42.Инициация элонгации и терминация транскрипции у эу и про:

Инициирующие факторы про:

Сигма субъединица РНК полимеразы: функция: узнать определенную последовательность промотера, связаться с ними, привлечь cor enzyme и содействовать началу элонгации. Сигма-ф способствует расплавлению двуцепочечной ДНК и катализирует основания примерно до 10 нуклеотидов. Сигма субъединица может уйти и работать будет только cor enzyme.

Инициирующие факторы эу: TF II D, TF II A, TF II B, TF II E (транскрибирующий факор необходимый для начала)

D – узнает и связывается с ТАТА-боксом.

А- подсоединяется к TF II D и привлекает к себе TF II B

В – связывается с полимеразой II, имеющей мощную АТФазную активность(=> добывается энергия)

Е- для чего-то нужен. Завершает образование комплекса и начинается транскрипция

РНК-полимеразы I и III тоже нужны.

Определенный факторы узнают enhancerы.

Терминация транскрипции:

Про: 1 способ: ро-зависимая(фактор-зависимая). Определенная терминирующая последовательность служит сигналом терминации ро-фактора. Ро-фактор требует энергию АТФ(имеется АТФазная активность).

2 способ: ро-независимая терминация

Существует особая терминирующая последовательность коэнзим (2альфа, бета, бета штрих), и когда до нее доползает , заставляет транскрипции прекратить.

РНК-полимераза доходит до полиндрома, где много Г-Ц-пар.

Эу: существует небольшое кол-во терминирующих последовательностей. Для большинства генов эу транскрипция продолжается и после полиаденилатного хвоста

43. Процессинг у прокариот

Процессинг - посттрансляционное дозревание РНК

Процессинг м-РНК: нет процессинга в м-РНК – она готова сразу,нет интронов

До завершения процесса транскрипции может развиваться трансляция(благо нет ядра).

Процессинг р-РНК: существует 7 участков, отвечающих за кодирование

В р-РНК метилируются некоторые азотистые основания

30S предшественник, кот. будет в р-РНК превращаться впоследствии 5S, 16S, 23S, т-РНК.

Эндонуклеазы внутри транскрипта фосфодиэфирн.связи разрушают.

Процессинг т –РНК: существуют длинноцепочечные предшественники

2-7 генов разных т-РНК(друг за другом идут)

Первичный длинный транскрипт с помощью РНКаз разрушается, и к 3’-концу добавляется послед-ть ССА – то кресло для АМФ, кот. будет акцептировать АК.

Многие основания в т-РНК модифицируются для поддержания уникальной конформации (метилирование и т.д.)

44. Процессинг у эу:

Этапы м-РНК и эу:

1. Удаление некоторых последовательностей нуклеотидов по краям hn-РНК с помощью экзонуклеаз(откусывается по одному нуклеотиду)

2. Capping – создание шапочки на 5’-конце, с помощью гуанилилтрансферазы.

Capping – Cap 0, 1, 2 модели

0: 7-метилгуанилат(связ. С 5’-концом hn-РНК особой 5’-5’-трифостфатной связью)

1: 7-метилгуанилат + первое азот. основание. Метилируется крайнее азот. основание рибозы hn-РНК

2: 7-метилгуанилат

Cap – защита от РНК-аз, м-РНК с Сap транслируется гораздо более эффективно.

3. Полиаденилирование 3’-конца(200-300 аденилатн.остатков добавляем к 3’-концу)

ААУААА downstream 11-30 нуклеотидов

Функции хвоста: Стабилизация структуры м-РНК, учет и контроль прошедших транскрипций (после очередного считывания уходит аденилатфостат). м-РНК деградирует, когда слишком много раз читается.

4. Сплайсинг – процесс удаления интронов, в результате которого hn-РНК превращаются в м-РНК

Механизм: сплайсиосома-комплекс. Состоящий из 5 SNURPS(в ядре). В составе имеют 5 sn-РНК(5S и 7S),которые катализируют сплайсинг.

5 sn-РНК узнают определенную последовательность экзон-интронный стык с 5”-конца,где есть: …GU…A…AG… и делают насечку. Сначала интрон выпадает с 5”-стороны.

Функции интронов:точно не знаем,возможно соответствуют определенным доменам,чтобы четче вырезать, возможно они-ловушки для мутаций, или возможность перестановок крупных экзонных блоков при вырезании.

5. Модификация оснований в транскрипции

Это процессинг,похож на прокариот. Отличия: некоторые т-РНК содержат интронные вставки и имеют другой сплайсинг(точно не знаем какой).