- •Поиск мотивов в последовательности белка панкреатической липазы (pnlip). Id p16233
- •Поиск мотивов в последовательности белка панкреатической липазы Chlorocebus sabaeus (Green monkey) (Cercopithecus sabaeus). Id upi00045db9ed
- •Поиск мотивов в последовательности белка каталазы Bacillus subtilis.Id a0a0a1m3v2
- •Поиск мотивов в последовательности белка гиалуронидазы Clostridium perfringens. Id upi0004044754
- •Изображение доменной структуры липазы Homo sapiens id p16233:
- •Изображение доменной структуры липазы Chlorocebus sabaeus (Green
- •Изображение доменной структуры каталазы Bacillus subtilis.
- •Изображение доменной структуры гиалуронидазы Clostridium perfringens.
Поиск мотивов в последовательности белка панкреатической липазы (pnlip). Id p16233
С помощью программы ScanProsite были найдены 8 известных мотивов в последовательности белка панкреатической липазы.
Идентификатор паттерна (accession number) |
Идентификатор документации PROSITE и краткое описание или название паттерна в соответствии с этим документом |
Паттерн (регулярное выражение ) или правила |
Число мотивов, обнаруженных в моем белке |
||
PS00008 |
PDOC00008 сайт N- миристоилирования |
G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} |
9 |
||
PS00005 |
PDOC00005 Сайт фосфорилирования протеинкиназы С |
[ST]-x-[RK] |
7 |
||
PS00006
|
PDOC00006 Cайт фосфорилирования казеин киназы II |
[ST]-x(2)-[DE] |
4 |
||
PS00009 |
PDOC00009 сайт амидирования |
x-G-[RK]-[RK] |
2 |
||
PS00001 |
PDOC00001 сайт N-гликозилирования |
N-{P}-[ST]-{P} |
1 |
||
PS00017 |
PDOC00016 ATP / GTP-связывающий сайт (P-петля) |
[AG]-x(4)-G-K-[ST] |
1 |
||
PS00004
|
PDOC00004 –сайт фосфорилирования цАМФ- и цГМФ-зависимых протеинкиназ |
[RK](2)-x-[ST] |
1 |
||
PS00120
|
PDOC00110 Липазный серин активный сайт |
[LIV]-{KG}-[LIVFY]-[LIVMST]-G-[HYWV]-S-{YAG}-G-[GSTAC] |
1 |
||
[N-{P}-[ST]-{P}- это паттерн мотива PDOC00001. Пример аминокислотной последовательности, идеально удовлетворяющей условиям данного паттерна, но не такой, как в последовательности белка: N-P-S-T
Поиск мотивов в последовательности белка панкреатической липазы Chlorocebus sabaeus (Green monkey) (Cercopithecus sabaeus). Id upi00045db9ed
С помощью программы ScanProsite были найдены 7 известных мотивов в последовательности белка панкреатической липазы.
Идентификатор паттерна (accession number) |
Идентификатор документации PROSITE и краткое описание или название паттерна в соответствии с этим документом |
Паттерн (регулярное выражение ) или правила |
Число мотивов, обнаруженных в моем белке |
||
PS00008 |
PDOC00008 сайт N- миристоилирования |
G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P}[GistheN-myristoylationsite] |
9 |
||
PS00006 |
PDOC00006 Сайт фосфорилирования казеинкиназы II |
[ST]-x(2)-[DE][SorTisthephosphorylationsite] |
5 |
||
PS00005 |
PDOC00005 Cайт фосфорилирования протеинкиназы С |
[ST]-x-[RK] |
6 |
||
PS00009 |
PDOC00009 сайт амидирования |
x-G-[RK]-[RK] |
2 |
||
PS00001 |
PDOC00001 сайт N-гликозилирования |
N-{P}-[ST]-{P} |
1 |
||
PS00017 |
PDOC00017 ATP / GTP-связывающий сайт (P-петля) |
[AG]-x(4)-G-K-[ST] |
1 |
||
PS00004 |
PDOC00004 –сайт фосфорилирования цАМФ- и цГМФ-зависимых протеинкиназ |
[RK](2)-x-[ST] |
1 |
||
[RK](2)-x-[ST]- это паттерн мотива PDOC00004. Пример аминокислотной последовательности, идеально удовлетворяющей условиям данного паттерна, но не такой, как в последовательности белка:
R-K-R-K
Поиск мотивов в последовательности белка Tyrosinase Bacillus sp. Aph1. ID UPI0003A69D7A
С помощью программы ScanProsite были найдены 6 известных мотивов в последовательности белка Tyrosinase.
.
Идентификатор паттерна (accession number) |
Идентификатор документации PROSITE и краткое описание или название паттерна в соответствии с этим документом |
Паттерн (регулярное выражение ) или правила |
Число мотивов, обнаруженных в моем белке |
||
PS00005 |
PDOC00005 Сайт фосфорилирования протеинкиназы С |
[ST]-x-[RK] |
5 |
||
PS00006 |
PDOC00006 Сайт фосфорилирования казеинкиназы II |
[ST]-x(2)-[DE] |
7 |
||
PS00008 |
PDOC00008 сайт N- миристоилирования |
G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} |
5 |
||
PS00004
|
PDOC00004 –сайт фосфорилирования цАМФ- и цГМФ-зависимых протеинкиназ
|
[RK](2)-x-[ST]
|
1
|
||
PS00497 |
PDOC00398 Сигнатура тирозиназы |
H-x(4,5)-F-[LIVMFTP]-x-[FW]-H-R-x(2)-[LVMT]-x(3)-E |
1 |
||
PS00498 |
PDOC00398 Сигнатура тирозиназы |
D-P-x-F-[LIVMFYW]-x(2)-H-x(3)-D |
1 |
||
[RK](2)-x-[ST]- это паттерн мотива PDOC00004. Пример аминокислотной последовательности, идеально удовлетворяющей условиям данного паттерна, но не такой, как в последовательности белка:
R-K-R-K