Prokaryotic viruses classificaion
http://www.ictvonline.org
Fuseloviridae
Globuloviridae
Rudiviridae Bicaudoviridae
Ampullaviridae
Caudovirales
Порядок |
Caudovirales (tailed |
|
phages) |
||
|
Семейства |
Myoviridae |
Podoviridae |
Siphoviridae |
|
одсемейства-Eucampyvirinae (Cp8)-Autographivirinae (T7)-Arquatrovirinae (R4) |
|
-Peduovirinae (P2) -Picovirinae (Phi29) |
-Bclasvirinae |
-Spounavirinae (SPO1)-Sepvirinae |
-Guernseyvirinae |
-Tevenvirinae (T4) |
-Mclasvirinae |
-Vequintavirinae (V5) |
-Pclasvirinae |
-Ounavirinae (FelixO1) |
-Tunavirinae (T1) |
Роды |
Устанавливаются в пределах подсемейств или семейств (в |
|
|
|
дальнейшем предполагается ввести соответствующие |
|
подсемейства). |
T5likevirus 
T5virus
Schizot4likevirus Schizot4virus
дние нововведения подкомитета по вирусам бактерий и www.ictv.global/subcommittee.asp?se=5&committee=56)
Исключить1) использование суффикса “-like” в наименовании родов «It is important to realize that “viruses are real
physical entities produced by biological evolution and genetics, whereas virus species and higher taxa are abstract concepts produced by rational thought and logic.” (ICTV)»
P22-like virus |
|
P22likevirus |
|
P22virus |
|
|
|
||||
NB! В некоторых родах название типового вида транскрибируется, |
|||||
например PAK_P1 |
|
Pakpunavirus |
|||
2) |
Исключить использование префикса Phi в |
||||
|
наименовании таксонов, кроме исторически |
||||
|
устоявшихся случаев, как, например, Phi29virus, PhiKZ |
||||
|
etc. ICTV рекомендует исключить использование любых |
||||
|
греческих букв для наименования новых вирусов. |
||||
|
Неофициально некоторые члены комитета призывали |
||||
3) |
использовать более длинные названия вместо |
||||
буквенно-цифровых индексов, как, например, “Nazgul”, |
|||||
Исключить использование дефиса кроме разделений цифровых индексов “Corndog”, “Firecracker” вместо PS21a и т.п.
так фаг L-413 будет L413, но Р23-45 остается допустимым
4)Заменить слово “phage” в названии таксонов на “virus”. Подкомитет считает, что не существует фундаментального различия фагов от других вирусов, поэтому слово “вирус” более правильно.
Pseudomonas phage phiKMV |
Pseudomonas virus phiKMV |
Включить5) родовое название хозяина, использованного при выделении в нование вида. Видовой эпитет не упоминать.
Enterobacteria phage T7 |
|
Escherichia virus T7 |
|
6)Комитет рекомендует использовать алгоритм blastN и основанные на нем другие программы для определения уровня сходства ДНК-ДНК фагов для целей классификации. По текущим правилам граница различения видов – сходство менее 95% нуклеотидов. Для выделения более высоких таксонов требуется использование дополнительных критериев, таких как сходство белков и пр.