- •Методические указания по микробиологической диагностике заболеваний, вызываемых энтеробактериями
- •1. Классификация и номенклатура энтеробактерий
- •2. Бактериологическая диагностика
- •2.1. Материал для исследования
- •2.2. Посев материала и выделение чистой культуры
- •2.3. Идентификация энтеробактерий
- •2.3.1. Первичная идентификация
- •2.3.2. Дифференциация родов
- •2.3.3. Идентификация видов и внутривидовая дифференциация
- •2.3.4. Ускоренная идентификация и выявление антигенов
- •2.3.4.1. Системы индикаторные бумажные (сиб)
- •2.3.4.2. Метод иммунофлуоресценции
- •2.4. Формулировка ответов, сроки выдачи
- •3.1. Консерванты
- •3.3. Среды для первичных посевов материала
- •3.4. Среды для первичной идентификации
- •3.5. Среды для биохимической дифференциации
- •3.6. Полужидкий агар для определения подвижности
- •3.7. Среды и реактивы для дифференциации энтеробактерий
- •4. Определение эпидемиологических маркеров
- •4.1. Определение сероваров у некоторых условно-патогенных
- •4.2. Определение биоваров
- •4.3. Фаготипирование
- •4.5. Типирование шигелл по чувствительности к колицинам
- •4.6. Другие методы типирования
- •5. Серологическая диагностика заболеваний
- •5.1. Рпга в диагностике брюшного тифа,
- •5.2. Реакция агглютинации с бактериальными диагностикумами
- •5.3. Реакция агглютинации с аутоштаммами в диагностике
1. Классификация и номенклатура энтеробактерий
В настоящее время определение таксономических категорий в бактериологии основано на сочетании морфологических, тинкториальных, биохимических, генетических и других биологических характеристик.
Классификация и номенклатура энтеробактерий в данных "Методических указаниях" приняты в соответствии с широко известным 8-м изданием Bergey's Manual (1974) <*>.
--------------------------------
<*> На русском языке издан его сокращенный вариант - Краткий определитель бактерий Берги (1980).
С целью унификации и правильности написания названий бактерий Международным кодексом номенклатуры бактерий (1975) сформулированы определенные правила. В частности, наименование бактерий следует писать только по-латыни, при этом род - с заглавной буквы, а видовой эпитет - со строчной. Например: Salmonella typhi, или сокращенно S. typhi. Рекомендовано также при внутривидовой дифференциации употреблять термины фаговар вместо фаготип, серовар вместо серотип и т.д.
Семейство Enterobacteriaceae объединяет обширную группу грамотрицательных палочек, подвижных или неподвижных, образующих или не образующих капсулы, некислотоустойчивых, не образующих спор, аэробов или факультативных анаэробов. Они образуют кислоту при ферментации глюкозы, цитохромоксидазоотрицательны, восстанавливают нитраты до нитритов (кроме некоторых штаммов Erwinia). Характеристики отдельных родов и видов приведены далее.
В таблице 1 представлены основные таксономические категории и номенклатура энтеробактерий.
Таблица 1
КЛАССИФИКАЦИЯ СЕМЕЙСТВА ENTEROBACTERIACEAE
(ПО BERGEY'S MANUAL OF DETERMINATIVE BACTERIOLOGY, 1974)
┌─────────────┬─────────────────┬────┬────────────────────────┬─────────────┐
│ Т. лба │ Род │Под-│ Вид (серовар) │ Группа │
│ │ │род │ │ (особое │
│ │ │ │ │обозначение) │
├─────────────┼─────────────────┼────┼────────────────────────┼─────────────┤
│I. │I. Escherichieae │ │1. E. coli │ │
│Escherichieae│II. Edwardsiella │ │1. E. tarda │ │
│ │III. Citrobacter │ │1. C. freundii │ │
│ │ │ │2. C. intermedius │ │
│ │IV. Salmonella │I │ │ │
│ │ │II │ │ │
│ │ │III │ │ │
│ │ │IV │ │ │
│ │V. Shigella │ │1. B. dysenteriae │ │
│ │ │ │2. B. flexneri │ │
│ │ │ │3. S. boydii │ │
│ │ │ │4. S. sonnei │ │
├─────────────┼─────────────────┼────┼────────────────────────┼─────────────┤
│II. │VI. Klebsiella │ │1. K. pneumoniae │ │
│Klebsielleae │ │ │2. K. ozaenae │ │
│ │ │ │3. K. rhinoscleromatia │ │
│ │VII. Enterobacter│ │1. E. cloacae │ │
│ │ │ │2. E. aerogenas │ │
│ │VIII. Hafnia │ │1. H. alvei │ │
│ │IX. Serratia │ │1. S. maroescens │ │
├─────────────┼─────────────────┼────┼────────────────────────┼─────────────┤
│III. Protoeae│X. Proteus │ │1. P. vulgaris │ │
│ │ │ │2. P. mirabilis │ │
│ │ │ │3. P. morganii │ │
│ │ │ │4. P. rettgari │ │
│ │ │ │5. P. inconstans │ │
│ │ │ │(Providencia) │ │
├─────────────┼─────────────────┼────┼────────────────────────┼─────────────┤
│IV. │XI. Yersinia │ │1. Y. pestis │ │
│Yersiuieae │ │ │2. Y. pseudotuberculosis│ │
│ │ │ │3. Y. enterocolitica │ │
├─────────────┼─────────────────┼────┼────────────────────────┼─────────────┤
│V. Erwinieae │XII. Erwinia │ │ │1. Axylovora │
│ │ │ │ │2. Herbicola │
│ │ │ │ │3. Carotovora│
└─────────────┴─────────────────┴────┴────────────────────────┴─────────────┘
Классификация семейства Enterobateriaceae, предложенная Юингом (W. Ewing, 1967 - 1972) и имеющая признание до настоящего времени, по некоторым позициям расходится с Определителем бактерий Берги. Поэтому считаем необходимым указать на наиболее существенные расхождения.
Тек, в Определителе Берги не упоминается Klebsiella oxytoca, фактически представляющая биовар K. pneumoniae, отличающийся по тестам на индол и желатин. В классификации Юинга K. oxytoca рассматривают как самостоятельный вид. В роду Serratia по Берги имеется единственный вид - S. maroescens, а Юингом в этот род включены еще два вида: S. liquefaciens и позднее S. rubideae. У Берги имеется вид Proteus inconstans, по Юингу это род Providencia. В Определителе Берги в род Citrobacter включены два вида: C. freundii и C. intermedius. У Юинга имеется третий вид - C. diversus, который является биоваром C. intermedius.
Эти сопоставления приведены лишь для справок, так как в "Методических указаниях..." принята классификация по Берги.
