- •1. Определение биотехнологии, основные направления. Особенности биотехнологических процессов.
- •2. Краткий исторический очерк развития биотехнологии. Новейший этап биотехнологии. Особенности создания продуцентов нового поколения.
- •3. Задачи биотехнологии в решении проблем здоровья человека и человечества.
- •4. Задачи биотехнологии в решении энергетических проблем: перспективы получения экологически чистых источников энергии.
- •5. Отличия биотехнологических процессов от химических и агротехнических.
- •6. Понятие типовая биотехнологическая система биосинтеза продуктов, характеристика ее основных стадий.
- •7. Продуценты биотехнологических процессов: прокариоты, эукариоты, ферментные препараты, культуры клеток и тканей растений и животных.
- •8. Использование продуцентов прокариот для получения микробных биомасс: вакцин, пробиотиков и пищевых продуктов.
- •10. Особенности и типы метаболизма микроорганизмов, условия культивирования микроорганизмов- автотрофов и гетеротрофов.
- •11. Культивирование клеток животных. Получение гибридов: цели и условия культивирования.
- •12. Цели и методы создания и культивирования суспензионных культур растений. Характеристика протопластов растений: цели и методы получения.
- •13. Цели создания и культивирования культур клеток животных.
- •14. Питательные среды для культивирования микроорганизмов. Жидкофазное и твердофазное культивирование продуцентов.
- •15. Методы определения численности клеток и биомассы продуцентов.
- •16. Аппараты для культивирования микроорганизмов-продуцентов.
- •17. Характеристика процессов ферментации.
- •18. Классификация процессов ферментации по фазе культивирования продуцента.
- •19. Основные и вспомогательные стадии биотехнологического процесса.
- •20. Постферментационная стадия: процессы, выполняемые в постферментационную стадию.
- •31. Оптимизация биотехнологических процессов по методу «крутого восхождения-спуска» Бокса–Уилсона.
- •32. Блочные принцип математического моделирования биотехнологических систем.
- •33. Методы отделения биомассы продуцентов от культуральной жидкости.
- •34. Модели, учитывающие влияние субстрата на рост популяции микроорганизмов: модель Перта, модель Андрюса.
- •35. Модели, учитывающие влияние субстрата на рост популяции микроорганизмов: модель Кобозева, модель Блэкмана, модель Моно.
- •36. Определение факторов оптимизации. Методы математического планирования экспериментов.
- •37. Модели, учитывающие влияние продуктов метаболизма на скорость роста культур.
- •38. Основные характеристики процесса роста продуцентов: скорость роста, время генерации, удельная скорость роста. Рост продуцентов в условиях глубинного и поверхностного культивирования.
- •39. Особенности метаболизма фотоавтотрофов и фотогетеротрофов. Использование в биотехнологии.
- •40. Обобщенная технологическая схема получения биомасс продуцентов. Удельная скорость роста продуцента.
- •45. Характеристика ферментов: строение, каталитическая активность ферментов.
- •47. Характеристика основных способов получения микробных ферментных препаратов.
31. Оптимизация биотехнологических процессов по методу «крутого восхождения-спуска» Бокса–Уилсона.
По этому методу вблизи исходной точки («фона») ставится специальным образом спланированная небольшая серия опытов, в которой одновременно варьируются все изучаемые факторы, каждый на 2 уровнях (верхнем и нижнем). Результаты этих опытов математически обрабатывают для получения приближенного математического описания процесса в этой локальной области. Для двух уровней варьирования факторов можно найти только линейное уравнение, величина факторов входит в первой степени (его иногда называют уравнение регрессии). В уравнение могут входить также коэффициенты при S1S2, S2S3, S1S3 и так далее – мультипликативные члены, учитывающие межфакторные взаимодействия.
Уравнение используют для определения направления крутого восхождения, при котором возрастает выходной показатель Р наиболее круто по градиенту. Так происходит до тех пор, пока уравнение адекватно процессу. Что когда-нибудь оно станет неадекватным, очевидно, раз процесс имеет оптимум в виде «хребта» или «купола».
В направлении крутого восхождения ставят 5-6 проверочных экспериментов. В какой-то точке происходит снижение параметра оптимизации. Поскольку микробиологические процессы сложны и плохо воспроизводимы, планируемые опыты не приводят сразу к «тотальному» оптимуму. Поэтому в наилучшей достигнутой точке ставят новую серию «изучающих» экспериментов, и цикл крутого восхождения повторяется.
Т
очки
1,2,3 и 4 представляют собой начальную
серию исследовательских экспериментов
вокруг исходной среды А. их математический
анализ дает уравнение, по которому
определяют направление крутого
восхождения (градиента), показанное на
рисунке сплошной прямой, перпендикулярной
к топографическим линиям поверхности
отклика. Проверочные точки на прямой
не представлены, указана только точка
«перевала» при движении в этом направлении
(точка 5), после которой значение выходного
показателя начинает уменьшаться.
В этой точке проводят новую серию опытов 6,7,8 и 9, их обрабатывают, находят новое уравнение и по нему вновь ставят эксперименты в направлении крутого восхождения. В точке 10 достигнуто новое значение оптимума, уже весьма близкое к «тотальному». Линии крутого восхождения до «перевала» изображены сплошными, после – пунктирными. По методу Бокса–Уилсона всего за 2 подхода удалость получить близкий к оптимальному результат (по сравнение с методом Гаусса_Зайделя).
32. Блочные принцип математического моделирования биотехнологических систем.
33. Методы отделения биомассы продуцентов от культуральной жидкости.
34. Модели, учитывающие влияние субстрата на рост популяции микроорганизмов: модель Перта, модель Андрюса.
Основоположником математических популяционных моделей принято считать Т.Мальтуса, который сформулировал закон роста народонаселения по геометрической прогрессии. В дальнейшем было предложено множество моделей, которые учитывали влияние различных факторов на рост популяции, в том числе и клеточных популяций. К наиболее простой модели, используемая в наши дни, можно отнести модель Ферхюльста, которая предполагает существование некоторого предела K, называемого емкостью среды, к которому стремится численность популяции N при t → ∞ (I):
dN/dt=ε(K-N) N, (1)
где εK=μ — удельная скорость роста популяции. Модель показывает, что смертность в популяции пропорционально ее численности. Однако, эта модель не учитывает лимитирующие факторы, которые способны ограничивать рост.
Часть А. Влияние лимитирующего фактора на рост клетки
К наиболее простым уравнениям описывающие рост клетки на питательной среде можно отнести модели, которые учитывают влияние зависимости роста от концентрации лишь одного субстрата (вещества), который называют лимитирующим; другие субстраты при этом полагаются находящимися в избытке и не влияющими на скорость роста.
Модель Перта – это модель, в которой учитывается зависимость максимальной удельной скорость роста от концентрации лимитирующего субстрата до его насыщения является. Модель Перта учитывает зависимость µ(S) не для лимитирующего, а для «стимулирующего» субстрата и описывается уравнением вида.
Графическая модель Перта
Модель Андрюса учитывает ингибирование повышенными концентрациями субстрата и описывается уравнением
(Это уравнение отличается от уравнения Моно наличием в знаменателе квадратичного члена S2 с новым кинетическим параметром Ki)
Зависимость µ(S) ингибированием повышенными концентрациями субстрата по модели Андрюса
Рост микроорганизмов зависит не только от концентрации субстрата S, но так же и от концентрации продуктов метаболизма Р. Причем чаще всего накопление продуктов снижает (ингибирует) скорость роста. Это ингибирование учитывается различными моделями.
