- •УЧастина і загальна мікробіологія
- •Організація, устаткування, режим роботи бактеріологічних, імунологічних і вірусологічних лабораторій
- •Методи лабораторних досліджень
- •1. Феноловий генціанвіолет
- •Культивування мікроорганізмів
- •Екологія мікроорганізмів
- •Мікробіологічне дослідження води
- •Визначення індексу бгкп на етапах очищення
- •Дослідження мікрофлори повітря
- •Мікробіологічне дослідження грунту
- •Мікробіологічні дослідження харчових продуктів
- •Дослідження мікрофлори людини
- •Експериментальна інфекція. Використання тварин в лабораторних дослідженнях
- •Способи зараження експериментальних тварин
- •Мікробіологічне дослідження трупа
- •Визначення чутливості бактерій до антибіотиків
- •Основні набори дисків, які рекомендуються для визначення чутливості залежно від виду виділеної культури та патологічного матеріалу
- •Частина іі імунологія
- •Імунологічні методи діагностики інфекційних захворювань
- •Імунопрофілактика та імунотерапія інфекційних захворювань
- •Мікробіологічна діагностика окремих інфекційних захворювань Стафілококові інфекції
- •Захворювання, спричиненні умовно-патогенними ентеробактеріями
- •Ранова анаеробна газова інфекція
- •Бактероїдози
- •Дифтерія
- •Коклюш і паракоклюш
- •Псевдомонадні інфекції
- •Інфекції, викликані гемофільними бактеріями
- •Легіонельози
- •Лістеріоз
- •Туберкульоз
- •Лепра (проказа)
- •Мікобактеріози
- •Актиномікоз
- •Нокардіоз
- •1 2 Рис. 80. N.Asteroides: колонії (1), ланцюжки і конідії в мазку (2).
- •Сифіліс та інші трепонематози
- •Ендемічні побутові трепонематози
- •Лептоспіроз
- •Епідемічний поворотний тиф
- •Ендемічний поворотний тиф
- •Бореліоз Лайма
- •Рикетсіози
- •Епідемічний висипний тиф
- •Ендемічний висипний тиф
- •Північноазіатський рикетсіоз
- •Гарячка цуцугамуші
- •Пароксизмальний рикетсіоз
- •Трахома
- •Респіраторний хламідіоз
- •Сечостатевий хламідіоз
- •Будова і класифікація вірусів
- •Методи лабораторної діагностики вірусних інфекцій
- •Методи ідентифікації вірусів
- •Виділення та титрування бактеріофагів
- •Парагрип
- •Епідемічний паротит
- •Респіраторно-синцитіальні інфекції
- •Ентеровірусні інфекції
- •Ротавірусні гастроентерити
- •1 Ерпесвірусні інфекції
- •Простий герпес
- •Вітряна віспа - оперізуючий герпес
- •Цитомегалія
- •Аденовірусні інфекції
- •Коронавірусні інфекції
- •Гарячки Марбург і Ебола
- •Арбовірусні інфекції
- •Весняно-літній кліщовий енцефаліт
- •Японський енцефаліт
- •Гарячка Західного Нілу
- •Жовта гарячка
- •Геморагічні гарячки
- •Кримська-Конго геморагічна гарячка
- •Геморагічна гарячка з нирковим синдромом
- •Краснуха
- •Лімфоцитарний хоріоменінгіт
- •Гепатит в
- •Кандидоз
- •.Частина VI протозойні інфекції
- •Методи лабораторної діагностики
- •Малярія
Будова і класифікація вірусів
Відомо тисячі видів різноманітних вірусів людини, тварин, комах, рослин, бактерій. Вони відіграють надзвичайно велику роль у природі: виступають як фактор, що об'єднує складні живі системи органічного світу, служать переносниками генетичної інформації. Саме за допомогою вірусів зроблені фундаментальні відкриття з розшифрування структури нуклеїнових кислот, механізмів реплікації ДНК та синтезу білка. Фундаментальне вивчення вірусів та бактеріофагів увінчалося грандіозними успіхами генної інженерії. Отже, вони дають ключ до розуміння функціонування нуклеїнових кислот і сутності життя.
Понад 500 вірусів викликають різноманітні захворювання людини. Грип, інфекційні гепатити, жовта гарячка, геморагічні гарячки Ебола та Ласса, сказ, поліомієліт, СНІД.
Віруси - неклітинні форми живих істот, які характеризуються малими розмірами, відсутністю власних білоксинтезуючих та енергієгенеруючих систем, а також облігатним внутрішньоклітинним паразитизмом.
За ступенем небезпеки для людини віруси поділяють на чотири групи. До першої групи належать збудники гарячки Ебола, Ласса, Марбурга, Мачупо, натуральної віспи, до другої входять арбо- і аренавіруси, віруси сказу, гепатитів А і В, ВІЛ. До третьої групи належать віруси грипу, поліомієліту, енцефаломіокардиту, вісповакцини. Четверта група представлена адено-, корона-, герпес-, рео- та онко- вірусами. Цей поділ певною мірою умовний, так як внаслідок генетичної мінливості можуть з'являтися штами вірусів з підвищеною вірулентністю.
Структура вірусів. Окрема вірусна частинка одержала назву віріон. Він складається з однієї молекули нуклеїнової кислоти (ДНК або РНК) та білкового футляра, що її оточує, - капсида. Разом вони формують нуклеокапсид. Капсиди утворені з білкових субодиниць (поліпептидів), які називаються капсомерами. Їх кількість стабільна для кожного виду вірусів і використовується як таксономічна ознака. Віруси з таким типом будови називають простими. До них належать найдрібніші з патогенних вірусів людини: поліовіруси, аденовіруси, паповавіруси.
Проте більшість вірусів має ще одну оболонку - суперкапсидну, яка містить ліпіди. Вона пронизана вірусспецифічними білками-глікопротеїдами, які на поверхні оболонки утворюють особливі стуктури, що називаються шипами. Такі віруси називають складними або оболонковими. Структурною одиницею суперкап-
сидної оболонки є пепломер. До них належать віруси сказу, герпесу, грипу, енцефалітів, імунодефіциту людини та ін.
Віріони характеризуються поняттям симетрії. Тип симетрії залежить від способу укладки нуклеїнової кислоти і, відповідно, розташування капсомерів навколо неї. Виділяють ізометричний (або кубічний), спіральний та змішаний типи симетрії. Кубічний тип характеризується тим, що капсомери утворюють багатогранник (найчастіше ікосаедр - 20-гранник). Усі відомі ДНК-геномні віруси мають складні капсиди (аденовіруси, герпесвіруси, парвовіруси), а також деякі віруси, що містять РНК - пікорнавіруси, тогавіруси.
У віріоні зі спіральною симетрією молекула нуклеїнової кислоти закручена разом із капсомерами в тугу спіраль. Такий тип симетрії мають віруси мозаїчної хвороби тютюну, грипу, кору, епідемічного паротиту та ін.
Комбінований тип симетрії спостерігається у деяких бактеріофагів. При цьому головка бактеріофага має кубічний тип симетрії, а нуклеопротеїд, розміщений у хвості, укладається спірально.
Форма вірусів може бути найрізноманітнішою: паличкоподібна (віруси мозаїчної хвороби тютюну), кулеподібна (віруси сказу), сферична (віруси грипу, папіломи), кубоїдальна (віруси натуральної віспи), головчаста або сперматозоїдна (бактеріофаги), ниткоподібна (віруси Ебола, віруси бактерій). На рис 85 і 86 представлені основні форми і структури найпоширеніших РНК- і ДНК-геномних вірусів.
Класифікація вірусів. В основі сучасної класифікації вірусів лежать ознаки, що характеризують тип нуклеїнової кислоти, їх морфологію, особливості репродукції, антигенні властивості тощо. За наявністю нуклеїнової кислоти їх поділяють на ДНК-геномні та РНК-геномні віруси. Із 71 відомої родини вірусів 20 родин містять віруси, патогенні для людини (табл. 68).
100 нм
® ©
1 2 3 4 5
Рис. 85. Форма, розміри і структура деяких ДНК-геномних вірусів:
1 - Poxviridae; 2 - Herpesviridae; 3 - Adenoviridae; 4 - Papovaviridae; 5 - Parvoviridae.
Рис.
86.
Форма,
розміри і структура деяких РНК-геномних
вірусів:
1
- Paramyxoviridae; 2 -Orthomyxoviridae; 3 - Coronaviridae; 4 -
Arenaviridae; 5 - Retroviridae;
6
- Reoviridae; 7 - Picornaviridae; 8 - Rhabdoviridae; 9 -
Orbiviridae; 10 - Togaviridae;
11
- Bunyaviridae.
Білки вірусів (70-90 % маси віріона) поділяються на структурні та неструк- турні. Структурними називають такі білки, які входять до складу зрілих позаклітинних віріонів. Вони виконують ряд важливих функцій: захищають нуклеїнову кислоту від зовнішнього пошкодження, взаємодіють з мембранами чутливих клітин, і забезпечують проникнення вірусу в клітину, мають РНК- і ДНК-поліме- разну активність та ін. Неструктурні білки не входять до складу зрілих віріонів, однак утворюються під час їх репродукції. Вони забезпечують регуляцію експресії вірусного геному, є попередниками вірусних білків, здатні пригнічувати клітинний біосинтез. Залежно від розташування у віріоні, білки поділяються на капсидні, суперкапсидні, матриксні, білки серцевини та асоційовані з нуклеїновою кислотою.
Ліпіди містяться в складних вірусах і входять до складу суперкапсидної оболонки, утворюючи її подвійний ліпідний шар. Вони стабілізують вірусну оболонку, забезпечують захист внутрішніх шарів віріонів від гідрофільних речовин зовнішнього середовища. Віруси мають до 15-35 % ліпідів. Ліпопротеїди - комплекс вірусних суперкапсидних білків та ліпідів клітинної мембрани яких віруси набувають при виділенні з клітини під час репродукції.
Молекули вуглеводів входять до складу глікопротеїнів, гліколіпідів, сягаючи 3,5-9 %. Вони відіграють важливу роль, забезпечуючи захист відповідних молекул від дії клітинних протеаз.
Різні групи вірусів мають неоднакову стійкість до дії факторів зовнішнього середовища. Найчутливіші до них віруси, що мають ліпопротеїнову оболонку. Наприклад, віруси грипу, парагрипу, епідемічного паротиту інактивуються на поверхнях за декілька годин, проте аденовіруси зберігають інфекційні властивості декілька днів. Чутливість вірусів до дії рентгенівського та ультрафіолетового оп-
Таблиця 68 Родина, рід |
Наявність суперкап- сиду |
Тип симетрії |
Розміри (нм) |
Структура РНК |
Віруси, патогенні для людини |
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
6 |
РНК-геномні віруси |
|||||
Рісогпауігі^е |
Ні |
Кубічний |
28 |
Однониткова, лінійна, несегментована, "плюс" |
Поліовіруси, Коксаки-, ЕСНО-, рино- віруси, віруси ящура, віруси гепатиту А |
Саіісшгі^е |
Ні |
Кубічний |
38 |
Однониткова, лінійна, несегментована, "плюс" |
Вірус Норвoлк, вірус гепатиту Е |
А8ЦоуМае |
Ні |
Кубічний |
28-30 |
Однониткова, лінійна, несегментована, "плюс" |
Астровіруси людини |
Togaviridae |
Так |
Кубічний |
60 |
Однониткова, лінійна, несегментована, "плюс" |
Віруси Синдбіс, Чикунгунья, віруси східного американського, західного американського і везикулярного енцефаломієлітів коней, віруси краснухи |
Біауіу^ае |
Так |
Кубічний |
45-60 |
Однониткова, лінійна, несегмен- тована, "плюс" |
Віруси кліщового та японського енцефалітів, жовтої гарячки, гарячки Західного Нілу, гепатиту С |
Coronaviridae |
Так |
Спіральний |
80-220 |
Однониткова, лінійна, несегментована, "плюс" |
Коронавіруси |
Paramyxoviridae |
Так |
Спіральний |
120-150 |
Однониткова, лінійна, несегментована, "мінус" |
Віруси пара- грипу, кору, паротиту, респі- раторно-синци- тіальний вірус |
Rhabdoviridae |
Так |
Спіральний |
75-180 |
Однониткова, лінійна, несегментована, "мінус" |
Вірус сказу, везикулярного стоматиту |
Класифікація
вірусів
Продовження табл. 68 1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
6 |
Filoviridae |
Так |
Спіральний |
80-14000 |
Однониткова, лінійна, несегмен- тована, "мінус" |
Віруси Ебола і Марбург |
ОАотухо- viridae |
Так |
Спіральний |
80-120 |
Однониткова, лінійна, 8 сегментів, "мінус" |
Віруси грипу |
Bunyaviridae |
Так |
Спіральний |
80-120 |
Однониткова, циркулярна, 3 сегменти, "мінус" |
Хантавіруси, вірус Кримської- Конго гарячки, вірус каліфорнійського енцефаліту |
Arenaviridae |
Так |
Спіральний |
110-130 |
Однониткова, циркулярна, 2 сегменти, "мінус" |
Вірус лімфоцитарного хоріоменінгіту, віруси гарячки Ласса, Мочупо |
Reoviridae |
Ні |
Кубічний |
70-80 |
Двониткова, 10-11 сегментів |
Реовіруси, орбівіруси, ротавіруси |
Retroviridae |
Так |
Кубічний |
80-100 |
Однониткова, лінійна, несегмен- тована, "плюс" |
ВІЛ, вірус Т- клітинної лейкемії людини |
Некласифіковані РНК-геномні віруси |
|||||
Bornaviridae |
Так |
Кубічний |
До 100 |
Однониткова, лінійна, несегмен- тована, "мінус" |
Віруси хвороби Борна |
Deltavirus |
Так |
Невідомо |
37 |
Однониткова, циркулярна, кільпе, "мінус" |
Вірус гепатиту Дельта |
ДНК-геномні віруси |
|||||
Hepadnaviridae |
Так |
Кубічний |
40-48 |
Частково двониткова, циркулярна |
Вірус гепатиту В |
Parvoviridae |
Ні |
Кубічний |
18-26 |
Однониткова, лінійна |
Віруси ревматоїдного артриту, інфекційної еритеми, гемолітичної анемії |
Papovaviridae |
Ні |
Кубічний |
45-55 |
Двониткова, циркулярна |
Віруси папіломи, поліоми |
Adenoviridae |
Ні |
Кубічний |
85-110 |
Двониткова, лінійна |
Аденовіруси |
Продовження табл. 68 1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
6 |
Негреєу^ае |
Так |
Кубічний |
150-200 |
Двониткова, лінійна |
Віруси простого і оперізуючого герпесу, итомега- ловірус, вірус Епштейна-Барр, віруси герпесу 6, 7, 8 |
Poxviridae |
Так |
Змішаний |
220-450 у довжину 140-260 у товщину 140-260 у висоту |
Двониткова, лінійна |
Вірус натуральної віспи, вірус вакцини |
ромінення залежить від величини геному вірусів: чим менший геном, тим резис- тентніший вірус до опромінення. Віруси, які мають ліпопротеїдну оболонку, чутливі до ефіру, хлороформу та дезоксихолату натрію, інших жиророзчинників і детергентів.
Важливою особливістю вірусів є їх чутливість до концентрації водневих іонів. Частина з них стійка до кислих значень рН (2,2-3,0). До них належать віруси, які викликають кишкові інфекції, проникаючи в організм аліментарним шляхом (віруси поліомієліту, Коксакі, ЕСНО). Віруси, які потрапляють в організм через верхні дихальні шляхи (риновіруси, віруси грипу та ін.), чутливі до кислих значень рН.
Взаємодія вірусів і клітини. Розрізняють декілька типів взаємодії. При продуктивній інфекції вірус функціонує в клітині автономно, а його репродукція відбувається незалежно від репродукції клітинного генетичного апарата. При цьому утворюється нове покоління інфекційних вірусів.
Якщо цикл репродукції вірусів блокується на одній із стадій, а інфекційні віріони не утворюються, такий тип взаємодії позначають як абортивний.
Коли з клітиною взаємодіють онкогенні РНК- та ДНК-геномні віруси (СНІДу, лейкозу), нуклеїнова кислота інтегрується в клітинну хромосому та існує там у вигляді провірусу. В результаті може спричинятися зміна спадкових властивостей клітини. Такий тип взаємодії називають вірогенією.
Отже, віруси є особливими інфекційними агентами, які вимагають своєрідних прийомів для роботи з ними, не подібних до мікробіологічних. Вірусологічні дослідження проводять у спеціально обладнаних вірусологічних лабораторіях.