Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

биохим 2 часть

.pdf
Скачиваний:
102
Добавлен:
11.03.2016
Размер:
4.1 Mб
Скачать

- 81 -

Функции глутатиона в организме ом. Л 5. Структура ^S-глутатиона:

цнс ч«с

4—

1 I

/ L .

\ ^ с о

 

ГДУ

 

 

СН-М$\

 

 

ioOHj

ГАМ

 

ГАН

 

32.Основными конечными продуктами обмена серы в организме, выде­ ляющимися о мочой, являются неорганические сульфаты (около 80 % выде­ ляемой серы) и эфиры серной киолоты (около 5 % выделяемой серы). Ос­ тальное количество оеры в моче (около 15 % представляет собой так на­ зываемую органическую (нейтральную) серу, входящую в состав органичес­ ких соединений (в основном это серосодержащие аминокислоты и таурин).

Серная кислота в организме возникает из серы цистеина, она необ­ ходима для синтеза гликозаминогликанов, сульфолипидов, в процессах де­ токсикации. Используется серная кислота в биологически активной форме -

ввиде 3^фосфоаденозин-5ч£осфооульфата (ФАФС).

33.Недостаток в пище метионина (эссенциальная аминокислота, липотропный фактор) ведет к нарушению процессов трансметилирования. Вслед­ ствие этого сильно ухудшается синтез фосфатидилхолинов в печени, что затормаживает образование здесь липопротеинов очень низкой плотности, транспортирующих жиры из печени в жировую ткань. В результате триацилрлицерины начинают накапливаться в печени, развивается ее жировая ин­ фильтрация.

34.Аргинин участвует в орнитиновом цикле синтеза мочевины, он

ЛМ

 

 

является донором амидиновой группы

W - 1 ~#Ц-СИгГe«*-cv СН-со он

в процессе синтеза креатина (учас­

 

УИг

 

твуют также аминокислоты глицин и

Аргинин

 

метионин), наконец, он служит ис­

 

точником для образования пролина

 

 

 

(через орнитин и глутаминовую кислоту).

 

 

35. Образование глутамата путем трансаминирования:

 

соон

 

 

 

соон

си,

CHt

СЪ

 

 

СНг

 

 

I

Ы о

СН-МНг

Аланин-

ОН*

Сso

соон

аминотранс-

ЬН'/*Нг

ieoH

С О О Н

фераза

 

&ООН

2-0ксоглутарат

Аланин

 

 

Глутамат

Пируват

6 -3 5 5

-8 2-

36.Еяутаминовая кислота является лоточником 2-окоогдутарата, ко­ торый возникает при ее окислительном дезаминировании под влиянием очень активной гдутаматдегидрогеназы. 2-Оксоглутарат же представляет собой

акцептор аминогрупп, поступающих на него от большинства аминокиолот в процессе трансаминирования. Таким образом, система 2-окаоглутарат-глу- тамат "собирает" аминогруппы от распадающихся аминокислот и высвобож­ дает их в вцде аммиака (трансдезаминирование), токсические же овойотва ашиака устраняются путем овяэывания его главным образом в процеосе синтеза мочевины.

37. Образование ГАМК - тормозного медиатора нервной системы из

глутаминовой кислоты:

COg

 

*

^ г

йоос-CHc CMt-М-САОН

Глутаматдеиарбок-'* М °С

***

*

Глутамат

 

v силаза

 

 

" н*

 

 

Гамма-аминомасляная к-та

38. Образование аспаратата путем трансаминирования:

Ч00*

соон

 

« * «

 

СООН

 

СИ

+*

* ________________ ^

Ы

+

 

С-»0

 

 

Аспартат-амино- СН-УН*

 

i Л

соон

 

 

траясфераза

^

 

 

Оксалоацетат

 

Глутамат

Аспартат

2-Оксоглутарат

39.Глутаминовая и аспарагиновая киолоты могут связывать аммиак

собразованием глутамина и аспарагина, аспартат является донором ато­

мов азота и водорода в процессе синтеза мочевины, глутамин является

#

нетоксичной транспортной формой аммиака, глутамин'в почках высвобоада-

 

ет ашиак для его последующей нейтрализации кислотами и выделения в

 

виде солей аммония, глутамин является донором аминогруппы для синтеза

 

пуриновых и пиримидиновых азотиотых оснований.

 

40. Глутаминовая и аспарагиновая кислоты учаотвуют в синтезе пу­

 

риновых и пиримидиновых азотистых оснований, входящих в состав нукле­

 

иновых кислот.

 

Глутамат связывает аммиак и превращается в глутамин, амидный аз о т

1

которого затем включается в структуру пуринового (атомы Л 3 и Л 9) и

 

пиримидинового (атом Л 3) ядер.

 

Аспартат является донором азота для синтезирующегося пуринового

 

ядра (атом Л I ), он также служит основой для формирования пиримидино­

 

вой структуры - из аспарагиновой кислоты происходят атомы Л I, Л 4,

 

Л 5 и Л 6 пиримидинового ядра.

 

- 83 -

ОБМЕН БЕЛКОВ

З а н я т и е 3

1. Функции ДНК в клетке: I. Сохранение генетической (наследствен­ ной) информации благодаря очень точному механизму копирования нуклео­ тидных последовательностей в процессе деления клеток, а также благода­ ря действию механизма репарации спонтанных повреждений ДНК.

2.Воспроизведете генетической информации цри каждом клеточном де­ лении, т.е. передача ее дочерним клеткам о помощью механизма реплика­ ции ДИК.

3.Реализация генетической информации, осуществляющаяся путем синте­ за соответствующих белков с использованием механизмов транскрипции и трансляции.

Впокоящейся клетке ДНК находится в стабильном состоянии с мини­ мальной скоростью обновления.

Репликацией называется воспроизведение (удвоение) молекул ДНК в процеосе деления клетки. Механизм репликации является полуконсервативным.

2.Опероном называют совокупность генов, функционирующих, как еди­ ное целое. Структурные гены в опероне обычно располагаются последова­ тельно друг за другом, они в целом составляют элементарную единицу транскрипции, называемую также транскриптоном.

Ген представляет собой участок ДНК, в котором закодирована инфор­ мация о структуре определенного белка или РНК. Термин "циотрон" чаще

воего эквивалентен термину "ген".

Кодонами называются триплеты матричной Ш К (мШК), кодирующие оп­ ределенные аминокислоты. Антикодонами являются триплеты транспортных НОС (тРНК), комплементарные соответствующим кодонам мРНК.

3. мШК (матричная или информационная РНК) представляет собой комплементарную (с заменой тимина на урацил) копию гена. Матричные РНК эукариот - моноцистронные, в то же время мРНК прокариот могут быть полицистронными. мРНК несут информацию о структуре белков и используются в качестве матриц в процессе трансляции (синтеза белков).

Длительность существования молекул мГОК в клетках прокариот изме­ ряется минутами, у эукариот же мРНК гораздо стабильнее, особенно при соединении с белками и образовании информосом, время жизни их может достигать нескольких суток.

ь1

-84 -

4.Транскрипция (переписывание, копирование) это процесс перено­

са информации о одной нуклеиновой киолоты на другую, обычно о ДЕК на ГОК. В процессе транскрипции на генах ДНК синтезируются комплемен­ тарные (с заменой тимина на урацил) копии, представляющие собой пер­ вичные транокрипты или РНК-предшественники (пре-РНК).

Транскрипция осуществляется ферментом РНК-полимеразой, которая сначала присоединяется к участку ДНК, называемому промотором. Отсюда ГОК-полимераза движется вдоль транскрибируемой нити ДНК, синтезируя комплементарную копию гена. Действие РНК-полимеразы прекращается (терминация транскрипции) при достижении ею терминатора или стоп-сигнала, представляющего собой особую нуклеотидную последовательность, напри­ мер, поли(А).

Синтезированные РНК-полимеразой первичные транскрипты (пре-мШК, пре-рРНК, пре-тШК) отделяются от ДНК и подвергаются созреванию (про­ цессингу) .

Молекулы пре-мШК (или гяГНК - гетерогенной ядерной ШК) присое­ диняют к 5-концу "колпачок” из 2-3 метилированных нуклеотидов (кэширо­ вание), а к 3-концу - около 200 адениловых нуклеотидов. Затем из моле­ кул пре-мГНК удаляются (вырезаются) ферментами рибонуклеазами неинфор­ мативные участки, соответствующие интронам генов, а несущие информа­ цию части (соответствуют экзонам генов) объединяются, сшиваются фер­ ментами НПС-лигазами (сплайсинг). Накапливаются данные о том, что сплайсинг может вести к объединению информативных участков первичного транскрипта в разной последовательности, что обусловливает синтез раз­ личных мРНК. Возникающая в результате матричная РНК в комплексе с бел­ ком (информофером) поступает из ядра в цитоплазму, где мРНК еще и ме­ тилируется.

Другие пре-ЙЖ (пре-тРНК, пре-рШК) соединяются с белками, образуя РНП-частицы, и подвергаются созреванию (процессингу) с образованием со­ ответствующих тРНК и рРНК.

5. Генетический код представляет собой природную систему обозна­ чения аминокислот, входящих в состав белков, с помощью нуклеотидов. Генетический код характеризуется следующими свойствами.

1. Триплотность: каждая аминокислота обозначается (кодируется) тройкой (триплетом) рядом расположенных в нуклеиновой кислоте нуклео­ тидов. Такие триплеты в мРНК называются кодонами, а в ДНК - кодогенами. Существует 64 различных триплета, из них 61 кодируют аминокислоты, а 3 являются "бессмысленными" (стоп-кодоны, терминирующие).

2. Неперекрываемость кода: в подавляющем большинстве случаев при

- 85 -

считывания информации с нуклеиновой кислоты триплеты не наслаиваются своими частями друг на друга, т.е. каждый нуклеотид входит лишь в один триплет.

3.Вырожденность (избыточность) кода: так как для обозначения 20 аминокислот используется 61 триплет, то, следовательно, каждая амино­ кислота (за исключением метионина и триптофана) кодируется не одним,

анесколькими триплетами (от 2 до 6).

4.Непрерывность кода или Отсутствие запятых”, то есть раздели­ тельных сигналов между триплетами. В то же время сами триплеты (3 из

64)выполняют роль разграничительных знаков (нонсенс-кодоны или стопкодоны), сигнализируя окончание синтезируемой полипептидной цепи.

5.Универсальность кода: смысловое значение триплетов одинаково для всех живых организмов, что подтверждает их общее происхождение. Лишь в геноме митоховдрий эукариот обнаружены некоторые отличия.

6. Трансляция представляет собой процесс декодирования информа­ ции, заложенной в триплетной последовательности мРНК, и использования ее для создания соответствующей аминокислотной последовательности в молекуле синтезируемого белка.

Впроцессе трансляции у эукариот участвуют:

1.мРНК, выполняющая роль матрицы, нооителя информации о последо­ вательности аминокислот в синтезируемом белке.

2.Полный набор 20 аминокислот, необходимых для синтеза белковой молекулы.

3.Раличные тРНК, доставляющие аминокислоты к месту синтеза белка.

4.Ферменты аминоацил-тРНК-синтетазы, активирующие аминокислоты

исоединяющие их с тРНК.

5.АТФ, являющаяся источником энергии для активирования аминокис­ лот и соединения их о тРНК.

6. Рибосомы - субклеточные частицы» являющиеся биохимическими ме­ ханизмами, обеспечивающими соединение аминокислот (образование поли­ пептидной цепи белка) соответственно информации, заключенной в после­ довательности кодонов мРНК.

7.Белковые факторы инициации трансляции (у эукариот их 9).

8. Белковые факторы элонгация - удлинения синтезируемой полипеп­ тидной цепи (у эукариот их 2).

9. Белковый фактор терминации (f?-фактор), освобождающий синтезиванную полипептидную цепь от рибосомы.

Ю. ГГФ - является источником энергии, необходимой для осуществле­ ния всех этапов трансляции: инициации, элонгации и терминации.

- 86 -

Трансляция начинается с образования инициаторного комплекса, в котором соединены мРНК, рибосома и метионил-тЙПС. Затем следует много­ кратно повторяющийся этап элонгации растущей пептидной цепи в процес­ се движения рибосомы вдоль матрицы. Синтез полипептидной цепи заверша­ ется, как только будет достигнут "бессмысленный" триплет (стоп-кодон). Полностью сформированная полипептидная цепь отделяется от рибосомы,

от нее отщепляется с /V-конца метионин (или несколько аминокислот), про­ исходит формирование пространственной (третичной) структуры белка.

По завершении синтеза полипептидная цепь подвергается посттрансляционным изменениям. Это может быть образование дисульфидных связей, ассоциация мономеров, расщепление некоторых пептидных связей, присое­ динение кофактора, кофермента, простетической группы, возможна также химическая модификация - гидроксилирование, карбокоилирование, иодиро­ вание и другие.

7. Рибосомы эукариот (805) состоят из большой (60S) и малой (4Q3) оубъединиц. Большая субъединица включает нуклеиновые кислоты (рВДК) о коэффициентами седиментации 28$, 5,85, и 5£, а также около 50 различ­ ных белков. Малая субъединица состоит из рРНК 18£>и около 30 белков.

В рибосомальных Ш К содержатся различные минорные азотиотые оонования. В клетках рибосомы функционируют в качестве биохимических молеку­ лярных механизмов, обеспечивающих оинтез полипептидных цепей белков из свободных аминокислот в соответствии о генетической информацией, зако­ дированной в триплетных последовательностях мШК и генов ДНК. Рибосомы

фиксируют матрицу (мРНК), пептидил-тРНК и аминоацил-тРНК, обеспечивая их оптимальную взаимную ориентацию; фермент пептидилтранофераза, явля­ ющийся компонентом 60$ субъединицы рибосом, катализирует образование пептидных связей; перемещение рибосомы вдоль мШК (транслокация) поз­ воляет последовательно "прочитывать" информацию, заключенную в калщом триплете матрицы. Функцию транслоказы выполняет второй фактор элонга­

ции.

Полирибосомами (полисомами) называют ансамбли из одной мРНК и нес­ кольких (до 20) прикрепленных к ней рибосом, одновременно ведущих оин­ тез белка.

Функциональными участками рибосомы (большой субъединицы) являют­ ся: A-участок (аминоацильный, акцепторный), на котором фиксируется вновь поступающая аминоацил-тРНК, и П-участок (пептидальный, донорный), на который перемещаетоя пептидил-тШК в процессе транолокации.

8. Ферменты аминоацил-тРНК-синтетазы (относятся к классу лигаз) катализируют аминоацилирование тРНК, т.е. присоединение

- 87 -

аминокислоты к ?ЭДК. Первым этапом данного процеоса является активи­ рование аминокислоты (расходуется АТФ) с образованием аминоациладенилатферментного комплекса, который затем передает аминокислоту на тШК.

Каждая аминокислота» участвующая в построении белков, активиру­ ется и переносится на тРНК особой аминоацил-тРНК-синтетазой.

9. Транспортные ВДК (тРНК) - самые маленькие по размерам нуклеи­ новые кислоты» они содержат в среднем около 80 нуклеотидов, у многих из которых азотиотые основания являются минорными (модифицированными). Вторичную отруктуру тРНК называют "клеверным листом”. В ней чаоть

азотистых оснований комплементарно спарена водородными связями» ос­ тальные же образуют петли и "хвост”. Хвост состоит из 4 нуклеотидов, из них 3 последние одинаковы у всех тРНК - ЦЦА. Именно к последнему* адениловому нуклеотиду хвоста» к 3-ОН его рибозы, присоединяется пере­ носимая транспортной РНК аминокислота.

Антикодоновая петля содержит триплет (антикодон), комплементарный одному из кодонов мРНК, о которым он и соединяется водородными связя­ ми в процессе трансляции. Псевдоуридиловая петля (один из ее нуклеоти­ дов содержит псевдоурвдин) участвует в фиксации тРНК на рибоооме. Дигидроуридиловая петля (содержит нуклеотид о дигидроурацилом) обеспечи­ вает связь с аминоацил-тРНК-синтетазой. функция добавочной петли раз­ ного размера неясна. Третичная структура тРНК напоминает латинскую букву L.

В клетках молекулы тРНК, присоединяя различные аминокислоты, тран­ спортируют их к рибосомам, участвуя тем самым в процессе биосинтеза белка.

Для разных аминокислот существуют свои транспортные РНК. Боли аминокислота кодируется несколькими триплетами, то она может транспор­ тироваться несколькими же различными тРНК (такие тРНК называются изоакцепторными). Общее количество различных тГНК в клетке соответствует числу смысловых кодонов.

10. 7 прокариот геном-регулятором называется участок ДНК, кодиру­ ющий структуру регуляторного белка-репрессора или белка-активатора, функционирование генов-регуляторов обеспечивает продукцию репресооров (иди активаторов, например, САР), воздействие же последних на оператор соответствующего оперона блокирует (или инициирует) транскрипцию отруктурных генов путем црепятотвия (или облегчения) контакта РНК-полимера- зы с промотором. У эукариот регуляторными являются белки-рецепторы гор­ монов и другие мало изученные белки.

- 88 -

Промотором называют участок ДНК в начале оперона, к которому при­ соединяется ШК-полимераза и с которого начинается процесс транскрип­

ции.

Оператор это фрагмент оперона у прокариот, следующий за промото­ ром и иноцда частично его перекрывающий. К оператору присоединяется репрессор (либо активатор, например, САР), тем самым транскрипция по­ давляется (или стимулируется).

В составе генов эукариот обнаружены участки, называемые энхансерами и сайленсерами, с которыми взаимодействуют регуляторные белки. Воздействие белка-регулятора на энхансер усиливает транскрипцию, при действии же такого белка на сайленсер транокрипция тормозится. Механизм этих явлений пока неясен.

Терминатор - нуклеотидная последовательность ДНК в конце оперона, сигнализирующая об окончании процесса транскрипции.

11.Индуцируемыми являются ферменты, обычно участвующие в процес­ сах катаболизма, синтез которых ускоряется при увеличении в клетке кон­ центрации их субстратов.

фи отсутствии субстратов (индукторов) индуцируемые ферменты не . синтезируются, поскольку процесс транскрипции их генов подавлен актив­ ными репрессорами, связывающимися с соответствующими операторами. Появ­ ление в клетке субстратов (индукторов) подобных ферментов обусловлива­ ет взаимодействие молекул субстрата с репрессором, вследствие чего репрессор инактивируется и отделяется от оператора, что позволяет РНК-по- лимеразе начать транскрипцию, т.е. синтез мРНК с последующим синтезом соответствующих ферментов (индукция). Понижение концентрации субстра­ тов в клетке цедет к диссоциации комплекса репрессор-ивдуктор, актив­ ный репрессор высвобоздаетоя, и, взаимодействуя с оператором, вновь вы­ ключает транскрипцию оперона.

Индукция синтеза ферментов молекулами их субстратов у прокариот может быть очень интенсивной, ее можно наблюдать уже через несколько минут после повышения концентрации субстрата в среде. У эукариот сход­ ная индукция некоторых ферментов возникает лишь спустя несколько чаоов или суток пооле воздействия индуктора. У высших организмов регуляция синтеза ферментов осуществляется главным образом через воздействие спе­ циальных, в том числе и внеклеточных, регуляторных агентов - гормонов.

12.Репрессируемыми являются ферменты, обычно участвующие в ката­ лизе анаболических процессов, цричем синтез данных ферментов подавляет­ ся (репрессируется) при накоплении в клетке конечного продукта процеоса.

Цри обычной низкой концентрации в клетке конечного продукта про-

- 89 -

цеоса (корепрессора) репреооор соответствующего оперона являетоя неак­ тивным и не может взаимодействовать о оператором, никаких препятствий для процесса транскрипции и синтеза ферментов нет. Накопление конечно­ го продукта обусловливает взаимодействие его молекул о репреосором, что ведет к активированию последнего о образованием активного комплек­

са репрессор-лорепрессор и присоединению его к оператору оперона, вслед­ ствие чего блокируется процесс транскрипции, а, следовательно, рецресоируетоя и синтез соответствующих ферментов. Использование конечного продукта по назначению и снижение его концентрации в клетке ведет к диссоциации комплекса рецрессор-корепрессор, освобождаясь, репрессор переходит в неактивное состояние и покидает оператор, что позволяет РНКполимеразе начать транскрипцию.

Указанный механизм регуляции синтеза ряда ферментов характерен для прокариот, у высших же организмов интенсивность синтеза ферментов нахо­ дится под контролем гормонально-медиаторной системы.

13.Цуклеопротеины представляют собой сложные белки, состоящие из простых белков и нуклеиновой кислоты. Нуклеиновые кислоты, являющиеся биологическими полимерами, построены из нуклеотидов (мононуклеотидов).

Вмолекулах ДНК общее количество мономерных единиц (нуклеотидов) может исчисляться сотнями миллионов и миллиардами. Транспортные РНК со­ держат в среднем около 00 нуклеотидов, рибосомные РНК - от 120 до 4000 нуклеотидов, в различных же мРНК количество нуклеотидов зависит от раз­ меров полипептидной цепи, которая в них закодирована, оно может дости­ гать нескольких тысяч.

14.В переваривании пищевых нуклеопротеинов участвуют пищевари­ тельные ферменты (относятся к классу гидролаз): дезоксирибонуклеазы (ДНКазы) панкреатического и кишечного соков, рибонуклеазы (НШазы), та­ кже содержащиеся в поджелудочном и кишечном соках, нуклеотидазы и нуклеозидазы кишечного сока. В кишечный сок указанные ферменты не секретиРуются, они попадают в просвет кишечника благодаря десквамации кишечно­ го эпителия.

Всасыванию подвергаются нуклеозиды, азотистые основания, пентозы (рибоза, дезоксирибоза), фосфаты.

15.В покоящихся клетках ДНК находится в стабильном состоянии с минимальной скоростью обновления. Такое обновление необходимо в связи 0 тем, что молекулы ДНК постоянно подвергаются спонтанному воздействию тепловых флуктуаций, реакционноспособных метаболитов, а в ряде тканей

-90 -

иультрафиолетовой радианта оолнца, в результате чего в ДОК возникает мяожеотво случайных повреждений (чаще других - опонтанная ацуриниэация) . Возникшие изменения уотраняютоя о помощью специальных механиз­ мов репарации. Скорооть обновления ДНК увеличена у растущих и пролифе­ рирующих тканей.

Обновление Я К гораздо интенсивнее, оообеняо мРНК.

Удаление повременных учаотков ДНК и раопад молекул РНК осущест­ вляется нуклеаэами (ДНКаза, РНКаза). Особенно много этих ферментов со­ держится в лизооомах.

16.Конечными продуктами раопада пуриновых нуклеотидов являются мочевая киолота, С02, Н^О, фосфаты, адоиак.

17.Конечными продуктами распада пиримидиновых нуклеотидов явля­ ются ашиак, С02, Н20 , фосфаты.

18.Аллантоин являетоя продуктом частичного распада мочевой кио­ лоты под воздействием фермента уратоксвдазы. Аллантоин - главный конеч­ ный продукт пуринового обмена у млекопитающих за исключением человека

иприматов.

19.У птиц, рептилий и большинства насекомых мочевая киолота яв­ ляетоя конечным продуктом обмена не только пуриновых структур, но и аминокислот (белков), то есть всего азотистого обмена. Это связано с особенностями эмбрионального развития данных организмов в замкнутом пространстве (в яйце). В этих условиях мочевая кислота вследствие очень плохой растворимости в воде не изменяет сколько-нибудь значительно ос­ мотическое давление в окружающей зародыш ореде.

Мь 20. Васпад адениловой кислоты:

 

 

 

 

Н3К >4

 

АГСз

t o

ы? + Н-ОН /

^

)>

+ Н-ОН У

 

Нуклво^идаза

(— ^ СН£ОН

_Ад^Денозин-

'

 

 

 

 

 

дезаминаза

(2)

Адениловая кислота (АМФ)

 

 

 

 

 

ОН

 

 

^2^2

 

 

 

 

 

 

 

 

+ Н-ОН + 02 f

 

 

Инозин-нукле-JJL У

Ксантиноксвдаза

 

озидаза (3)

н ЧГТУй

Ре-ФАД-Мо (4)

 

Инозин

 

Пшоксантин