
- •1.Структура и функции мембран.Виды трансмембранного переноса.Механизм работыNa-k-Атф-азы.
- •2.Функции и свойства белковых и липидных компонентов мембран. Белки-рецепторы.Транспортная передача сигналов в клетку.
- •3.Структура,классификация аминокислот по строению радикалов.
- •4.) Структура аминокислот. Заменимые и незаменимые аминокислоты, кетогенные и гликогенные.
- •5.) Физико-химические свойства аминокислот.
- •6.)Структура и функции белков.
- •8.Структура белков. Связи характерные для третичной и четвертичной структуры
- •9. Физико-химические свойства белков
- •11.Методы выделения и очистки белков.
- •12.Оценка степени очистки и Определение Mr.
- •Вопрос 22. Типы ферментативных реакций. Механизмы 2-хсубстратаых реакций. Механизм ферментативного действия пиридоксаль-зависимого фермента аланинаминотрансферазы.
- •Вопрос 23. Кинетика ферментативных реакций. Единицы активности. Измерения скорости реакции. Порядок реакции.
- •Вопрос 24. Зависимость скорости ферментативной реакции от рН, температуры, концентрации фермента, субстрата.
- •31. Применение ферментов в медицине. Способы определения активности ферментов в сыворотке крови.
- •32. Строение и функции нуклеотидов в живых организмах.
- •33. Биосинтез и катаболизм пиримидиновых нуклеотидав. Регуляция биосинтеза.
- •3 7. Строение и физико-химические свойства днк. Методы исследования структуры днк
- •38. Строение и функции рнк.
- •39.Репликация днк у прокариот. Свойства днк-полимераз прокариот. Лекарственные препараты, тормозящие репликацию.
- •40. Репликация днк у эукариот. Свойства днк-полимераз эукариот. Репликация днк и клеточный цикл.
- •41.Этапы процесса транскрипции. Днк-зависимые рнк-полимеразы эукариот и прокариот.
- •42.Инициация элонгации и терминация транскрипции у эу и про:
- •43. Процессинг у прокариот
- •44. Процессинг у эу:
- •45. Активирование аминокислот и необходимые компоненты этапов трансляции
- •46.Процесс трансляции и прокариот
- •47.Процесс трансляции у эукариот
- •Инициация трансляции
- •Механизм инициации трансляции у прокариот
- •Элонгация
- •51. Источники и пути расходования ак в организме. Азотистый баланс. Общая схема потока азота при катаболизме ак.
- •53. Цикл синтеза мочевины. Болезни, вызванные генетическими дефектами ферментов цнс. Методы определения концентрации мочевины в крови и моче.
- •Вопрос 60
- •Вопрос 61
- •Вопрос 62
- •64. Механизм сопряжения окисления и фосфорилирования.
- •65.Основной энергетический обмен и теплопродукция. Потоки важнейших метаболитов, поступающих в митохондрии и выходящих из них.
- •66.Токсичность активных форм кислорода (афк). Свободные радикалы. Перекисное окисление. Окислительный стресс. Механизмы антиоксидантной защиты.
- •70. Катаболизм глюкозы в условиях недостатка кислорода (анаэробный)
- •71. Катаболизм глюкозы в условиях недостатка кислорода (аэробный)
- •772.Глюконеогенез: локализация, функции, регуляция глюконеогенеза.
- •57. Биологически активные производные тирозина. Локализация синтеза и их роль в организме.
- •2.Меланины
- •58. Биосинтез креатина, креатинфосфата и креатинина в организме. Карнитин, карнозин, ансерин. Их роль в организме
- •59. Синтез и катаболизм гема. Значение конъюгирования продуктов метаболизма гема в печени.
- •75.Классификация и функции липидов.
- •76.Окисление жирных кислот.Реакции пути в-окисления.
- •77.Синтез и использование кетоновых тел.Изменения метаболизма при голодании.
- •78.Образование триацилглицеринов из углеводов.Метаболизм триацилглицеринов. Переваривание пищевых жиров. Депонирование и мобилизация жиров.
- •79.Стероиды.Роль и биосинтез холестерина в организме.
- •80.Механизмы формирования атеросклеротического повреждения сосудов.
- •82. Классификация, метаболизм, функции лп. Дислипопротеинемии.
- •83. Биологические активные вещества. Витамины.
- •67.Строение функции углеводов(ув)
- •69. Глюкоза как важнейший метаболит углеводного обмена. Источники и пути использования глюкозы в организме.
- •Вопрос 73. Соотношение превращений субстратов и процессов, происходящих в печени, мышцах и жировой ткани.
- •Регуляция гликолиза и глюконеогенеза.
- •Вопрос 74. Биосинтез и мобилизация гликогена. Схема регуляции активности гликогенфосфорилазы и гликогенсинтазы.
- •Гликгенолиз.
- •Ингибирование субстратом
- •90. Регуляторные полипептиды. Калликреин-кининовая и ренин-ангиотензиновая системы организма.
- •92.Интеграция и регуляция метаболизма. Направление потоков ключевых метаболитов между различными метаболическими путями.
- •84.Механизмы передачи гормонального сигнала.
- •Гидрофильные:
- •Липофильные
- •Вопрос 86.Синтез и секреция кортикостер.Г.Их роль
- •Вопрос87.Синтез и секреция гормонов щитов.Железы
- •Вопрос 88.Синтез и секреция половых гормонов.
- •Вопрос 89.Простагландины и их роль.
- •48.Лекарства и другие ингибиторы трансляции.
- •94.Интеграция метаболизма основных специализированных тканей организма человека.
- •50. Молекулярные механизмы канцерогенеза. Пути активации протоонкогенов.
- •49.Регуляция экспрессии генов.
- •13. Последовательность и методы изучения первичной и вторичной структуры белка
- •20.Классификация и номенклатура ферментов.
- •21. Механизмы ферментативного катализа. Энергия активации. Образование фермент-субстратного комплекса.
- •22.Типы ферментативных реакций.Механизмы 2-х субстратных реакций.Механизм ферментативного действия пиридоксаль-зависимого фермента аланинаминотрансферазы.
- •54 Катаболизм углеродного скелета ак. Кетогенные и гликогенные аминокислоты.
- •55 Биогенные амины:гистамины, серотонин, катехоламины. Происхождение и функции в организме.
- •56 Обмен фенилаланина и тирозина. Болезни, вызванные генетическими дефектами ферментов обмена этих аминокислот.
- •93 Интеграция и регуляция метаболизма. Стратегии регуляции потока метаболитов.
45. Активирование аминокислот и необходимые компоненты этапов трансляции
Трансляция («перевод») – перевод информации, заложенной в последовательности нуклеотидов мРНК в последовательность аминокислотных остатков в полипептидные (ПП) цепи.
Последовательность аминокислот (АК) в белке коллинеарна последовательности кодонов в кодирующей РНК (последовательность нуклеотидов однозначно определяет расположение АК остатков в ПП цепи)
Активирование АК и присоединение их к соответствующей тРНК
Сборка ПП цепи с помощью рибосом, кодирующей движение вдоль мРНК, считывая информацию от 5/ к 3/ концу мРНК
Формирование шапочки ( защита от РНКаз) происходит во время трансляции или сразу после окончания
Полиаденилирование 3/ - конца 200-300 аденилатных остатков
Функции полиА-го хвоста:
стабилизация структуры мРНК
счетчик использования рибосом
Сплайсинг – процесс удаления интронов. Процесс катализирует сплайсносома.
Маленькие RNA узнают определенные последовательности в интроне, а затем сводят последовательности экзонов в ряд для РНК.
Интроны – ловушки мутаций.
Активированние АК
Идет в цитоплазме. Необходим. АК, тРНК, амино-ацил – тРНК-синтетазы, АТФ и Mg2+
Активирование происходит за счет энергии АТФ
Энергетическая связь ост. в АК ( на оборот. пептид. связи )
Затем с помощью тРНК-синтетазы идет процесс рекогнации («узнавание») определенной АК своей тРНК, после идет присоединение.
Трансляция имеет три стадии: Инициация, элонгация, терминация.
Инициация
Малая субъединица начинает движение с 5/ до 3/ конца, находя норм. правильное место, может разместить только 2 кодона (2 сайта)
Левый называется пептидный кодон ( стартовый ), это АУГ (редко ГУГ) код-ый нуклеотид – метионин.
Правый называется – аминоацильный центр А.
Завершение инициации – присоединение с помощью интикодоновой петли тРНК, на конце у которой метионин,подсоед. своей бывшей карбоксильной группы.
А-Ц:Г-Ц, затем «схлопывание» рибосом.
Элонгация
К кодону 2 подходит петля. Между АК должна возникнуть пептидная связь. Пептидин-трансфераза – фермент большой субъединицы. Происходит присоединение субъединицы. Рибосома скользит от одного кодона к другому; необходимо ГТФ и транслоказа.
Процесс повторяется до тех пор, пока на АК сайт не придет стоп-кодон (УАА,УГА) так белковые факторы узнают терминирующие кодоны и блокируют дальнейшую элонгацию цепи – этап терминации.
Необходимые компоненты Трансляции (факторы)
|
Прокариоты |
Эукариоты |
Инициация |
IF-1;IF-2;IF-3 |
eIF - №/или буква eIF – 1/альфа |
Элонгация |
EF-T4;EF-G (транслоказы) |
eIF – 2/бетта eIF – 2 |
Терминация |
RF-1;RF-2;RF-3 (узнают стоп-кодон) |
eRF-1 eRF-3 |
46.Процесс трансляции и прокариот
мРНК (инициирующий кодон АУГ, редко ГЦГ)
рибосомные субъединицы 30S и 50S, энергия ГТФ, Mg2+, факторы инициации IF-1;IF-2;IF-3
Стадия инициации
Формирование 30S инициирующего комплекса
IF-3 фактор антиассоциаций, объединенный в комплекс с малой субъединицей и препятствующий «схлопыванию» малой и большой субъединицам.
IF-2 –фактор, подводящий энергию, связанную с ГТФ
IF-1 – ускоряет все превращения 30S со специфическим сайтом на мРНК в присутствии IF-1 и IF-2 и начинает движение вдоль мРНК. Доходит до последовательности (АГГАГГЦ) богат пурином. Как только это происходит , это означает, что ниже по течению находится стартовый инициирующий кодон (АУГ) ГУГ. Скорее мРНК, имеющая данную последовательность, установлен. временное соответствие с малой субъединицей на мРНК и Р-сайте. На Р сайт встает АУГ. К нему подходит формилметианин –РНК, чтобы произошло узнавание с антикодоновой петлей + ГТФ.
16S рибос. РНК + белки = 30S
Процесс инициации заканчивается тем, что от субъединицы 30S отходит IF-3 и диссоциирует. Возникает 70S инициирующий комплекс.
30S+50S=70S (общая субъединица)
Элонгация
Вырожденность – возможность кодирования АК несколькими кодонами. (иногда даже шестью) Существует гипотеза качаний (колебаний), основание тРНК антикодон петли вступают в отношение комплементарн. соответствия с кодонами матричной цепи анти параллельным образом. Некоторые тРНК образую пары более, чем с одним кодоном. Антикодоны спариваются по правилу Г-Ц, А-У.
V = 20 АК/сек.