- •Глава 1. Биологические макромолекулы…………………………………… 7
- •Глава 2. Информационные макромолекулы………………………………... 11
- •Часть I. Глава 3. Белки…………………………………………………… 11
- •Часть II. Глава 4. Hуклеиновые кислоты…………………………………… 75
- •Глава 1. Биологические макромолекулы
- •Типы связей, участвующие в формировании
- •Глава. 2. Информационные макромолекулы
- •Часть I. Глава 3. Белки
- •3.1. Аминокислоты – мономеры белка
- •Модифицированные аминокислоты
- •3.2. Пептиды и пептидная связь
- •(Стрелкой показано направление образования пептидной связи)
- •3.3. Биологически активные низкомолекулярные пептиды
- •Природные низкомолекулярные биологически активные пептиды
- •3.4. Структура высокомолекулярных пептидов - белков
- •3.4.1. Вторичная структура белка
- •Параллелльная β-структура; б – параллельные β-структуры
- •3.4.2.Третичная структура белка
- •3.4.2.1.Супервторичная структура белков
- •3.4.2.2.Доменная структура белка
- •Обозначены α-спирали, стрелками – β-структуры
- •3.4.3.Четвертичная структура белка
- •3.5. Фолдинг белков
- •3.5.1.Фолдазы
- •3.5.2.Шапероны
- •3.5.3.Болезни нарушения фолдинга
- •6.3.1.Амилоидозы
- •3.5.3.2.Прионовые болезни
- •3.6. Функционирование белка
- •3.6.1. Вещества, влияющие на функционирование белка
- •Гемоглобина при присоединении о2
- •3.7. Классификация белков
- •Некоторые сложные белки
- •3.8. Семейство гемоглобинов
- •3.8.1.Миоглобин
- •3.8.2.Гемоглобины
- •3.8.2.1. Мутантные гемоглобины человека
- •3.9.Суперсемейство иммуноглобулинов
- •3.9.1.Семейство иммуноглобулинов
- •3.10.2. Семейство т-клеточных, антигенраспознающих рецепторов
- •3.9.3.Семейство белков главного комплекса гистосовместимости
- •3.10.Семейство сериновых протеаз
- •И химотрипсина (б)
- •3.11.Изобелки
- •3.12.Роль белков в питанин
- •3.13. Изменение белкового состава организма
- •Часть II. Глава 4. Hуклеиновые кислоты
- •4.1.Общая структура нуклеиновых кислот
- •Наиболее распространенные нуклеозиды и нуклеозидфосфаты:
- •4.1.2.Структура нуклеиновых кислот
- •Нуклеотида фосфодиэфирная связь
- •Фосфорной кислоты; р – сахар пентоза , ао - азотистое основание.)
- •Структура молекулы днк
- •4.2.1. Первичная структура днк
- •4.2.2. Вторичная структура днк
- •3′ 5′ Цепей днк
- •4.2.3.Третичная структура днк (суперспирализация днк)
- •4.2.3.1. Нуклесомная нить.
- •4.2.3.2.Наднуклеосомная укладка днк
- •Фибрилла – нуклеомер: а – нуклеосома,
- •Уровни компактизации хроматина
- •4.3. Физико-химические свойства и функции днк
- •4.4. Разнообразие форм организации днк в клетках.
- •4. 5. Рнк: виды, структура и функции.
- •Рнк (Из: Николаев, 2007)
- •4.5.1. Структура и функции мРнк
- •Существующей петли мРнк вируса r-17 (б)
- •4.5.2. Структура и функции тРнк
- •4.5.3.Структура и функции рРнк
- •4.6. Комплексы нуклеиновых кислот и белков.
- •Проверочные тесты
3.6.1. Вещества, влияющие на функционирование белка
Лиганды, связываясь с белками, способны изменять их конформацию таким образом, что формируются новые активные центры для связи и другими лигандами. Как уже было указано выше, взаимодействие белка с лигандом имеет высокую специфичность. Тем не менее, всегда можно подобрать вещество (природное или синтетическое), которое является структурным аналогом лиганда и может быть комплиментарным активному центру белка. Если это вещество соединится с белком вместо естественного лиганда, функция белка будет заблокирована. Вещество, взаимодействующее с активным центром белка и блокирующее действие белка, называется ингибитором белка или антагонистом. Так молекула угарного газа СО2 сходна с молекулой О2 и ее средство к гемоглобину в 200 раз больше, чем к О2, поэтому даже при низкой концентрации СО2 в воздухе, значительная часть гемоглобина оказывается блокированной угарным газом и не участвует в транспорте О2, что приводит к тяжелому отправлению. Дитилин (лекарственное вещество) является аналогом ацетилхолина, который обеспечивает передачу импульса нерва на мышцу, являясь медиатором синапса. При введении в организм дитилина он связывается с Н-холинорецепторами холинергических синапсов, являясь антагонистом ацетилхолина - нейромедиатора, вызывающего сокращение мыщц. В результате передача блокируется и возникает расслабление мышцы (паралич). Поэтому дитилин применяют как миорелаксант при операциях и эндоскопических обследованиях. Следовательно, структурные аналоги естественных лигандов могут быть и ядами, и лекарственными вещест- вами. Другим лекарственным веществом, выступающим как ингибитор белка, является атропин – алкалоид растительного происхождения, который явяляется также естественным аналогом ацетилхолина, но взаимодействует с М-холинорецепторами мембраны эффекторных клеток. Являясь антагонистом ацетилхолина, он устраняет раздражение парасимпатических нервов, и вместо сокращения гладких мышц, которое стимулируется ацетилхолином, снимает их спазм. Ингибиторами белков являются яды, которые связываются с молекулами белка, ингибируют их и тем самым вызывают нарушение его биологических свойств. Например, яд кобры содержит ά-нейротоксин, который соединяясь с рецепторами постсинап- тических мембран, блокируют их работу, нарушая их функцию (восприятие сигнала).
Другая группа лекарственных веществ, будучи структурными аналогами лигандов не являются ингибиторами, а вызывает такие же, но более сильные длительные физиологические эффекты, как природные лиганды. Эта группа называется агонисты. Мезатон, аналог нейромедиаторов симпатической нервной системы норадреналина и адреналина, сильнее и длительнее их повышает тонус сосудов и артериальное давление и используется при гипотонии и коллапсе.
Лиганды могут оказывать влияние на конформацию белков; при этом форма белок-лигандных взаимодействий может быть разной:
1 - связываясь с белком, лиганд стабилизирует его конформацию, не нарушая ее. Так, лиганд (ионы Са2+) лизоцима обеспечивает возникновение дополнительных связей между радикалами, что снижает степень денатурации белка.
2 - лиганд может значительно менять третичную структуру белка, что делает белок функционально более активным. Иногда присоединение какого-либо лиганда изменяет конформацию белка, в результате чего формируются центры связывания с другими лигандами и белок приобретает способность взаимодействовать с ферментами, меняя их активность. Так, белок кальмодулин – 4Са2+, который может присоединяться ко многим ферментам и активировать их. Например, сокращение гладких мышц связано с активацией их ферментов комплексом кальмодулин - 4Са2+ .
3 - лиганды завершают процессы образования вторичной, третичной и четвертичной структур белка. Без лиганда белок находится в состоянии расплавленной глобулы (вторичная завершена не до конца, третичной нети). У белка лактальбумина лигандом является ион Са2+, без которого третичная структура разрушается, хотя компактная глобулярная форма сохраняется. У остеокальцина - белка матрикса кости лигандом выступают 5 ионов Са2+ ,при связывании с которыми существенно уменьшается объем глобулы, формируется третичная структура и глобулы объединяются в олигомеры. У цитохрома С (белок цепи переноса электронов в митохондриях) удаление лиганда (гем) приводит к полному разворачиванию молекулы.
4 - связывание лиганда с белком вызывает масштабные подвижки доменов и субъединиц белка. Взаимодействие гемоглобина с лигандном (О2) вызывают многочисленные и сложные конформационные превращения, в частности поворот субъединиц гемоглобина относительно друг друга (рис.39).
Рис.39. Кооперативные изменения конформации протомеров
