- •Дипломная работа распространение и молекулярная диагностика полиморфизма c1/c2 в гене cyp2e1
- •Задание на дипломную работу
- •Реферат
- •Содержание
- •1 Обзор литературы 7
- •Обозначения и сокращения
- •Введение
- •1 Обзор литературы
- •1.1 Система детоксикации цитохрома р450 и его представители
- •1.2 Ген cyp2e1, строение и локализация
- •1.2.1 Полиморфные варианты и мутации гена cyp2e1
- •1.3 Популяционно-генетические исследования полиморфизмов в гене cyp2e
- •1.4 Прикладное значение исследований полиморфизмов гена cyp2e1
- •1.5 Гены и их белковые продукты участвующие в развитии алкоголизма
- •2.2.2 Проведение полимеразной цепной реакции (пцр)
- •2.2.3.1 Приготовление агарозного геля
- •2.3 Статистическая обработка результатов анализа
- •3 Результаты и их обсуждение
- •Заключение
- •Список использованных источников
- •Приложение а (обязательное)
1.4 Прикладное значение исследований полиморфизмов гена cyp2e1
В последнее время проводится все больше исследований по изучению полиморфизмов гена CYP2E1. Эти исследования имеют очень важное значение в медицинской генетике. С помощью ПЦР анализа можно обнаружить различные генетические полиморфизмы. Очень важно сравнивать частоту полимофного генотипа с нормальным генотипом в различных популяциях. Также большое значение уделяется исследованию внешних факторов. Довольно много проводится исследований посвященных изучению влияния мутагенных факторов (ионизирующие и электромагнитное излучение, УФ, различные химические вещества) на частоту полимофных и мутантных генотипов. Генетическая диагностика заболеваний до начала развития манифестных форм может предотвратить развитие заболевания или улучшить его клиническое протекание и дальнейший прогноз [7,29,39].
С использованием данных генотипирования полиморфизма генов ФМЭ, социально-биологических и психологических характеристик разработан способ индивидуального прогнозирования риска развития алкогольной зависимости. Полученные данные могут рассматриваться как предикторы алкоголизма, что открывает перспективы для научно обоснованного подхода к раннему выявлению, лечению и профилактике этого заболевания. На основании генотипирования полиморфизма генов ФМЭ, изучения социально-биологических и психологических характеристик разработана статистическая регрессионная модель вероятностного прогнозирования риска развития алкогольной зависимости. Использование модели в практике медико-генетического консультирования, психологической реабилитации, подразделений наркологических служб позволит своевременно формировать группу повышенного риска алкоголизма, оптимизировать и индивидуализировать лечебно-профилактические мероприятия [23,46,59].
1.5 Гены и их белковые продукты участвующие в развитии алкоголизма
Алкоголизм - непростое в генетическом плане заболевание.
Гены, ответственные за возможное развитие алкоголизма, влияют на многие физиологические процессы: на расщепление этанола, сбалансированность работы головного мозга, вкусовые ощущения и т.д. Изменения в этих генах могут вызывать как непереносимость алкоголя, так и тягу к нему. Некоторые генные версии связаны с другими признаками или расстройствами. Следовательно, отклонения в поведении, настроении и разного рода зависимости могут иметь общую первопричину [13,54].
Были идентифицированы особые участки хромосом 1, 2, 4 и 7, в которых по данным хромосомного картирования располагаются такие специфические гены, как АDН4 и GABRA2 (хромосома 4), а также СНRМ2 (хромосома 7).
В основе алкогольной зависимости лежат различные физиологические механизмы
Появляется все больше данных, свидетельствующих о том, что некоторые варианты генов, которые кодируют рецепторы нейромедиатора гамма-аминомасляной кислоты, ассоциируются со склонностью к алкоголизму.
Как показали исследования, проведенные в рамках программы СОGА, нарушения в гене GABRA2, не сопровождающиеся изменением архитектуры рецептора ГАМКА, связаны с алкоголизмом. Была выявлена также связь между изменениями в гене СНRМ2 и клиническими проявлениями алкогольной зависимости и депрессии. Как и в случае с геном GABRA2, нарушения в гене СНRМ2, влияющие на биоэлектрическую активность мозга и связанные с развитием алкоголизма и депрессии, сопровождаются не структурными изменениями рецепторов, а уменьшением их числа. Гены отвечающие за предрасположенность к алкоголизму представлены в таблице1.
В метаболизме алкоголя участвуют два основных фермента. Сначала под действием алкогольдегидрогеназы этанол превращается в ацетальдегид, а далее ацетальдегид при помощи альдегиддегидрогеназы в ацетат. Работа этих ферментов, скорость их обмена обусловлены генетически и зависят от разных вариантов генов, кодирующих их.
Этанол (этиловый спирт) является достаточно токсичным соединением, и алкоголь наносит вред здоровью, хотя ряд исследований позволяет предположить пользу умеренного потребления, например, красного вина. Как выяснили ученые, все зависит от особенностей метаболизма алкоголя в организме человека.
Белок алкогольдегидрогеназа состоит из альфа-, бета- и гамма-субъединиц, каждая из которых кодируется соответствующим геном. Ген алкогольдегидрогеназы ADH1B кодирует бета-субъединицу белка ADH. На активность фермента может влиять замена одного нуклеотида в кодирующей ее последовательности ДНК. В процессе эволюции образовались два варианта данного гена. Основной вариант обозначается как *1 (или А), а вариант гена, произошедший в результате мутации, – как *2 (или G). Вследствие такой замены меняется активность фермента ADH. Многими авторами было показано увеличение активности фермента до 100 раз у лиц, имеющих генотип *2/*2, по сравнению с людьми, несущими основные варианты гена – *1/*1.
Таблица 1.5.1.1 - Гены ответственные за предрасположенность к алкоголизму
Ген; Локализация |
Кодируемый белок; функция |
Влияние |
Связь с другими признаками или заболеваниями |
CYP2E1, хромосома 10 |
Цитохром 2E1 фермент, участвующий в метаболизме этанола |
Повышение риска (некоторые генные версии) |
ГБ, АБП |
АDН4; хромосома 4 |
Алкогольдегидрогеназа; фермент, участвующий в метаболизме этанола |
Повышение риска (некоторые генные версии) |
Нет |
ALDH1; хромосома 4 |
Алкогольдегидрогеназа; фермент, участвующий в метаболизме этанола |
Непереносимость алкоголя |
Нет |
CHRM2; хромосома 7 |
Мускариновый/ацетилхолиновый М2-рецептор; регулирует сигнальные процессы |
Повышение риска |
Депрессия; изменение характеристик дельта- и тета-волн на ЭЭГ |
DRD2; хромосома 11 |
Дофаминовый D2-рецептор; регулирует активность системы вознаграждения |
Повышение риска |
Пристрастие к курению |
GABRG3; хромосома 15 |
g3-субъединица ГАМКА-рецептора; регулирует сигнальные процессы |
Повышение риска |
Нет |
НТАS2R16; хромосома 7 |
hTS2R16-рецептор; влияет на ощущение сладкого |
Повышенный риск |
Нет |
ОРRК1; хромосома 8 РDYN; хромосома 20 |
Рецептор каппа-опиоида и продинор-фин, пептид, который связывается с этим рецептором; оба белка участвуют в регуляции влечения и отвращения к алкоголю |
Повышенный риск |
Реакция на стресс; может влиять на пристрастие к героину и |
2 Материалы и методы
2.1 Объект исследования
Материалом для исследования послужили образцы ДНК, полученные из цельной венозной крови человека. Выборки больных людей с алкоголизмом на базе республиканского наркологического диспансера г. Саранска. Выборка составила – человек больные и человек здоровые (доноры) в качестве контрольной группы. В исследование были включены больные не родственные между собой.
2.2. Методы исследования
2.2.1 Выделение ДНК с использованием протеиназы К
Лизис эритроцитов
В 1,5 мл пробирки внести последовательно 700 мкл цельной крови и 700 мкл буфера ТЕ 1(10 мМ трис-HCl и 1мМ ЭДТА). Перемешать содержимое переворачиванием (8-10 раз).
Центрифугировать при 11000 об/мин 6 мин.
Супернатант удалить над видимым осадком лейкоцитов. Осадок тщательно суспендировать в 700 мкл буфера ТЕ1. Повторить процедуру 2—3 раза.
Лизис ядер клеток.
К отмытому осадку добавить 300 мкл ТЕ 2 (20 мМ трис-HCl, 10 мМ ЭДТА, pH 7,4), тщательно перемешать и добавить 25 мкл 10% SDS, 10 мкл протеиназы. Инкубировать смесь 65°С 20 мин. Остудить пробирки во льду 1 мин.
Осаждение ДНК.
К лизату добавить 250 мкл 5,3 М NaCl для высаливания белков. Перемешать содержимое пробирок на вортексе до появления хлопьев.
Центрифугировать смесь 6 мин при 10 тыс об/мин. Перенести супер- натат. содержащий ДНК, в новые пробирки не забирая осадок.
Добавить 700 мкл холодного изопропанола. Перемешать переворачиванием пробирки 10-12 раз до выпадения видимого осадка ДНК.
Центрифугировать смесь при 13 тыс об/мин 2 мин. Осторожно, не забирая нитей ДНК, удалить супернатант.
Промывка и растворение ДНК.
Добавить 70% этанол до объема 1,5 мл. Встряхнуть на вортексе.
Центрифугировать 2 мин при 13 тыс об/мин. Осторожно удалить супернатант, не забирая осадок.
Открытые пробирки подсушить на воздухе до испарения спирта.
Добавить к осадку 300 мкл буфера 0,1 М трис-HCl pH 8,5 (НЕ ТЕ!). Перемешать и прогреть при 65°С 5 мин до растворения ДНК.
Полученный раствор ДНК хранить при -20°С. Допустимо кратковременное хранение раствора ДНК при +4 °С.
