
- •Введение. Термодинамические процессы
- •Термодинамика биологических процессов
- •Параметры (2 основн-х типа):
- •8.Первый закон тд в биологии; доказательства его применимости к живым системам. Своеобразие проявления первого закона тд в биосистемах.
- •9.Характеристика энтальпии системы как функция состояния. Тепловой эффект процесса.
- •Практич. Применение:
- •Следствия из закона Гесса:
- •Осн. Положения:
- •Применимость 2 закона т/д для характеристики свойств биосистем
- •Применимость второго закона тд к биосистемам:
- •15.Теория Онзагера. Гетерогенность энтропии в биосистемах. Уравнение второго закона термодинамики для открытых систем.
- •Механизмы саморегуляции систем
- •18. Организм и клетка как химическая машина. Химический потенциал живой системы.
- •19.Критерии спонтанности, самопроизвольности протекания процессов в тд системах.
- •20.Применение тд в биологии: методы расчёта стандартной и реальной свободной энергии биохимических процессов. Свободная энергия Гиббса и Гельмгольца.
- •Расчёт тд параметров для тд систем:
- •21. Потенциал переноса атомных группировок в различных трансферазных реакциях.
- •21.Понятие макроэргической связи. Характеристика атф как универсального аккумулятора энергии в биосистемах.
- •23.Причины высоких значений потенциала переноса при гидролизе ди- и полифосфатов. Разнообразие макроэргических соединений в биосистемах.
- •24.Типы энергетического обмена в биосистемах
- •26. Термодинамическая характеристика анаэробного распада глюкозы. Расчет кпд.
- •Баланс атф при анаэробном гликолизе
- •Анаэробная фаза дыхания (гликолиз)
- •27. Термодинамическая характеристика окисления пвк в цикле Кребса. Ресчет кпд.
- •Значение окислительного декарбоксилирования пирувата
- •Регуляция общего пути катаболизма
- •28. Термодинамика полного окисления глюкозы. Расчет биологического окисления глюкозы.
- •Реакции подготовительного этапа:
- •Общее уравнение декарбоксилирования и окисления пвк:
- •29. Этапы унификации энергетических субстратов в процессах катаболизма.
- •Суть гипотезы Митчела можно выразить следующей схемой
- •33. Разнообразие механизмов образование атф и их вклад в энергетику клетки.
- •В упрощенном виде ресинтез атф аэробным путем может быть представлен схемой:
- •Гликолитический путь ресинтеза атф
- •Итоговое уравнение анаэробного расщепления гликогена имеет следующий вид:
- •34. Различные типы электрон-транспортных путей в живых организмах. Их роль в биоэнергетике клетки.
- •Электронтранспортные цепи митохондрий эукариот
- •Электронтранспортные цепи бактерий
- •35. Биофизика фотосинтеза
- •Квантовый расход фотосинтеза для одноклеточных водорослей в лабораторных условиях составляет 8-12 квантов на молекулу co2.
Механизмы саморегуляции систем
Функционируют по принципу обратной связи. Обратная связь – это понятие, обозначающее влияние выходного сигнала системы на ее рабочие параметры. Различают положительную и отрицательную. "–" чаще встречается в биосистемах, направлена на снижение влияния выходного сигнала на рабочие параметры системы. "+" усиливает влияние выходного сигнала, в результате чего система может выходить из данного состояния.
Гомеостаз – постоянство многих параметров.
18. Организм и клетка как химическая машина. Химический потенциал живой системы.
Метаболический цикл – это открытая система последовательных р-ций, в ходе которых поступающий субстрат перерабатывается таким и происходит регенерация исходного продукта. Такой цикл можно рассматривать как «химическую машину», совершающую работу по превращению одних видов веществ и Е в другие.
Увеличение энтропии, сопровождающее внутренние процессы в этой химической машине, определяется измерением суммарного потенциала системы и внешней среды, взятым с обратным знаком, и равно TdiS = -d(G + G*), где G — термодинамический потенциал системы, a G* — термодинамический потенциал внешней среды, за счет поступления продуктов из которой «работает» химический цикл.
После совершения одного оборота цикла через время t система вновь вернется в первоначальное состояние, а =>, через время t dG = 0. При этом для внешней среды dG* <> 0, так как именно за счет взаимодействия с внешней средой и совершился оборот цикла с произведенной им за это время работой.
Хим. потенциал — величина, определяющая ТД характеристику не системы в целом, а одной м-лы в этой системе.
Если добавлять в систему м-лу за м-лой при постоянном давлении, то на добавление каждой новой частицы надо затратить в точности ту же работу, что на добавление любой предыдущей: объем системы будет расти, а плотность системы — и интенсивность взаимодействий в ней — меняться не будет.
Поэтому ТД состояние м-лы в системе удобно определять величиной свободной энергии Гиббса G, деленной на число молекул N,
µ= G/N
Молекулы перетекают из той фазы, где их хим. потенциал выше, в ту, где их хим. потенциал ниже, — это понижает общую свободную энергию системы и приближает ее к равновесию. А в равновесии хим. потенциал мо-л в одной фазе равен хим. потенциалу тех же м-л в другой фазе.
19.Критерии спонтанности, самопроизвольности протекания процессов в тд системах.
Критерий устойчивости стационарного состояния – в виде положительного характера величины избыточной продукции энтропии при небольшом возмущении системы.
Отрицательный характер этой величины указывает на неуст. стац. (особой) точки. Вблизи равновесия критерий устойч. > 0 совпадает с теоремой о минимуме продуцирования энтропии в стационарном состоянии. Что касается ТД критериев эволюции открытых систем, то эта задача решена только для состояний, близких к равновесию. Именно в этой области монотонное уменьшение скорости продуцирования энтропии < 0 и служит критерием самопроизвольного стремления к устойчивому стационарному состоянию.
Обратимый ТД процесс - процесс перехода одного состояния системы в другое, если обратный переход не связан с некомпенсированным превращением E в А.
Процесс перехода одного состояния системы в другое называется необратимым, если обратный переход связан с необходимостью E из вне.
Биохим. р-ция обратима, если можно осуществить в прямом и обратном направлении (даже если Е из окружающей среды).
Любой ТД обратимый процесс стремится к состоянию ТД равновесия, т.е. к наиболее деградирующему состоянию. Б\х обратимый процесс - стремится к равновесию, но не достигает его. Скорость прямой реакции =скорости обратной реакции.
Формальный признак обратимости - время. Если для к-л процесса знак + можно заменить на знак - перед параметром времени (например, если t^2), то процесс обратим. Если t зависит от знака, то данный процесс является необратимым.
По знаку и величине ТД потенциала можно судить о направленности процесса, если в результате процесса величина ТД потенциалов уменьшается, такой процесс является самопроизвольным, идет с выделением энергии и называется экзергоническим, если т/д потенциалы увеличивается, то процесс идет не самопроизвольный, требует притока энергии извне и называется эндергоническим.