
- •Учреждение образования «Международный государственный экологический университет имени а.Д.Сахарова»
- •Список сокращений
- •Содержание
- •Раздел 1. Обзор литературы …………………………………………… 8-36
- •Глава 1. Метилирование днк у млекопитающих …………………………… 8-10
- •Глава 2. Метилирование днк: биохимия …………………………................ 13-18
- •Глава 3. Биологическое значение метилирования днк ……………………. 19-22
- •Глава 4. Роль метилирования днк в канцерогенезе ……………………….. 23-36
- •Раздел 2. Материал, методология и методики ………............ 37-45
- •Глава 1. Метилирование днк: методы исследования ……………..……........... 37
- •Введение
- •Обзор литературы
- •1. Метилирование днк у млекопитающих
- •1.1 Метилирование днк: общие сведения
- •1.2 Метилирование днк генома млекопитающих
- •1.3 Распределение CpG динуклеотидов в геноме человека
- •1.6 Метилирование одиночных CpG-динуклеотидов
- •2. Метилирование днк: биохимия
- •2.1 Ацетилирование гистонов
- •2.3 Необходимость метилирования днк у эукариот
- •2.4 Dnmtl: днк-метилтрансфераза 1 белок и Dnmt3: днк-метилтрансфераза 3 белок
- •2.5 Метилирование генома как динамический процесс
- •2.6 Метилирование днк: влияние на структуру хроматина
- •3. Биологическое значение метилирования днк
- •3.1 Импринтинг: общебиологический аспект
- •3.2 Регуляция метилирования днк в эукариотических клетках
- •3.3 Метилирование днк во время эмбриогенеза
- •3.4 Регуляция экспрессии с помощью метилирования днк
- •4. Роль метилирования днк в канцерогенезе
- •4.1 Мутации метилированной днк
- •4.2 Региональное гиперметилирование в опухолях
- •4.3 Роль метилирования при канцерогенезе
- •4.4 Нарушения метилирования днк при канцерогенезе
- •4.5 Опухолевые клетки: свойства и метилирование днк
- •4.6 Метилирование CpG-островков в геноме опухлевых клеток
- •4.7 Полное гипометилирование генома и локальное гиперметилирование. Их роль. 5-МеС как эндогенный мутаген
- •4.8 Гены инактивированные метилированием в опухолях
- •Материал, методология и методики
- •1. Метилирование днк: методы исследования: общие сведения
- •1.1 Выделение днк
- •1.2 Бисульфитный метод и постановка амплификации. Определние гиперметилирования генов pten, mgmt, p16.
- •Заключение
- •Список использованных источников
4.4 Нарушения метилирования днк при канцерогенезе
За последние 15-20 лет было установлено, что паттерн метилирования в неопластических клетках значительно изменяется по сравнению с нормальными клетками, причем тотальное деметилирование генома сопровождается увеличением активности метилтрансферазы и локальным гиперметилированием CpG-островков. Во всех, без исключения, исследованных неоплазиях наблюдается подобный дисбаланс метилирования. В свете описанных выше функций метилирования в нормальных клетках, очевидно, что эти нарушения могут изменять структуру хроматина и функции ДНК, внося тем самым значительный вклад в создание генетической и фенотипической нестабильности опухолевой клетки [11].
4.5 Опухолевые клетки: свойства и метилирование днк
Исследования рака выявили относительно небольшой набор молекулярных, биохимических и клеточных признаков (приобретенных свойств), которые присущи большинству (если не всем) типов опухолевых клеток. Обретение клетками совокупности этих свойств есть необходимое и, по-видимому, достаточное условие развития злокачественной (дающей метастазы) опухоли.
Выделяют шесть основополагающих признаков злокачественного новообразования (см. Табл.1), порядок появления которых случаен. Только обладая всеми перечисленными свойствами, трансформированные клетки могут эволюционировать в метастазирующую опухоль. Единственная ситуация, при которой на протяжении относительного короткого срока (жизни индивидуума) становится возможным накопление в клетке нескольких (4-7) независимых генетических событий, это - дестабилизация ее генома. С этой точки зрения вклад эпигенетических событий в канцерогенез представляется наиболее очевидным в возникновении таких признаков, как нечувствительность к антиростовым сигналам ("эпимутация" Rb), инвазия и метастазирование (инактивация E-cad).
Принимая, однако, во внимание то обстоятельство, что механизмы апоптоза и ангиогенеза находятся под множественным контролем, включающим как позитивные (активирующие), так и негативные (ингибирующие) воздействия, нельзя исключить, что вклад эпигенетических факторов в нарушения онтогенеза и апоптоза также весьма значителен.
Более того, известные сегодня данные о влиянии аберрантного метилирования на сигнальные пути семейства р53 и о дестабилизирующем действии деметилирования ДНК свидетельствуют о том, что и кардинальное свойство опухолевой клетки - нестабильность ее генома - может иметь значительную эпигенетическую составляющую.
Таблица 1.
Приобретенные свойства раковой клетки [3]
Признак (пример) |
Молекулярный механизм |
Самообеспеченность ростовыми сигналами H-ras |
Активация онкогена |
Нечувствительность к антиростовым сигналам |
Инактивация супрессора Rb |
Блок апоптоза |
Активация Bcl-2 |
Неограниченный потенциал деления |
Активация теломеразы |
Стимуляция ангиогенеза |
Продукция индуктора VEGF |
Инвазия и метастазирование |
Инактивация E-cadherin |
4.6 Метилирование CpG-островков в геноме опухлевых клеток
Аберрантное метилирование CpG-островков в опухоли - крупномасштабный феномен. Подавляющее число исследований метилирования CpG-островков в опухоли имело своей целью конкретные гены. В последнее время, однако, появилась возможность методом рестрикционно-ориентированного геномного сканирования анализировать одновременно статус метилирования тысяч CpG-островков. Таким способом были сопоставлены примерно 1200 CpG-островков в 98 опухолях человека разного происхождения и в соответствующей нормальной ткани. Такой "взгляд с птичьего полета" на глобальное метилирование генома нормальных и опухолевых клеток позволил прийти к важным выводам. Установлено, в частности, что метилирование CpG-островков проявляет, с одной стороны, определенную опухолевую специфичность (т.е. существуют сайты, метилированные во многих опухолях разной локализации и неметилированные в норме) и, с другой стороны, некоторую специфичность по отношению к разным видам опухолей (т.е. некоторые сайты метилированы в одних опухолях и неметилированы в других). Приблизительные расчеты показывают, что среднее число CpG-островков, гиперметилированньгх в геноме опухолевой клетки, составляет примерно 600 (от 0 до 4500) из общего их числа в геноме человека (примерно 45 000) и, следовательно, примерно таким же должно быть число аберрантно ингибированных в опухолевой клетке генов. Тот факт, что особой разницы в степени метилирования CpG-островков в зависимости от стадии опухолевого процесса не выявлено, свидетельствует о том, что соответствующие сдвиги появились на раннем этапе развития опухоли. Масштаб выявленных изменений позволяет предположить существование большого числа генов помимо уже установленных, критически важных для роста опухоли и ее прогрессии. Выявление CpG-островков, гиперметилированных в опухолях, есть первый шаг к идентификации близко расположенных генов, большинство из которых пока не установлено.