- •Дипломная работа распространение и молекулярная диагностика полиморфизма c1/c2 в гене cyp2e1
- •Задание на дипломную работу
- •Реферат
- •Содержание
- •1 Обзор литературы 7
- •Обозначения и сокращения
- •Введение
- •1 Обзор литературы
- •1.1 Система детоксикации цитохрома р450 и его представители
- •1.2 Ген cyp2e1, строение и локализация
- •1.2.1 Полиморфные варианты и мутации гена cyp2e1
- •1.3 Популяционно-генетические исследования полиморфизмов в гене cyp2e
- •1.4 Прикладное значение исследований полиморфизмов гена cyp2e1
- •1.5 Гены и их белковые продукты участвующие в развитии алкоголизма
- •2.2.2 Проведение полимеразной цепной реакции (пцр)
- •2.2.3.1 Приготовление агарозного геля
- •2.3 Статистическая обработка результатов анализа
- •3 Результаты и их обсуждение
- •Заключение
- •Список использованных источников
- •Приложение а (обязательное)
Заключение
В ходе выполнения работы нами были изучены:
1 Структура гена CYP2E1, его строение, локализация в хромосоме. Было показано, что данный ген находится в хромосоме 10, в локусе10q24.3–qter имеет молекулярную массу 56 кД. Наличие полиморфизмов в гене CYP2E1, связанно с высоким риском развития алкогольной болезни печени, гипертонической болезни у людей злоупотребляющих алкоголем.
Вариант T полиморфизма RsaI (RsaI c2) характеризуется повышенной транскрипционной активностью и был ассоциирован с алкогольной болезнью печени в то время как вариант С полиморфизма PstI (PstI+) соответсвует повышенному риску развития онкологических заболеваний. Вариант C полиморфизма DraI также является онкологическим маркером.
2 Проведен анализ данных по частоте встречаемости полиморфизмов гена CYP2E1 в различных популяциях. В исследуемой нами группе людей было выявлено для полиморфизма с1/с2 в гене CYP2E1, согласно полученным данным, частота нормального гомозиготного генотипа 27% (4 из 15 образцов). Встречаемость гетерозиготного генотипа наблюдалось у 53% (8 из 15 образцов). Встречаемость патологического генотипа составляет 20% (3 из 15 образцов)
Список использованных источников
Парк Д.Б. Биохимия чужеродных соединений / Парк Д.Б - М.:Медицина, 1973. - 288 с.
Арчаков А.И. Микросомальное окисление / Арчаков А.И. – М.: Наука, 1975. - 327 с.
Колесниченко Л.С. Успехи современной биологии / Колесниченко Л.С. Кулинский В.И. - 1989. Т. 107, вып. 2. - С. 179-194.
Саприн А.Н. Успехи биол. Химии / Саприн А.Н. – 1991,Т. 32.- С. 146-175.
Pacifici G.V. Advances in Drug Metabolism in Man / G.V. Pacifici, G.N. Fracchia. Brussels; Luxembourg: Europ. Comis., 1995. 834 p.
Кулинский В.И. Успехи биол. Химии / Кулинский В.И., Колесниченко Л.С. - 1990. - Т. 31. - С. 157-179.
Кулинский В.И. Успехи современной биологии / Кулинский В.И., Колесниченко Л.С.- 1990. -Т. 51, вып. 1(4).- С. 20-33.
Обезвреживание ксенобиотиков (КУЛИНСКИЙ В.И. , 1999), БИОЛОГИЯ [Электронный ресурс] – режим доступа: http://www.pereplet.ru/obrazovanie/stsoros/697.html
Баранов В.С. Геном человека и гены «предрасположенности» (введение в предиктивную медицину) / Баранов В.С., Баранова Е.В., Иващенко Т.Э., Асеев М.В.– СПб.: Интермедика, 2000. - 272 с.
Владимиров Ю.А Свободные радикалы в живых системах. Итоги науки и техники. / Владимиров Ю.А., Азисова О.А., Деев А.И., Козлов АК.В., Осипов А.Н.. Рощупкин Д.И. –Серия биофизика. - М., 1991. - 251 с.
Кулинский В.И. Обезвреживание ксенобиотиков//Соровский Образовательный журнал.- 1999.- №1. - С. 8-12.
Bartsch H, Nair U, Risch A et al. Genetic polymorphism of CYP genes, alone or in combination, as a risk modifier of tobacco-related cancers Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. – 2000. – Vol.9, № 1. - P. 3-28.
Hayashi S., Watanabe J., Kawajiri K. Genetic polymorphism in 5, - flanking region change transcriptional regulation of the human cytochrome P 450 Gene / S.Hayashi, J.Watanabe, K.Kawajiri // J. Biochem. – 1991. – Vol. 110. – P. 559-565.
Huang C.Y. The GSTT1 and CYP2E1 genotypes are possible factiors causing vinyl chloride induced abnormal liver function / C.Y.Huang, K.L. Huang, T.J Cheng et al. // Arch. Tojcjl. – 1997. – Vol.71 –P. 482-488.
Медицинские Диссертации http://medical-diss.com/medicina/gigienicheskoe-znachenie-geneticheskogo-polimorfizma-sistem-biotransformatsii-vysokotoksichnyh-veschestv-u- heloveka#ixzz3c1Db7hSX
Пузырев В. П. Генетика мультифакториальных заболеваний: между прошлым и будущим / В. П. Пузырев // Мед. генетика. – 2003. – Т. 2, № 12. – С. 498–508.
Баранов В. С. Геном человека и гены «предрасположенности»: Введение в предективную медицину / В. С. Баранов, В. Е. Баранова, Т. Э. Иващенко, М. В. Асеев. – СПб.: Интермедика, 2000. – С. 115–118.
Колчанов Н. А. Регуляция транскрипции генов эукариот: базы данных и компьютерный анализ / Н. А. Колчанов // Mol. Biol. – 1997. – T. 31. – C. 581–583.
Kolpakov F. A. GeneNet: a database for gene networks and its automated visualization / N. A. Kolchanov, E. A. Ananko, G. B. Kolesov // Bioinformatics. – 1998. – V. 14. – P. 529–537.
Dielis A. W The prothrombotic paradox of hypertension: role of the renin-angiotensin and kallikrein-kinin systems. / A. W Dielis M. Smid, H. M. Spronk, K. Hamulyak, A. A. Kroon ten H. Cate de P. W. Leeuw // Hypertension. – 2005. – 46: 6: 1236–42.
Интернет ресурс: http:// w.w.w.ncbi.hlm.nih.gov
База данных GenBank [Электронный ресурс] – Режим доступа: http: //www.ncbi.nlm/nih/gov//. – Загл. с экрана.
Интернет ресурс: http://cardiology.eurodoctor.ru/atherosclerosis/
Интернет ресурс: http://medportal.ru/enc/cardiology/infarction/
Интернет ресурс: http:// w.w.w.ncbi.hlm.nih.gov
Esmon Ch. T. Crosstalk between inflammation and thrombosis / Ch. T. Esmon // Maturatis. – 2004. – Vol. 47. – P. 305–314.
Ратнер В. Л. Молекулярная генетика: принципы и механизмы / В. Л. Ратнер. – Новосибирск: Наука, 1983. – 256 с.
База данных Вionet.nsc.ru [Электронный ресурс] – Режим доступа: http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/gnw/genenet //. – Загл. с экрана.
База данных GenBank [Электронный ресурс] – Режим доступа: http://www.genepassport.ru/description.cgi?gid=28//. – Загл. с экрана.
Nobuyo, MaedaS. Targeted Disruption of the Apolipoprotein (2-111 Gene in Mice Results in Hypotriglyceridemia and Protection fro Postprandial Hypertriglyceridemia / Nobuyo MaedaS, Hao Li, Denise Lee, Paula Oliver, Steven H. Quarfordtg, and Jesus Osadan // THE JOURNAL OF BIOLCICAL CHEMIST. – 2009. – P. 121–122.
Заяц Р. Г. Основы общей и медицинской генетики / Р. Г. Заяц, И. В. Рачковская. – М.: Высш. школа, 2003. – 239 с.
Patrushev L. I. New DNA diagnostic system for detection of factor V Leiden / L. I. Patrushev, E. S. Zykova, A. L. Kayushin, M. D. Korosteleva, I. N. Bokarew, S. G. Leont’en, V. M. Koshkin, E. S. Severin // Thrombosis. Res. – 1998. – Vol. 92. – P. 251–259.
Kyrle P. A. Clinical studies and thrombin generation in patients homozygous or heterozygous for the G20210A mutation in the prothrombin gene / P. A. Kyrle, C. Mannhatter, S. Beguin, A. Stumpflen, M. Hirschi // J. Mol. Diagnostics. – 2000. – Vol. 2. – P. 153–157.
Single Nucleotide Polymorphism Database: Entrez SNP: updated on 11.08.2009 [Электронный ресурс] – Bethesda : National Institute of Health, USA. – 2009. – Режим доступа: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP.
Jones T. C. Genetic regulation of endothelial function / T. C. Jones, A. D. Hingorani // Heart. – 2005. – № 91. – P. 1275–1277.
Буркин М. М., Основы наркологии : Учебное пособие / М. М. Буркин, под ред. С. В. Торанская. – Петрозаводск: Карелия, 2002. – С. 64–143.
Журнал «Алкоголизм: Клинические и экспериментальные исследования» (Alcoholism: Clinical & Experimental Research) №2 (1 2011) Ranking 201. – 26 с.
Nelson D. R The P450 superfamily: update on new sequences, gene mapping, accession numbers, early trivial names of enzymes, and nomenclature /D. R Nelson [Электронный ресурс] PubMed США. – 1993. – №12. – Режим доступа: www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/7678494.
Nelson D. R. P450 superfamily: update on new sequences, gene mapping, accession numbers and nomenclature /D. R. Nelson, L. Koymans, T. Kamataki, J. J. Stegeman, R. Feyereisen, D. J. Wama, M. R. Waterman, O. Goton, M.J. Coon, R.W. Estabrook, D.W. Nebert [Электронный ресурс] Department of Biochemistry, University of Tennessee, Memphis 38163, USA. – 1996.– Feb №6(1)1–42р – Режим доступа: www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8845856.
Nebert D.W. P450 надсемейства: обновленная информация о новых последовательностей, картирование генов, и рекомендуемая номенклатура. ДНК Cell Biol. / D.W. Nebert , D. R. Нельсон , M. J. Кун Отдел гигиены окружающей среды, Университет Цинциннати медицинский центр, OH 45267–0056– 1991.–№ 10 (1) 1–14.
ru.wikipedia.org/wiki/Кукес (округ) Материал из Википедии, проверенный 2 августа 2011.
URL: http://www.pynny.ru.
Mckinnon D. Genetic Determinants of Toxic Response
in General Principles of Toxicology, Silbergeld, Ellen, Editor, Encyclopedia of Occupational Health and Safety, Jeanne Mager Stellman, Editor–in–Chief./ D. Mckinnon, Ross, Nebert,W. Daniel [Электронный ресурс] International Labor Organization, Geneva.– © 2011.– 15р – Режим доступа: http://www.ilo.org/oshenc/part–iv/toxicology.
Mckinnon D. Genetic Determinants of Toxic Response
in General Principles of Toxicology, Silbergeld, Ellen, Editor, Encyclopedia of Occupational Health and Safety, Jeanne Mager Stellman, Editor–in–Chief./ Mckinnon, Ross, Nebert, W. Daniel [Электронный ресурс] International Labor Organization, Geneva. – © 2012. – 9р – Режим доступа: http://www.ilo.org/oshenc.
Gonzalez A schematic pedigree of the development of some XMEs, especially the CYP2 family/ Gonzalez & Nebert, Nelson. – 1996.– 3р.
Pirmohamed M. Genetic polymorphism of cytochrome P4502E1 and risk of alcoholic liver disease in Caucasians/ M. Pirmohamed, N. R. Kitteringham, L.J. Quest, R. L. Allott, V.J. Green, I. T. Gilmore, B. K. Park [Электронный ресурс] Pharmacogenetics. – 1995.– Dec;5(6):351–7 – Режим доступа: http://www.ncbi.nlm.nih.gov.
Hayashi S. Genetic polymorphisms in the 5'–flanking region change transcriptional regulation of the human cytochrome P450IIE1 gene / S.Hayashi, J. Watanabe , K. Kawajiri [Электронный ресурс] – 1991.– Oct;110(4):559–65 – Режим доступа: www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/1778977.
Mariette V. Genetic polymrphisms in alcohol–metabolizing enzymes and chronic pancreatitis /V. Mariette, H. M. Rene, T. E. Morsche1, M. J. Hennie . Alcohol & Alcoholism Vol. 2004.–39, No. 1– pp. 20–24.
Apweiler R. Universal Protein Knowledgebase./ R. Apweiler et al. UniProt [Электронный ресурс] Nucleic Acids 2004.– Res., 32, D115–D119 – Режим доступа: www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc.
Brill E. Transformation–based error–driven learning and natural language processing: a case study in part–of–speech tagging. [Электронный ресурс] Comput. Linguist.,–1995.– 21, 543–565р– Режим доступа: acl.ldc.upenn.edu/J/J95/J95.
Blaschke C. et al. Automatic extraction of biological information from scientific text: protein–protein interactions. [Электронный ресурс] Proc. Int. Conf. Intell. Syst. Mol. Biol.–1999.– P. 60–67– Режим доступа: www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10786287.
Cohen P. The origins of protein phosphorylation. [Электронный ресурс] Nat. Cell Biol.– 2002.– 4, 27–30р – Режим доступа: www.ibgm.med.uva.es.
Collier N. JExtracting the names of genes and gene products with a hidden Markov model. In Proceedings of the 18th International Conference on Computational Linguistics, Saarbruken/ N. Collier, C. Nobata, and Tsujii [Электронный ресурс] Germany.– 2000.– P. 201–207 – Режим доступа: dl.acm.org/citation.cfm.
Pirmohamed M. Genetic polymorphism of cytochrome P4502E1 and risk of alcoholic liver disease in Caucasians / M. Pirmohamed, N. R. Kitteringham, L. J. Quest, R. L. Allott, V. J. Green, I. T. Gilmore, B. K. Park [Электронный ресурс] Pharmacogenetics.– 1995.– Dec;5(6):351–7 – Режим доступа: www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8747406.
Киржанова В. В. Наркологические расстройства в России / В. В. Киржанова Демоскоп Weekly (электронная версия бюллетеня «Население и общество». – 2007. – № 275–276 7 – Режим доступа: http://demoscope.ru/weekly/2007/0275.
Kalsi G. Unraveling the molecular mechanisms of alcohol dependence Trends Genet./ Kalsi G. et al. [Электронный ресурс] – 2009. – N 1. – P. 49–55.– Режим доступа: www.unboundmedicine.com.
Cotton N.S. The familial incidence of alcoholism:A review / N.S. Cotton [Электронный ресурс] J. Stud. Alcohol. – 1979.– N 40. – P. 89 –116 – Режим доступа: www.jsad.com.
Kendler K.S. et al.: Temperance board registration for alcohol abuse in a national sample of Swedish male twins, born 1902 to 1949 / K. S. Kendler et al. [Электронный ресурс] Arch. Gen. Psychiatry. – 1997. – V. 54, N 2. –P. 178–184 – Режим доступа:books.google.ru/books.
Pirmohamed M. Genetic polymorphism of cytochrome P4502E1 and risk of alcoholic liver disease in Caucasians. / M. Pirmohamed, N. R. Kitteringham, L. J. Quest, R. L. Allott, V. J. Green, I. T. Gilmore, B. K. Park [Электронный ресурс] Pharmacogenetics.– 1995.– Dec; 5(6):351–7 – Режим доступа: www.pynny.ru/information/173.html.
Pastorelli R. Genetic determinants of alcohol addiction and metabolism: a survey in Italy / R. Pastorelli, G. Bardazzi, C. Saieva et al. [Электронный ресурс] Alcohol. Clin. Exp. Res.– 2001.– V. 25, N 2. – рр.221–227 – Режим доступа: www.journal–of–hepatology.eu.
Lucas D. Cytochrome p4502E1 and p4501A1genotypes and susceptibility to cirrhosis or upper aerodigestive tract cancer in alcoholic Caucasians/A. D. Lucas M.nez C., F. Floch et al [Электронный ресурс] Alcohol. Clin. Exp. Res.– 1996. –V. 20. – рр1033– 1037– Режим доступа: www.inserm.fr/content/download.
