1.2.1.1 Критерии подразделения на виды внутри рода.

Серологически различающиеся серотипы (синоним типов, обозначаемых арабскими цифрами) были сгруппированы в виды. Название вида соответствует виду хозяина, дополнение буквой используется, если у данного вида хозяина обнаруживаются несколько видов вирусов. Распознавание вида зависит минимум, от двух важных характеристик: расчет филогенетической дистанции (основана, в первую очередь, на сравнительном дистанционном матриксном анализе аминокислотных сиквенсов протеазы, pVIII, гексонов и ДНК полимеразы);

· ДНК-гибридизация;

· рестрикционный анализ;

· процент G + C в геноме, онкогенность для грызунов;

· ростовые характеристики, спектр хозяев подверженных инфекции, перекрестная нейтрализация;

· рекомбинативные способности;

· количество генов VA РНК;

· гемагглютинация;

· генетическая организация региона ЕЗ.

Отсутствие перекрестной нейтрализации в сочетании с филогенетической

дистанцией, превышающей 10 %, дают основание для разделения двух серотипов в разные виды. Если филогенетическая дистанция меньше 5 %, то все другие упомянутые выше критерии могут быть использованы для классифицирования данного серотипа как отдельного серотипа внутри рода, если даже он был выделен от другого вида хозяина. В настоящее время официально зарегистировано 19 основных и 5 предполагаемых видов.

1.2.2 Род: Aviadenovirus

Типовой вид: Fowl adenovirus A (FadV-A) (аденовирус кур-А).

Авиаденовирусы отличаются по серологии от мастаденовирусов. Отличия заключаются в организации генома: отсутствие генов, кодирующих протеины V и IX, сходных участкам ранних генов Е1 и Е2, также смещение гена Е4.

1.2.2.1 Критерии подразделения на виды внутри рода.

Типы аденовирусов птиц могут быть классифицированы по шести отдельным видам, с точки зрения серологии. Названия видов соответствуют виду хозяина, а буквенное дополнение применяется, при обнаружении несколько видов вирусов для данного вида хозяйна. Распознавание вида так же как и в распознавании вида ,рода Mastadenovirus являются 2 характеристики: расчет филогенетической дистанции и рестрикционный анализ;

· рестрикционный анализ;

· спектр восприимчивых хозяев;

· патогенность;

· перекрестная нейтрализация;

·способность к рекомбинации.

Например, серотипы аденовирусов кур могут быть сгруппированы в пять видов на основе рестрикционного анализа и результатам перекрестной нейтрализации. А в настоящее время официально найдено 6 основных и 3 предполагаемых вида.

1.3 Неклассифицированные вирусы семейства

Филогенетическое родство внутри семейства. Анализ семейсва на основе матриксной дистанции или parsimony analysis белков или ДНК подходящих генов подтверждают, что среди аденовирусов существуют не менее трех отдельных генетических групп: мастаденовирусы, авиаденовирусы и, предположительно, атаденовирусы. Эволюционные дистанции между вирусами соответствуют различиям по виду хозяина. Однако есть исключения, когда один вид является хозяином вирусов, не имеющих близкого родства. Например, типы аденовирусов,выделенные от КРС были отнесены в разные подгруппы кластера вирусов (BadV-10 по сравнению с BAdV-1 или BAdV-З) или в совершенно отдельные кластеры (BAdV-4, б и 7).

Сходство с другими таксонами. Фиберы HAdV-2 и HAdV-5 взаимодействуют для прикрепления с тем же клеточным рецептором (CAR), что и вирусы коксаки В. Аденовирусы могут встречаться вместе с зависимыми парвовирусами, для которых они могут обеспечивать функции помощника.