Вопрос 2. Понятие и классификация вирусов. (см 21 и 22 билет)

Ви́рус (от лат. virus — яд; мн.ч. vira) — микроскопическая частица, состоящая из белков и нуклеиновых кислот и способная инфицировать клетки живых организмов. Вирусы являются облигатными паразитами — они не способны размножаться вне клетки. В настоящее время известны вирусы, размножающиеся в клетках растений, животных, грибов и бактерий (последних обычно называют бактериофагами). Вирусы представляют собой молекулы нуклеиновых кислот (ДНК или РНК), заключённые в защитную белковую оболочку (капсид). Наличие капсида отличает вирусы от других инфекционных агентов, вироидов. Вирусы содержат только один тип нуклеиновой кислоты: либо ДНК , либо РНК.

Классификация

(тут я сделала две части. Одна – по википедии, другая- по цыпе цыпа идет во второй части. )

Систематику и таксономию вирусов кодифицирует и поддерживает Международный Комитет по Таксономии Вирусов.

Ictv классификация

Международным Комитетом по Таксономии Вирусов в 1966 году была принята система классификации вирусов основанная на различии типа (РНК и ДНК), количества молекул нуклеотических кислот (одно- и двухцепочечные) и на наличии или отсутствии оболочки ядра. Система классификации представляет собой серию иерархичных таксонов:

Отряд (-virales)

Семейство (-viridae)

Подсемейство (-virinae)

Род (-virus)

Вид (-virus)

Классификация Балтимора

Нобелевский лауреат, биолог Дэвид Балтимор, предложил свою схему классификации вирусов, основываясь на различиях в механизме продукции мРНК. Эта система включает в себя семь основных групп:

(I) Вирусы, содержащие двуцепочечную ДНК и не имеющие РНК-стадии (например, герпесвирусы, поксвирусы, паповавирусы, мимивирус).

(II) Вирусы, содержащие двуцепочечную РНК (например, ротавирусы).

(III) Вирусы, содержащие одноцепочечную молекулу ДНК (например, парвовирусы).

(IV) Вирусы, содержащие одноцепочечную молекулу РНК положительной полярности (например, пикорнавирусы, флавивирусы).

(V) Вирусы, содержащие одноцепочечную молекулу РНК негативной или двойной полярности (например, ортомиксовирусы, филовирусы).

(VI) Вирусы, содержащие одноцепочечную молекулу РНК и имеющие в своем жизненном цикле стадию синтеза ДНК на матрице РНК, ретровирусы (например, ВИЧ).

(VII) Вирусы, содержащие двуцепочечную ДНК и имеющие в своем жизненном цикле стадию синтеза ДНК на матрице РНК, ретроидные вирусы (например, вирус гепатита B).

В настоящее время, для классификации вирусов используются обе системы одновременно, как дополняющие друг друга.

Дальнейшее деление производится на основе таких признаков как структура генома (наличие сегментов, кольцевая или линейная молекула), генетическое сходство с другими вирусами, наличие липидной оболочки, таксономическая принадлежнось организма-хозяина и так далее.

Формальными таксонами в царстве Vira являются:

Порядок - состоит из семейств вирусов с очевидным общим эволюционным происхождением. Обозначается словами, оканчивающимися на — virales. Выделяют 3 порядка: Caudovirales (включает семейства Myoviridae, Syphoviridae,Podoviridae), Mononegavirales (с семействами Paramyxoviridae, Rhabdoviridae, Bornaviridae, Filoviridae), Nidovirales (с семействами Coronaviridae, Alteviridae). Другие вирусы не объединены в порядки в связи с отстутствием данных, позволяющих объединить их семейства в более высокий таксон.

Семейство (подсемейство) — объединяет роды, представители которых имеют один вид генома и сходную структурную организацию вирусной частицы. Семейства (подсемейства) вирусов обозначаются словами, оканчивающимися на — viridae (virinae).

Род — объединяет вирусы на основе стратегии генома, феномена генетических взаимоотношений, архитектуры вириона, круга восприимчивых хозяев, патогенности, географического распространения, способа передачи. Названия родов вирусов оканчиваются на — virus.

Вид — формально каждый отдельный вирус может быть определен как вид. Название начинается или оканчивается на слово — вирус.

Для характеристики вирусов разработана система обозначений (криптограмма), включающая следующие признаки: Антигенная группа — вид происхождения — место происхождения — обозначение штамма — год выделения — субтип антигена — генотип. Согласно этим признакам, например, ротавирус обезьян штамм SA11 описывается следующим образом — A/Si/S. Africa/SA11/58/GЗ Р2 [6] SI; вирус гриппа А, штамм Гонконг — A/SW/Goncong/Fort Warren/50/H1N2.

Билет №26