- •Часть 1
- •Список сокращений
- •Введение.
- •Ориентировочная схема изучения
- •Занятие: белки. Функции белков. Общие свойства белков. Классификация белков (простые и сложные белки) Вопросы и ответы для самоподготовки:
- •Понятие о белках, аминокислоты - структурные единицы белковой молекулы
- •2. Аминокислоты, заменимые и незаменимые, химическая природа, биологическое значение, иминокислоты.
- •5. Размеры и формы белковых молекул, глобулярные и фибриллярные белки.
- •6. Общая природа продуктов гидролиза белков, виды гидролиза, биологически активные пептиды.
- •7. Способы связи аминокислот в молекуле белка (пептидная, дисульфидная, водородная, ионная, гидрофобное взаимодействие), показать на конкретных примерах.
- •Образование дисульфидной связи
- •Типы слабых связей
- •Амфотерность белка.
- •Кислые и основные белки, особенности их строения, иэт
- •12. Полноценные и неполноценные белки.
- •15.Чем обусловлена устойчивость белка в растворе? Факторы устойчивости.
- •16.Реакции осаждения. Как можно осадить белок из раствора? Значение этих реакций в медицине
- •Упражнения и ситуационные задачи для самоконтроля
- •Вопросы и ответы для самоподготовки:
- •Гликопротеиды, общая характеристика, свойства, классификация: истинные гликопротеиды и протеогликаны, отличие истинных гликопротеидов от протеогликанов.
- •Протеогликаны, строение, представители, значение.
- •Хромопротеиды, общая характеристика, классификация (гемопротеиды, пигменты, магнийпорфирины).
- •Дыхательные белки (миоглобин, гемоглобин), строение, роль.
- •Модель миоглобина и гемоглобина
- •9.Металлопротеиды, строение, представители, значение.
- •10. Липопротеиды - структурные, транспортные, строение
- •Упражнения и ситуационнве задачи для самоконтроля
- •Вопросы и ответы для самоподготовки:
- •1. Нуклеопротеиды, общий план строения, роль.
- •2.Нуклеотиды – мономеры нуклеиновых кислот, их строение, значение. Нуклеозиддифосфорные (ндф) и нуклеозидтрифосфорные (нтф) кислоты, их значение.
- •Основные дезоксирибонуклеотиды и рибонуклеотиды
- •5. Днк, строение, нуклеотидный состав, комплементарные нуклеотидныецепи, структурная организация, связи, стабилизирующие днк.
- •Форма в
- •Первичная структура днк
- •Первичная структура днк
- •Структура днк
- •Третичная структура днк
- •Четвертичная структура днк
- •7. Рнк, нуклеотидный состав, строение, виды рнк (м – рнк, т – рнк, р – рнк).
- •Характеристика генетического кода
- •Вторичная структура т-рнк
- •11.Рибосома, полисомы, строение, роль.
- •Упражнения и ситуационные задачи для самоконтроля:
- •Ферменты. Энергетический обмен. Типы окисления
- •Вопросы и ответы для самоподготовки:
- •1. Ферменты, понятие.
- •2.Сходства в действии ферментов и неорганических катализаторов.
- •3. Механизм ферментативного катализа.
- •4. Общие свойства ферментов.
- •5. Сложное строение ферментов. Простые (однокомпонентные) и сложные (двукомпонентные) ферменты.
- •Что такое аллостерический центр фермента, его роль?
- •10. Виды субстратной специфичности: относительная, абсолютная, стериохимическая.
- •11. Мощность действия фермента, ее характеристика. Единицы измерения.
- •12. Проферменты, механизм активации.
- •13. Мультиферментные комплексы. Виды, значение.
- •Упражнения и ситуационные задачи для самоконтроля
- •Вопросы и ответы для самоподготовки:
- •1. Регуляция активности ферментов. Факторы, влияющие на активность ферментов.
- •2. Влияние температуры на активность ферментов.
- •3. Влияние рН среды на скорость ферментативной реакции.
- •4. Влияние концентрации субстрата на скорость ферментативного катализа.
- •5. Активаторы и ингибиторы действия ферментов. Специфические и неспецифические эффекторы.
- •9. Классификация и номенклатура ферментов.
- •Упражнения и ситуационные задачи для самоконтроля
- •1. Гидролазы, строение, классификация, биологическая роль, распространение.
- •3. Гликозидазы, представители, нахождение, каталитическое действие, место нахождение.
- •4.Пептидазы (пептидгидролазы), строение, классификация, каталитическое действие, место нахождения.
- •5. Эндопептидазы, представители, каталитическое действие, место нахождения.
- •6. Экзопептидазы, представители, каталитическое действие, место нахождения.
- •7. Применение гидролаз в медицине и промышленности
- •2Подкласс –гидро-лиазы
- •10. Трансферазы, строение, классификация, представители, каталитическое действие, распространение
- •12. Ацилтрансферазы
- •13. Аминотрансферазы
- •Вопросы и ответы для самоподготовки:
- •1. Оксидоредуктазы, классификация, строение, биологическая роль.
- •2. Дегидрогеназы, представители, каталитическое действие, строение.
- •5.Убихинон (КоQ), химическая природа, формы существования, роль в биологическом окислении.
- •6. Цитохромы общая характеристика, роль.
- •7. ЦхВ, представители, строение, роль.
- •12. Гидроксилазы, понятие о строении, виды, каталитическое действие.
- •Занятие : энергетический обмен. Специфические пути катаболизма. Цикл трикарбоновых кислот. Вопросы и ответы для самоподготовки:
- •1. Стадии энергетического обмена:
- •Занятие: «энергетический обмен. Биологическое окисление. Окислительное фосфорилирование. Типы окисления» Вопросы и ответы для самоподготовки
- •1.Этапы биологического окисления; ферменты, участвующие в переносе водородов и электронов.
- •2.Освобождение энергии при биологическом окислении. Отчего зависит последовательность ферментов в цепи бо?
- •3. IV стадия энергетического обмена. Окислительное фосфорилирование (оф), сущность, значение.
- •4. Регуляция цепи переноса электронов. Дыхательный контроль.
- •5. Разобщение тканевого дыхания и окислительного фоcфорилирования.
- •7. Оксидазное окисление, значение, ферменты, участвующие в этом процессе, конечные продукты.
- •Упражнения и ситуационные задачи для самконтроля
- •Витамины. Ориентировочная схема изучения
- •Вопросы и ответы для самоподготовки:
- •Витамины. Понятие. Механизмы действия.
- •Номенклатура и классификация витаминов. Распространение в природе. Суточная потребность.
- •Перечислите водорастворимые витамины
- •4. Перечислите жирорастворимые витамины
- •5.Понятие о гиповитаминозах, авитаминозах, полиавитаминозах. Гипервитаминозы. Витамеры. Провитамины. Антивитамины.
- •6.Витамины в1, в2, рр, в6, Вс, в12, н, с, р. Их химическая природа, биологическое значение, авитаминозы, распространение в природе, суточная потребность.
- •Рибофлавин, витамин в2, витамин роста Химическая природа:
- •Занятие: «жирорастворимые витамины. Витаминоподобные вещества» Вопросы и ответы для самоподготовки:
- •2. Витамин д, витамеры, понятие о химической природе, обменно-активная форма витамина д, биологическое действие, авитаминоз, гипервитаминоз суточная потребность, распространение в природе.
- •4. Витамин к (нафтохиноны, антигеморрагический витамин), химическая природа, биологическая функция, авитаминоз, распространение в природе.
- •Витамины – лекарственные вещества.
- •Упражнения и ситуационные задания для самоподготовки
12. Гидроксилазы, понятие о строении, виды, каталитическое действие.
Гидроксилазы играют важную роль в обмене стероидов, ксенобиотиков и других циклических соединений. Это двукомпонентные ферменты, в состав кофермента входит вит.С – аскорбиновая кислота. Гидроксилазы делятся на диоксигеназы: включают в субстрат молекулярный кислород, активируя его за счет электрона атома железа в активном центре; и монооксигеназы требуют участия в реакции НАДФН2:
субстрат + О2 субстрат-ОН +Н2О.
Гидроксилазы также участвуют в образовании холестерина и адреналина. Эти ферментысодержатся в цитоплазме, в мембране ЭПР, митохондрий и микросом.
Упражнения и ситуационные задачи
1.Дописать формулу, назвать вещество. Коферментом какого фермента является данное соединение?
2. Расставить двойные связи в приведенном соединении. Дать его название и указать, коферментом каких ферметов оно является?
3. В состав, какого цитохрома входит гем, похожий на гем гемоглобина. Дать рациональное название. Написать его формулу.
4.Чем отличаются цитохромы группы А друг от друга?
5. Чем отличается цитохром а от цитохрома с?
6. Роль КоQ в переносе Н+ и электронов.
7. Написать кофермент СДГ.
8. Написать гем цитохрома С1 .
9. Атом водорода на КоQ расщепился на Н+ и электрон.Чем это объяснить?
10. Биологическая роль Цха в переносе электронов от Цхс к Цха3. Почему невозможен обратный перенос?
11. Н2О2 может разрушаться с образованием Н2О и О2 или с образованием Н2О и [О]. Какие ферменты ускоряют ту или иную из названных реакций?
12. Как называется реакция? Какой фермент ускоряет эту реакцию?
13. К раствору янтарной кислоты и трифенилтетразолия добавили гомогенат печени, поместив пробирку на 30 минут в оптимальные условия. Раствор окрасился в красный цвет.
а) Что произошло в пробирке?
б) Произойдет ли реакция, если в пробирке будет отсутствовать янтарная кислота? Какую роль играет в этих условиях янтарная кислота?
14. В две пробирки добавили раствор янтарной кислоты и трифенилтетразолия.
Затем в первую пробирку добавили гомогенат печени, во - вторую- гомогенат мышц. Через 30 минут пробирки извлекли из термостата (температура 37оС).
Раствор в первой пробирке окрашен интенсивнее. Что доказывает эта реакция?
15. В пробирку добавили раствор гидрохинона, Н2О2 и вытяжку из хрена, во второй пробирке - все те же реактивы, за исключением Н2О2. В какой из пробирок гидрохинон окислится? Почему? Какой фермент содержится в вытяжке из хрена?
Занятие : энергетический обмен. Специфические пути катаболизма. Цикл трикарбоновых кислот. Вопросы и ответы для самоподготовки:
1. Стадии энергетического обмена:
а) I стадия – специфические пути катаболизма
В превращениях основных питательных веществ ключевым промежуточным соединением является ацетил КоА - активная уксусная кислота. В аэробных условиях ацетил-КоА образуется из глюкозы при окислительном декарбоксилировании пировиноградной кислоты; из липидов при β-окислении СЖК и из глицерина при его окислении;
из 18 аминокислот через промежуточные соединения; пируват (ала, гли, сер, цис, тре), α-кетоглутарат и оксалоацетат (асп, глу, фен, тир, тис, арг, мет, про, вал), ацетоацетил-КоА (лей, лиз, фен, тир, три).
Центральная роль ацетил-КоА определяется тем, что, являясь продуктом катаболизма углеводов, липидов, большинства аминокислот, он может быть окислен в цикле трикарбоновых кислот (ЦТК).
б) II стадия – ЦТК. Сущность, значение. Реакции и ферменты, участвующие в ЦТК.
ЦТК представляет собой 2 этап энергетического обмена и является началом общего катаболического пути для всех классов органических соединений. Суммарное уравнение ЦТК:
ЦТК
АцетилКоА 2 СО2 + 3НАД→ 3НАДН2 + ФП → ФПН2 + АТФ
Функции ЦТК-
1. ЦТК является амфиболическим циклом. Это означает, что в ЦТК происходят анаболические и катаболические процессы.
Анаболические процессы в ЦТК — путь для синтеза предшественников многих молекул. Эту функцию ЦТК можно назвать пластической. Например, из α-кетоглутарата при переаминировании с аланином можно получить аминокислоту глутамат и пируват, а из оксалоацетата в такой же реакции с аланином получается аспартат. Сукцинил-КоА можно использовать на синтез гема гемоглобина, миоглобина, цитохромов, каталазы и пероксидазы.
Лимонная кислота может быть использована на синтез свободных жирных кислот. Катаболические процессы в ЦТК обеспечивают расщепление двууглеродных ацетильных остатков углеводов, жирных кислот и аминокислот.
2. ЦТК является важным компонентом клеточного дыхания и системы захвата и переработки энергии аэробными клетками. В этом цикле «сгорают» активные уксусные кислоты, т.е. это единственный путь окисления АУК в клетке. ЦТК считают началом общего пути для окончательного окисления всех метаболических соединений — источников энергии, таких как углеводы, свободные жирные кислоты, кетоновые тела, аминокислоты. Указанные соединения конкурируют за кофермент А (КоА), НАД+ и ФАД+.
3. В ЦТК образуются восстановленные дегидрогеназы, которые в дальнейшем используются в цепи биологичсеского окисления. ЦТК, таким образом, можно считать процессом, поставляющим в БО восстановленные эквиваленты (ДГН2)
4. Так как цикл Кребса является местом перекреста всех обменов веществ, за счет этого может происходит взаимосвязь метаболизмов всех веществ.
Реакции цикла трикарбоновых кислот
1 реакция ЦТК начинается с образования цитрата путем конденсации оксалоацетата с ацетилКоА .
2 реакция. Цитрат превращается в цис-аконитат в следующей реакции с участием аконитазы, при этом происходит дегидратация цитрата:
3 реакция. Цис-аконитовая кислота под действием соответствующей гидратазы превращается в изоцитрат за счет присоединения воды.
При исчезновении изоцитрата на следующем этапе ЦТК данная реакция сдвигается вправо.
4 реакция. Под действием ИДГ (изоцитратдегидрогеназы) изолимонная кислота окисляется в оксалосукцинат. Данная реакция — первая из четырех окислительно-восстановительных реакций ЦТК. В процессе этой дегидро-геназной реакции происходит образование первой из трех молекул НАДН2, синтезируемых в ЦТК.
5 реакция. Щавелевоянтарная кислота подвергается декарбоксилированию (фермент оксалосукцинатдекарбоксилаза), в результате образуется α-кетоглутаровая кислота.
6 реакция. Вторая окислительно-восстановительная реакция ЦТК катализируется α-кетоглутаратдегидрогеназным комплексом - в ней происходит выход двуокиси углерода СО2, образование второй из трех молекул НАДН2, синтезируемых в ЦТК.
7 реакция. СукцинилКоА превращается в сукцинат сукцинил-КоА-синтетазой, сохраняя высокоэнергетическую связь тиоэфирной группы путем фосфолирования на уровне субстрата и превращения гуанозиндифосфата (ГДФ) в ГТФ.
ГТФ, образуемый в процессе реакции, превращается в АТФ с помощью нуклеозиддифосфаткиназы:
8 реакция, катализируемая сукцинатдегидрогеназой (СДГ), является третьей окислительно-восстановительной реакцией ЦТК и сопровождается образованием ФПН2. Это единственный этап ЦТК, где образуется ФПН2.
Сукцинатдегидрогеназа ингибируется малонатом (—ООС—СН2—СОО~), а также оксалоацетатом. Фермент активируется с помощью АТФ, неорганического фосфора и сукцината. Сукцинатдегидрогеназа относится к флавинферментам с Ко – ФАД.
9 реакция. Фумаратгидратаза катализирует обратимую гидратацию фумарата с образованием L-малата.
10 реакция. Заключительный этап ЦТК катализируется малатдегидрогеназой и является четвертой окислительно-восстановительной реакцией, здесь образуется третья молекула НАДН2.
Упражнения и ситуационные задачи для самоконтроля
Может ли работать ЦТК в бескислородных условиях? Почему?
Написать реакцию окислительного декарбоксилирования а-кетоглутаровой кислоты, использование указанной реакции?
Роль щавелевоуксусной кислоты в ЦТК.
Написать реакцию окисления янтарной кислоты. Какой фермент участвует в этой реакции?
5.В клетке создались анаэробные условия. Что происходит с реакциями ЦТК? Почему?
6.При окислительном декарбоксилировании а-кетоглутаровой кислоты образуется сукцинил-КоА. Какие ферменты ускоряют эту реакцию? Какая кетокислота подвергается превращениям по такой же схеме?
7.Известно, что в ЦТК восстанавливаются 3 молекулы НАД. Укажите участки ЦТК, где это происходит.
