- •Правила работы с оборудованием: Центрифуги
- •1. Общая характеристика органических соединений.
- •1.1 Основные понятия и классификация органических соединений
- •1.3 Химическая связь в органических соединениях
- •Валентные состояния атома углерода
- •Концепция электронных смещений
- •Получение цис - и транс - бутен-2-овой кислот
- •2. Химические свойства органических соединений
- •2.1 Кислотные и основные свойства органических соединений
- •Зависимость кислотности от гетероатома.
- •Влияние углеводородного радикала и присутствующих в нем заместителей
- •Влияние растворителя.
- •Основные свойства органических соединений. Π-основания и n-основания.
- •Теория Льюиса.
- •2.2 Радикальные и электрофильные реакции углеводородов и их производные
- •Механизм радикального замещения в общем виде
- •2.3 Нуклеофильные реакции
- •Определение степени окисления атомов в органических веществах
- •Окисление и восстановление органических веществ
- •3. Биологически важные органические соединения
- •3.1 Полифункциональные соединения в процессах жизенедеятельности
- •3.1.1 Общая характеристика.
- •3.1.2. Реакционная способность и специфические реакции многоатомных спиртов и фенолов
- •3.1.3 Реакционная способность и специфические реакции дикарбоновых кислот
- •3.1.5. Функциональные производные угольной кислоты
- •3.2.1 Общая характеристика
- •3.3. Реакционная способность и специфические свойства биологически важных гетерофункциональных соединений
- •3.3.1. Аминоспирты
- •3.3.2. Гидроксикарбонильные соединения
- •3.3.3. Гидрокси- и аминокислоты
- •3.3.4. Оксокислоты
- •3.4. Гетерофункциональные производные бензола как лекарственные средства
- •3.4 Важнейшие гетероциклические биоорганические соединения.
- •3.4.1. Общая характеристика
- •3.4.2. Номенклатура
- •3.4.3. Реакционная способность ароматических гетероциклов
- •3.4.4. Кислотно-основные и нуклеофильные свойства
- •3.4.5 Особенности реакций электрофильного замещения
- •3.4.6. Пятичленные гетероциклы
- •3.4.7 Шестичленные гетероциклы
- •3.4.8. Гетероциклы с двумя гетероатомами
- •3.4.9 Конденсированные гетероциклы
- •4. Биополимеры и их структурные компоненты
- •4.1 Углеводы. Поли-, олиго- и моносахариды.
- •4.1.1. Моносахариды
- •Цикло-оксо-таутомерия
- •Конформации
- •Неклассические моносахариды
- •Химические свойства
- •4.1.2. Олигосахариды
- •4.1.3 Полисахариды
- •4.1.3. Гетерополисахариды
- •4.2 Простые и сложные липиды.
- •4.2.1 Структурные компоненты липидов
- •10.3. Простые липиды
- •10.3.1. Воски
- •10.3.2. Жиры и масла
- •10.3.3. Церамиды
- •10.4. Сложные липиды
- •10.4.1. Фосфолипиды
- •10.4.2. Сфинголипиды
- •10.4.3. Гликолипиды
- •10.5. Свойства липидов
- •10.5.1. Гидролиз
- •10.5.2. Реакции присоединения
- •10.5.3. Реакции окисления
- •Глава 12. Α-аминокислоты, пептиды и белки
- •12.1.1. Классификация
- •12.1.2. Стереоизомерия
- •12.1.3. Кислотно-основные свойства
- •12.1.5. Биологически важные химические реакции
- •12.2. Первичная структура пептидов и белков
- •12.2.1. Строение пептидной группы
- •12.2.2. Состав и аминокислотная последовательность
- •12.2.3. Строение и номенклатура пептидов
- •12.3. Вторичная структура полипептидов и белков
- •Глава 14. Нуклеиновые кислоты. Нуклеотидные коферменты
- •14.1. Нуклеотиды
- •14.1.1. Нуклеозиды
- •14.1.2. Нуклеотиды
- •14.2. Структура нуклеиновых кислот
- •14.2.1. Первичная структура
- •14.2.2. Вторичная структура днк
- •14.3. Нуклеотидные коферменты
- •14.3.1. Нуклеозидполифосфаты
- •14.3.2. Никотинамиднуклеотиды
- •Ферментативный гидролиз крахмала
- •Обнаружение крахмала в продуктах питания
- •Практическое задание
- •Выделение нуклеопротеинов из дрожжей
- •Гидролиз нуклеопротеинов При выполнении данной работы следует соблюдать особую осторожность!
- •Часть 1. Выделение клеточных ядер методом дифференциального центрифугирования
- •Часть2. Экстракция фпФазы из клеточных ядер
- •5. Физико-химические методы анализа в биоорганической химии
- •5.1 Хроматографические методы анализа
- •5.2 Спектральные методы анализа
- •5.3 Электрохимические методы анализа
3.4.3. Реакционная способность ароматических гетероциклов
Пиридин по электронному строению напоминает бензол. Все атомы углерода и атом азота находятся в состоянии sp2-гибридизации, и все σ-связи (C-C, C-N и C-H) лежат в одной плоскости (рис. 3.1, а). Из трех гибридных орбиталей атома азота две участвуют в образовании
Рисунок 3.1 - Пиридиновый атом азота (а), распределение электронов по орбиталям (б) и сопряженная система в молекуле пиридина (в) (связи С-Н для упрощения рисунка опущены)
σ-связей с атомами углерода (показаны только оси этих орбиталей), а третья орбиталь содержит неподеленную пару электронов и в образовании связи не участвует. Атом азота с такой электронной конфигурацией называют пиридиновым.
За счет электрона, находящегося на негибридизованной р-орбитали (см. рис. 3.1, б), атом азота участвует в образовании единого электронного облака sр-электронами пяти атомов углерода (см. рис. 3.1, в). Таким образом, пиридин является π,π-сопряженной системой и удовлетворяет критериям ароматичности.
В результате большей электроотрицательности по сравнению с атомом углерода пиридиновый атом азота понижает электронную плотность на атомах углерода ароматического кольца, поэтому системы с пиридиновым атомом азота называют π-недостаточными. Кроме пиридина, примером таких систем служит пиримидин, содержащий два пиридиновых атома азота.
Пиррол также относится к ароматическим соединениям. Атомы углерода и азота в нем, как и в пиридине, находятся в состоянии sp2-гибридизации. Однако в отличие от пиридина атом азота в пирроле имеет иную электронную конфигурацию (рис. 3.2, а, б).
Рисунок 3.2. - Пиррольный атом азота (а), распределение электронов по орбиталям (б) и сопряженная система в молекуле пиррола (в) (связи С-Н для упрощения рисунка опущены)
На негибридизованной р-орбитали атома азота находится неподеленная пара электронов. Она участвует в сопряжении с р-электронами четырех атомов углерода с образованием единого шестиэлектронного облака (см. рис. 3.2, в). Три sp2-гибридные орбитали образуют три σ-связи - две с атомами углерода, одну с атомом водорода. Атом азота в таком электронном состоянии получил название пиррольного.
Шестиэлектронное облако в пирроле благодаря р,п-сопряжению делокализовано на пяти атомах цикла, поэтому пиррол представляет собой π-избыточную систему.
В фуране и тиофене ароматический секстет также включает неподеленную пару электронов негибридизованной p-АО кислорода или серы соответственно. В имидазоле и пиразоле два атома азота вносят разный вклад в образование делокализованного электронного облака: пиррольный атом азота поставляет пару и-электронов, а пиридиновый - один p-электрон.
Ароматичностью обладает также пурин, представляющий собой конденсированную систему двух гетероциклов - пиримидина и имидазола.
Делокализованное электронное облако в пурине включает 8 π-электронов двойных связей и неподеленную пару электронов атома N-9. Общее число электронов в сопряжении, равное десяти, соответствует формуле Хюккеля (4n + 2, гдеп = 2).
Гетероциклические ароматические соединения обладают высокой термодинамической устойчивостью. Неудивительно, что именно они служат структурными единицами важнейших биополимеров - нуклеиновых кислот.
