Информационно-схематичный материал Репарация днк

1. BER – путь, репарация АР-сайтов.

2. Репарация по пути NER в молчащих областях генома (global genom repair).

3. MMR – путь эксцизионной репарации.

4. Рекомбинантная репарация.

5. Транскрипционная репарация.

Рекомбинация днк

1. Модель полухиазмы Холлидея.

2. Три рекомбинационные реакции, осуществляемые белком RecA.

3. Схема рекомбинации с участием RecBCD-нуклеазы.

4. Схема сайт-специфической рекомбинации фага лямбда.

5. Схема сайт-специфической инверсии сегмента G в ДНК фага Mu.

6. Структурная организация некоторых подвижных элементов.

7. Молекулярные механизмы транспозиции на примере транспозона.

8. Молекулярные механизмы транспозиции на примере ретротранспозона.

9. Общие представления о конверсии гена.

10. Эктопическая конверсия гена.

Лабораторное занятие № 7

«Геном»

«Биосинтез белка и его регуляция»

Контрольные вопросы.

1. История формирования понятия ген. Общая схема организации генома эукариот. Структурно-функциональная организация геномов эукариот.

2. Характеристика генома – мало генов много белков, большая доля некодирующей ДНК и повторяющихся последовательностей.

3. Блочно-иерархическая модель организации генома – базальный, более высокий, высший уровень. Классификация регуляторных районов

4. Регуляция активности генов – посттрансляционные модификации аминокислот, позиционирование нуклеосом, конкурентное связывание TF и гистонов с ДНК, метилирование ДНК (родительский геномный импринтинг, волны метилирования, возникновение метилирования, метилирование и рак, инактивация Х-хромосом млекопитающих), активация гена или изменение его активности при внедрении МГЭ, способность МГЭ изменять границы оберегающие ген от воздействия окружающей ДНК.

5. МГЭ в геноме. Молекулярные механизмы перемещения транспозонов и ретротранспозонов. Роль ретротранспозонов в сохранении теломерных концов хромосом и залечивание двунитевых разрывов ДНК Роль МГЭ в перестройках хромосом. Горизонтальный перенос генов и эволюция генома.

6. Геном человека и биология XXI века – геномика, ее перспективы. Протеомика.

Биосинтез белка

7. Общая характеристика. Транскрипция – инициация: строение промотора класса II, регуляция инициации транскрипции, ремонтаж нуклеосом. Элонгация. Терминация. Формирование а.а.тРНК – комплекса.

8. Трансляция общая характеристика и аппарат трансляции. Инициация – факторы инициации (eIF 1, 2, 3, 4, 5, 6) и их роль; подготовка рибосом, мРНК и а.а.тРНК к трансляции.

9. Образование инициирующего комплекса и его соединение с мРНК. Поиск стартового кодона – два пути у эу- и прокариот (сканирующая модель М. Козак – терминальная инициация и внутренняя инициация), влияние контекста, рамка считывания, формирование на мРНК 80S рибосомы.

10. Декодирующая функция малой и энзиматическая функция большой субъединицы.

11. Элонгация – модель элонгационного цикла («смыкание-размыкание»), этапы элонгации – формирование кодон-антикодонового взаимодействия в А-участке рибосомы, пептизация, транслокация, терминация.