138. Каковы возможные причины выхода на плато значений признака, подвергающегося отбору?

в первую очередь значения признака выходят на плато, то есть отбор по признаку становится неэффективным в связи с тем, что в какой-то момент исчерпывается генетическая изменчивость (в частности, различные генетические сочетания), обеспечивавшая изменчивость фенотипическую.

исчерпан мутационный, рекомбинационный и физиологический потенциал

139. Какие ограничения могут накладываться на отбор по конкретному признаку фенотипа?

может казаться, что если отбор по определенному признаку приводит к увеличению показателей по этому признаку, то почему бы отбору не увеличивать и не увеличивать показатели, приводя к коррелятивным изменениям тела. например? но дело в том, что на организм каждой популяции каждого вида одновременно действует множество факторов среды, следовательно, любая популяция как единица эволюции подвергается одновременному действию множества векторов естественного отбора. и дальнейшему програссированию данного признака будет препятствовать контрбаланс векторов движущего отбора и в какой-то момент отбор по конкретному признаку приведет к его стабилизации на определенном уровне. примерами служат травяная лягушка с высокой плодовтитостью, плодовитость которой стабильна и из-за действия множества векторов отбора не может больше увеличиваться без ликвидации множества факторов внешней среды (таких как нехватка кислорода в слишком большой кладке. хищники, низкие температуры), кладка яиц воробьиных.

140. Какая ситуация, возникающая в ходе отбора, описывается как «trade-off»? Приведите примеры таких ситуаций.

принцип “trade-off”, или принцип компромисса

это ситуация, когда отбору препятствует усиление элиминации по другим признакам фенотипа.

с этим тесно связано то, что естественный отбор всегда имеет много векторов. отбор на плодовитость воробьиных птиц все время стремится увеличить количество яиц в кладке, но этому препятствует трудность вскармливания многочисленного выводка, в итоге такой противоотбор приводит к стабилизации признака на определенном “компромиссном” уровне

141. Тест МакДональда-Крейтмана. Необходимые данные, получаемые результаты.

(используется для оценки интенсивности отбора; основан на сравнении синонимичных и несинонимичных полиморфизмов и количеством замен между двумя близкими видами)

сравнение доли синонимичных и несинонимичных точечных мутаций среди полиморфных и дивергировавших локусов.

Тест М-К гораздо лучше ловит отбор,чем Ka/Ks, поскольку не требует постоянного отбора по одним и тем же позициям. Нужны данные по

внутривидовому полиморфизму, но разрешающая способность выше

142. В чем состоит явление “выметания отбором” (“selective sweep”)? как это явление используется для поиска следов отбора на уровне нуклеотидных последовательностей

уменьшение и элиминация изменчивости нуклеотидной последовательности на определенном участке ДНК в результате сильного положительного естественного отбора

143. Для чего используется тест Kn/Ks? Как зависит значение Kn/от формы отбора, действующего в данной популяции?

Используются для детекции отбора на основе соотношения синонимичных нуклеотидных различий.

Kn (Ka) – среднее число несинонимичных замен на несинонимичный сайт (т.е. отношение к общему числу возможных).

Ks – среднее число синонимичных замен на синонимичный сайт.

Ka/Ks > 1 – положительный отбор (т.е. увеличение частоты полезных мутаций)

Ka/Ks ≈ 1 – нет отбора, нейтральная эволюция.

Ka/Ks <1 – очищающий отбор (т.е. уменьшение частоты вредных).

Применяется при сравнении разошедшихся гомологичных

последовательностей – ортологов или паралогов (если ген существует у некоего вида, который дивергирует с образованием двух видов, то копии этого гена у дочерних видов называются ортологами,если в пределах одного организма в результате хромосомной мутации произошло удвоение гена, то его копии называют паралогамами).