- •Цитологические основы законов Менделя
- •Пенетрантность, экспрессивность, норма реакции
- •Нехромосомное (цитоплазматическое) наследование
- •Генетика популяций и эволюция
- •Изменчивость, ее типы и роль
- •Генетический груз, его значение. Роль антропогенного фактора. Охрана генофонда
- •Соматические и генеративные мутации
- •Генные мутации. Частота. Механизм
- •Мутагены. Мутагенез
- •Хромосомные мутации, их типы и причины появления
- •Проявления в мейозе и генетические последствия хромосомных мутаций.
- •Геномные мутации. Полиплоидия
- •Анеуплоидия (гетероплоидия), ее типы, роль в эволюции и использование в селекции
- •Молекулярные основы наследственности.
- •Доказательства генетической роли днк
- •Трансформация у про- и эукариот
- •Первичная и вторичная структуры днк
- •Третичная и четвертичная структура днк (суперспирализация днк)
- •Денатурация, ренатурация и гибридизация нуклеиновых кислот
- •Молекулярная организация хромосом.
- •Постулаты матричной теории крика.
- •Генетический код и его параметры. Универсальность кода. Кодон.
- •Экпериментальные доказательства триплетности кода
- •Молекулярные механизмы мутагенеза, мутон.
- •Молекулярные механизмы репликации. Репликон
- •Строение и функционирование репликативной вилки
- •Молекулярные механизмы репарации днк
- •Молекулярные механизмы рекомбинации
- •Транскрипция, ее этапы. Транскриптон
- •1.Инициация транскрипции
- •2.Элонгация транскрипции
- •3.Терминация
- •Процессинг различных рнк. Сплайсинг. Созревание м-рнк.
- •Адаптерные функции т-рнк и их роль в реализации генетического кода
- •Генетическая роль и механизмы трансляции
- •Цистрон. Функциональный критерий аллелизма.
- •Тонкое строение гена.
- •Рестрикционный анализ, рестрикционные карты, их роль и возможности метода.
- •Построение рестрикционных карт
- •Секвенирование днк (энзиматический метод).
- •Секвенирование днк (метод химического гидролиза).
- •Сравнительный анализ строения гена вирусов, прокариот и эукариот
- •Мозаичные гены. Интроны. Экзоны.
- •Перекрывающиеся гены
- •Структура лактозного оперона e. Coli, регуляция его генетической активности.
- •Биологический смысл
Секвенирование днк (энзиматический метод).
Дезоксинуклеотидный метод, или метод «обрыва цепи», был разработан Ф. Сенгером в 1977 году и в настоящее время широко используется для определения нуклеотидной последовательности ДНК. При дидезокси-секвенировании происходит гибридизация синтетического олигонуклеотида длиной 17—20 звеньев со специфическим участком одной из цепей секвенируемого участка. Этот олигонуклеотид является праймером, поставляющим 3'-гидроксильную группу для инициации синтеза цепи, комплементарной матрице.
Раствор с праймером распределяют по четырем пробиркам, в каждой из которых находятся четыре дезоксинуклеотида, dATP, dCTP, dGTP и dTTP (один из них — меченный радиоактивным изотопом) и один из четырех 2',3'-дидезоксинуклеотидов (ddATP, ddTTP, ddGTP или ddCTP). Дидезоксинуклеотид включается по всем позициям в смеси растущих цепей, и после его присоединения рост цепи сразу останавливается.
В результате этого в каждой из четырех пробирок при участии ДНК-полимеразы образуется уникальный набор олигонуклеотидов разной длины, включающих праймерную последовательность. Далее в пробирки добавляют формамид для расхождения цепей и проводят электрофорез в полиакриламидном геле на четырех дорожках. Проводят радиоавтографию, которая позволяет «прочесть» нуклеотидную последовательность секвенируемого сегмента ДНК.
В более современном варианте дидезоксинуклеотиды метят четырьмя разными флуоресцентными красителями и проводят ПЦР в одной пробирке. Затем во время электрофореза в полиакриламидном геле луч лазера в определенном месте геля возбуждает флуоресценцию красителей, и детектор определяет, какой нуклеотид в настоящий момент мигрирует через гель. Современные приборы используют для секвенирования ДНК капиллярный электрофорез.[3]
Секвенирование днк (метод химического гидролиза).
Секвенирование ДНК – это определение ее нуклеотидной последовательности
В 1976 г. А. Максамом и У. Гилбертом был разработан метод секвенирования, основанный на специфической химической деградации фрагмента ДНК, радиоактивно меченного с одного конца. Препарат меченной ДНК разделяли на четыре аликвоты и каждую обрабатывали реагентом, модифицирующим одно или два из четырех оснований. А. Максам и У. Гилберт предложили модифицировать пуриновые основания диметилсульфатом. При этом происходит метилирование адениновых остатков по азоту в положении 3, а гуаниновых - по азоту в положении 7. Обработка образца ДНК соляной кислотой при 0°С приводит к выщеплению метиладенина. Последующая инкубация при температуре 90°С в щелочной среде вызывает разрыв сахарно-фосфатной цепи ДНК в местах выщепления оснований. Обработка пиперидином приводит к гидролизу образца по остаткам метилгуанина. Пиримидиновые основания модифицируют гидразином. Если реакцию вести в бессолевой среде, то модифицируются как цитозин, так и тимидин; если обработку вести в присутствии 2М NaCl, то модифицируется лишь цитозин. Расщепление цепи ДНК на фрагменты и в этом случае осуществляется пиперидином. Условия реакций авторы подбирали таким образом, чтобы в итоге получить полный набор субфрагментов разной длины. Последующий электрофорез в полиакриламидном геле позволяет восстановить полную структуру исследуемого фрагмента.