- •28.1 Принципи регуляції генів
- •Ініціація транскрипції регулюється протеїнами які зв’язуються із промотором або поблизу нього
- •Багато генів прокаріот об’єднані в кластери і регулюються оперонами
- •Регуляторні протеїни мають спеціальні днк-зв’язуючі домени
- •Гелікс-поворот-гелікс
- •Гелікс-поворот-гелікс
- •Цинковий палець
- •Основний мотив гелікс-петля-гелікс
- •Поєднання субодиниць в регуляторних протеїнах еукаріот
- •Підсумок 28.1 Принципи регуляції генів
- •28.2 Регуляція експресії генів у прокаріот
- •Lac оперон здатний до позитивної регуляції
- •Спільний ефект глюкози і лактози на експресію lac оперона
- •Багато генів ензимів, що задіяні в біосинтезі амінокислот регулюються сповільненням транскрипції
- •Trp оперон
- •Індукція sos відповіді потребує утилізації репресорних протеїнів.
- •Синтез рибосомальних протеїнів скоординований із синтезом рРнк
- •Трансляційний зворотній зв’язок у деяких рибосомальних протеїнових оперонів
- •Регуляція обмеженням в e.Coli
- •Деякі гени регулюються завдяки генетичній рекомбінації
- •Підсумки 28.2 Регуляція експресії генів в еукаріот
- •Регуляція Експресії генів в еукаріот
- •Транскрипційно активний хроматин структурно відрізняється від інактивного хроматину
- •Ремоделювання хроматину ацетилюванням і нуклеосомальними перестановками
- •Багато еукаріотичних промоторів регулюється позитивно
- •Кофактори і трансактиватори, які зв’язуються із днк полегшують монтаж загальних транскрипційних факторів.
- •Еукаріотичні промотори і регуляторні протеїни
- •Комплекси протеїнів коактиваторів
- •Хореографія транскрипційної активації
- •Обернена активація транскрипції
- •Гени галактозного метаболізму в дріжджів регулюються і позитивно, і негативно
- •Регуляція транскрипції генів метаболізму галактози в дріжджів
- •Гени галактозного метаболізму у дріжджів
- •Комплекси протеїнів задіяних в активації транскрипції споріднених груп генів еукаріот
- •Експресія генів еукаріот може регулюватися міжклітинними і внутрішньоклітинними сигналами
- •Елементи відповіді на дію гормонів (евг) до яких приєднуються гормони стероїдного типу
- •Регуляція може відбуватися через фосфорилювання ядерних транскрипційних факторів
- •Посттранскрипційне мовчання гену опосередковується перешкоджанням рнк
- •Трансляційна регуляція еукаріотичної мРнк
- •Мовчання генів викликане рнк першкоджанням
- •Розвиток організму контролюється каскадом регуляторних протеїнів
- •Життєвий цикл плодової мушки Drosophila melanogaster.
- •Ранній розвиток дрозофіли
- •Розподіл продуктів материнських генів в яйці дрозофіли
- •Регуляторний цикл передної -задньої вісі в яйці дрозофіли.
- •Розподіл продукту гену fushi tarazu (ftz) в ранньому ембріоні дрозофіли
- •Гени сегментації
- •Гомеотичні гени
- •Підсумки 2.3 Регуляція експресії генів в еукаріот
- •Регуляція експресії генів в прокаріот
- •Регуляція експресії генів в еукаріот
- •Біохімія в мережі Інтернет
Біохімія в мережі Інтернет
12. ТАТА зв’язуючий протеїн і ТАТА рамка Для виявлення взаємодій між транскрипційними факторами і ДНК зайдіть в Протеїновий Банк Даних (Protein Data Bank, www.rcsb.org/pdb) і завантажте PDB файл 1TGH. Цей файл моделює взаємодії між людським ТАТА-зв’язуючим протеїном і сегментом подвійної спіралі ДНК. Використайте Noncovalent Bond Finder на сторінці Chime Resources (www.umass.edu/microbio/chime/) для виявлення ролі водневих зв’язків і гідрофобних взаємодій залучених у механізмі приєднання цього транскрипційного фактору до ТАТА рамки.
(а) Які з основ ДНК формуватимуть водневі зв’язки із протеїном? Які з них долучаться до специфічної ідентифікації ТАТА рамки цим протеїном? (Довжина водневого зв’язку між донором і акцептором водню становить від 25 до 33 нм).
(б ) Які із залишків амінокислот протеїну взаємодіятимуть із цими парами основ? Чому Ви так думаєте? Чи ці спостереження узгоджуються із інформацією представленою в тексті?
(в) Якою є послідовність нуклеотидів в цій моделі і яка ділянка ДНК розпізнається ТЗП?
(г) Чи змогли б Ви ідентифікувати будь-які гідрофобні взаємодії в цьому комплексі? (Гідрофобні взаємодії мають місце у випадку дистанції між атомами від 33 до 40 нм).