- •Вопросы по «Ксенобиологии»
- •Особенности биотрансформации, поступления и выведения кс у разных организмов.
- •Общие представления об избирательном действии кс. Определение понятия избирательности. Роль физико-химических свойств кс в процессах избирательности.
- •Тестирование биологической активности кс. Стандартизация и подбор тест-систем. Специфические и неспецифические модели (тест-объекты).
- •Процессы метаболического превращения кс
- •8. Принципы организации системы тестирования биологической активности ксенобиотиков. Биологический эпиморфизм. Основные цели биотестирования.
- •9. Биоаккумулирование ксенобиотиков. Коэффициент накопления. Одно- и многоразовые дозы.
- •Многоячеечные системы
- •10. Характеристика факторов, влияющих на биоаккумулирование ксенобиотиков. Трофические цепи и экологические пирамиды.
- •11. Характеристика вредного влияния ксенобиотиков на экосистемы: критерии вредного влияния, последствия и формы, зависимость от времени.
- •12. Разнообразие видов биологической активности, причины ее обуславливаю-щие. Системы классификации биологического действия ксенобиотиков.
- •13.Система оценки первичной безопасности ксенобиотиков: характеристика тест-объектов и тест-реакций.
- •Примерный перечень тест-объектов и тест-реакций, используемых в системе первичной оценки безопасности ксенобиотиков
- •14. Экологический мониторинг среды. Биотесты и биоиндикаторы. Использование приемов биотестирования в системе экологического мониторинга.
- •15.Простая и облегченная диффузия ксенобиотиков через биологические мембраны, их отличительные черты.
- •Облегченная диффузия в отличие от простой, может ингибироваться некоторыми соединениями (иногда в весьма малых концентрациях), которые блокируют переносчик.
- •16.Влияние физиологических, генетических и факторов окружающей среды на биотрансформацию ксенобиотиков.
- •17.Основные пути поступления и выведения гидрофильных и гидрофобных ксенобиотиков живыми организмами.
- •18.Характеристика основных процессов поведения ксенобиотиков в экосистемах. Роль адсорбции и перемещения.
- •19.Экологическая опасность процессов разрушения ксенобиотиков в биоценозах.
- •20. Реакции метаболического окисления органическихксенобиотиков, основныетипы и ферменты.
- •21. Общая схема и основные реакции конъюгации в живых системах. Ферменты,катализирующие эти реакции.
- •Антагонизм, аддитивность и синергизм биологического действия кс. Примеры синергизма и схема антагонистических взаимодействий.
- •23.Образование хелатных комплексов. Характеристика лиганд (хелатирующих агентов). Сродство, коэффициент устойчивости.
- •24.Концепция рецепторов. Критерии отнесения молекулы к рецептору. Регуляция внутриклеточных процессов с участием вторичных мессенджеров.
- •25.Амфифильные кс, их классификация (на примере пав). Характеристика этапов их взаимодействия с биологическими мембранами, характер изменения селективности мембраны.
- •26. Роль физико-химических факторов в превращениях ксенобиотиков в окружающей среде
- •1.Фотохимические превращения.
- •2.Окислительно-восстановительные превращения.
- •3.Гидролиз.
- •4.Конъюгация ксенобиотика
- •27.Химиобиологические закономерности кс и подходы, используемые для их установления.
- •28.Понятия токсичности и опасности кс для живых систем. Яды и токсины. Приемы классификации.
- •29 Реакции метаболического восстановления и гидролиза органических ксенобиотиков, основные типы и ферменты.
- •1)Восстановление альдегидов и кетонов в спирты под действием алкогольдегидрогеназ.
- •4) Немикросомное метаболическое восстановление:
- •1)Гидролиз эфиров карбоновых кислот
- •2) Гидролиз амидов, гидразидов и нитрилов
- •3) Гидролиз фосфорорганических веществ
- •30) Активный транспорт ксенобиотиков через биологические мембраны: определение и характеристика основных механизмов.
- •31) Характеристика процессов адсорбции ксенобиотиков. Изотерма Лэнгмюра.
- •32) Экологическая и токсикологическая характеристика оксидов азота, серы и фторсодержащих углеводородов
- •33. Экологическая и токсикологическая характеристика тяжелых металлов
- •34) Экологическая и токсикологическая характеристика пестицидов, удобрений и биогенных элементов
- •Экологическая и токсикологическая характеристика органических ксенобиотиков: полихлорбифенилы, нефть и нефтепродукты, поверхностно-активные вещества.
- •Виды мембранотропных эффектов. Типы мембранотропности кс.
- •Описание процессов связывания молекул кс с активными сайтами биологических мембран в отсутствии диффузионных ограничений.
- •Модели биофазы и Хилла, их использование для описания закономерностей взаимодействия веществ с активными центрами биологических мембран.
- •Пиноцитоз и фагоцитоз кс. Основные этапы.
- •Пассивный транспорт кс. Общие закономерности, виды пассивного транспорта. Движущие силы пассивного транспорта.
- •Масштабы химического загрязнения биосферы. Основные типы и причины роста глобального химического загрязнения.
- •1) Газообразные вещества:
- •2) Тяжелые металлы
- •4) Органические соединения.
- •Связь процессов ионизации молекул кс с их биологической активностью
- •Кс, обладающие большей биологической активностью в ионизированном состоянии.
- •2)Кс, обладающие большей биологической активностью в неионизированном состоянии.
- •3) Кс, проявляющие биологическое действие в виде ионов и неионизированных молекул.
- •44. Поверхностные явления в системах воздух-вода, масло (липид) - вода. Классификация поверхностно-активных веществ. Мицеллообразование пав. Виды мицелл.
- •Развитие биологической реакции на действие эффектора. Многоканальная система передачи сигнала.
- •Экологическая и токсикологическая характеристика моно-, диоксида углерода и озона
- •Основные типы химических связей и их роль в процессах связывания эффектора с мембранактивными сайтами (рецепторами).
- •Ионизация, ее природа. Константа и степень ионизации молекул кс.
- •Периоды и этапы формирования представлений о биологической активности химических соединений.
- •Роль природы превращений и процессов перемещения кс для функционального состояния экосистем.
- •Накопление и распределение как один из механизмов избирательного действия кс. Цитологический механизм избирательного действия.
- •Биохимический механизм избирательного действия кс для различных организмов.
- •Удаление или маскировка как один из механизмов биологического действия хелатирующих агентов. Характеристика антидотов.
- •1. Аденилциклазные и ионизитодфосфатные пути передачи внутриклеточного сигнала
- •Влияние наноматериалов на среду
- •Наноматериалы и примеры их токсическогр действия
Тестирование биологической активности кс. Стандартизация и подбор тест-систем. Специфические и неспецифические модели (тест-объекты).
Практика показывает, что часто у применяемого вещества открываются новые, совсем неожиданные свойства (полезные и вредные). Поэтому в случае поиска веществ с конкретными видами биологической активности необходимо максимально полно определить у них весь спектр видов биологической активности.
Общие принципы
Необходимо эффективное массовое испытание КС на биологическую активность.
Скрининг - проверка большого массива КС на один или несколько видов БА.
Системное определение БА всего массива соединений может быть осуществление путем создания высокопроизводительной системы их классификации по видам БА. Каждый КС обладает определенными видами и степенью биологической активности.
Система тестирования КС по видам БА может включать два взаимосвязанных подхода:
уровень целевого объекта испытаний (человек, животное, растение, биогеоценоз), на который должно быть направлено действие искомого ксенобиотика, исходя из целей поиска (лекарства, ветеринарное средство, гербицид и т. д.),
совокупность тест-объектов, базирующихся на использовании более примитивной организации живой материи, чем целевой использование второго подхода оправдано в тех случаях, когда первый не обеспечивает достаточной производительности и т. д.
Использование принципа качественного подобия - эпиморфизма тест-объекта и целевого объекта в отношении определенного биологического свойства ксенобиотика.
Принцип эпиморфизма - принцип конструктора: из небольшого числа деталей построить как можно большее количество фигур.
Главные методологические трудности при использовании эпиморфных моделей заключаются в том, чтобы определить оптимальный уровень детализации модели по отношению к моделирующему процессу, т. е. целостному организму. Этого можно достичь исходя из того, что в системе тест-объектов на клеточном уровне организации представляются все царства живого и основные типы тканей организма человека, а также из того, что у тест-объектов в совокупности определяются все основные реакции (гибель, повреждение, адаптация, проницаемость, метаболизм ксенобиотиков, синтез белка и ДНК, возбудимость и т. д.).
Говоря о БА КС, то для ее определения необходимы тест-объекты, на которых регистрируются определенные виды биологической реакции (гибель, измене- нис роста, изменение различных метаболических реакций и т. д.) при их действии; эти реакции часто называются тест-реакциями. В этой связи следует рассмотреть принципы отбора и стандартизации тест-объектов при классификации КС по видам БА.
Совокупность набора тест-объектов клеточно-тканевого уровня должна удовлетворять главному принципу системы - представительности выбранных биологических тест-объектов (БТО) по отношению к моделям биосферы и организму человека с соответствующим набором характеристик (тест-реакций), т, е. максимально удовлетворять поставленным задачам.
Предлагается подбирать тест-объекты по КРИТЕРИЯМ:
по молек-м рецепторам, являющимся мишенями для в-в с данными видами активности;
по принципу надмолек организации и молекулярному составу (близость по структуре);
по функциональному сходству;
по органному или тканевому происхождению;
по близости патологического состояния тест-объекта и реального объекта.
Первый критерий - самый сильный и надежный. На нём основан выбор ганглиев прудовика как модели нейронов головного мозга в отношении медиаторных и антимедиаторных видов БА. Высокая гомология или даже тождество рецепторов для медиаторов у моллюсков и позвоночных служит основанием для надежности прогноза этих активностей на целевой тест-объект.
Второй (близость по структуре) и третий (близость по функции) критерии используются при выборе моделей для оценки влияния на подвижность (сперматозоиды, тетрахимена), на дыхание и гликолиз (печень, эритроциты, клетки опухолей), на фотосинтез (водоросль Nitella), на химический гомеостаз (печень - монооксигеназная система).
При всех трех критериях остается неопределенность прогноза, обусловленная необходимостью переносить результаты ответов in vitro на систему in vivo, а именно тем, что in vitro не учитывается доступность объекта-мишени, метаболизма ксенобиотика и строения реального объекта. Гибель клетки - это не значит гибель организма. большая степень неопределенности существует для тех видов активности, которым характерны системные эффекты на уровне ткани, органа или организма, т. е. в тех случаях важные, определяющие особенности действия химических соединений зависят не от взаимодействия с какой-либо мишенью, а от взаимодействия с многими мишенями или всей реакцией системы на связывание с мишенью. Такие проблемы характерны для адаптогенов, витаминов, наркотиков.
В этом случае подбор биологических тест-объектов 4) по критерию органного происхождения дает значительную гарантию прогноза. Но надежнее строить прогноз по данным испытаний на всех объектах. И следует учитывать последний признак - близость патологического состояния тест-объекта и реального объекта.
Классификация КС по видам БА по-новому ставит вопрос о подборе и стандартизации тест-объектов. Система должна обеспечить возможность сопоставления результатов испытаний на БА разных соединений, проведенных в разные годы. Именно степень воспроизводимости, стандартность набора тест-объектов непосредственно определяют надежность принимаемых решений и степень автоматизации системы (возможно, в большей степени, чем ЭВМ).
И если с молекулярными тест-объектами это сделать проще, то объекты клеточно-тканевого уровня организации - «живые». Как все живое, они непрерывно развиваются, подвергаются сильному влиянию эндогенных и экзогенных факторов, физиологическое состояние тест- объектов подвержено сезонным колебаниям и т. д.
Каждый тест-объект индивидуален, что приводит к целому ряду затруднений при регистрации его характеристик, интерпретации данных, выявлении их соответствия поставленным целям и т. д.
Методич подходы для стандартизации, подбора, приготовления тест-объектов, напр:
- стандартизация условий содержания животных;
- использование контрольных карт (отбраковка животных, для которых отклонения согласно карте превышают определенную величину);
- выбор наиболее щадящих условий выделения и инкубации;
- использование дополнительных воздействий, переводящих тест-объект в заданное состояние; нормирование регистрируемых параметров (приведение к норме);
- выбор тест-реакций, минимальным образом зависящих от индивид-ти тест-объектов и т. д.
В конечном итоге для каждого тест-объекта клеточно-тканевой природы можно создать формализованный стандарт в виде набора количественных параметров, характеризующих стационарные и кинетические показатели тест-объектов.
Моделируемые объекты (клетки, организм, биосфера) предстают в системе в виде представительных наборов тест-объектов, обладающих основными элементарными функциями, присущими целевым объектам. В принципе, модели клетки и организма могут быть нормальными и патологическими.
Выборки тест-объектов и их расположение в системе должны отражать реальную иерархию элементов природного объекта, иерархию, обусловленную его развитием. Поэтому для организма детализацию видов БА следует строить по тканевой тропности действия, опираясь на чисто генетическую классификацию типов тканей, отражающую ход онтогенеза. Представление биосферы в системе классификации должно основываться на таксономической классификации организмов, отражающей процесс эволюции.
Вся совокупность операций по классификации КС выглядит:
классификация химических соединений по видам БА на основании химических, физических и физикохимических свойств испытуемых чужеродных соединений при отсутствии биологического тест-объекта: расчетных операций над структурой соединения; экспериментального определения физико-химических свойств химических соединений;
классификация по результатам взаимодействия чужеродных соединений с моделями клетки, организма, биосферы, включающая последовательные иерархические уровни организации биологической материи.
различать СПЕЦИФИЧЕСКИЕ И НЕСПЕЦИФИЧЕСКИЕ МОДЕЛИ ТЕСТ-ОБЪЕКТОВ. Первые - имеют четко выраженные молекулярные мишени-рецепторы (вспомним первый критерий), реагирующие на определенные химические соединения, т. е. на определенные виды биологической активности.
Однако неспецифическая модель является обязательным компонентом для классификации КС. С одной стороны, оказывается возможным различать химические соединения, обладающие разными видами активности на полностью неспецифической для этих видов активности модели. Так, разработана аппаратура и методика для регистрации 16 параметров реакции эритроцитов на воздействия химических соединений. При испытаниях таких разных по активности и химической природе веществ, как силитраны, тетрациклины, пенициллины, кортикостероиды.
В этом случае один и тот же тест-объект используется в качестве эпиморфной модели и как элемент классифицирующей системы, работающей в режиме логического конструктора.
основным вариантом является случай, когда предсказание биологической активности осуществляется через построение логической функции, элементами которой становятся реакции отдельных биодатчиков. Эти датчики являются одновременно ЭПИМОРФНЫМИ МОДЕЛЯМИ, позволяющими улавливать многие виды БА на основе как эпиморфных соответствий, так и логических функций, полученных при обратном скрининге. С другой стороны, использование неспецифической модели позволяет охарактеризовать дополнительный вид биологической активности химических соединений. Например, при многих заболеваниях значительная часть неспецифических общепатологических симптомов связана с появлением так называемых средних молекул (СМ) - вторичных эндогенных токсинов пептидной природы. Для вскрытия одного из путей патологического действия СМ была выбрана модель - клетка Nitella, на которой было показано прямое неспецифическое мембранотропное действие СМ, обусловленное их поверхностной активностью.
на этой модели можно предсказание широкий спектра БА с классификацией веществ по их механизму действия (например, на ионную проницаемость, ионные токи, функционирование отдельных транспортных систем и т. д.).
Вещества, представляющие по своим свойствам научный и практический интерес, проходят тестирование на безопасность. Объекты испытаний по-прежнему модельные, но оценке подлежат и такие виды опасного действия, как мутагенность, канцерогенность, эмбриотоксичность и др.
Реакции биотрансформации неорганических КС.
Реакции восстановления атомов с переменной валентностью. Трансформация арсенатов As5+ в арсениты As3+, селенатов Se6+ в селениты Se4+, хлоратов CI+6 в хлориты С1+4. При трансформациях этого типа токсичность вещества нередко возрастает. атомов с переменной валентностью.
Реакции метилирования. Мо могут использовать реакции метилирования для превращения металлов в металлорганические соединения. Особое значение имеет способность некоторых мо превращать ионы ртути в метил- и диметилртуть:
Hg2+ + донор метильной группы —> СН3 - Hg+,
СН3 - Hg+ + донор метильной группы -> СН3 - Hg+ - СН3
Организмы, способные осуществлять эти реакции, в своих обычных метаболических процессах используют трансметилирование, образуя такие соединения, как метан; в этих системах могут реагировать также и металлы.
В этой связи повышается опасность отравления живых организмов, В отличие от металлической ртути метилртуть почти полностью поглощается организмом и лишь незначительная часть выводится из него. Метилртуть распределяется во всех тканях, тогда как неорганическая ртуть накапливается главным образом в печени и почках. Кофактором, принимающим участие в переносе метальной группы к иону ртути, является метилкорриноид - вещество, содержащее витамин В12.
Неорганическое соединение мышьяка трансформируется с образованием тримсталированного производного.
Scopulariopsis brevicaulis CH3 As203 ►CH3-As-CH3.
протекания процесса метилирования попытка оценить способность других металлов участвовать в этой реакции Считают, что олово, палладий, золото, серебро и таллий могут метилироваться, тогда как свинец, кадмий и цинк не способны вступать в эту реакцию. вывод обусловлен тем, что алкины свинца, кадмия и цинка в водных растворах неустойчивы, и витамин B12 не переносит метальные группы к этим элементам. способность металлов участвовать в метаболических процессах и превращаться в металл органические соединения должна учитываться в оценке их потенциальной значимости для окружающей среды.
Реакции конъюгации. Неорганический цианид обезвреживается в живых организмах конъюгацией с серой,-образуется тиоцианит:
SS032" + CN -> SO32" + SCN
Процесс катализирует роданаза. Фермент находится в митохондриях печени различных видов животных и растений. Донорами серы служат тиосульфаты, тиосульфонаты, полисульфиды.
Белки с низкой молекулярной массой и высоким содержанием цистеина (металлотионины) связывают ионы тяжелых металлов. Наиболее изучено связывание ими кадмия, хотя они могут связывать и др. металлы.
Путь биотрансформации сернистого газа (SO2). Изучен в растениях. Первая стадия - окисление в сульфиты (SO3 2-) и сульфаты (SO 42-) происходит в клеточной стенке при участии пероксидазы, затем происходит включение в фотосинтетический метаболизм серы.
Аденозинфосфосульфат (AФS) - первый продукт в реакции взаимодействия SO4 2- с АТФ. Активированный сульфат связывается с серосодержащим переносчиком белковой природы и образуется комплекс C-SO3, который восстанавливается до сульфида (CS-SH) при участии света через ферродоксин.При переносе на о-ацетилсерин (AS) образуется цистеин и метионин. В случае высокого содержания сульфаты аккумулируются в виде глутатиона.
Если восстан-щая сила превышает имеющиеся в наличии источники углерода, сера, соединяясь с водородом, образует дисульфид (H2S), который теряется в результате газового обмена.
Эффективность реакций детоксикации ограничена. При продолжительном поглощении SO2 и увеличении кислотности буферная способность цитоплазмы становится недостаточной, уровень сульфитов в хлоропластах увеличивается, и S02 занимает места связывания С02 на рибулозодифосфаткарбоксилазе. В результате этого происходит ингибирование вторичных процессов фотосинтеза и разрушение третичной структуры ферментов.
Общие представления о стадиях биотрансформации КС. Ферментные системы, основные закономерности действия ферментов. Индукция защитных свойств организма.
Все биохимические реакции в живых системах носят ферментативный характер. А это значит, что клетка обходится без высоких t и давлений именно благодаря деятельности ферментов-катализаторов, способных ускорять реакции в миллионы раз в самых обычных условиях.
Все ферменты имеют белковую макромолекулярную природу и упрощенно могут быть представлены в виде сферических или палочковидных образований, на поверхности которых располагаются активные и регуляторные центры. Как сам фермент, так и его центры состоят из упорядоченно расположенных, создающих определенный пространственный узор полимерных нитей, построенных из аминокислот. Эти ам-ты последовательно сшиты между собой ковалентными (пептидными) связями.
Для каждого фермента характерен свой геометрический узор активного и регуляторного центров, что определяет его высокую специфичность к превращаемым веществам-субстратам.
Реакция начинается после того, как образуется фермент-субстратный комплекс, т. е. как только ключ субстрата войдет в замочную скважину активного (сорбционного) центра фермента, для чего необходимо строгое геометрическое соответствие их форм (пространственных и зарядовых геометрий). Специфичность такого взаимодействия столь велика, что стереоизомеры одного и того же вещества, например d- и I-ам-ты с одинаковыми структурными формулами, подвластны действию своих специальных ферментов: оксидаза d-аминокислот не окисляет l-изомер и наоборот. Высокая специфичность ферментов - одно из главных условий для наведения должного порядка в химических превращениях.
Как же ферменту удается резко ускорить течение реакции? Для процесса взаимодействия двух веществ А и В с образованием продукта С необходимо, чтобы к моменту столкновения А и В они обладали таким запасом энергии, которого было бы достаточно для критической деформации электронных облаков молекулы, т. е. для разрыва и новообразования прочных химических связей, превращающих субстраты А и В в новый продукт С. Этот энергетический барьер - энергия активации - главный ограничитель скорости химического процесса. Действие фермента сводится к снижению высоты барьера. С этой целью фермент вступает в прямой контакт (комплекс) с молекулами субстрата, снижая энергетический барьер несколькими способами. Во-первых, на упругом полимерном каркасе фермента может растянуться и ослабиться «неугодная» химическая связь между атомами субстрата. Во-вторых, субстрат на ферменте может приобрести способность принимать множество конфигураций, из которых хотя бы одна облегчит переход к новому веществу. В-третьих, не исключена возможность сближения и принятия нужной ориентации реагирующих молекул субстрата. Все эти события разыгрываются на активных центрах, хотя и остальная часть белковой глобулы служит резервуаром энергии для борьбы с энергетическим барьером.
Ферменты способны неутомимо и без износа повторять реакцию миллиарды раз, перерабатывая все новые и новые молекулы субстрата.
Есть еще и регуляторные центры. В них не происходят каталитические превращения. В зависимости от избытка или недостатка продуктов ферментативной реакции эти центры замедляют или ускоряют ход процесса. В самом простом случае при избытке продукт присоединяется к центрам и предотвращает наработку новых. Когда продукта мало, регуляторные центры освобождаются и перестают тормозить работу активных центров.
Для обозначения фермента к названию катализируемой реакции прибавляется суффикс «аза». Например, дегидрогеназа - это фермент, катализирующий удаление из молекулы атомов водорода; метил- трансфераза - трансформирует метальную группу и т. д.
Особую группу КС представляют самораспадающиеся соединения (основное место здесь занимают лекарственные препараты), спонтанно разрушающиеся в организме с образованием продуктов, не обладающих биологической активностью в данных концентрациях. Распад таких соединений не зависит от наличия ферментов, что важно в случаях, когда наблюдаются нарушения функций отдельных органов (печени или почек), т. е. в случаях, когда в организме отмечается нехватка ферментов метаболизма.
