- •Молекулярно- генетические исследования, ПЦР в диагностике заболеваний
- •МОЛЕКУЛЯРНАЯ
- •МОЛЕКУЛЯРНАЯ
- •МОЛЕКУЛЯРНАЯ
- •МОЛЕКУЛЯРНАЯ ДИАГНОСТИКА
- •ПЦР в диагностике заболеваний
- •ПЦР в диагностике заболеваний
- •ПЦР в диагностике заболеваний
- •Что такое ПЦР
- •Особенности метода
- •Изобретение
- •Механизм ПЦР
- •Стадии постановки ПЦР
- •Пробоподготовка (подготовка пробы биологического материала)
- •На чем основана амплификация
- •Механизм ПЦР
- •Детекция
- •Стадии
- •Как все происходит
- •Экспоненциальная
- •Проблема контаминации
- •Варианты контаминации продуктами амплификации
- •Изобретение флуоресцентной ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Основы «флуоресцентной» ПЦР
- •Основы «флуоресцентной» ПЦР
- •Варианты флуоресцентной ПЦР
- •Кинетические кривые PCR
- •Сравнение принципов качественного и количественного ПЦР анализа
- •Флуоресцентные методы в ПЦР
- •Особенности «флуоресцентной» ПЦР
- •Тест-системы для “real-time” PCR
- •Организация ПЦР-лаборатории
- •Устройство ПЦР-лаборатории с
- •Устройство ПЦР-лаборатории с
- •Устройство ПЦР-лаборатории с флуоресцентной детекцией (количественный анализ)
- •Основы «флуоресцентной» ПЦР
- •Основы «флуоресцентной» ПЦР
- •Нанодиагностика (обнаружение ДНК)
- •Контроль за прохождением реакции
- •Качественный и количественный анализ
- •Эпоха ПЦР
- •Особенности «классической» ПЦР
- •Особенности «флуоресцентной» ПЦР
- •Применение ПЦР
- •Применение ПЦР
- •Медицина
- •Гемотрансфузионные инфекции
- •ПЦР в диагностике ВИЧ
- •Гемотрансфузионные инфекции
- •Оппортунистические инфекции
- •ИППП
- •ПЦР в диагностике ИППП
- •Заболевания дыхательной системы
- •Диагностика наследственных заболеваний
- •Онкология
- •Иммунология
- •Эпидемические инфекции
- •HLA-типирование
- •Ветеринария
- •ПЦР в ветеринарии
- •ГМО - генетически модифицированные организмы
- •Организация контроля за ГМИ
- •Пострегистрационный мониторинг
- •Современные тенденции развития ПЦР
- •Количественный анализ: ДТ- 322
- •Принципы количественного анализа в real-time ПЦР
Устройство ПЦР-лаборатории с флуоресцентной детекцией (количественный анализ)
1.Зона подготовки реакционной смеси (чистая зона)
•ПЦР-бокс
•Микроцентрифуга вортекс
•Набор одноканальных дозаторов
•Штативы (рабочее место + хранение)
•Холодильник
2. Зона пробоподготовки
•ПЦР-бокс
•Твердотельный термостат
•Микроцентрифуга вортекс
•Высокоскоростная центрифуга
•Насос с колбой-ловушкой
•Набор одноканальных дозаторов
•Штативы (рабочее место + хранение)
•Холодильник
•Детектирующий амплификатор ДТ-322
Рабочее место |
Рабочее место |
Пробоподготовка |
ДТ-322 |
Чистая зона |
Рукомойник |
Зона детекции (другой этаж или другое здание)
Форез |
Основы «флуоресцентной» ПЦР
эффект переноса энергии (гашение флуоресценции)
•5’- экзонуклеазная aктивность
Taq- полимеразы
Основы «флуоресцентной» ПЦР
эффект переноса энергии (гашение флуоресценции)
•5’- экзонуклеазна я aктивность
Taq- полимеразы
Нанодиагностика (обнаружение ДНК)
Контроль за прохождением реакции
Качественный и количественный анализ
Качественный анализ:
любой материал для исследований
ответ: ДА/НЕТ
для скрининга и идентификации
Количественный анализ
только «количественный» материал
ответ: сколько инф. ед. на мл
для уточнения диагноза и выбора терапии
для контроля за ходом терапии и т.д.
Эпоха ПЦР
изобретение «классической» ПЦР
расцвет «классической» ПЦР, изобретение «флуоресцентной»
ПЦР
расцвет
флуоресцентной»ПЦР
198 |
199 |
200 |
3 |
3 |
4 |
Особенности «классической» ПЦР
Высокая
чувствительность
Высокая специфичность
Универсальность
Н
• О
Проблема контаминации
•Отсутствие количественного
анализа
Особенности «флуоресцентной» ПЦР
Высокая чувствительность
Высокая специфичность
Универсальность
+
•Решение проблемы
контаминации
•Возможность количественного
анализа
Применение ПЦР
Медицина
диагностика инфекций, наследственных заболеваний, иммунных патологий, онкологических заболеваний
HLA генотипирование при трансплантациях
Ветеринария и растениеводство
-Инфекционные заболевания
-Определение видовой принадлежности
Наука
генная инженерия, микробиология, генетика и
др.