- •28.1 Принципи регуляції генів
- •Ініціація транскрипції регулюється протеїнами які зв’язуються із промотором або поблизу нього
- •Багато генів прокаріот об’єднані в кластери і регулюються оперонами
- •Регуляторні протеїни мають спеціальні днк-зв’язуючі домени
- •Гелікс-поворот-гелікс
- •Гелікс-поворот-гелікс
- •Цинковий палець
- •Основний мотив гелікс-петля-гелікс
- •Поєднання субодиниць в регуляторних протеїнах еукаріот
- •Підсумок 28.1 Принципи регуляції генів
- •28.2 Регуляція експресії генів у прокаріот
- •Lac оперон здатний до позитивної регуляції
- •Спільний ефект глюкози і лактози на експресію lac оперона
- •Багато генів ензимів, що задіяні в біосинтезі амінокислот регулюються сповільненням транскрипції
- •Trp оперон
- •Індукція sos відповіді потребує утилізації репресорних протеїнів.
- •Синтез рибосомальних протеїнів скоординований із синтезом рРнк
- •Трансляційний зворотній зв’язок у деяких рибосомальних протеїнових оперонів
- •Регуляція обмеженням в e.Coli
- •Деякі гени регулюються завдяки генетичній рекомбінації
- •Підсумки 28.2 Регуляція експресії генів в еукаріот
- •Регуляція Експресії генів в еукаріот
- •Транскрипційно активний хроматин структурно відрізняється від інактивного хроматину
- •Ремоделювання хроматину ацетилюванням і нуклеосомальними перестановками
- •Багато еукаріотичних промоторів регулюється позитивно
- •Кофактори і трансактиватори, які зв’язуються із днк полегшують монтаж загальних транскрипційних факторів.
- •Еукаріотичні промотори і регуляторні протеїни
- •Комплекси протеїнів коактиваторів
- •Хореографія транскрипційної активації
- •Обернена активація транскрипції
- •Гени галактозного метаболізму в дріжджів регулюються і позитивно, і негативно
- •Регуляція транскрипції генів метаболізму галактози в дріжджів
- •Гени галактозного метаболізму у дріжджів
- •Комплекси протеїнів задіяних в активації транскрипції споріднених груп генів еукаріот
- •Експресія генів еукаріот може регулюватися міжклітинними і внутрішньоклітинними сигналами
- •Елементи відповіді на дію гормонів (евг) до яких приєднуються гормони стероїдного типу
- •Регуляція може відбуватися через фосфорилювання ядерних транскрипційних факторів
- •Посттранскрипційне мовчання гену опосередковується перешкоджанням рнк
- •Трансляційна регуляція еукаріотичної мРнк
- •Мовчання генів викликане рнк першкоджанням
- •Розвиток організму контролюється каскадом регуляторних протеїнів
- •Життєвий цикл плодової мушки Drosophila melanogaster.
- •Ранній розвиток дрозофіли
- •Розподіл продуктів материнських генів в яйці дрозофіли
- •Регуляторний цикл передної -задньої вісі в яйці дрозофіли.
- •Розподіл продукту гену fushi tarazu (ftz) в ранньому ембріоні дрозофіли
- •Гени сегментації
- •Гомеотичні гени
- •Підсумки 2.3 Регуляція експресії генів в еукаріот
- •Регуляція експресії генів в прокаріот
- •Регуляція експресії генів в еукаріот
- •Біохімія в мережі Інтернет
Експресія генів еукаріот може регулюватися міжклітинними і внутрішньоклітинними сигналами
Ефекти стероїдних гормонів (як і тироїдних, і ретиноїдних гормонів, що мають подібні механізми дії) надають додаткові добре вивчені приклади модуляції еукаріотичних регуляторних протеїнів шляхом прямої взаємодії з молекулярними сигналами (див.Рс.12-40). На відміну від гормонів інших видів, стероїдні гормони не зв’язуються із плазматичними мембранними рецепторами. Замість цього вони взаємодіють із внутрішньоклітинними рецепторами які самі по собі є транскрипційними трансактиваторами. Стероїдні гормони які є надто гідрофобними для того, щоб легко розчинятися в крові (наприклад естроген, прогестерон чи кортизол) переносяться спеціальними протеїнами-перенощиками із місця їх виділення до місця їх дії (тканин-мішеней). В тканинах-мішенях гормони проходять через плазматичну мембрану шляхом простої дифузії і приєднується до специфічних рецепторних протеїнів в ядрі. Гормон-рецепторний комплекс зв’язується із високоспецифічними ділянками ДНК, що носять назву елементи відповіді на дію гормонів (ЕВГ) (Hormone response elements (HREs), англ), і змінює експресію генів. Приєднання гормону призводить до конформаційних змін рецепторних протеїнів, уможливлюючи їх взаємодію із додатковими транскрипційними факторами. Приєднаний гормон-рецепторний комплекс може або прискорювати, або сповільнювати експресію суміжних генів. ЕВГ послідовності ДНК до яких приєднується гормон-рецепторні комплекси є однаковими за довжиною і впорядкуванням, але відрізняються послідовністю нуклеотидів у залежності від різних стероїдних гормонів. Кожен рецептор має консенсусну ЕВГ послідовність (Табл.28-4) до якої приєднується гормон-рецепторний комплекс, і яка складається із шести нуклеотидів. Ця послідовність може бути суміжною, або тандемом, розділеним трьома нуклеотидами, чи паліндромною. Гормональні рецептори мають висококонсервативні ДНК-зв’язуючі домени із двома цинковими пальцями (Рис.28-31). Гормон-рецепторний комплекс зв’язується із ДНК у виді димеру, завдяки приєданнню доменів цинковий палець на кожному із мономерів до однієї із шести нуклеотидних послідовностей. Здатність даного гормону діяти через гормон-рецепторний комплекс і змінювати експресію специфічних генів залежить від точної послідовності ЕВГ, його розташування і кількості ЕВГ асоційованих із цим геном.
Таблиця 28-4
Елементи відповіді на дію гормонів (евг) до яких приєднуються гормони стероїдного типу
Рецептор Консенсусна послідовність
Андроген |
ГГ(А/Т)АЦАН2ТГТТЦТ |
Глюкокортикоїд |
ГГТАЦАН3ТГТТЦТ |
Ретиноїдна кислота |
АГГТЦАН5АГГТЦА |
Вітамін D |
АГГТЦАН3АГГТЦА |
Тироїдний гормон |
АГГТЦАН3АГГТЦА |
RX* |
АГГТЦАНАГГТЦАНАГГТЦАНАГГТЦА |
Буквою Н пбудь-який нуклеотид
*Утворює димер із рецептором ретиноїдної кислоти чи рецептором вітаміну Д
На відміну від ДНК-зв’язуючого домену ділянка для зв’язування ліганду чи рецепторного протеїну завжди знаходиться в карбоксил-термінальному домені і є досить специфічною для відповідного рецептора. У ліганд-зв’язуючій ділянці глюкокортикоїдний рецептор має лише 30% -ну подібність до естрогенового рецептора і 17% -ну подібність із рецептором тироїдного гормону. Розмір ліганд-зв’язуючої ділянки може змінюватися драматично; наприклад, рецептор вітаміну Д має лише 25 амінокислотних залишки, а рецептор металокортикоїдів - 603 залишки амінокислот. Мутації, що призводять до зміни однієї амінокислоти в цій ділянці можуть викликати втрату відповіді до специфічного гормону. Деяким людям, що не реагують на дію кортизолу, тестостерону, вітаміну Д чи тироксину притаманні мутації такого типу.
