Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
Гены и геномы. Т1.pdf
Скачиваний:
376
Добавлен:
28.12.2019
Размер:
57.56 Mб
Скачать

3. АППАРАТ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ И ЕГО ЛОГИКА

163

РИС. 3.55.

Пуромицин имитирует аминоацил-тРНК и прерывает элонгацию полипептидной цепи.

Пептидилпуромицин

Пуромицин

Пептидил-тРНК

 

в А-участке

в Р-участке

3.10. СУДЬБА СИНТЕЗИРОВАННЫХ БЕЛКОВ

Соединение аминокислот с образованием полипептидной цепи–это только первый шаг в процессе формирования многих белков. Полипептидная цепь должна быть уложена так, чтобы образовались правильные вторичная и третичная структуры, а в большинстве случаев отдельные полипептиды должны объединиться в функциональные олигомерные комплексы. Являются ли эти процессы полностью саморегулирующимися или протекают при участии ферментов – пока неясно. До образования функционально активных белков первичные продукты трансляции часто претерпевают разные сложные изменения. Приведем несколько примеров таких изменений.

а. Посттрансляционная модификация полипептидных цепей

Функционально активный гемоглобин образуется только после того, как α- и β-цепи объединятся в α2β2-структуру и с боковыми группами аминокис-

лот обеих субъединиц свяжется гемогруппа. Для того чтобы пируваткарбоксилаза и ацетил-СоА-кар- боксилаза стали активными ферментами, с определенными боковыми цепями их аминокислот должен ковалентно связаться биотин. Некоторые белки, участвующие в процессе свертывания крови, должны претерпеть карбоксилирование специфических остатков глутаминовой кислоты, для того чтобы образовались центры связывания Са2+. Для образования коллагена должно произойти гидроксилирование специфических пролиновых и лизиновых остатков. Очень важным и широко распространенным способом регуляции метаболизма являются фосфорилирование и дефосфорилирование определенных остатков серина, треонина и тирозина особыми протеинкиназами и протеинфосфатазами соответственно. Многие протеолитические белки, участвующие в процессах пищеварения и свертывания крови, синтезируются в виде крупных предшественников, которые далее активируются путем отщепления участка полипептидной цепи. Инсулин синтезируется в виде препроинсулинового полипептида и превращается в зрелый инсулин после расщепления цепи и удаления сначала N-концевого, а затем внутренне-

164

ЧАСТЬ I. МОЛЕКУЛЯРНЫЕ ОСНОВЫ НАСЛЕДСТВЕННОСТИ: ОБЗОР

В-цепь А-цепь

Препроинсулин

Проинсулин

Инсулин

РИС.3.56.

 

 

 

Превращение препроинсулина в инсулин. При трансля-

те чего удаляется центральная часть (С) первичного

ции инсулиновой мРНК образуется крупный предшест-

трансляционного продукта. Остающиеся А- и В-цепи

венник - препроинсулин. Функциональный гормон, пред-

активного инсулина удерживаются вместе дисульфид-

ставляющий собой гетеродимер, образуется после от-

ными связями, образовавшимися в исходном полипеп-

щепления N-концевого сигнального сегмента и расщеп-

тиде.

 

ления молекулы проинсулина в двух местах, в результа-

 

 

го сегмента (рис. 3.56). Многие вирусные белки,

да такой информации и как она реализуется?

гормоны, нейропептиды образуются из первичных

Сложный транспортный аппарат эукариотиче-

трансляционных продуктов полипротеинов–в ре-

ских клеток. Рибосомы в эукариотических клетках

зультате расщепления по многим сайтам и образо-

существуют в двух состояниях: в свободном и свя-

вания нескольких зрелых белков и пептидов мень-

занном с мембранами. Белки, предназначенные для

шего размера.

 

некоторых органелл и цитозоля–водной фракции

 

 

цитоплазмы,–синтезируются на свободных рибосо-

б. Доставка эукариотических белков

мах, а белки, остающиеся в лизосомах, структурах

Гольджи и плазматической мембране, образуются

к клеточным

мембранам

на рибосомах, ассоциированных с эндоплазматиче-

и проникновение через них

ским ретикулумом (ЭР)–непрерывной сети внутри-

 

 

клеточных мембран, окружающих пространство, на-

В клетках эукариот помимо плазматических

зываемое просветом ЭР. Мембраны ЭР, с которыми

мембран имеются разнообразные внутриклеточные

связаны рибосомы,

называются шероховатым ЭР,

мембраны, отграничивающие различные клеточные

а мембраны, не связанные с рибосомами,– гладким

органеллы: митохондрии, хлоропласты (у расте-

ЭР (рис. 3.57). Белки, синтезированные на рибосо-

ний), эндоплазматический ретикулум, аппарат Гольд-

мах, связанных с ЭР, проходят через мембраны ЭР

жи, пероксиомы, лизосомы и секреторные пузырьки

в просвет ЭР, а «прокладывает» им путь N-концевой

(везикулы) (рис. I.1, А). Каким образом белки, пред-

участок (рис. 3.58). Затем этот участок, состоящий

назначенные для столь многочисленных клеточных

преимущественно из

гидрофобных аминокислот,–

мембран и компартментов, попадают к месту сво-

сигнальная последовательность – отщепляется специ-

его назначения? Закодирована ли в белковой струк-

фическими эндопептидазами, локализованными в

туре информация об их внутриили внеклеточной

просвете ЭР. Такой направленный перенос белков

локализации? Если да, то какова химическая приро-

от рибосом в просвет ЭР начинается уже во время

3. АППАРАТ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ И ЕГО ЛОГИКА

165

Шероховатый

эндоплазматический

ретикулум

Гладкий

эндоплазматический

ретикулум

РИС. 3.57.

Электронная микрофотография среза печени крысы, на

тиц. Напротив, протяженные мембранные структуры

которой видны гладкий и шероховатый эндоплазмати-

шероховатого ЭР (справа и внизу) усеяны рибосомами.

ческий ретикулум (ЭР). Мембраны гладкого ЭР (слева

Крупные, более плотные структуры - митохондрии. (С

вверху) почти не содержат связанных рибосомных час-

любезного разрешения George E. Palade.)

синтеза полипептидной цепи и поэтому называется

кислот. Элонгация полипептидной цепи замедляется

котрансляционным транспортом.

до тех пор, пока комплекс СРЧ – сигнальная после-

Направление

синтезируемых полипептидных це-

довательность не свяжется с СРЧ-Р в мембране ЭР.

пей в просвет ЭР. Транспорт мембранных и секре-

Сразу после этого СРЧ отделяется, скорость синтеза

тируемых белков в просвет ЭР опосредуется вза-

полипептидной цепи увеличивается и растущая по-

имодействием полипептидной сигнальной последо-

липептидная цепь протягивается сквозь мембрану

вательности с сигнал-распознающей частицей (СРЧ)

в просвет. Итак, ассоциация транслирующей рибо-

и рецептором этой частицы (СРЧ-Р). Что заставляет

сомы с СРЧ-Р приводит к однонаправленному пе-

рибосому направиться к ЭР, если белок, который

реносу растущей полипептидной цепи в просвет ЭР.

она синтезирует, должен впоследствии секретиро-

Особая пептидаза, локализованная в просвете ЭР,

ваться или транспортироваться в лизосомы или

осуществляет специфическое отщепление сигналь-

плазматические мембраны? Несомненно, это зави-

ной последовательности от новосинтезированного

сит не от самой рибосомы. Белки цитозоля синтези-

белка.

руются на рибосомах, идентичных рибосомам, син-

СРЧ представляет собой комплекс из шести бел-

тезирующим белки ЭР. В самом деле, рибосома,

ков с мол. массами от 10000 до 75000 Да и единст-

в одном раунде

синтезирующая белок цитозоля,

венной молекулы РНК длиной 300 нуклеотидов –

в следующем может синтезировать мембранный

7SL-PHK. Ни РНК, ни белки сами по себе не могут

белок. Попадание белка в ЭР происходит только

функционировать как СРЧ. Однако при смешивании

в результате взаимодействия СРЧ с сигнальной

РНК и белков in vitro образуется функциональная

последовательностью синтезируемой белковой цепи

СРЧ. В таких экспериментах молекулы 7SL-PHK из

(рис. 3.59). Комплекс «СРЧ–сигнальная последова-

клеток млекопитающих, амфибий и насекомых мо-

тельность» взаимодействует впоследствии с рецеп-

гут образовать СРЧ с белками млекопитающих.

тором СРЧ, локализованным в мембране ЭР. Таким

Этот факт наряду с данными о близости нуклеотид-

образом, СРЧ служит адаптером между аппаратом

ных последовательностей 7SL-PHK из этих источни-

синтеза белка в цитоплазме и аппаратом его до-

ков говорит о том, что структура 7SL-PHK эволю-

ставки и отвечает за попадание белков в просвет

ционно консервативна. Состоит ли роль 7SL-PHK

ЭР. СРЧ связывается с сигнальной последователь-

в прямом узнавании сигнальной последовательно-

ностью сразу после выхода ее из рибосомы, т.е.

сти или она служит каркасом для сборки разных

после синтеза сегмента длиной примерно 70 амино-

белковых субъединиц в функциональной СРЧ, а воз-

40S

60S

Мембраны ЭР

Просвет ЭР

С-концевой якорь

3. АППАРАТ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ И ЕГО ЛОГИКА

167

РИС. 3.58.

Котрансляционный транспорт полипептидных цепей. Полипептиды, синтезируемые на рибосомах шероховатого ЭР, направляются через мембраны в просвет ЭР. Гидрофобный N-концевой участок нового белка - сигнальная последовательность - проходит через мембрану вскоре после начала трансляции и по мере элонгации полипептида выходит в просвет ЭР. Синтезированные белковые молекулы подвергаются в ЭР различным модификациям в зависимости от их окончательной судьбы, однако все они утрачивают свою сигнальную последовательность. N' - это новый N-конец, образующийся после отщепления сигнальной последовательности. На верхнем рисунке сигнальная последовательность заякорена в мембране; она отщепляется по завершении трансляции, и полипептид с новым N-концом оказывается в просвете ЭР. На среднем рисунке сигнальная последовательность отщепляется еще до завершения трансляции; С-конец синтезированного полипептида заякорен в мембране ЭР. На нижнем рисунке сигнальная последовательность отщепляется сразу после попадания полипептида в просвет ЭР.

можно, и то и другое,– пока неизвестно. Сигнальная последовательность обычно нахо-

дится на N-конце белков, предназначенных для экспорта к одной из клеточных мембран или внутриклеточным органеллам. В некоторых случаях, однако, аминокислотная последовательность, узнаваемая СРЧ, не является ни N-концевой, ни отщепляемой от транспортируемого белка, а отдельные секретируемые белки не содержат вообще никакой сигнальной последовательности.

Длина сигнальной последовательности колеблется от 15 до 35 аминокислот, и в первых трех ее четвертях преобладают гидрофобные остатки (рис. 3.60), однако никакой консервативной аминокислотной последовательности этот участок не имеет. Для узнавания сигнальной последовательности СРЧ скорее важна ее вторичная структура. Интересно, что сигнальные последовательности белков эукариот узнаются аппаратом транслокации бактерий, а сигнальные последовательности секретируемых бактериями белков могут проникать через мембранные компоненты эукариотических клеток.

В пределах сигнальной последовательности находится также и сайт, распознаваемый сигнальной пептидазой. Обычно расщепление происходит со

Рибосома

Сигналраспознающая частица (СРЧ)

Рецептор СРЧ

Мембрана ЭР

Просвет ЭР

Свободный белок в просвете ЭР

РИС. 3.59.

Перенос синтезированного полипептида в ЭР опосредуется сигнал-распознающей частицей (СРЧ). Показано, как СРЧ связывается с N-концевой сигнальной последо-

вательностью растущей полипептидной цепи и затем с СРЧ-рецептором в мембране ЭР, в результате чего пептид проникает в просвет ЭР.

168

ЧАСТЬ I. МОЛЕКУЛЯРНЫЕ ОСНОВЫ НАСЛЕДСТВЕННОСТИ: ОБЗОР

Гиброфобный участок

Заряженный участок

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Белок

Липопротеин

β-Лактамаза pBR322

Основной белок оболочки фага td

Щелочная фосфатаза

Мальтозосвязывающий белок

Лейцинсвязывающий белок Проальбумин Легкая цепь IgG

Лизоцим

Пролактин

Гликопротеин вируса везикулярного стоматита

ных аминокислот, а за ним следует гидрофобный сег-

мент. [S. Michaelis, J. Beckwith, Ann. Rev. Microbiol., 36

(1982), p. 435; D.P. Leader, Trends Biochem. Sci., 4

(1979), p. 205.]

РИС. 3.60. Характерные сигнальные последовательности, находя-

щиеся на N-конце некоторых прокариотических и эука-

риотических белков. В начале этих последовательностей

имеется короткий участок из одной или более заряжен-

A

Секреторные везикулы, выходящие с транс-стороны

Цистерны

Гольджи

 

Транспортные везикулы,

Б

отделяющиеся от

шероховатого ЭР

 

РИС. 3.61.

Аппарат Гольджи. А. Электронная микрофотография экзокринных клеток поджелудочной железы крысы, на которой видны примыкающие к ЭР цистерны аппарата Гольджи. Цистерны, расположенные ближе к ЭР, называются цис-цистернами, а дальше - транс. Видны везикулы, отпочковывающиеся от элементов ЭР. [Е.М. Меrisko, M. Fletcher, G. Palade, Pancreas, 1 (1986), p. 95. С любезного разрешения M.G. Farquhar.] Б. Схематическое изображение цистерн и везикул аппарата Гольд-

жи. [J.

Darnell,

H. Lodish, D.

Baltimore,

Molecular Cell

Biology

(New

York: Scientific

American

Books, 1986)

и в соответствии с моделью J. Kephart]

 

3. АППАРАТ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ И ЕГО ЛОГИКА

169

Клеточная мембрана

Цитозоль

Транс-поверхность

Просвет

аппарата

Гольджи

Цис-поверхность

Транспортные

везикулы

Рибосомы

Просвет ЭР

Ядро

Оболочка

РИС. 3.62.

Транспортные везикулы, содержащие полипептиды, ко-

ность в составе транспортных везикул, отделяющихся от

торые должны попасть в лизосомы, плазматические

цистерн Гольджи. Во время прохождения полипептидов

мембраны или секретироваться, отделяются от ЭР и

через структуры аппарата Гольджи они претерпевают

сливаются с цис-поверхностью аппарата Гольджи. По-

такие посттрансляционные модификации, как протеоли-

липептиды проходят через аппарат Гольджи в составе

тическое расщепление и гликозилирование.

этих везикул и выходят в цитозоль через транс-поверх-

 

стороны С-конца остатков глицина, серина или

ных, взаимопроникающих, окруженных мембрана-

аланина, поэтому N-конец многих зрелых секрети-

ми цистерн (рис. 3.61). Перенос белков к аппарату

руемых или мембранных белков соседствует с одной

Гольджи осуществляется с помощью так называе-

из этих аминокислот в сигнальной последователь-

мых окаймленных пузырьков (везикул), отпочковы-

ности.

вающихся от ЭР и сливающихся с цистернами

Транспорт белков от ЭР к аппарату Гольджи

Гольджи (рис. 3.62). Белки проходят через аппарат

и из него. Белки направляются к лизосомам, плаз-

Гольджи от цис-цистерн к транс. Транспорт белков

матическим мембранам или секретируются с по-

через цистерны также осуществляется с помощью

мощью аппарата Гольджи–набора тесно упакован-

окаймленных транспортных везикул.

170

ЧАСТЬ I. МОЛЕКУЛЯРНЫЕ ОСНОВЫ

НАСЛЕДСТВЕННОСТИ: ОБЗОР

 

Шероховатый ЭР

Гольджи

 

цис

транс

 

N-ацетилглюкозамин

Долихол

Манноза

Глюкоза

 

Галактоза

 

Фукоза

 

Сиаловая кислота

 

Фосфат

РИС. 3.63.

Гликозилирование белков в шероховатом ЭР и цистер-

белок проходит через аппарат Гольджи. Разные белки

нах Гольджи. В ЭР разветвленный олигосахарид, свя-

содержат различные N-связанные олигосахариды в за-

занный с липидом долихолом с помощью пирофосфат-

висимости от первичной и вторичной структуры белка,

ного мостика, переносится на аспарагиновый остаток

а также от наличия или отсутствия специфических фер-

белка в последовательности asn-x-ser или asn-x-thr (где

ментов, осуществляющих процессинг

олигосахаридов

х - любая аминокислота). Затем N-связанный олигоса-

в клетках [J. Darnell, H. Lodish, D. Baltimore, Molecular

харид модифицируется в результате последовательных

Cell Bioilogy (New York: Scientific

American

Books,

специфических гликозилгидролазных и гликозилазных

1986).]

 

 

реакций, протекающих либо в ЭР, либо в то время, когда

 

 

 

Белки, предназначенные для секреции, сначала

в. Транспорт белков

 

попадают в секреторные везикулы, которые в конце

в эукариотические клеточные

 

концов сливаются с плазматическими мембранами

органеллы

 

 

и высвобождают свое содержимое наружу. Когда

 

 

 

секреция белков индуцируется (как в случае инсули-

Не все белки, направляемые к внутриклеточным

на или некоторых нейропептидов), цитозольные сек-

органеллам, следуют маршрутом, включающим ЭР

реторные пузырьки сливаются с мембраной и вы-

и аппарат Гольджи. Большинство белков митохонд-

свобождают содержимое наружу только после ин-

рий, ядер, хлоропластов растений синтезируются на

дукции. Как окаймленные везикулы различают бел-

свободных цитоплазматических рибосомах

либо

ки, предназначенные для того или иного клеточного

сразу в виде зрелых форм, либо в виде предшест-

компартмента, неясно. Неизвестно также, различа-

венников и затем подхватываются соответствую-

ются ли между собой везикулы, несущие разные

щими органеллами. Остальные белки митохондрий

белки, и если различаются, то чем именно.

и хлоропластов кодируются ДНК,

содержащейся

Гликозилирование. Проходя через ЭР и аппарат

в этих органеллах, и синтезируются с помощью

Гольджи, белки подвергаются интенсивной модифи-

аппарата трансляции этих органелл аналогично то-

кации (рис. 3.63). Специальный фермент ЭР присо-

му, как это происходит в цитоплазме.

 

единяет разветвленный олигосахарид к специфиче-

Митохондрии, например, имеют несколько ком-

ским аспарагиновым остаткам транспортируемых

партментов: матрикс, наружную мембрану и меж-

белков. Далее олигосахарид подвергается действию

мембранное пространство (рис. 3.64). Белки, коди-

целого ряда специфических гликозилгидролаз и гли-

руемые ядерной ДНК, которые должны быть

козилированию; эти реакции протекают в ЭР и в

локализованы в матриксе, синтезируются в виде

то время, когда белки проходят через аппарат

предшественника и содержат от 25 до 60 лишних

Гольджи.

аминокислот на N-конце. После связывания с ре-

 

цептором на наружной мембране предшественник

 

транспортируется в этот внутренний матрикс. Дви-

 

жущей силой процесса является электрохимический

3. АППАРАТ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ И ЕГО ЛОГИКА

171

потенциал на внутренней мембране, генерируемый с помощью энергетически выгодных реакций, протекающих в митохондрии. Одновременно с переносом или сразу после него лишние аминокислоты на N-конце удаляются специфическими протеазами, находящимися в матриксе. Некоторые белки остаются во внутренней мембране, а другие проходят сквозь мембрану и попадают в матрикс. Белки, синтезированные в цитозоле и направленные в межмембранное пространство митохондрий, переносятся несколькими способами (рис. 3.64). Некоторые предшественники содержат особый N-концевой сегмент и попадают в митохондрии так, как это было

описано выше. У других предшественников отщепление концевой последовательности приводит к тому, что белки остаются временно встроенными во внутреннюю мембрану; затем следующий процессирующий фермент расщепляет этот промежуточный продукт, и зрелый белок выходит в межмембранное пространство. Белки, локализуемые в наружной мембране, транспортируются энергонезависимым путем и без превращения предшественника в зрелый белок. В некоторых случаях переносу цитозольного белка в наружную мембрану способствуют конформационные изменения белковой молекулы при связывании простетической группы. Белки закрепляют-

Наружная

мембрана

митохондрий

Цитозоль

Внутренняя

мембрана

Белок, включающийся во митохондрий внутреннюю мембрану

Межмембранный

белок

Матриксныйбелок

 

Спонтанная

Белок,включающийся

реакция

в наружную мембрану

 

РИС. 3.64.

Включение белков в митохондрии. В зависимости от способ транспортировки и подвергаются разным моконечной локализации митохондриальных белков (она дификациям.

указана слева) последние используют тот или иной