- •Глава 1. Биологические макромолекулы…………………………………… 7
- •Глава 2. Информационные макромолекулы………………………………... 11
- •Часть I. Глава 3. Белки…………………………………………………… 11
- •Часть II. Глава 4. Hуклеиновые кислоты…………………………………… 75
- •Глава 1. Биологические макромолекулы
- •Типы связей, участвующие в формировании
- •Глава. 2. Информационные макромолекулы
- •Часть I. Глава 3. Белки
- •3.1. Аминокислоты – мономеры белка
- •Модифицированные аминокислоты
- •3.2. Пептиды и пептидная связь
- •(Стрелкой показано направление образования пептидной связи)
- •3.3. Биологически активные низкомолекулярные пептиды
- •Природные низкомолекулярные биологически активные пептиды
- •3.4. Структура высокомолекулярных пептидов - белков
- •3.4.1. Вторичная структура белка
- •Параллелльная β-структура; б – параллельные β-структуры
- •3.4.2.Третичная структура белка
- •3.4.2.1.Супервторичная структура белков
- •3.4.2.2.Доменная структура белка
- •Обозначены α-спирали, стрелками – β-структуры
- •3.4.3.Четвертичная структура белка
- •3.5. Фолдинг белков
- •3.5.1.Фолдазы
- •3.5.2.Шапероны
- •3.5.3.Болезни нарушения фолдинга
- •6.3.1.Амилоидозы
- •3.5.3.2.Прионовые болезни
- •3.6. Функционирование белка
- •3.6.1. Вещества, влияющие на функционирование белка
- •Гемоглобина при присоединении о2
- •3.7. Классификация белков
- •Некоторые сложные белки
- •3.8. Семейство гемоглобинов
- •3.8.1.Миоглобин
- •3.8.2.Гемоглобины
- •3.8.2.1. Мутантные гемоглобины человека
- •3.9.Суперсемейство иммуноглобулинов
- •3.9.1.Семейство иммуноглобулинов
- •3.10.2. Семейство т-клеточных, антигенраспознающих рецепторов
- •3.9.3.Семейство белков главного комплекса гистосовместимости
- •3.10.Семейство сериновых протеаз
- •И химотрипсина (б)
- •3.11.Изобелки
- •3.12.Роль белков в питанин
- •3.13. Изменение белкового состава организма
- •Часть II. Глава 4. Hуклеиновые кислоты
- •4.1.Общая структура нуклеиновых кислот
- •Наиболее распространенные нуклеозиды и нуклеозидфосфаты:
- •4.1.2.Структура нуклеиновых кислот
- •Нуклеотида фосфодиэфирная связь
- •Фосфорной кислоты; р – сахар пентоза , ао - азотистое основание.)
- •Структура молекулы днк
- •4.2.1. Первичная структура днк
- •4.2.2. Вторичная структура днк
- •3′ 5′ Цепей днк
- •4.2.3.Третичная структура днк (суперспирализация днк)
- •4.2.3.1. Нуклесомная нить.
- •4.2.3.2.Наднуклеосомная укладка днк
- •Фибрилла – нуклеомер: а – нуклеосома,
- •Уровни компактизации хроматина
- •4.3. Физико-химические свойства и функции днк
- •4.4. Разнообразие форм организации днк в клетках.
- •4. 5. Рнк: виды, структура и функции.
- •Рнк (Из: Николаев, 2007)
- •4.5.1. Структура и функции мРнк
- •Существующей петли мРнк вируса r-17 (б)
- •4.5.2. Структура и функции тРнк
- •4.5.3.Структура и функции рРнк
- •4.6. Комплексы нуклеиновых кислот и белков.
- •Проверочные тесты
3.8. Семейство гемоглобинов
Сюда относятся гемсодержащие родственные глобулярные белки: миоглобин и гемоглобин. Оба белка имеют родственное происхождение, сходную конформацию полипептидных цепей и сходную функцию (транспорт О2), но различаются по молекулярной массе, количеству протомеров в четвертичной структуре и локализации в тканях (рис.42).
Рис.42. Сравнение конформации миоглобина и β-цепи гемоглобина
3.8.1.Миоглобин
Миоглобин содержится в клетках красных мышцах; присоединяет кислород, доставляемый гемоглобином и транспортирует его в митохондрии, а также в форме оксигемоглобина участвует в запасании О2. При кислородном голодании (сильная физическая нагрузка) кислород высвобождается из комплекса с миоглобином и поступает в митохондрии. Миоглобин – это глобулярный сложный белок; состоит из простетической не белковой группы гема и белковой части - апомиоглобина. Гем – состоит из органической части протопорфирина, в которой атомы азота 4 пирольных колец связаны 4 координационными связями с атомом Fe2+ (рис.43).
Рис.43. Строение гема миоглобина
Апомиоглобин (рис.44) - состоит из одной полипептидной цепи, включающей 153 аминокислых остатков, которые во вторичной структуре уложены в 8 α–спиралей.
Рис.44. Графическая формула апомиоглобина
( квадратом выделен гем)
Спирали обозначаются буквами от А до Н, аминокислотные остатки в спирали обозначаются цифрами их порядкового номера в спирали (Гис F8). Третичная структура - компактная глобула. Активный центр миоглобина находится между двумя α–спиралями F и Е, и содержит в основном гидрофобные остатки аминокислот и 2 остатка гистидина (Гис Е7 и Гис F8), расположенные по обе стороны от гемма (рис. 45).
Рис.45. Расположение гемма в активном центре апомиоглобина протомеров апогемоглобина
Атом Fе2+ может образовывать 6 связей: 4 - с атомами протопо- фирина гемма, 5я - с азотом идозольного кольца Гис8, 6я - с лигандом О2; Гис Е7 не связан с гемом; он обеспечивает правильные присоединение О2 к миоглобину. Гидрофобные остатки аминокислот, окружающие их, припятствуют проникновению воды в центр связывания миоглобина и окислению Fе2+ в Fе3+, так как Fе3+ не способно связывать О2.
3.8.2.Гемоглобины
Гемоглобины – это родственные белки, находящиеся в эритроцитах человека и позвоночных животных. Они выполняют функцию: 1 - переноса О2 из легких в ткани; 2 - участвуют в переносе СО2 и Н+ из периферических тканей в легкие. Гемоглобин извлекает из воздуха и передает тканям за сутки около 600л О2. В тканях образуется за сутки около 500л. СО2, который удаляется из тканей при участии гемоглобина. Гемоглобин насыщается О2 в клетках и легко отдает его в тканях, но О2 является также сильным окислителем и его избыток в тканях может привести к повреждением молекул, структуры клеток и их гибели. Регулировку количества О2 в тканях при разных условиях осуществляет гемоглобин, благодаря особенностям своей четвертичной структуры.
Гемоглобин – это глобулярный сложный белок с простетической группой – гемом (рис.43), сходный с миоглобином. В отличии от миоглобина образует четвертичную структуру, состоящую из 4 полипептидных цепей - 2α и 2β протомеров (рис.46).
Рис.46. Строение гемоглобина
Каждый протомер образует вторичную конформацию, подобно миоглобину (рис.42), состоящую из 8 α–спиралей, свернутых в третичную глобулу с ядром и «карманом» для связывание гема. В каждом протомере имеется белковая часть – глобин, которая соединяется с не белковой – гемом. Соединения гемма с глобином аналогично таковому у миоглобина – атом железа Fе2· гемма образует 6 связей: 4 - с атомами протопорфирина гемма, 5я - с азотом идозольного кольца Гис F8 и 6юсвязь - с О2. Для правильной ориентации присоединения О2 к гемму необходим Гис Е7 (рис.45).
Протомеры гемоглобина соединяются вместе, образуя почти правильную форму шара с диаметром 55А (1А - 10м-10) (рис.47).
Рис. 47 Модель гемоглобина при низком разрешении
Центральная полость
Четыре цепи молекулы гемоглобина расположены в форме тетраэдра. Четыре гема находятся на внешней стороне молекулы. α1-цепь и β1-цепь образуют один димер, соединяясь гидрофобными водородными и ионными связями, α2-цепь и β2-цепь - второй димер. Связи между димерами слабее, чем внутри димера, а между двумя α- и двумя β- цепями вообще незначительны. Кроме того, димеры способны перемещаться относительно друг друга. Протомеры в центре не могут прилегать друг к другу плотно, так как у них неровные поверхности и поэтому формируется «центральная полость».
Гемоглобин – это основной белок эритроцитов крови. У человека встречается 4 вида гемоглобина (Нв), в состав которых входят 5 видов полипептидов (субъединиц): α, β, δ, ε, γ.
1.Гемоглобин А (НвА) – основной гемоглобин взрослого человека, составляет 98% от общего количества гемоглобина; тетрамер, состоит из 2α- и 2β-субъединиц – формула - (α2 + β2) .
1.Гемоглобин А (НвА) – основной гемоглобин взрослого человека, составляет 98% от общего количества гемоглобина; тетрамер, состоит из 2α- и 2β-субъединиц – формула - (α2 + β2) .
2.Гемоглобин А2 (НвА2) – гемоглобин взрослого человека, составляет 2% от общего количества гемоглобина. Состоит из 2α- и 2δ-субъединиц – формула - (α2 + δ2).
3.Эмбриональный гемоглобин (НвЕ) – синтезируется в эмбриональном желточном мешке через несколько недель после оплодотворения. Состоит из 2α- и 2ε-субъединиц. Через 2 недели после формирования печени плода в ней начинает синтезироваться фетальный гемоглобин, который полностью заменяет эмбриональный к 6 месяцам. Формула НвЕ – (α2+ε2).
4.Фетальный гемоглобин или гемоглобин плода (НвF) – синтезируется в печени и костном мозге плода до его рождения. Состоит из 2α- и 2γ-субъединиц. γ–субъединицы бывают 2 разновидностей: γσ (в положении 196 находится глицин) и γА (в том же положении находится аланин). После рождения заменяется на гемоглобин А, который начинает синтезироваться в клетках костного мозга на 8 месяце развития плода. Формула - (α2+γ2).
Общая для всех α-цепь состоит из 141 аминокислотного остатка, резко отличаясь от других цепей по аминокислотному составу (рис. 48).
Положение в спирали
Гемоглобин человека F1 F2 F3 F4 F5 F6 F7 F8 F9
α-цепь
- Leu - Ser - Ala - Leu - Ser - Asp - Leu -
His - Ala -
β-цепь - Phe - Ala -Thr -Leu - Ser - Glu - Leu -His -Cys- миоглобин кашалота - Leu - Lys - Pro - Leu - Ala - Gin - Str - His - Ala –
Рис.48. Сравнение структуры гемоглобина человека и кашалота
β-, γ-, δ-цепи имеют сходное строение и содержат 146 аминокислотных остатков, различаясь по двум аминокислотам. Но, у всех изученных видов животных, гемоглобины при всем их разнообразии имеют 9 положений в последовательностях, где стоят одни и те же аминокислоты: гистидин в F8 и E7 , фенилаланин в СД1, лейцин в F4 и т.д. (табл.6). Эти аминокислоты участвуют в присоединении О2 к гемму или стабилизируют молекулу.
Гемоглобины взрослого человека, эмбрионов и плодов различаются по способности связывать О2 (сродство к О2). Так, НвF имеет большее срод- ство к О2, чем НвА и это усиливает транспорт О2 из крови матери в кровь плода.
Гемоглобин, присоединивший О2, называется оксигемоглобином и именно он выполняет функцию транспорта О2. СО2 присоединяется к концевым α-аминокислотам протомеров гемоглобина, образуя гемоглобин, транспортирующий СО2 и называющийся карбогемоглобином. Гемогло- бин, не связанный с О2, называется дезоксигемоглобином.
Гемоглобин является аллостерическим белком, то есть белком, имеющим несколько лигандов: О2, СО2, Н+ и БФГ (2,3-бифосфоглицерат); каждый лиганд имеет свой собственный активный центр. Присоединение лигандов к молекуле гемоглобина уменьшает его сродство к О2, в зависимости от тканевых условий. Этот же механизм регулирует количес- тво транспортируемого СО2 (присоединение О2 уменьшает сродство к СО2).
Таблица 6.
Консервативные последовательности аминокислот в гемоглобине
(Из: Страйер, 1984)
положение
|
аминокислота
|
функция
|
F8
|
гистидин
|
Проксимальный связанный с гемом гистидин |
Е7
|
гистидин
|
Дистальный гистидин вблизи гема |
CD1
|
фенилаланин
|
Контакт с гемом
|
F4
|
Лейцин |
То же |
В6
|
Глицин
|
Разрешает сближение спиралей В и Е |
С2
|
Пролин |
Терминирование спиралей |
НС2
|
Тирозин
|
Перекрестная связь между спиралями Н и F |
С4
|
Треонин
|
Не установлена
|
Н10
|
Лизин |
//-//-//-//-//-//-// |
