- •Поиск мотивов в последовательности белка панкреатической липазы (pnlip). Id p16233
- •Поиск мотивов в последовательности белка панкреатической липазы Chlorocebus sabaeus (Green monkey) (Cercopithecus sabaeus). Id upi00045db9ed
- •Поиск мотивов в последовательности белка каталазы Bacillus subtilis.Id a0a0a1m3v2
- •Поиск мотивов в последовательности белка гиалуронидазы Clostridium perfringens. Id upi0004044754
- •Изображение доменной структуры липазы Homo sapiens id p16233:
- •Изображение доменной структуры липазы Chlorocebus sabaeus (Green
- •Изображение доменной структуры каталазы Bacillus subtilis.
- •Изображение доменной структуры гиалуронидазы Clostridium perfringens.
Поиск мотивов в последовательности белка каталазы Bacillus subtilis.Id a0a0a1m3v2
С помощью программы ScanProsite были найдены 8 известных мотивов в последовательности белка каталазы.
Идентификатор паттерна (accession number) |
Идентификатор документации PROSITE и краткое описание или название паттерна в соответствии с этим документом |
Паттерн (регулярное выражение ) или правила |
Число мотивов, обнаруженных в моем белке |
||
PS00006 |
PDOC00006 Сайт фосфорилирования казеинкиназы II |
[ST]-x(2)-[DE] |
15 |
||
PS00005 |
PDOC00005 Сайт фосфорилирования протеинкиназы С |
[ST]-x-[RK] |
11 |
||
PS00009 |
PDOC00009 сайт амидирования |
x-G-[RK]-[RK] |
2 |
||
PS00004 |
PDOC00004 –сайт фосфорилирования цАМФ- и цГМФ-зависимых протеинкиназ |
[RK](2)-x-[ST] |
2 |
||
PS00008 |
PDOC00008 сайт N- миристоилирования |
G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} |
9 |
||
PS00007
|
PDOC00007 сайт фосфолирования тирозинкиназы |
[RK]-x(2)-[DE]-x(3)-Yor[RK]-x(3)-[DE]-x(2)-Y |
1 |
||
PS00438 |
PDOC00395 Профиль и сигнатура каталазы |
[IF]-x-[RH]-x(4)-[EQ]-R-x(2)-H-x(2)-[GAS]-[GASTFY]-[GAST] |
1 |
||
PS00437 |
PDOC00395 Профиль и сигнатура каталазы |
R-[LIVMFSTAN]-F-[GASTNP]-Y-x-D-[AST]-[QEH] |
1 |
||
R-[LIVMFSTAN]-F-[GASTNP]-Y-x-D-[AST]-[QEH]- это паттерн мотива PDOC00395. Пример аминокислотной последовательности, идеально удовлетворяющей условиям данного паттерна, но не такой, как в последовательности белка:
R-L-F-G-Y-N-D-A-Q
Поиск мотивов в последовательности белка гиалуронидазы Clostridium perfringens. Id upi0004044754
С помощью программы ScanProsite были найдены 7 известных мотивов в последовательности белка гиалуронидазы.
Идентификатор паттерна (accession number) |
Идентификатор документации PROSITE и краткое описание или название паттерна в соответствии с этим документом |
Паттерн (регулярное выражение ) или правила |
Число мотивов, обнаруженных в моем белке |
||
PS00006 |
PDOC00006 Сайт фосфорилирования казеинкиназы II |
[ST]-x(2)-[DE] |
28 |
||
PS00005 |
PDOC00005 Сайт фосфорилирования протеинкиназы С |
[ST]-x-[RK] |
20 |
||
PS00007 |
PDOC00007 сайт фосфолирования тирозинкиназы |
[RK]-x(2)-[DE]-x(3)-Yor[RK]-x(3)-[DE]-x(2)-Y |
3 |
||
PS00001 |
PDOC00001 сайт N-гликозилирования |
N-{P}-[ST]-{P} |
11 |
||
PS00008 |
PDOC00008 сайт N- миристоилирования |
G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} |
10 |
||
PS00009 |
PDOC00009 сайт амидирования |
x-G-[RK]-[RK] |
1 |
||
PS00004 |
PDOC00004 –сайт фосфорилирования цАМФ- и цГМФ-зависимых протеинкиназ |
[RK](2)-x-[ST] |
2 |
||
x-G-[RK]-[RK]- это паттерн мотива PDOC00009. Пример аминокислотной последовательности, идеально удовлетворяющей условиям данного паттерна, но не такой, как в последовательности белка:
G-R-K-R