- •Н.Ф. Клещев., н.В. Решетняк, н.М. Мартынюк Биоорганическая химия. Практикум
- •Центрифуги
- •1. Общая характеристика органических соединений.
- •Валентные состояния атома углерода
- •Концепция электронных смещений
- •Получение цис - и транс - бутен-2-овой кислот
- •2. Химические свойства органических соединений
- •Зависимость кислотности от гетероатома.
- •Влияние углеводородного радикала и присутствующих в нем заместителей
- •Влияние растворителя.
- •Основные свойства органических соединений. Π-основания и n-основания.
- •Теория Льюиса.
- •Механизм радикального замещения в общем виде
- •Определение степени окисления атомов в органических веществах
- •Окисление и восстановление органических веществ
- •3. Биологически важные органические соединения
- •3.1 Полифункциональные соединения в процессах жизенедеятельности
- •3.1.1 Общая характеристика.
- •3.1.2. Реакционная способность и специфические реакции многоатомных спиртов и фенолов
- •3.1.3 Реакционная способность и специфические реакции дикарбоновых кислот
- •3.1.5. Функциональные производные угольной кислоты
- •3.2.1 Общая характеристика
- •3.3. Реакционная способность и специфические свойства биологически важныхгетерофункциональных соединений
- •3.3.1. Аминоспирты
- •3.3.3. Гидрокси- и аминокислоты
- •3.3.4. Оксокислоты
- •3.4. Гетерофункциональные производные бензола как лекарственные средства
- •3.4 Важнейшие гетероциклические биоорганические соединения.
- •3.4.1. Общая характеристика
- •3.4.2. Номенклатура
- •3.4.3. Реакционная способность ароматических гетероциклов
- •3.4.4. Кислотно-основные и нуклеофильные свойства
- •3.4.5 Особенности реакций электрофильного замещения
- •3.4.6. Пятичленные гетероциклы
- •3.4.7 Шестичленные гетероциклы
- •3.4.8. Гетероциклы с двумя гетероатомами
- •3.4.9 Конденсированные гетероциклы
- •4. Биополимеры и их структурные компоненты
- •4.1 Углеводы. Поли-, олиго- и моносахариды.
- •4.1.1. Моносахариды
- •Цикло-оксо-таутомерия
- •Конформации
- •Неклассические моносахариды
- •Химические свойства
- •4.1.2. Олигосахариды
- •4.1.3 Полисахариды
- •4.1.3. Гетерополисахариды
- •4.2 Простые и сложные липиды.
- •4.2.1 Структурные компоненты липидов
- •4.2.2 Простые липиды
- •4.2.3 Свойства липидов и их структурных компонентов
- •4.3 Протеины, пептиды и аминокислоты.
- •4.4 Нуклеиновые и кислоты и нуклеотиды
- •4.4.1. Нуклеотиды
- •4.4.2. Структура нуклеиновых кислот
- •4.4.3. Нуклеотидные коферменты
- •Получение фосфатидилхолинов из яичного желтка
- •Эмульгирование
- •Осаждение фосфатидилхолинов хлористым кадмием
- •Гидролиз фосфатидилхолинов
- •Определение жирных кислот
- •Обнаружение глицерина
- •Обнаружение фосфора
- •Диализ белка
- •Обессоливание белкового раствора методом гель-фильтрации
- •Выделение нуклеопротеинов из дрожжей
- •Опыт №2 Гидролиз нуклеопротеинов. При выполнении данной работы следует соблюдать особую осторожность!
- •5. Физико-химические методы анализа в биоорганической химии
- •5.1 Хроматографические методы анализа
- •5.2 Спектральные методы анализа
- •5.2.1 Основные характеристики электромагнитного излучения
- •5.2.2 Молекулярная спектроскопия
- •5.2.3 Электронная спектроскопия
- •5.2.5 Масс-спектрометрия
- •5.3. Электроанализ в биоорганической химии
- •1. Экстракция липидов из биологического материала.
- •2. Фракционирование липидов методом адсорбционной хроматографии.
Диализ белка
Диализом называется процесс разделения высокомолекулярных и низкомолекулярных веществ с помощью полупроницаемых мембран (коллодий, целлофан, пергамент и др.). Обладая большим диаметром, белковые молекулы не способны проникать через такие мембраны, в то время как частицы низкомолекулярных веществ легко проходят через них.
Реактивы: 1) альбумин, 3 % раствор; 2) (NH4)2SO4, насыщенный раствор; 3) BaCl2, 5 % раствор; CuSO4; 4) биуретовый реактив; 5) реактив Несслера; 6) 1% NH4OH.
Ход работы:
1. В пробирку наливают 2 мл раствора альбумина и прибавляют к раствору 1 каплю насыщенного раствора сульфата аммония. Из листа целлофана, намоченного водой, делают мешочек (диализатор) и выливают в него содержимое пробирки. Края мешочка зажимают между двумя стеклянными палочками, прижатыми друг к другу резиновыми колечками, надетыми на концы палочек. Мешочек помещают в стакан с дистиллированной водой, укладывают палочки на края стакана. Уровень жидкости в мешочке должен быть ниже жидкости в стакане.
2. Через 1 час от началадиализа берут в 2 пробирки по 1 мл жидкости из стакана и проводят следующие определения:
а) на присутстви SO42-: добавляютпервую пробирку 3-4 капли 5 % раствора BaCl2 и наблюдают образование осадка BaSO4 в виде белой мути.
б) на присутствие белка: проделывают биуретовую реакцию.
в) на присутствие аммиачного азота: добавить несколько капель реактива Несслера. При наличии аммиачного азота проявится желтое окрашивание. Для контроля проделать такую же реакцию с раствором NH4OH. Реактив Несслера состоит из двойной соли йодистой ртути и йодистого калия (HgI2, KI), растворенной в растворе КОН. Аммиак с реактивом Несслера дает соединение - йодистый меркураммоний, которое при малых количествах аммиака в растворе окрашивает его в желтый цвет, при значительных - в красно-желтый.
NH3 + 2 (HgI2* HI) + 3 KOH → NH2HgIO3 + 7 КI + 2 H2O
3. Жидкость из мешочка (диализат) сливают в пробирку, отмеряют 10 капель диализата и с ним тоже проделывают биуретовую реакцию.
Обессоливание белкового раствора методом гель-фильтрации
Низкомолекулярные вещества из белкового раствора можно достаточно быстро и полно уловить с помощью гель-фильтрации. Хроматографическую колонку наполняют гелем, набухшим в воде или буферном растворе. Разделение веществ этим методом основано на различии в размерах молекул.
Крупные молекулы не проникают в поры гранул геля и выходят из колонки в первую очередь, в то время как небольшие молекулы попадают через поры гранулы, вследствие чего задерживаются наколонке и вижутся с меньшей скоростью. Метод гель-фильтрации часто называют разделением веществ по принцип молекулярного сита.
Свойствами молекулярного сита обладают многие пористые материалы. Наиболее часто для этих целей применяют органические полимеры с трехмерной структурой. Например, гели полисахарида декстрана (коммерческое название сефадексы). Существует несколько типов сефадексов, различающихся как размерами, так и количеством пор и величиной гранул. Это позволяет применять их для разделения веществ с разными размерами молекул. Благодаря высокому содержанию гидроксильных групп гранулы сефадекса легко набухают, образуя гель. Чем выше способность геля к набуханию, тем больше номер сефадекса. Для свобождения белковых растворов от солей обычно используют сефадекс марки G-25.
Реактивы: 1) раствор белка; 2) K2CrO4, 5% раствор; 3) биуретовый реактив.
Нанесение раствора белка. Перед нанесением раствора открывают кран на колонке и наблюдают за уменьшением столбика воды над слоем сефадекса. Как только над поверхностью геля остается слой жидкости толщиной 1-2 мм, кран закрывают и пипеткой аккуратно наносят на гель 1 мл белкового раствора, в который предварительно добавляют раствор K2CrO4. Кран открывают и следят за проникновением раствора в гель. Снова закрывают кран, стенки колонки ополаскивают 1 мл дистиллированной воды, открывают кран и позволяют жидкости впитаться в гель. Затем кран закрывают, и, стараясь не взмучивать гель, аккуратно добавляют пипеткой по стенке 4-6 мл дистиллированной воды.
Сбор фракций. В 12 пробирок отмеряют по 1 мл биуретового реактива. К колонке приливают воду и открывают кран. Собирают по 10 капель в пробирки, содержащие биуретовый реактив. Наблюдают изменение окраски в порциях элюата, содержащего белок.
Выход хромата калия отмечают по появлению желтого окрашивания раствора в очередной пробирке.
Гель в колонке отмывают водой до полного удаления хромата калия. После этого колонка вновь готова к употреблению.
Оформление работы: описывают принцип метода, результаты опыта заносят в таблицу:
№ пробирки |
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
6 |
7 |
8 |
9 |
10 |
11 |
12 |
Белок |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
K2CrO4 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Отсутствие окраски обозначают знаком "-", появление окраски - знаком "+", несколько знаков "+" указывают на значительную интенсивность окраски. Выводы, полученные изрезультатов опыта, также заносят в протокол.
ЛАБОРАТОРНАЯ РАБОТА № 20. НУКЛЕОПРОТЕИНЫ
Опыт №1 Гидролиз нуклеопротеинов дрожжей
Для изучения химического состава нуклеопротеинов проводят кислотный гидролиз дрожжей, поскольку они очень богаты нуклеопротеинами. Специфическими реакциями для каждого вещества открывают продукты гидролиза — полипептиды, пуриновые основания, углевод и фосфорную кислоту. Реактивы, оборудование и исследуемый материал:
1. Серная кислота, 10% раствор.
2. Едкий натр, 10% paствор.
3. Сульфат меди, 1% раствор.
4. Аммиак концентрированный.
5. Нитрат серебра, 2% раствор.
6. Молибденовый реактив.
7. Серна кислота концентрированная.
8. Тимол, 1 % раствор спиртовой
9. α-Нафтол, 0,2% спиртовой раствор.
10. Лакмус.
11. Дифениламиновый реактив, 1% раствор.
12. Круглодонная колба с воздушным холодильником.
13. Воронка с фильтром.
14. Мерный цилиндр вместимостью 50 мл.
15. Дрожжи пекарские:
Ход работы. Помещают 2,5 г пекарских дрожжей в круглодонную колбу вместимостью 100 мл с воздушным холодильником длягидролиза, добавляют 20 мл 10% раствора серной кислоты и колбу закрывают пробкой с длинной стеклянной трубкой. Гидролиз дрожжей проводят при нагревании в течение часа с момента закипания жидкости. После охлаждения гидролизат фильтруют и с фильтратом проделывают качественные реакции на составные части нуклеопротеинов.
Биуретовая реакция на полипептиды. К 5 каплям гидролизата приливают 10 капель 10% раствора едкого натра до отчетливойщелочной реакции (по лакмусу, опущенному в пробирку), затем 2 капли 1% раствора сульфата меди; появляется розовая или розово-фиолетовая окраска.
Серебряная проба на пуриновые основания. К 10 каплям гидролизата добавляют по каплям крепкий раствор аммиака — приблизительно 10 капель до щелочной реакции (по лакмусу, опущенному в пробирку), затем добавляют 10 капель 2% аммиачного раствора нитрата серебра. При отстаивании через 3—5 мин образуется светло-коричневый осадок серебряных солей пуриновых основани (содержимое пробирки перемешивать при стоянии не надо).
Качественная реакци на пентозу (Молиша).
К 10 каплям гидролизата дрожжей добавляют 3 капли 1 % спиртового раствора тимола, перемешивают и по стенке пробирки осторожно приливают 20—30 капель концентрированной серной кислоты.
При встряхивании на дне пробирки образуется продукт конденсации фурфурола с тимолом красного цвета.
При взаимодействии концентрированной серной кислоты с гексозами или пентозами происходит дегидратация их: из пентоз образуется фурфурол, а изгексоз оксиметилфурфурол, которые дают с тимолом продукт конденсации красного цвета:
Качественная реакция на углевод. К 5 каплям гидролизата дрожжей приливают 3 капли 0,2% спиртового раствора α-нафтола и 20 капель концентрированной серной кислоты; появляется розово-фиолетовое окрашивание.
Реакция на дезоксирибозу и рибозу. Дифениламин с дезоксирибозой дает синее окрашивание, а с раствором рибозы — зеленое. К 5 каплям гидролизата дрожжей добавляют 20 капель 1% раствора дифениламина и кипятят в водяной бане в течение 15 мин; при этом образуется сине-зеленое окрашивание.
Молибденовая проба на фосфорную кислоту. К 10 каплям гидролизата приливают 20 капель молибденового реактива и кипятят.
При этом жидкость окрашивается в лимонно-желтый цвет (не осадок). Пробирку сразу охлаждают в струе холодной воды. На дне пробирки появляется кристаллический лимонно-желтый осадок фосфорномолибденовокислого аммония.
Молибденовая проба на фосфорную кислоту:
H3PO4+12(NH4)2MoO4+21HNO3→(NH4)3PO4·12MoO3+21NH4NO3+12H2O
Фосфорномолибденовокислый
аммоний (желтый кристаллический осадок)
