- •Раздел 1. Основы строения и факторы, определяющие реакционную способность органических соединений
- •1.1. Введение в биоорганическую химию. Основные понятия и термины
- •1.2. Классификация и номенклатура органических соединений
- •Классификация органических соединений по строению углеродного скелета
- •Основные функциональные группы и классы органических соединений
- •Классификация органических соединений по наличию функциональных групп
- •Приставки и окончания, применяемые для обозначения некоторых групп в биологически важных соединениях
- •При построении названия соединения:
- •Ациклические углеводороды
- •Карбоциклические углеводороды
- •Гетероциклические соединения
- •1.3. Электронное строение органических соединений
- •1.4. Химические связи атома углерода
- •Бензол как прототип ароматических соединений
- •Гетероциклические ароматические системы.
- •1.6. Электронные эффекты заместителей
- •Характер совместного действия заместителей
- •1.7. Пространственное строение органических соединений. Изомерия.
- •Пространственная изомерия
- •Конфигурационный стандарт – глицериновый альдегид
- •Пространственное строение циклических соединений
- •Типы реагентов и характер изменения связей в реакционном центре субстрата
- •По характеру изменения связей в субстрате и реагенте
- •По направлению (конечному результату)
- •По числу молекул (частиц), участвующих в стадии, определяющей общую скорость реакции
- •Методики выполнения общих качественных реакций на функциональные группы
- •1. Бромирование бромной водой
- •2. Реакция гидроксилирования (реакция Вагнера)
- •Реакция идентификации многоатомных спиртов
- •Идентификация первичных и вторичных спиртов реакцией окисления бихроматом калия в кислой среде
- •Реакция идентификации фенольного гидроксида
- •2. Реакция “медного зеркала”
- •Б. Определение уксусного альдегида
- •Сводные вопросы к теоретическому экзамену по биоорганической химии
- •Теоретические основы строения и реакционной способности органических соединений.
- •II. Общие закономерности реакционной способности органических соединений как химическая основа их биологического функционирования.
- •III. Биополимеры и их структурные компоненты. Липиды.
- •Библиографический список
Пространственное строение циклических соединений
При замыкании колец в органических соединениях можно наблюдать возникновение углового напряжения.
Угловое напряжение – увеличение энергии молекулы, вызванное отклонением угла между связями от идеальной величины (109º28´) − напряжение Байера. Это напряжение необходимо отличать от торсионного напряжения.
Торсионное напряжение – увеличение энергии молекулы, вызванное заслоненным положением заместителей – обычно по σ-связям.
Циклогексановое кольцо встречается во многих биологически активных соединениях. Все шесть углеродных атомов находятся в состоянии sp3-гибридизации, следовательно, их химические связи не лежат в одной плоскости. Если бы циклогексановое кольцо было плоским, то все его заместители находились бы в невыгодной заслоненной конформации, что приводило бы к возникновению торсионного напряжения. На деле кольцо это очень прочно, так как существует в виде двух конформаций: кресла или ванны (лодки):
конформация кресла конформация ванны (лодки)
Наиболее выгодной является конформация «кресла», так как в ней полностью отсутствует угловое напряжение.
Каждый атом углерода в циклогексановом кольце может иметь два заместителя: в аксиальном (а) и экваториальном (е) положениях.
Аксиальные заместители (а) располагаются вверх и вниз параллельно оси симметрии.
Экваториальные заместители (е) расположены под углом 109º28´ к оси симметрии в направлении к периферии от молекулы.
Наиболее энергетически выгодным является экваториальное расположение заместителей в циклогексановом кольце, так как при этом отсутствует торсионное напряжение.
При аксиальном расположении заместителей возникают 1,3 диаксиальные взаимодействия, что ведет к возникновению торсионного напряжения и образованию термодинамически менее устойчивых соединений.
1.8. Классификация реагентов и органических реакций.
Реакционная способность – способность вещества вступать в ту или иную химическую реакцию и реагировать с большей или меньшей скоростью.
Реакционный центр – атом или группа атомов в молекуле, непосредственно участвующие в химической реакции.
Субстрат – вещество, подвергающееся изменениям в результате химической реакции.
Реагент – партнер субстрата и более простое вещество.
Типы реагентов и характер изменения связей в реакционном центре субстрата
Кислотные реагенты (кислоты) – доноры протона по отношению к реакционному партнеру: частично или нацело ионизированные в водных растворах нейтральные молекулы (HCl, CH3COOH) или положительно заряженные частицы (NH4+, H3O+).
Основные реагенты (основания) – акцепторы протона по отношению к реакционному партнеру. Отрывают протон от кислотного центра:
отрицательно заряженные частицы B(ASE)- HO-, CH3O-
или нейтральные молекулы B: – NH3 , H2O.
Нуклеофильные реагенты (нуклеофилы) – частицы, образующие новую ковалентную связь за счет своей электронной пары.
Свойства:
- обладают повышенной электронной плотностью, взаимодействуют с любым атомом (кроме водорода), несущим частичный или полный положительный заряд;
- нуклеофил заряжен отрицательно (Nu-, Cl-, HO-, CH3O-, R3C- - карбоанион) или имеет неподеленную пару электронов (Nu, NH3 , H2O) или π-связь CH2= CH2, C6H6.
Электрофильные реагенты (электрофилы) – частицы, образующие новую ковалентную связь за счет пары электронов партнера.
Свойства:
- взаимодействуют с реакционным центром партнера с повышенной электронной плотностью;
- имеют атом, несущий частичный или полный положительный заряд или обладают вакантной орбиталью.
Радикальные реагенты (радикалы) – свободные атомы или частицы с неспаренным электроном (парамагнитные частицы).
R• – Cl•, Br•, HOO•, R•, •O–O• (бирадикал)
-
Окислители – нейтральные молекулы или ионы, принимающие электроны или атомы водорода от органического субстрата.
[O] (или Ox) – O2, Fe3+, органические окислители
Восстановители – нейтральные молекулы или ионы, отдающие электроны или атомы водорода органическому субстрату.
[H] (или Red) – Р2, Fe2+, Н-, органические восстановители
реакционный центр кислотный, реагент основный |
реакционный центр основный, реагент кислотный |
Способы разрыва ковалентной связи
Гомолитический (свободнорадикальный)
гомолиз связи
Образующиеся промежуточные частицы – свободные радикалы
Гетеролитический (ионный)
гетеролиз связи
Образующиеся органические промежуточные частицы
- карбокатионы (с положительным зарядом на атоме углерода) или
- карбоанионы (с отрицательным зарядом на атоме углерода)
Классификация реакций
