Химическая модификация аминогрупп в белках.

Подробно стр. 186 учебника Степанова, стр 161 учебника Овчинникова

Тип реакции	Реактив	А зачем?
Ацилирование	Ангидриды кислот	Необратимая модификация
	Цитраконовый альдегид	Обратимая модификация лизина для гидролиза трипсином только по остаткам Arg
Арилирование	2,4-динитрофтор-бензол	Замена гидрофильной аминокислоты на гидрофобную, введение флуоресцентной метки
Образование реактивов Шиффа с восстановлением	Альдегиды, NaBH4	Добавление функциональной группировки на ε-конец Lys
Реакция с имидоэфирами	Имидоэфиры CH3-O-C(=NH)-R	Введение гидрофобного заместителя или увеличение заряда в данной точке молекулы
Гуанидирование	H3C-O-C(=NH)-NH2	лизин -> гомоаргинин
Карбамоилирование	KN=C=O	Сиквенирование
Дансилирование	Дансил хлорид	Добавление флуоресцентной метки

Время жизни белков в цитозоле клетки. Шапероны Hsp90.

Время жизни белков – от минут (факторы транскрипции, циклины) до дней, пока их не уничтожит протеасома.

Hsp90 – шаперон, занимающийся фолдингом, противостоящий тепловому шоку и помогающий в деградации белков. Консервативен, найден в бактериях и эукариотах (нет в археях).

Белок содержит 4 структурных домена:

• Высококонсервативный N-концевой домен ~25 кДа. Содержит АТФ-связывающий карман;

• Линкер с большим количеством заряженных аминокислот;

• Средний домен ~40 кДа. Место связывания различных белков;

• С-концевой домен ~12 кДа. Альтернативный АТФ-связывающий карман.

В открытом состоянии (АТФ связан) Hsp90 снаружи содержит гидрофобные участки и неверно фолдированные белки прекрасно с ними связываются. После связывания происходит гидролиз АТФ, изменения конформации шаперона и «зажимание» нефолдированного белка. Если белок не развернулся правильно, то Hsp90 навешивает на него убиквитиновые метки.