- •1 Кинетика процессов утилизации субстрата, образования продуктов метаболизма и биомассы в культурах клеток
- •1.1 Идеальные реакторы для изучения кинетики клеточного роста
- •1.2 Идеальный реактор периодического действия
- •1.3 Идеальный проточный реактор с полным перемешиванием (прпп)
- •1.2 Кинетика сбалансированного роста
- •Рост филаментозных организмов
- •Структурированные модели кинетики клеточного роста
- •Компартментальные модели
- •Неструктурированные модели
- •Химически структурированные модели кинетики образования продуктов жизнедеятельности клеток
- •Кинетика образования продуктов жизнедеятельности филаментозными организмами
- •Кинетика тепловой гибели клеток и спор
- •Заключение
- •Вопросы для самоконтроля.
- •2 Проектирование и расчет биологических реакторов
- •1. Идеальные биореакторы
- •1.1. Реакторы периодического действия с добавлением субстрата
- •1.2. Реакции в прпп, катализируемые ферментами
- •1.3. Проточные реакторы с полным перемешиванием для культур клеток и пристеночный рост клеток
- •9.1.4. Идеальный трубчатый реактор полного вытеснения (трпв)
- •3. Реакторы с неидеальным перемешиванием
- •3.1. Время выравнивания концентраций в реакторах с перемешиванием
- •3.4. Взаимосвязь между перемешиванием и биологическими превращениями
- •4. Стерилизаторы
- •4.1. Периодическая стерилизация
- •4.2. Непрерывная стерилизация
- •5. Иммобилизованные биокатализаторы
- •5.1. Типы биокатализаторов на основе иммобилизованных клеток и их свойства
- •5.2. Применение биокатализаторов на основе иммобилизованных клеток
- •7. Технология микробиологических процессов
- •7.1. Подбор состава среды
- •7.2. Проектирование типичного асептического аэробного микробиологического процесса и его ведение
- •7.3. Биореакторы других типов
- •8. Особенности технологии процессов с участием растительных и животных клеток и соответствующих реакторов
- •8.1. Культивирование животных клеток; требования к среде
- •8.2. Промышленные реакторы для крупномасштабных процессов с участием животных клеток
- •8.3. Культивирование растительных клеток
- •1. Детекторы для определения физических и химических параметров среды и газов
- •1.1. Детекторы для определения физических свойств среды и газов
- •1.2. Детекторы для определения химического состава среды
- •1.3. Газовый анализ
- •2. Детекторы для непрерывного контроля характеристик популяции клеток
- •3. Автономные методы анализа
- •3.1. Определение свойств среды
- •3.2. Анализ состава популяции клеток
- •4. Эвм и интерфейсы
- •4.1. Основные элементы цифровых эвм
- •4.2. Интерфейсы и периферийные устройства эвм
- •4.3. Системы программного обеспечения
- •5. Анализ данных
- •5.1. Сглаживание и интерполяция данных
- •6. Управление процессами биохимической технологии
- •6.1. Непосредственное управление процессами
- •6.2. Каскадное управление метаболизмом
1.2 Идеальный реактор периодического действия
Основой многих биохимических процессов является периодический рост популяций клеток, при котором после посева инокулята живых клеток в жидкую среду к последней в течение всего периода роста ничего не добавляется и из нее ничего не выделяется (за исключением, быть может, некоторых газов). Обычно в таком реакторе по мере роста популяции изменяются концентрации питательных веществ, клеток и продуктов метаболизма.
М
атериальный
баланс по компоненту i показывает, что
скорость его накопления, выраженная в
виде производной общего количества
компонента i по времени, должна быть
равна скорости его образования,
обусловленного химическими реакциями
в реакторе. Таким образом,
где VR — объем культуры;
с-количество молей i в единице объема культуры;
rf — количество образовавшихся в реакции молей i в единице объема культуры за единицу времени.
Если в реактор не добавляют и из него не отбирают никаких жидких веществ и если потерями жидкости с потоком газа можно пренебречь, то VR постоянно и уравнение (7.2) упрощается:
dci/dt=rfi
Следует отметить, что аналогичными уравнениями может быть выражено не только изменение количества молей, но и массы или концентрации (плотности) компонента. Если же компонент i входит в состав газового потока, поступающего в реактор (или выходящего из реактора), то указанные выше уравнения должны быть дополнены слагаемыми, отражающими результирующую скорость поступления компонента i с газовой фазой.
Из уравнения (7.3) следует, что определение скорости изменения концентрации компонента i позволяет непосредственно определить общую скорость образования i в реакциях (в том числе внутриклеточных), которые происходят в реакторе периодического действия. В общем случае скорость образования rfi зависит от состояния клеточной популяции (состава, морфологии, распределения по возрасту и т. д.) и всех параметров среды, оказывающих влияние на скорости реакций в клетках и среде. В то же время, как мы уже упоминали во введении к этой главе, обычно кинетику клеточного роста описывают упрощенно, принимая во внимание только наиболее важные параметры. В последующих разделах мы увидим, каким образом стехиометрия реакций и их скорости связаны со скоростью образования продуктов жизнедеятельности клеток.
1.3 Идеальный проточный реактор с полным перемешиванием (прпп)
Н
а
рис. 7.3, а изображены основные узлы
лабораторного
проточного реактора
с полным перемешиванием (ПРПП), а на рис.
7.3, б указаны основные обозначения,
используемые при моделировании и анализе
такого рода реакторов. Если эти реакторы
предназначены для изучения роста культур
клеток, то их часто называют хемостатами.
Как показано на этих рисунках, перемешивание
осуществляется с помощью мешалки, потока
восходящих пузырьков газа или того и
другого. Примем, что в ПРПП перемешивание
культуральной жидкости осуществляется
настолько эффективно,
что каждая фаза содержимого реактора
вполне однородна
по составу, т.е. концентрации любых
компонентов в любой из фаз одинаковы
во всем объеме реактора. Как показано
на схеме, отсюда следует важный вывод
о том, что состав
вытекающего потока не отличается от
состава содержимого реактора.
Полное перемешивание должно обеспечивать и одинаковую концентрацию растворенного кислорода во всем объеме жидкой фазы. Этот факт особенно важен при анализе аэрируемых ПРПП, поскольку отсюда следует, что в большинстве случаев мы можем изучать происходящие в реакторе процессы независимо от конструкций аэратора или мешалки. Если система аэрации обеспечивает такую концентрацию растворенного кислорода, которая не лимитирует клеточный рост в ПРПП, то анализ кинетики клеточного роста мы можем рассматривать как независимую проблему. Аналогичные соображения применимы и к проблемам теплопередачи, которые могут возникать, в ходе роста микроорганизмов. Систему можно считать изотермической, если реактор снабжен устройствами для полного перемешивания, эффективного отвода тепла и регулирования температуры на заданном уровне; тогда можно изучать процессы микробиологических превращений в изотермических условиях.
В большей части последующего материала мы будем принимать все указанные допущения. В стационарном состоянии, когда концентрации всех компонентов в реакторе не изменяются во времени, к любому компоненту системы применимо следующее уравнение:
Обозначив, как и раньше, символом VR общий объем культуры в реакторе, указанное уравнение стационарного состояния можно записать в следующем виде:
где F — объемная скорость потока раствора питательных веществ и вытекающего потока; сif — молярная концентрация компонента i в потоке питательных веществ; сi — концентрация компонента i в реакционной смеси и вытекающем потоке. Преобразовав уравнение (7.5),
можно без труда определить скорость образования компонента i, измерив его (стационарные) концентрации на входе в реактор и на выходе из него. Введенный в уравнение (7.6) параметр D называют скоростью разведения и определяют в виде
Этот параметр определяет время пребывания или скорость переработки в реакторе и равен числу объемов жидкой фазы реактора, проходящей через него в единицу времени. Параметр D представляет собой величину, обратную более обычным в химической технологии параметрам среднего времени пребывания или среднего времени удерживания. Здесь, однако, мы будем пользоваться общепринятым в литературе по биохимической технологии понятием о скорости разведения.
Из сравнения уравнений (7.3) и (7.6) нетрудно заметить, что кинетика процессов в ПРПП проще, чем в реакторе периодического действия; действительно, здесь нет необходимости в определении зависимости концентрации от времени и в последующем дифференцировании полученных данных. Изучение кинетики роста популяции клеток в этих условиях имеет еще одно преимущество, заключающееся в том, что в ПРПП клетки могут приспособиться к стационарным условиям и таким путем перейти в состояние сбалансированного или почти сбалансированного роста. Этим самым создается реальная возможность для обеспечения относительно определенного, воспроизводимого состояния клеточной популяции; в случае периодических процессов с участием микроорганизмов решить эту задачу значительно труднее. С другой стороны, эксперименты по изучению роста клеток в периодических процессах могут быть выполнены в небольших сосудах, размещенных на термостатированной качалке; оборудование для ПРПП значительно сложнее и дороже. Состояние стационарности в биологических ПРПП может быть достигнуто только через несколько часов или даже дней, что существенно повышает опасность внесения загрязнений, обесценивающих результаты эксперимента. Наконец, в крупномасштабном производстве в ряде случаев, вероятно, более целесообразными окажутся периодические процессы, отличающиеся непостоянным, несбалансированным ростом, различными метаболическими процессами и активностями в разные периоды процесса; для таких производств кинетические модели, основанные на стационарных условиях в ПРПП, могут оказаться вообще непригодными. Отсюда следует, что экспериментальному изучению кинетики роста популяций клеток микроорганизмов и высших организмов и разработке соответствующих математических выражений должно предшествовать точное определение предполагаемой сферы применения этих выражений. Это требование является основой для разработки программ экспериментального и математического моделирования.
В следующем разделе мы рассмотрим простейшие модели роста популяций клеток. При этом основное внимание мы будем уделять кинетике роста клеток в ПРПП, поскольку основные принципы построения кинетических уравнений были разработаны и наиболее полно развиты именно в экспериментах с хемостатами.
