты
- •3.3.4. Оксокислоты
- •3.4. Гетерофункциональные производные бензола как лекарственные средства
- •3.4 Важнейшие гетероциклические биоорганические соединения.
- •3.4.1. Общая характеристика
- •3.4.2. Номенклатура
- •3.4.3. Реакционная способность ароматических гетероциклов
- •3.4.4. Кислотно-основные и нуклеофильные свойства
- •3.4.5 Особенности реакций электрофильного замещения
- •3.4.6. Пятичленные гетероциклы
- •3.4.7 Шестичленные гетероциклы
- •3.4.8. Гетероциклы с двумя гетероатомами
- •3.4.9 Конденсированные гетероциклы
- •4. Биополимеры и их структурные компоненты
- •4.1 Углеводы. Поли-, олиго- и моносахариды.
- •4.1.1. Моносахариды
- •Цикло-оксо-таутомерия
- •Конформации
- •Неклассические моносахариды
- •Химические свойства
- •4.1.2. Олигосахариды
- •4.1.3 Полисахариды
- •4.1.3. Гетерополисахариды
- •4.2 Простые и сложные липиды.
- •4.2.1 Структурные компоненты липидов
- •4.2.2 Простые липиды
- •4.2.3 Свойства липидов и их структурных компонентов
- •4.3 Протеины, пептиды и аминокислоты.
- •4.4 Нуклеиновые и кислоты и нуклеотиды
- •4.4.1. Нуклеотиды
- •4.4.2. Структура нуклеиновых кислот
- •4.4.3. Нуклеотидные коферменты
- •Получение фосфатидилхолинов из яичного желтка
- •Эмульгирование
- •Осаждение фосфатидилхолинов хлористым кадмием
- •Гидролиз фосфатидилхолинов
- •Определение жирных кислот
- •Обнаружение глицерина
- •Обнаружение фосфора
- •Диализ белка
- •Обессоливание белкового раствора методом гель-фильтрации
- •Выделение нуклеопротеинов из дрожжей
- •Опыт №2 Гидролиз нуклеопротеинов. При выполнении данной работы следует соблюдать особую осторожность!
- •5. Физико-химические методы анализа в биоорганической химии
- •5.1 Хроматографические методы анализа
- •5.2 Спектральные методы анализа
- •5.2.1 Основные характеристики электромагнитного излучения
- •5.2.2 Молекулярная спектроскопия
- •5.2.3 Электронная спектроскопия
- •5.2.5 Масс-спектрометрия
- •5.3. Электроанализ в биоорганической химии
- •1. Экстракция липидов из биологического материала.
- •2. Фракционирование липидов методом адсорбционной хроматографии.
5.2.2 Молекулярная спектроскопия
Методы основаны на взаимодействии электромагнитного излучения с молекулами вещества.
Свет – распространение электромагнитных волн в пространстве.
Как любое электромагнитное колебание характеризуется скоростью, длиной волны и частотой.
Методы молекулярной спектроскопии основаны на взаимодействии вещества или смеси веществ, их растворов с различного вида излучениями. К ним относятся электронная, инфракрасная спектроскопия; метод люминесценции, оптический и рентгеновский спектральный анализ; рефрактометрия; поляриметрия; метод ядерного магнитного резонанса. На взаимодействии с магнитным полем основанметод электронного парамагнитного резонанса, последовательно с электрическим и магнитым –масс-спектрометрия.
В настоящее время спектрофотометрические методы с большим успехом используются при решении таких вопросов, как контроль чистоты химических соединений, идентификация, установление структуры, исследование различных видов изомерии, количественный анализ смесей, определение констант диссоциации кислот и оснований, исследование кинетики химических реакций, определение микропримесей и т.д.
5.2.3 Электронная спектроскопия
Изучает поглощение органическими веществами света в УФ области спектра (200-400 нм). Излучение с такой длиной волны поглощают только соединения, с p-связями (С=О, С=С). |
Поглощение света вызвано электронными переходами:
|
5.2.4 ИК-спектроскопия
Инфракрасные спектры возникают в результате возбуждения колебаний атомов и целых группировок в молекуле в результате поглощения тепловых квантов энергии, расположенных от 760 нм спектра.
Колебательные движения молекул
Структурный анализ по ИК-спектрам сводится в настоящее время к отысканию характеристических полос поглощения и их отнесению к соответствующим структурным элементам с учетом численных значений частот maxпоглощения, контура (формы) и интенсивности полос.
Характеристические частоты и их интенсивности для некоторых функциональных групп
Частота |
Природа колебания |
Тип соединения |
Интенсивность |
3640-3610 |
Валентные О-Н |
Разбавленные растворы спиртов в неполярных растворителях |
40-70 |
3530 |
Ассим. валентные свободной NH2 |
Разбавленные растворы первичных аминов |
130 |
3415 |
Симм. валентные свободной NH2 |
То же |
120 |
1820-1650 |
Валентные С=О |
Карбонильные соединения |
250-1250 |
1560-1480 |
Колебания кольца |
Арены |
50-100 |
1335-1310 |
Ассим. валентные –SO2 |
Алкилсульфоны |
250-600 |
1160-1130 |
Симм. Валентные –SO2 |
Алкилсульфоны |
500-900 |
5.2.5 Масс-спектрометрия
Применяется для идентификации и определения молекулярной массы и молекулярной формулы вещества.
Молекулы, находящиеся в парообразном состоянии в глубоком вакууме, подвергаются бомбардировке электронами. Молекулы в этих условиях теряют один электрон. Образующийся молекулярный ион последовательно распадается на осколки-катионы, свободные радикалы или молекулы.
5.2.6 ЯМР – спектроскопия
Метод пригоден для исследования молекул, в состав которых входят атомы с нечетным числом протонов или нейтронов. Такие ядра обладают ядерным спином и являются парамагнитными (ЯМР1Н,13С,19F,31Р).
При взаимодействии излучения на исследуемый образец, ядра переходят с более низкого энергетического уровня на более высокий, происходит поглощение энергии.
Атомы в молекуле находятся в различном химическом окружении. Этой небольшой разницы достаточно для изменения разности энергий между спиновыми состояниями и, следовательно, частоты поглощаемого излучения (эффект экранирования).
Количественной характеристикой степени экранирования ядер служит химический сдвиг – расстояние между сигналом ядра и сигналом эталонного вещества, выраженного в миллионных долях величины напряженности внешнего тока.
Электроноакцепторные группы и сопряженные связи уменьшают экранированность (сигнал отмечается в более слабом поле);
В ароматических циклах, при действии на них сильного магнитного поля возникает кольцевой ток, собственное магнитное поле, что понижает напряженность внешнего поля (смещение сигнала в более слабое поле).
Параметры спектра:
Положение сигнала (тип атома);
Площадь сигнала (число атомов данного типа);
Мультиплетность (форма) – число соседних атомов других типов.
Строение сигналов (мультиплетов) спектра ЯМР 1Н
Название
|
Число пиков |
Число Н у соседних атомов углеродов |
Синглет Дуплет Триплет Мультиплет |
1 2 3 х+1 |
0 1 2 х |
