- •Дипломная работа распространение и молекулярная диагностика полиморфизма c1/c2 в гене cyp2e1
- •Задание на дипломную работу
- •Реферат
- •Содержание
- •1 Обзор литературы 7
- •Обозначения и сокращения
- •Введение
- •1 Обзор литературы
- •1.1 Система детоксикации цитохрома р450 и его представители
- •1.2 Ген cyp2e1, строение и локализация
- •1.2.1 Полиморфные варианты и мутации гена cyp2e1
- •1.3 Популяционно-генетические исследования полиморфизмов в гене cyp2e
- •1.4 Прикладное значение исследований полиморфизмов гена cyp2e1
- •1.5 Гены и их белковые продукты участвующие в развитии алкоголизма
- •2.2.2 Проведение полимеразной цепной реакции (пцр)
- •2.2.3.1 Приготовление агарозного геля
- •2.3 Статистическая обработка результатов анализа
- •3 Результаты и их обсуждение
- •Заключение
- •Список использованных источников
- •Приложение а (обязательное)
1.2 Ген cyp2e1, строение и локализация
Цитохром СУР2Е1относится к группе генов суперсемейства цитохромов Р-450, ответственных за I фазу детоксикации ксенобиотиков. Цитохром СУР2Е1 метаболизирует этанол и многие известные проканцирогены, такие как нитрозамины, находящиеся в табачном дыме [10.11.12]. В гене СУР2Е1,на сегодняшний день индентифицировано несколько полиморфных локусов. Полиморфизмы, выявленные с помощью эндонуклеаз рестрикции RsaI: G/C(-1259), PstI: C/T(-1019), локализованы в 5, - области гена и находятся в неравновесном сцеплении друг с другом [13,14]. Показано, что мутация гена СУР2Е1, обусловленная транзицией C/T в -1019 позиции нуклеотидной последовательности промоторной области гена, способствует синтезу фермента с повышенной активностью [15].
CYP2E1 - микросомальная монооксигеназа - участвует в первой фазе детоксикации ксенобиотиков и, также, утилизирует этанол на первом этапе, экспрессируется главным образом в печени.
Ген CYP2E1находится на хромосоме 10 в локусе10q24.3-qter и кодирует белок, состоящий из 493 аминокислотных остатков и имеющий молекулярную массу 56 кД. Фермент обнаружен в основном в печени и составляет около 7% от всех изоферментов цитохромов Р-450 [7].
Рисунок 1.2.1.1 - Хромосома 10
Рисунок 1.2.1.2 - Расположение экзонов в гене CYP2E1
Рисунок 1.2.1.3- Структура гена cyp2e1
1.2.1 Полиморфные варианты и мутации гена cyp2e1
Полиморфизмы гена CYP2E1 определяют по рестрикционным эндонуклеазам PstI/RsaI (мутантный аллель CYP2E1*5B), локализованные в 5’-фланкируещем регионе гена [15], при которых мутантный аллель способствует повышенной транскрипционной и ферментативной активности, а также DraI полиморфизм (мутантный аллель CYP2E1*6)[16], расположенный в 6 интроне, для редкого аллеля которого показаны мутации, влияющие на экспрессию гена и каталитическую активность соответствующего белка [17].
Вариант T полиморфизма RsaI (RsaI c2) способствует повышенной транскрипционной активностью и связан с алкогольной болезнью печени в тоже время вариант С полиморфизма PstI (PstI+) соответсвует повышенному риску развития онкологических заболеваний. Вариант C полиморфизма DraI также является онкологическим маркером. В европейских популяциях, частоты встречаемости вариантов RsaI c2 и PstI+ составляют 1–3%, встречаемость варианта DraI около 10%.[12,27,31]
Окислительный стресс, вызываемый этанолом – это основной механизм повреждения печени этанолом. Фермент CYP2E1 производит перекиси водорода и свободных радикалов пероксида и гидроксила. CYP2E1 индуцируется этанолом. Поэтому, изменение активности фермента или его уровня в тканях соответствует измененному риску повреждения тканей организма.[17,28,53]
Полиморфизм c1/c2 в 5’-фланкирующем регионе гена CYP2E1 (-1293G>C) регистрируется рестрикцией Pst I и представлен предковым С1 (410 п.н.) и производным С2 (290 + 120 п.н.; СYP2E1*5B; +Pst I) аллелями. Промоторный полиморфизм –1293G>C гена CYP2E1 увеличивает риск развития гипертонической болезни у мужчин, злоупотребляющих алкоголем.
Таблица 1.2.1.1 – Номенклатура аллелей CYP2E1 гена [18]
Аллель |
Белок |
Однонуклеотидные замены |
Эндонуклеаза рестрикции |
CYP2E1*1A |
CYP2E1.1
|
– |
|
CYP2E1*1B
|
CYP2E1.1
|
9893C>G |
TaqI |
CYP2E1*1C
|
CYP2E1.1
|
6 тандемов
|
|
CYP2E1*1D
|
CYP2E1.1 |
6 тандемов
|
|
CYP2E1*1D
|
CYP2E1.1
|
8 тандемов
|
DraI, XbaI
|
CYP2E1*2
|
CYP2E1.2
|
1132G>A
|
|
CYP2E1*3
|
CYP2E1.3
|
10023G >A
|
PstI
|
CYP2E1*4
|
CYP2E1.4
|
4768G>A
|
RsaI
|
CYP2E1*5A
|
CYP2E1.1 |
–1293G>C –1053C>T
|
DraI PstI
|
CYP2E1*5B
|
CYP2E1.1
|
7632T>A –1293G>C
|
RsaI DraI |
CYP2E1*6 |
CYP2E1.1 |
–1053C>T
|
|
CYP2E1*7A
|
CYP2E1.1 |
7632T>A |
|
CYP2E1*7B
|
CYP2E1.1 |
–333T>A
|
|
CYP2E1*7C |
|
–71G>T;–333T>A –333T>A;–352A>G |
|
