
- •Билет 2
- •Билет№3
- •1) В природе существуют как простые, так и сложные ферменты. Первые целиком представлены полипептидными цепями и при гидролизе распадаются исключительно на аминокислоты. Большинство
- •1. Конкурентное ингибирование
- •II комплекс цепи тканевого дыхания – сукцинат-убихинон-оксидоредуктаза.
- •Билет 10
- •1. Регуляции активности ферментов:
- •Билет № 36
Билет 1
1) Ферменты – высокоспец. Белки ке ускоряют хим. реакции в организме.
Альфа Амилаза учасивует при гидролизе крахмала и гликогена
Сахараза при гидролизе сахарозы
Каталаза – катализирует расщепление перекиси водорода и препятствует их накоплении в организме.
2)график от скорости.
С повышением t до определенного уровня (оптимум) скорость хим. Реакции увеличивается. Дальнейшие увеличение t приводит к денатурации фермента и тем самым скорость хим реакции уменьшиться.
3)
Кофермент Q жирораастворимый хинон.
Ф-ия перенос электронов между комплексами 13 34
Класс флавинзависимая дегидрогеназа.
4)Альфа амилазы слюны относит к гидрогеназам.
Спец.субстратам для амилазы является полисахариды (крахмал,гликоген).При гидролизе крахмала с амилазой слюны образ. несколько промежуточных продуктов,а конечные продукты как мальтоза и глюкоза дают пробу Троммера.
А сахароза в гидрорлизе с амилазой ,конечные продукты не дают пробу Троммера.Поэтому с помощью пробы Троммера можно выявить произошел ли гидролиз сахарозы.В нашем случае нет.И тем самым можно сказать,что сахароза не является спец.субстратов для амилазы.
5) НАДН + Н + Q === HAД + QH2
Н +2е
3+ комплекс 3 + 2+
QH2 + 2e (Fe) ===== Q +2 H +2 e (Fe )
2+ комплекс 4 3+ 4-
4 e (Fe ) +Q == 4e (Fe ) + О2
_ цитохром
_ оксидаза
О2 + 4 е +4 Н ==== 2 H2O
Комплекс 1 НАДН дегидрогеназа Ф-ует QH2 редуктаза
Комплекс 3 Цитохромы в и с1 Ф-ует QH2 дегидрогеназа
Комплекс 4 Цитохромы а и а3 Ф-ует цитохромоксидаза
Комплекс 2 Сукцинатдегидрогеназа.
Пункты сопряжения.
Комплекс1 комплекс 3 комплекс 4
ФМН FeS цит б FeS цит с3 цит а цит а3
АДФ + Р АТФ АДФ + Р АТФ АДФ + Р АТФ
Местосопряжения 1 Местосопряжения2 Местосопряжения3
Билет 2
1)Отличие: Ферменты обладают высокой специфичностью.
-ферментативная реакция происходит при t 37 постоянном атмосферным давлением и физиологическом значении.
-Скор фермент. ре-ции выше чем у неорганических катализаторов.
Особенности при t инак
- при гидролизе распад на АК как и белки.
- Синтез из АК по ген.коду искусственных белков ,обладающих каталитическими свойствами ,присущими натуральным ферментам.
Скор реакции зависит от t pH среды.
Ск реакции ферментов опред изменением кол-ва субстрата или продукта за ед.времени.
Ск ферментативной реакции зависит от кат-й акт-и фер
2) Зависимость V от кол. фермента.
3)НАДН (измен в бенз. Кольцо) в книге есть.(308)
Функционирует как КоQ редуктаза
Способность промежуточного переносчика ионов водорода (Н) за счет амидоникотиновый кислоты ,(происходит обратимое гидрирование.)
4)Заболевание диагнос-я по измен активности фер-в.
Синдром Катахара- недостаток или отсутствие каталазы.
Хронический панкреатит-снижение ур-ня панкреатической липазы.
Рахит-повышение щелочной фосфатазы.
Заболевание моче выдел.системы (уреаза)
5)Биол-е Окис.- распад орган веществ в живых тканях сопровож-ся потреблением О2и выделением СО2 и Н2О и образ биологических видов энергии.
-В живой природе протекает при низкой t и с участием воды.
-Окисляется глюкоза в живых клетках (внутренний мембране митохондрии) и основная F энергетическое обеспечение метоболизма.
-окислительное фосфолирование -один из важнейших компонентов клеточного дыхания, приводящего к получению энергии в виде АТФ из АДФ с Н3РО4.
НАДН + Н + Q === HAД + QH2
Н +2е
3+ комплекс 3 + 2+
QH2 + 2e (Fe) ===== Q +2 H +2 e (Fe )
_ 2+ комплекс 4 _ 3+ 4-
4 e (Fe ) +Q == 4e (Fe ) + О2
_ цитохром
_ оксидаза
О2 + 4 е +4 Н ==== 2 H2O
Комплекс 1 НАДН дегидрогеназа Ф-ует QH2 редуктаза
Ком 3 Цитохромы в и с1 Ф-ует QH2 дегидрогеназа
Ком 4 Цитохромы а и а3 Ф-ует цитохромоксидаза
Ком 2 Сукцинатдегидрогеназа.
Билет№3
1)Классификация ферментов
1. Оксидоредуктазы, катализирующие овр
: аэробные и анаэроб дегидрогеназы, цитохромы, каталаза и пероксидаза;
2. Трансферазы, катализир-е реакции межмолекулярного переноса
различных химических групп и остатков: метил- и формилтрансферазы, ацетилтрансферазы, амино-, фосфотрансферазы.
3. Гидролазы, катал-е реакции гидролиза внутри-
молекулярных связей:эстеразы, гликозидазы, фосфатазы и пептидогидролазы.
4. Лиазы (синтазы), катализ-ерасщепление или образование
связи без участия окисления или гидролиза: фумарат-гидратаза, карбокси-лиазы, амидин-лиазы.
5. Изомеразы, катализ-е реакции изомеризации:рацемазы,эпимеразывнутримол-ные оксидоредуктазы и трансеразы.
6. Лигазы (синтетазы), катализирующие реакции присоединения,
сопряженные с разрывом макроэргической связи в АТФ или ГТФ, ЦТФ, УТФ,
ТТФ:L-глутамат, аммиак лигаза.
Амилаза и сахараза – класс гидролаз,
2)ФАДН2:
FAD — флавинадениндинуклеотид — кофермент, принимающий участие во многих окислительно-восстановительных биохимических процессах. FAD существует в двух формах — окисленной и восстанов-й, его биохимическая функция, как правило, заключается в переходе между этими формами. FAD может быть восстановлен до FADH2, при этом он принимает 2 атома H. Молекула FADH2 является переносчиком E и восстанов-й кофермент может быть использован как субстрат в реакции окислительного фосфорилирования в митохондрии.
3) График зависимости скорости от рН:
При постоянной температуре любой фермент работает наиболее эффективно в узких пределах рН. Оптимальным считается то значение рН, при к-ом реак протекает с макс скор-ю.
При более выс и более низ рН активность фермента сниж. С пониж рН возраст кислотность и увел концентрация Н+-ионов.
Увел к-во полож зарядов в среде. Сдвиг рН меняет заряд ион-ых кислотных и основ групп, что ведет к разруш-ию ионтсвязей, участ-их в поддержании специфичной формы молекул фер. В результате измен форма молекул фер и в первую очередь форма его актив центра. При слишком резких сдвигах рН фер денатурирует.
4)Метод определения активности альфа-амилазы по Вольгемуту:
Вольгемута метод — определение активности амилазы (диастазы) в биологических жидкостях (слюне, моче, крови и др.). Активность фермента измеряется амилаз единицами, т. е. числом миллилитров 0,1% раствора крахмала, расщепленного в течение 30 мин. при t° 45 9 1 мл исследуемого раствора. Например, в норме активность амилазы в моче равна 16—64. Повышенн значения наблюдаются при панкреатите, заболеваниях желчных путей и др., пониженные значения вплоть до нуля — при почечной недостаточности.
5) Аденозинтрифосфа́т — нуклеотид, играет важн роль в обмене энергии и веществ в организмах; в первую очередь соединение известно как универсальный источник энергии для всех биохим проц, прот-их в живых системах. АТФ был открыт в 1929 году Карлом Ломанном[1], а в 1941 году Фриц Липман показал, что АТФ является основным переносчиком энергии в клетке.
Аэробный путь ресинтеза АТФ - это основной, базовый способ образования АТФ, протек-й в митохондриях мышечных клеток. В ходе тканевого дыхания от окисляемого вещества отнимаются два атома водорода и по дыхательной цепи передаются на молек кислород - 02, доставляемый кровью в мышцы из воздуха, в результате чего возникает вода. За счет E, выделяющейся при образовании воды, происходит синтез АТФ из АДФ и фосфорной кислоты. Обычно на каждую образовавшуюся молекулу воды приходится синтез трех молекул АТФ.
В упрощенном виде ресинтез АТФ аэробным путем может быть представлен схемой:
Чаще всего H отнимается от промежуточных продуктов цикла трикарбоновых кислот - цикла Кребса. Цикл Кребса - это завершающий этап катаболизма, в ходе которого происходит окисление ацетилкофермента А до С02 и Н20. В ходе этого процесса от перечисленных выше кислот отнимается 4 пары атомов водорода и поэтому образуется 12 молекул АТФ при окислении одной молекулы ацетилкофермента А.
В ферменте выделяют 2 части:1)ак цен –уник комбинация Акных остатков,который принимает участие в ферм.р-ях.Состоит из :
-якорной площадки,который имеет высокое сродство с субстратом.
-каталитический центр,который отвечает за саму р-ю.
2)аллостерический центр связывает обычные низкомолекулярные вещества,молекулы,которые отличаются по структуре от субстратов.Присоединение сюда эффектора изменяет конфигурацию активного центра и снижает или повышает экзиматическую активность.
Сериновые протеазы (сериновые эндопептидазы) — ферм, способные разрезать белки рассечением пептидных связей и отличающиеся от других протеаз наличием в своём активном центре аминокислоты серина. Сериновые протеазы содержатся как у эукариотов, так и у прокариотов.Пример: Трипсин • Химотрипсин • Эластаза.
2. Кривая уравнения Михаэли-
са-Ментен: гиперболическая зависи-
мость начальных скоростей катализиру-
емой ферментом реакции от концентра-
ции субстрата.
Km-констатнта Михаэлиса-это та концентрация субстрата ,при котором скорость Vo=1\2Vmax.Чем больше величина Кm,тем медленнее происходит "насыщение"фермента,т.е. тем меньше его сродство к субстрату.
Одним из наиболее существенных факторов, определяющих скорость ферментатив-
ной реакции, является концентрация субстрата (или субстратов) и продукта
(продуктов). При постоянной концентрации фермента скорость реакции
постепенно увел, достигая определенного максимума
, когда дал-ее увеличение кол-ва субстрата практически
не оказывает влияния на скорость ферментативной реакции. В таких
случаях принято считать, что субстрат находится в избытке, а фермент
полностью насыщен, т.е. все молекулы фермента связаны с субстратом.
Ограy-им скорость реакции фактором в последнем случае ста-
новится концентрация фермента. Именно при этих условиях определяют
величину макс скорости (Vmax) и значения константы Михаэлиса
(Km)
3.ЦИТОХРОМЫ, сложные белки — переносчики электронов, простетическая группа которых представлена гемом. Содержатся в клетках всех организмов. Локализованы в мембранах митохондрий, хлоропластов, хроматофоров, эндоплазматического ретикулума и в других мембранных структурах, участвуют во всех основных группах окислительно-восстановительных процессов, протекающих в живых клетках, — дыхании, фотосинтезе, микросомальном окислении. Как правило, образуют так называемые цепи, по которым электроны последовательно переносятся от донора к конечному акцептору. При функ-ии цитохромов и переносе восс-ых эквивалентов обратимо изменяется уровень окисления прост-ой группы [Fe(II) <—> Fe(III)]. Формула простетической группы цитохрома.рисунок
4. α-амилаза гидролизует крахмал с образованием конечных
продуктов, не дающих цвет реакции с йодом. При взаимодействии крахмала с йодом,образуется окрашенный комплекс, оптическая плотность которого при 640 нмпропорциональна концентрации негидрол-ого крахмала. Активность α-амилазы оценивают по уменьшению интенсив окраски. Активность α-амилазы выражают в миллиграммах или граммах крахмала, гидролизованного 1 л исследуемого образца за
1 сек инкубации при 37 oС.
5.Дыхательная цепь представляет собой ряд белковых комп-ов, встроенных во внутр митохондриальную мембрану (рис. 210). Существуют три глав ферментных комплекса. Первый, НАД•Н-дегидрогеназный комплекс принимает электроны от НАД•Н и переносит их во второй комплекс — комплекс Ь—с1 который в свою очередь переносит их на цитохромоксидазный комплекс, а он их передает на O2, в результате чего образуется H2O. На этом окисление заканчивается. Цитохромоксидаза переносит e-ы с цитохрома с на кислород, помимо гема содержит ионы меди,которые,меняя валентность,участвуют в переносе e
Субстратом для комплекса 1 и 2 являюся орган в-ва.
Отношение количества фосфорной кислоты (Р), использованной на фосфорилирование АДФ, к атому кислорода (О), поглощённого в процессе дыхания, называют коэффициентом окислительного фосфорилирования и обозначают Р/О. Следовательно, для NADH Р/О = 3, для сукцината Р/О - 2.
Билет №5.
1) Ингибирование ферментов. Ингибитор – это вещество, вызывающее специфическое снижение активности фермента. Инактивация – это, например, денатурация белка в результате действия денатурирующих агентов.По прочности связывания ингибитора с ферментом ингибиторы делят на обратимые и необратимые.Необратимые ингибиторы прочно связаны и разрушают функциональные группы молекулы фермента, которые необходимы для проявления его катал активн-и. Все процедуры по очистке белка не влияют на связь ингибитора и фермента. Пр.: действие фосфороргани соед-ий на фермент – холинэстеразу. Хлорофос, зарин, зоман и др. Фосфороргие соедин-ия связываются с активным центром холинэстеразы. В результате происходит фосфорилирование каталитических групп активного центра фермента. В следствии молекулы фермента, связанные с ингибитором, не могут связываться с субстратом и наступает тяжелое отравление.
Также выделяют обратимые игнибиторы, например прозерин для холинэстеразы. Обратимое ингибирование зависит от концентрации субстрата и ингибитора и снимается избытком субстрата.
По механизму действия выделяют:
- конкурентное ингибирование;
- неконкурентное ингибирование;
- субстратное ингибирование;
- аллостерическое.
1) Конкурентное (изостерическое) ингибирование – это торможение ферментативной реакции, вызванное связыванием ингибитора с активным центром фермента. При этом ингибитор имеет сходство с субстратом. В процессе происходит конкуренция за активный центр: образуются фермент-субстратные и ингибитор-ферментные комплексы. E+SES EP E+P; E+I E. Пр.: сукцинатдегидрогеназная реакция [рис. COOH-CH2-CH2-COOH(над стрелкой СДГ, под ФАДФАДН2) COOH-CH=CH-COOH]. Истинным субстратом этой реакции является сукцинат (янтарная к-та). Ингибиторы: малоновая к-та (COOH-CH2-COOH) и оксалоацетат (COOH-CO-CH2-COOH). [рис. фермента с 3 дырками+ субстрат+ ингибитор= комплекс ингибитора с ферментом]
Пр.: фермент холинэстераза катализ-ет превращ-ие ацетилхолина в холин: (CH3)3-N-CH2-CH2-O-CO-CH3 (над стрелкой ХЭ, под – вода) CH3СOOH+(CH3)3-N-CH2-CH2-OH. Конкурентными ингибиторами являются прозерин, севин.
2) Неконкурентное ингибирование – торможение, связанное с влиянием ингибитора на каталит-ое превращение, но не на связывание фермента с субстратом. В этом случае ингибитор может связываться и с актив центром (каталитический участок) и вне его.
Присое-ие ингибитора вне активного центра приводит к изменению конформации (третичной структуры) белка, вследствие чего изменяется конформация активного центра. Это затрагивает каталитический участок и мешает взаимодействию субстрата с активным центром. При этом ингибитор не имеет сходства с субстратом и это ингибирование нельзя снять избытком субстрата. Возможно образование тройных комплексов фермент-ингибитор-субстрат. Скорость такой реакции не будет максимальной.
К неконкурентным ингибиторам относят:
- цианиды. Они связ-ся с атом железа в цитохромоксидазе и в результате этого фермент теряет свою актив-ть, а т.к. это фермент дыхательной цепи, то нарушается дыхание клеток и они гибнут - ионы тяжёлых мет и их органические соединения (Hg, Pb и др.). Механизм их действия связан с соединением их с различными SH-группами. [рис. фермента с SH-группами, иона ртути, субстрата. Все это соединяется в тройной комплекс]
- ряд фармак средств, которые должны поражать ферменты злокачественных клеток.
3) Субстратное ингибирование – торможение ферменой реакции, вызванное избытком субстрата. Происходит в результате образования фермент-субстратного комплекса, неспособного подвергаться катал превращению. Его можно снять и уменьшить концентрацию субстрата. [рис. связывания фермента сразу с 2 субстратами]
4) Аллостерическое ингибирование – торможение ферментативной реакции, вызванное присоединением аллостерического ингибитора в аллостерическом центре аллостерического фермента. Такой тип ингибирования характерен для аллост фер-в, имеющих четвертичструктуру. В качестве ингибиторов могут выступать метаболиты, гормоны, ионы металлов, коферменты.
Механизм действия:
а) присоед ингибра к аллост центру;б) изменяется конформация фермента;в) изменяется конформация активного центра;
г) нарушается комплиментарность активного центра фермента к субстрату;
д) уменьшается число молекул ES;
е) уменьшается скорость ферментативной реакции.
[рис. фермент с 2 дырками, к одной аллостерический ингибитор и вторая меняет форму]
К особен аллостерических ферментов относят ингибирование по отрицателтной обратной связи. при конкурентном ингибировании увеличивается константа Михаэлиса, а макс скорость ферментативной реакции остается неизменной.
При неконкурентном ингибировании максимальная скорость реакции умен, а константа Михаэлиса остается неизменной.
Пенициллин, одно из самых известных и распрстраненных лекарств, применяется для лечения ряда инфекционных заболеваний. Пенициллин необратимо ингибирует фермент бактерий гликопептид-трансферазу. Этот фермент участвует в синтезе бактериальной стенки, и поэтому в присутствии пенициллина размножение бактерий невозможно. Гликопептид-трансфераза содержит остаток серина в активном центре (сериновая петид-гидролаза) В МОЛЕКУле пенициллина есть амидная связь, по свойствам сходная с пептидной связью. В результате разрыва этой связи, катализируемого ферментом, остаток пенициллина оказ необратимо связанным с фер
2) Скор фер реакций , как всяких других, зависит от температуры: при пов темперна каждые 10 градусов С скорость увел-ся примерно вдвое. Однако для фермен-ых реакций это правило справедливо лишь в области низких температур – до 50-60градусов.Приболее высоких темп-х ускоряется денатурация фермента, что означает умен-е его количества; соответственно снижся и скорость реакции. При 80-90 градусах бол-тво ферментов денат-ся практически мгновенно. Кол-ое определение ферментов рекомендуется проводить при 25 градусах.
3)
рисунок
45рисунок
Ферменты участвующие:
НАДН-дегидрогеназа ФМН-содержащий фермент фермент. В процессе реакции водород сначала присоединяется к ФМН, соединенному с ферментом, а затем передается на убихинон.
Цитохромы – Гемопротеины, геминовые ферменты. Атом железа в Ц. меняет валентность присоединяя или отдавая электрон.
Комплекс I (НАДН дегидрогеназа) окисляет НАД-Н, отбирая у него два электрона и перенося их на растворимый в липидах убихинон, который внутри мембраны диффундирует к комплексу III. Вместе с этим, комплекс I перекачивает 4 протона из матрикса в межмембранное пространство митохондрии.
Комплекс II (Сукцинат дегидрогеназа) не перекачивает протоны, но обеспечивает вход в цепь дополнительных электронов за счёт окисления сукцината.
Комплекс III (Цитохром bc1 комплекс) переносит электроны с убихинона на два водорастворимых цитохрома с, расположенных на внутренней мембране митохондрии. Убихинон передаёт 2 электрона, а цитохромы за один цикл переносят по одному электрону. При этом туда также переходят 2 протона убихинона и перекачиваются комплексом.
Комплекс IV (Цитохром c оксидаза) катализирует перенос 4 электронов с 4 молекул цитохрома на O2 иперекачивает при этом 4 протона в межмембранное пространство. Комплекс состоит из цитохромов a и a3, которые, помимо гема, содержат ионы меди.
Кофермент Q (кофермент Q10, убихинон, ubiquinone, coenzyme Q10, coenzyme Q) — это группа коферментов —бензохинонов, содержащих хиноидную группу (отсюда обозначение Q) и содержащих несколько изопрениловыхгрупп (например, 10 в случае кофермента Q10
Перенос электронов в ЦПЭ происходит, потому что электроны всегда стремятся переходить от электроотрицательных систем к электроположительным.
Вроде 3 молекулы АТФ.
Билет8