- •Введение. Термодинамические процессы
- •Термодинамика биологических процессов
- •Параметры (2 основн-х типа):
- •8.Первый закон тд в биологии; доказательства его применимости к живым системам. Своеобразие проявления первого закона тд в биосистемах.
- •9.Характеристика энтальпии системы как функция состояния. Тепловой эффект процесса.
- •Практич. Применение:
- •Следствия из закона Гесса:
- •Осн. Положения:
- •Применимость 2 закона т/д для характеристики свойств биосистем
- •Применимость второго закона тд к биосистемам:
- •15.Теория Онзагера. Гетерогенность энтропии в биосистемах. Уравнение второго закона термодинамики для открытых систем.
- •Механизмы саморегуляции систем
- •18. Организм и клетка как химическая машина. Химический потенциал живой системы.
- •19.Критерии спонтанности, самопроизвольности протекания процессов в тд системах.
- •20.Применение тд в биологии: методы расчёта стандартной и реальной свободной энергии биохимических процессов. Свободная энергия Гиббса и Гельмгольца.
- •Расчёт тд параметров для тд систем:
- •21. Потенциал переноса атомных группировок в различных трансферазных реакциях.
- •21.Понятие макроэргической связи. Характеристика атф как универсального аккумулятора энергии в биосистемах.
- •23.Причины высоких значений потенциала переноса при гидролизе ди- и полифосфатов. Разнообразие макроэргических соединений в биосистемах.
- •24.Типы энергетического обмена в биосистемах
- •26. Термодинамическая характеристика анаэробного распада глюкозы. Расчет кпд.
- •Баланс атф при анаэробном гликолизе
- •Анаэробная фаза дыхания (гликолиз)
- •27. Термодинамическая характеристика окисления пвк в цикле Кребса. Ресчет кпд.
- •Значение окислительного декарбоксилирования пирувата
- •Регуляция общего пути катаболизма
- •28. Термодинамика полного окисления глюкозы. Расчет биологического окисления глюкозы.
- •Реакции подготовительного этапа:
- •Общее уравнение декарбоксилирования и окисления пвк:
- •29. Этапы унификации энергетических субстратов в процессах катаболизма.
- •Суть гипотезы Митчела можно выразить следующей схемой
- •33. Разнообразие механизмов образование атф и их вклад в энергетику клетки.
- •В упрощенном виде ресинтез атф аэробным путем может быть представлен схемой:
- •Гликолитический путь ресинтеза атф
- •Итоговое уравнение анаэробного расщепления гликогена имеет следующий вид:
- •34. Различные типы электрон-транспортных путей в живых организмах. Их роль в биоэнергетике клетки.
- •Электронтранспортные цепи митохондрий эукариот
- •Электронтранспортные цепи бактерий
- •35. Биофизика фотосинтеза
- •Квантовый расход фотосинтеза для одноклеточных водорослей в лабораторных условиях составляет 8-12 квантов на молекулу co2.
Термодинамика биологических процессов
1. Подходы: феноменологический и детальный. Значение имеют т/д параметры только в исходном и конечном состоянии. Термодинамика – это наука, изучающая наиболее общие закономерности превращения различных видов энергии в системе.
2. Практическая значимость т/д в биологии. Позволяет оценить энергетические изменения, происходящие в результате биохимических реакций; рассчитать энергию разрыва конкретных хим. связей; рассчитать осмотическое давление по обе стороны полупроницаемой мембраны; рассчитать влияние концентрации соли в растворе на растворимость макромолекул. Применяется для описания процессов, протекающих в электрохимических ячейках. Привлекается для обоснования теории возникновения и эволюции жизни на Земле.
5. Классификация ТД систем; особенности живых организмов, как ТД систем.
Система – всякий материальный объект, состоящий из большого числа частиц.
Система – совокупность взаимодействующих между собой относительно элементарных структур или процессов, объединяющихся в целое выполнением некоторой общей функции, несводимой к функциям ее компонентов. Т/д система – часть пространства с материальным содержимым, ограниченная оболочкой.
Система – тело или группа тел, реально или мысленно выделенных из окружающей среды.
Окр. среда – всё, что находится в контакте с системой.
Термодинамическая система – группа взаимодействующих тел системы, между которыми происходит обмен теплотой или веществом, либо она описывается термодинамическими параметрами.
Окружающая среда – всё, что находится в контакте с системой.
Выделяют несколько типов систем по их способности взаимодействовать с внешней средой:
1. Изолированная система – с-ма, которая не обменивается с окр. средой ни веществом, ни Е (пр: космонавт в космосе).
2. Замкнутая - система, которая не обменивается с окр. средой веществом, но обменивается Е и работой (горячий чай в стакане с крышкой – на холод).
3. Открытая т/д система - которая обменивается с окр средой и веществом и энергией (живой организм).
Т/Д функция – совокупность физич. и химич. свойств системы, которые определяют ее сост-е.
Параметры (2 основн-х типа):
экстенсивные, зависят от количества вещества в системе (масса, объем),
интенсивные, не зависят от количества вещества в системе (давление, t0).
6.Характеристика ТД функций, применяемых для анализа биолог процессов.
Функция – совокупность физ. и хим. св-в, кот. определяют конкретное сост. системы. Напр:t,V,P. ТД функции = ТД параметры. ТД параметры сост. системы – измеримые св-ва системы, связанные с Е и характеризующие её состояние.
Основные параметры состояния – параметры, поддающиеся прямому измерению.
Те, которые нельзя измерить непосредственно, рассм. как функции основных параметров сост-я.
Типы:
1) экстенсивные (=факторы ёмкости) – это ТД фукнции, кот зависят от кол-ва или числа частиц и их массы. Напр: масса, объём, E, энтропия (S), энтальпия (Н). Св-во системы = сумме свойств частей.
2) интенсивные – не зависят. Напр: t, давление, скорость изменения энтропии.
Состояние системы – совокупность всех физ. и хим. св-в системы.
ТД процесс - изменение сост. системы, характ-ся изм. её ТД параметров. Изменение может происходить при различных условиях, различают:
1). Равновесные и неравновесные процессы. Равн. пр. – непрерывный ряд равновесных сост. сист.; сост., не изм-ся во времени и не требующие для своего поддержания каких-либо внешних факторов. Неравн. — это пр-сы, после протекания кот. систему нельзя вернуть в исходное сост. без того, чтобы в ней не осталось каких-либо изменений.
2). Обратимые и необратимые процессы. Обр. – пр-сы, допускающие возможность возвращения системы в первоначальное сост. без того, чтобы в окр. среде остались какие-либо изменения. В противном случае – необр.
3). Самопроизвольные и несамопроизвольные процессы. Сам. – процессы, происходящие сами собой (не требующие затраты Е извне) и приближающие систему к равновесию. Несам. – процессы, требующие затраты Е извне.
Некоторые частные виды процессов:
а) изотермический (T = const);
б) изобарный (p = const);
в) изохорный (V = const);
г) адиабатический (нет обмена теплотой между системой и окр. средой);
д) изобарно – изотермический (p = const, T = const);
е) изохорно – изотермический (V = const, T = const).
7.Внутренняя энергия, теплота и работа, как ТД функции.
Энергия – мера определённой формы движения материи при её превращении из одной формы в другую. Е - мера способности системы совершать работу. Является произведением фактора экстенсивности на интенсивность. Напр: E=р*v, E=m*P и т.д
Закон сохранения Е: - Е не создаётся из ничего и не может превратиться в ничто.
ТД равновесие - состояние системы, при котором способность совершать работу =0 и из которой она не может выйти без затраты Е из вне. Все системы стремятся к этому состоянию.
Внутренняя Е (U) – весь запас внутр. кинетической и потенциальной Е в-ва. Абсолютное значение внутр. Е определить невозможно. Важно кол-но определить изменение внутр. Е при переходе из одного состояния в другое: ∆U=U2-U1. В равновесном сост. система обладает определённым запасом Е => внутр. Е является функцией состояния.
Работа и теплота – две возможные формы передачи Е от одной системы к др. Работа – это Е, передаваемая одним телом другому, не зависящая от t тел и не связанная с переносом массы. Работа положительна (А > 0), если она совершается системой против внешних сил, и отрицательна (А < 0), если она выполняется над системой. В хим. рассматривают работу расширения, совершаемую системой, тогда равновесному процессу всегда соответствует мах работа.
Теплота – Е, передаваемая одним телом другому, зависящая от t тел и не связанная с переносом массы. Теплота положительна (Q > 0), если теплота поступает в систему (эндотермическим процесс), и отрицательна (Q < 0), если теплота отводится из системы (экзотермический).
В равновесном состоянии система не обладает ни запасом теплоты, ни запасом работы, поэтому они являются функциями процесса. Передача теплоты или совершение работы осущ‑ся лишь при взаимодействии системы с внеш. средой или другой системой.
