Конкретные виды территориальных органов действуют на ос­новании положений о них, утверждаемых создавшими их органа­ми.

Типовое положение о территориальном органе федерального органа исполнительной власти устанавливает: основные задачи территориального органа; принципы деятельности; порядок утверждения положения о территориальном органе, его структуре, штатном расписании, численности и фонде оплаты труда; полномочия; организацию деятельности и финансовое обеспечение территориального органа.

Указом Президента РФ от 2 июля 2005 г. № 773 «Вопросы взаимодействия и координации деятельности органов исполнительной власти субъектов Российской Федерации и территориальных органов федеральных органов исполнительной власти» высшее должностное лицо субъекта РФ наделено полномочиями по организации взаимодействия и координации деятельности органов исполнительной власти соответствующего субъекта РФ и территориальных органов МВД России, МЧС России, Министерства юстиции РФ, Федеральной службы исполнения наказаний, Федеральной регистрационной службы, Федеральной службы судебных приставов, федеральных министерств и иных федеральных органов исполнительной власти, руководство которыми осуществляет Правительство РФ, федеральных служб и федеральных агентств, подведомственных этим министерствам.

руководитель федерального органа исполнительной власти, за исключением Министра внутренних дел Российской Федерации, директора Федеральной службы исполнения наказаний, директора Федеральной службы судебных приставов, директора Государственной фельдъегерской службы Российской Федерации, директора Федеральной службы безопасности Российской Федерации, директора Федеральной службы Российской Федерации по контролю за оборотом наркотиков, директора Федеральной службы охраны Российской Федерации, руководителя Федеральной службы финансово-бюджетного надзора, руководителя Федеральной антимонопольной службы, руководителя Федеральной таможенной службы, до решения вопроса о назначении на должность руководителя территориального органа федерального органа исполнительной власти согласовывает кандидатуру на эту должность с высшим должностным лицом субъекта Российской Федерации (руководителем высшего исполнительного органа государственной власти субъекта Российской Федерации).

Срок рассмотрения высшим должностным лицом субъекта Российской Федерации (руководителем высшего исполнительного органа государственной власти субъекта Российской Федерации) представленной кандидатуры не должен превышать 30 календарных дней со дня получения письменного обращения руководителя федерального органа исполнительной власти. В случае неполучения в указанный срок руководителем федерального органа исполнительной власти письменного уведомления о согласовании либо об отказе в согласовании представленной кандидатуры она считается согласованной. Решение о назначении руководителя территориального органа федерального органа исполнительной власти либо о представлении его к назначению в установленном порядке руководитель федерального органа исполнительной власти принимает в течение семи дней со дня получения письменного уведомления о согласовании кандидатуры или со дня окончания 30-дневного срока, в течение которого кандидатура должна быть рассмотрена высшим должностным лицом субъекта Российской Федерации (руководителем высшего исполнительного органа государственной власти субъекта Российской Федерации).

В случае отказа в согласовании кандидатуры руководитель федерального органа исполнительной власти не позднее чем в 3-месячный срок со дня поступления письменного уведомления об отказе в согласовании кандидатуры с указанием причин такого отказа вновь представляет кандидатуру на указанную должность.

В случае повторного отказа в согласовании кандидатуры руководитель федерального органа исполнительной власти в течение семи дней со дня получения письменного уведомления об отказе в согласовании кандидатуры принимает решение о назначении руководителя территориального органа федерального органа исполнительной власти либо о представлении его к назначению в установленном порядке.

Об отказе в согласовании кандидатуры руководитель федерального органа исполнительной власти одновременно с принятием решения о назначении руководителя территориального органа федерального органа исполнительной власти либо о представлении его к назначению в установленном порядке информирует Президента Российской Федерации или Правительство Российской Федерации.

руководитель федерального органа исполнительной власти вправе вносить в соответствии с законодательством Российской Федерации в Правительство Российской Федерации, а Правительство Российской Федерации - Президенту Российской Федерации предложение об отрешении от должности высшего должностного лица субъекта Российской Федерации (руководителя высшего исполнительного органа государственной власти субъекта Российской Федерации) за ненадлежащее исполнение полномочий Российской Федерации, переданных для осуществления органам исполнительной власти субъекта Российской Федерации.

3. Система органов исполнительной власти субъектов РФ.

Субъекты РФ формируют свои системы органов в соответствии с нормативными правовыми актами, устанавливающими общие принципы организации системы их органов государственной власти. Установление таких принципов относится к совместному ведению РФ и ее субъектов. По этому предмету предусматривается издание федеральных законов, в соответствии с ними законов и иных нормативных правовых актов субъектов РФ.

6 октября 1999 г. принят Федеральный закон «Об общих принципах организации системы органов государственной власти субъектов РФ», определяющий основы формирования системы органов исполнительной власти субъектов РФ.

В субъекте РФ устанавливается система органов исполнительной власти во главе с высшим исполнительным органом государственной власти субъекта РФ. Системы органов исполнительной власти субъектов РФ имеют существенные различия в формах составляющих их органов. В субъектах РФ действуют органы исполнительной власти общей, межотраслевой, отраслевой компетенции, имеющие различные организационные формы.

В соответствии с Конституцией РФ в пределах ведения РФ и полномочий РФ по предметам совместного ведения РФ и субъектов РФ федеральные органы исполнительной власти и органы исполнительной власти субъекта РФ образуют единую систему исполнительной власти в РФ.

Закон специально выделяет особое положение высшего должностного лица (руководителя высшего исполнительного органа государственной власти субъекта РФ), которое по своему содержанию является для них одинаковым.

Высшим должностным лицом субъекта РФ может быть гражданин РФ, достигший 30 лет. Он наделяется полномочиями высшего должностного лица субъекта РФ по представлению Президента РФ законодательным (представительным) органом субъекта РФ на срок не более пяти лет.

Порядок наделения гражданина РФ указанными полномочиями установлен ФЗ «Об общих принципах организации законодательных (представительных) органов субъектов РФ» и конституцией (уставом) данного субъекта.