
- •Список сокращений
- •Введение
- •Обзор литературы
- •Повсеместное распространение патогенов в окружающей среде
- •1.2 Salmonella typhimurium – патоген человека и животных
- •1.3 Особенности ультраструктуры некультивируемых форм микроорганизмов
- •Способы переживания неблагоприятных условий бактериями
- •1.5 Голодание как основной фактор перехода бактерий в некультивируемое состояние
- •1.6 Формирование адаптивного ответа бактерий на стресс
- •1.7 Межклеточная коммуникация у бактерий рода Salmonella
- •1.8 RpoS глобальный регулятор системы ответа на стресс
- •Экспериментальная часть
- •2. Материалы и методы
- •2.1 Культивирование микроорганизмов
- •2.2 Оценка роста бактериальной культуры
- •2.3 Конструирование праймеров
- •2.4 Выделение днк
- •2.5 Спектрофотометрическое определение концентрации днк
- •2.6 Электрофорез днк в агарозном геле
- •2.7 Количественная полимеразная цепная реакция (кПцр)
- •2.8 Окрашивание клеток Salmonella Typhimurium 14028s wt витальными красителями и их анализ при помощи конфокальной флуоресцентной микроскопии
- •2.9 Приготовление проб для электронной микроскопии
- •2.10 Статистическая обработка данных
- •Результаты и обсуждение
- •3.1 Определение титра кое голодающей культуры s. Typhimurium.
- •3.2 Определение титра геномных копий (гк) голодающей культуры s. Typhimurium 14028s wt на основе количественного пцр
- •3.3 Оценка жизнеспособности клеток s. Typhimurium 14028s с помощью конфокальной флуоресцентной микроскопии
- •3.4 Морфологические особенности клеток голодающей популяции s. Typhimurium 14028s wt с низкой и высокой начальной плотностью
- •3.5 Оценка фенотипа клеток s. Typhimurium 14028s ΔluxS::KanR в условиях голодания
- •3.6 Оценка фенотипа клеток s. Typhimurium 14028s ΔrpoS::KanR в условиях голодания
- •Список использованной литературы
3.3 Оценка жизнеспособности клеток s. Typhimurium 14028s с помощью конфокальной флуоресцентной микроскопии
В диагностики инфекционных заболеваний значительную роль играет метод ПЦР, который позволяет определить видовую принадлежность бактерий в инфицированном организме. Однако, данный подход может приводить и к показанию ложноотрицательных результатов. Это связано с тем, что бактериальные клетки способны трансформироваться в особые морфотипы, отличные от типичных вегетативных клеток. При этом изменение морфологии бактериальных клеток и их физиологического состояния часто бывает сопряжено с модификацией структуры генетического аппарата, приводящей к неэффективности выявления покоящихся форм микроорганизмов при помощи ДНК-диагностики. Такие «нетипичные» морфотипы (например, жизнеспособные, но некультивируемые формы и цистоподобные рефрактерные клетки) позволяют бактериям переживать стрессовые условия. Кроме того, есть основания считать, что эти морфотипы необходимы также для успешного протекания инфекционного процесса и являются важной стадией жизненного цикла популяции микробов.
На сегодняшний день известно, что популяция бактериальных клеток неоднородна и может быть представлена различными типами клеток, выполняющими разные функции (Олескин с соавт., 2000). В ней могут присутствовать как вегетативные клетки, необходимые для активного размножения и расселения, так и покоящиеся клетки различного типа, устойчивые к тем или иным неблагоприятным факторам. Вероятно, соотношение клеток различного типа в популяции определяет ее свойства. В связи с этим разработка способов выявления жизнеспособных клеток в популяциях «нетипичных» физиологических форм бактерий является актуальной задачей.
Для решения поставленной задачи были заложены опытные культуры S. typhimurium 14028s WT с начальной плотностью клеток 109 КОЕ/мл по схеме, описанной в разделе «материалы и методы». Численность культивируемых (вегетативных) клеток оценивали при помощи определения титра колониеобразующих единиц (КОЕ). При помощи коммерческого набора BacLightTM Bacterial Viability определяли титр клеток сохранивших интактность мембран (жизнеспособные клетки) и общий титр клеток. Для этого клетки окрашивали красителями пропидиум иодидом и SYTO 9 как описано в разделе материалы и методы, добавляли к ним раствор легкоплавкой агарозы (Bio-Rad, США) до 0,5% и 5 мкл полученной суспензии переносили на предметное стекло. Затем с помощью конфокальной флуоресцентной микроскопии проводили пошаговое (2 мкм) сканирование по оси Z заданного объема застывшей агарозы (28, 57 28,57 26,00-32,00 мкм) по результатам которого получали трехмерное изображение клеточных суспензий (Рис. 8). Далее в полученном просканированном объеме подсчитывали как количество клеток, сохранивших интактность мембран, (живые клетки), так и общее число клеток и пересчитывали на количество клеток в 1 мл для сопоставления с титром геномных копий, определяемом при помощи ПЦР РВ и с титром КОЕ.
Рисунок 8. Трехмерное изображение суспензий клеток S. typhimurium 14028s WT, инкубированных в среде AB в течение: А) 0 суток, Б) 16 суток. Масштабная метка соответствует 1 мкм.
При помощи данного метода нами было показано, что динамика титра жизнеспособных клеток (сохранивших интактность мембран) практически совпадала с общим титром клеток 3,6×109–3,5×109 КОЕ/мл.