
- •Лекция 1 Становление геномики как самостоятельного раздела молекулярной генетики
- •Лекция 2 Геномика вирусов и фагов. Вирусы как объект молекулярной генетики.
- •4. Взаимодействие вируса и клетки
- •5. Размножение вирусов и фагов. Лизогенный и литический путь
- •6. Устойчивость вирусов к факторам окружающей среды
- •Репликация генома и экспрессия генов вирусов
- •Вирусы I группы Балтимора (двухцепочечная днк)
- •Вирусы II группы Балтимора (одноцепочечная днк)
- •Вирусы III группы Балтимора (Двуцепочечная рнк)
- •Вирусы V группы Балтимора (одноцепочечная (-) рнк)
- •Вирусы VII группы Балтимора (двухцепочечная днк)
- •Характеристика вирусных геномов
- •1. Фаг (колифаг) λ лямбда
- •2. Фаг φХ174 (фи-десять 174)
- •4. Вирус sv-40
- •5. Аденовирусы
- •6. Герпесвирусы
- •7. Поксвирусы
- •8. Ретровирусы
- •9. Вирусоподобные инфекционные агенты
- •Сателлиты (вирусы-сателлиты)
- •Вироиды
- •Заключение
- •Лекция 3 Геномика прокариот
- •Прокариоты как объект молекулярно-генетических исследований
- •Структурная геномика прокариот
- •1. Размеры, нуклеотидный состав геномов и оперонная организация генов прокариот
- •2. Структуры репликации, выявление orf, интроны и интеины
- •3. Паралогичные и ортологичные гены. Сравнение геномов. Минимальный размер генома прокариот
- •Геномы прокариот в процессе функционирования и эволюции
- •1. Амплификация участков генома
- •2. Перестройки генома
- •3. Консервативная и оперативная части генома
- •4. Горизонтальный перенос генов (гпг)
- •5. Попытки установления филогенетического древа
- •Характеристика геномов прокариот
- •1. Haemophilus influenzae (возбудитель менингита, пневмонии)
- •2. Кишечная палочка Escherichia coli
- •3. Сенная палочка Bacillus subtilis
- •4. Актиномицеты рода Streptomyces
- •Заключение
- •Лекция 4 Геномика эукариот
- •Геном пекарских дрожжей Saccharomyces cerevisiae
- •Геном нематоды Caenorhabditis elegans
- •Геном плодовой мухи Drosophila melanogaster
- •Особенности исследований геномов высших растений
- •Геном резуховидки (арабидопсиса) Arabidopsis thalianа
- •Геном риса посевного Oryza sativa l.
- •Геном домовой мыши Mus musculus l.
- •Лекция 5 Геном человека
- •Программа «Геном человека»: цели и методы
- •Создание генетической карты генома
- •Создание физической карты генома
- •Секвенирование полного генома человека
- •«Черновой» (первый) вариант генома человека
- •Лекция 6 Разделы геномики
- •1. Структурная (описательная) геномика
- •Функциональная геномика и биоинформатика
- •Сравнительная (эволюционная) геномика
- •4. Экологическая геномика
- •5. Метагеномика
6. Устойчивость вирусов к факторам окружающей среды
Вирусы животных вне клетки-хозяина инактивируются, однако наблюдаются большие различия у разных форм. Вирус полиомиэлита сохраняет жизнеспособность в сточных водах в течение недель. Большинство вирусов погибает при пастеризации за несколько минут. В то же время вирус гомологичной сывороточной желтухи сохраняется после кипячения. Вирус табачной мозаики годами сохраняются в высушенных тканях растений.
Многие вирусы устойчивы к низким температурам и остаются живыми при -76°С в течение года. Хранят вирусы в твердой углекислоте. Облучение ультрафиолетом приводит к быстрому разрушению всех вирусов, так как нуклеиновые кислоты очень чувствительны к действию лучей. Фаги не обезвреживаются в малых концентрациях дезинфицирующих веществ, они резистентны к антибиотикам, хлороформу и ферментным ядам. Исследование вирусов имело огромное значение для возникновения и развития молекулярной генетики. За заслуги в области изучения лизогении французский микробиолог и вирусолог Андре Мишель Львов удостоин Нобелевской премии в 1965 г. За исключительные заслуги в деле изучения фагов три патриарха молекулярной генетики — Макс Дельбрюк, Альфред Д. Херши и Сальвадор Э. Лурия — удостоены Нобелевской премии в 1969 г.
Репликация генома и экспрессия генов вирусов
Геном вирусов внутри вирионов может быть представлен ДНК или РНК. которые могут быть одно- и двуцепочечными, кольцевой или линейной формы.
Размер и сложность строения генома вирусов разных групп варьируют в широком диапазоне — от наличия 4 генов у РНК-содержащего фага Q β До 250 генов у ДНК-содержащего вируса оспы. Геном вирусов может состоять из одной или нескольких молекул нуклеиновой кислоты. Двуцепочечная РНК реовирусов состоит из 10 молекул (или сегментов), а геном вирусов с одноцепочечной РНК может быть цельным (ретровирус) или сегментированным (вирус гриппа). Геномы ДНК-содержащих вирусов позвоночных состоят из одной линейной или кольцевой молекулы ДНК, с наличием одной или двух цепочек. Геном вируса гепатита В представляет собой кольцевую молекулу двуцепочечной ДНК, тогда как геномы вируса гепатитов А и С состоят из однонитевых РНК с положительной полярностью (+) РНК.
В настоящее время разработана «Классификационная система Балтимора», в которой учитывается два параметра — тип находящейся в вирионе нуклеиновой кислоты, а также стратегия ее репликации в клетке хозяине.
Все вирусы РНК разделяются на две группы по полярности ее молекулы — позитивные и негативные. Позитивные РНК обозначаемые как (+РНК), способны в клетке-хозяине транслироваться рибосомами, т. е. выполнять функцию мРНК. Геном с негативной РНК, обозначаемый как (-РНК), не способен выполнять функцию мРНК, а РНК этого типа служит матрицей для синтеза мРНК.
Репликация дочерних вирусных геномов после проникновения вируса в клетку, а также их транскрипция и трансляция (синтез собственных белков) имеет ряд особенностей:
во-первых, в клеточном ядре и цитоплазме отсутствуют ферменты, необходимые для транскрипции вирусных ДНК-геномов, т. е. для синтеза м-РНК на вирусных РНК. В цитоплазме также нет ферментов, которые способны транскрибировать вирусную ДНК. Поэтому ДНК-содержащие вирусы могут проникать в ядро клетки и использовать хозяина для считывания вирусных мРНК. Все остальные вирусы способны создавать собственные ферменты для синтеза мРНК;
во-вторых, белоксинтезирующий аппарат эукариот может транслировать только моноцистронные мРНК, а внутри полицистронных молекул мРНК не распознает инициации. Вирусы же способны синтезировать моноцистронные мРНК, а также мРНК для кодирования большого полипротеина, который затем расщепляется на отдельные белки.
По способам осуществления репликации, транскрипции и трансляции все вирусы разделяются на семь групп Балтимора.