
- •Лекции по Биофизике
- •Содержание
- •I. Термодинамика биологических процессов 10
- •II. Кинетика биологических процессов 20
- •III. Квантовая биофизика 32
- •Введение в биофизику Предмет биофизики
- •История развития биофизики
- •Что изучает биофизика?
- •Раздел 1. Общая биофизика. Включает в себя термодинамику биологических систем, кинетику биологических процессов, фотобиологию и молекулярную биофизику.
- •Раздел II. Биофизика клетки. Предметом данного раздела являются принципы организации и функционирования живой клетки и ее фрагментов, биологических мембран.
- •Особенности биофизических методов
- •I. Термодинамика биологических процессов Основные понятия термодинамики.
- •Законы термодинамики
- •Неравновесная термодинамика
- •II. Кинетика биологических процессов Введение
- •Молекулярность и порядок реакции
- •Кинетика реакции нулевого порядка
- •Кинетика прямой реакции первого порядка
- •Кинетика обратимой реакции первого порядка
- •Кинетика реакции второго порядка
- •Сложные реакции
- •Зависимость скорости реакции от температуры
- •Кинетика ферментативного катализа
- •III. Квантовая биофизика Классификация и стадии фотобиологических процессов
- •Природа света и его физические характеристики. Понятие кванта. Орбитальная структура атомов и молекул и энергетические уровни.
- •Взаимодействие света с веществом
- •Пути размена энергии возбужденного состояния молекулы
- •Люминесценция (флюоресценция и фосфоресценция), ее механизмы, законы и методы исследования.
- •Миграция энергии. Виды и условия миграции. Правила Ферстера
- •Фотохимические реакции. Законы фотохимии
- •IV. Молекулярная биофизика Предмет молекулярной биофизики
- •Методы исследования биомакромолекул
- •2. Термодинамические исследования
- •3. Оптические (спектральные) методы
- •Силы внутримолекулярного взаимодействия биомакромолекул
- •II. Водородные связи (заряд – дипольные взаимодействия)
- •Пространственная структура белка
- •V. Структура и функции биомембран Введение
- •Функции биологических мембран
- •Химический состав мембран
- •Липид-липидные взаимодействия. Динамика липидов в мембране
- •Белки мембраны и их функции
- •Модель биологических мембран
- •Сигнальная функция биологических мембран
- •VI. Транспорт веществ через мембраны Введение
- •Классификация видов транспорта
- •1. Относительно изменения энергии в процессе переноса веществ транспорт подразделяется на активный и пассивный.
- •2. Относительно количества переноса веществ через мембрану выделяют:
- •Методы изучения транспорта
- •Пассивный транспорт и его виды
- •Активный транспорт
- •VII. Пассивные электрические свойства биологических объектов Общие положения
- •Действие постоянного электрического тока на биологические объекты. Эдс поляризации
- •Статическая и поляризационная емкость
- •Виды поляризации в биологических тканях
- •Проводимость биологических объектов для переменного тока
- •VIII. Биофизика электровозбудимых тканей. Электрогенез Общие положения
- •Электродный потенциал
- •Диффузионный потенциал
- •Доннановское равновесие
- •Ионная теория электрогенеза Бернштейна
- •Теория постоянного поля и потенциал покоя (пп)
- •Потенциал действия (пд)
- •Современные методы регистрации биопотенциалов
- •Ионная природа потенциала действия (пд). Формальное описание ионных токов
- •Проведение возбуждение по нервным волокнам
- •IX. Биофизика синаптической передачи Общие положения
- •Электрические синапсы
- •Химический синапс
- •Основные положения о судьбе медиатора в химическом синапсе (Шеррингтон, 1897 г.)
- •X. Биофизика сокращения Введение
- •Скелетные мышцы
- •Молекулярные механизмы мышечного сокращения
- •Биомеханика скелетной мышцы
- •Миокард
- •Гладкая мускулатура
- •XI. Биофизика кровообращения Введение. Классификация сосудистого русла
- •Работа сердца как насоса
- •Энергетика кровообращения
- •Основные положения гемодинамики. Закона Гагена –Пуазейля
- •Применимость закона Гагена –Пуазейля
- •XII.Биофизика дыхания Введение
- •Основные объемы и емкости легкого
- •Основной уравнение биомеханики дыхания. Уравнение Родера
- •Работа дыхания
- •XIII. Биофизика всасывания и выделения Введение
- •Ассиметричный эпителий и его функции
- •Методы изучения трансцеллюлярного транспорта.
- •XIV. Биофизика анализаторов Общие положения
- •Орган зрения
- •Орган слуха
- •Список используемой литературы
- •Лекции по биофизике Учебно-методическое пособие
Липид-липидные взаимодействия. Динамика липидов в мембране
Длина растянутой углеводородной цепи жирной кислоты, состоящей из 18 атомов углерода, составляет 2 нм, на полярную головку приходится еще 0,5 – 0,7 нм, следовательно, толщина бислоя липидов должна превышать 4 нм, но в действительности толщина двойного слоя липидов оказывается равной 3,5 – 4 нм. Причиной обнаруженного феномена является рыхлое, а не упорядоченное расположения остатков жирных кислот. Раз одна из двух жирных кислот, образующих гидрофобный хвост, ненасыщенная, как правило, увеличивается вероятность образования цис-конформации.
Наличие цис-изомеров жирных кислот в составе фосфолипидов, а также высокая скорость вращения вокруг С-С связей жирно-кислотных радикалов (например, частота вращения вокруг единичной С-С связи составляет 1010, а вокруг двойной С=С связи – 108 с-1) обеспечивают неупорядоченное расположение гидрофобных хвостов. Различные конфигурации молекул жирных кислот, возникающие при поворотах вокруг С-С связей, называют ротамерами или конформерами. Процесс изменения конформации молекул за счет таких поворотов называется транс-гош-изомеризацией. Гош-конформация (“гош” – скошенный) аналогична цис-конформации. Вероятность транс-гош-перехода весьма велика и еще более возрастает при увеличении температуры. При переходе из транс- в гош-конформацию образуются складки или кинки (от англ. Kink – петля). Такого рода изменения способны захватывать целые кластеры мембранных липидов. Считается, что именно с образованием кинков связан транспорт воды и других веществ через мембраны.
Липиды способны совершать вращательные движения вокруг оси молекулы (вращательная диффузия), перемещаться вдоль одного слоя (латеральная диффузия), а также перемещаться из одного слоя в другой (трансмембранный переход или флип-флоп). Наибольшую скорость имеют вращательная и латеральная диффузия. Например, коэффициент латеральной диффузии составляет 1,8×10-8 см2 с-1. Это соответствует частоте парных перестановок соседних молекул 107 с-1. Наиболее медленным процессом является флип-флоп, что связано с высоким уровнем энергии, необходимой для проталкивания заряженных полярных головок через средний углеводородный слой мембраны. Поперечная диффузия молекул фосфолипидов на расстояние 5 нм занимает в 109 раз больше времени, чем диффузия на то же расстояние в латеральном направлении.
|
Рис.8. Виды диффузии липидов в мембране 1-латеральная диффузия; 2-трансмембранный переход или флип-флоп; 3-вращательная диффузия. |
Сочетание быстрой диффузии молекул липидов вдоль мембраны и медленной диффузии поперек мембраны имеет большое значение для функционирования мембран. Благодаря этому поддерживается упорядоченность в молекулярной структуре мембраны, определенная ориентация белков поперек мембраны, что имеет значение для направленного переноса веществ через мембрану, кроме того, обеспечивается асимметрия бислоя липидов. Функциональная асимметрия мембраны – один из важнейших аспектов, характеризующих липид – липидные взаимодействия. Асимметрия бислоя означает, что состав липидов каждого из слоев неодинаков.
Фазовые переходы липидов
В водной среде липидные структуры часто ведут себя как жидкие кристаллы – обладают анизотропией и некоторыми признаками упорядоченности. Это связано с тем, что они в качестве двуцепочечных амфифильных (амфипатических) молекул способны образовывать двойные слои в водной среде. Полярные головки при этом обращены в водную среду, а неполярные хвосты создают гидрофобную среду.
Бислой обладает свойствами лиотропного мезоморфизма (зависимость состояния от гидратации) и термотропного мезоморфизма (зависимость состояния от температуры). Эти свойства связаны друг с другом – температура фазового перехода зависит от степени гидратации, а так же от рН, электрического заряда и от ионного состава раствора.
При достижении критической температуры в липидном бислое происходит фазовый переход из состояния жидкого кристалла в гель и обратно. В полностью однородном бислое (состоящем из одного типа липидных молекул) фазовые переходы являются кооперативными. То есть в узком температурном интервале им охватывается весь бислой.
В момент фазового перехода возрастает подвижность полярных головок и гидрофобных хвостов, меняется геометрия бислоя – увеличивается его площадь и возрастает гидрофобный объём мембраны.
Фазовые переходы в мембране, обладают склонностью к кооперативности, то есть к генерализации с помощью так называемых конформационно –чувствительных сигналов.