
- •Транскрипция
- •Центральная догма генетики.
- •Транскрипция ДНК → РНК
- •Синтез РНК на ДНК-матрице – последовательность синтезированной мРНК комплементарна последовательности одной из цепей
- •Подтверждение роли РНК как посредника между ДНК и белком:
- •Все это говорит о том, что генетическая информация, записанная в ДНК, передается на
- •Гены – транскрибируемые участки ДНК
- •Знаки начала и окончания матричных синтезов
- •Принципы транскрипции
- •Асимметричность
- •Общие параметры транскрипции
- •Транскрипция генов в хромосоме
- •РНК-полимераза
- •Промоторы, связывание с ДНК-матрицей и -субъединица
- •У прокариот, подобных E. coli, σ (sigma) субъединица RNA polymerase связывается с районом
- •Промоторы разных генов слегка отличаются.
- •Важны два понятия 1) консенсусные последовательности ДНК – гомологичные
- •Инициация транскрипции и элонгация РНК
- •После инициации, σ (сигма) субъединица отделяется от холофермента, и продолжается удлинение цепи под
- •После прохождения всего гена фермент встречает сигнал терминации. Терминальная последовательность длиной около 40
- •Гены, кодирующие близкородственные продукты, у бактерий часто сгруппированы на хромосоме. Часто эти прилегающие
- •Транскрипция у эукариот
- •Первичный РНК-транскрипт подвергается процессингу или созреванию – обычно к 5’ концу добавляется кэп,
- •Инициация транскрипции у эукариот
- •Один из таких цис-элементов – ТАТА-бокс или блок Голдберга- Хогнесса – был обнаружен
- •Второй цис-элемент – СААТ-бокс локализован в промоторах большинства генов, примерно на 80 нуклеотидов
- •Другой класс цис-активирующих элементов – энхансеры, которые локализуются на обоих концах (3’ и
- •Эукариотическая РНК-полимераза (RNP) существует в трех уникальных формах, каждая из которых транскрибирует различные
- •Гетерогенные ядерные РНК и их процессинг – кэпы и хвосты
- •Первичная посттранскрипционная модификация эукариот
- •Затем обнаружили, что гяРНК и иРНК имеют на 3’ конце последовательность из 250
- •У эукариот, начальный транскрипт называется гетерогенной ядерной РНК (hnRNA), или пре-мРНК, содержащей некодирующие
- ••Поли-А "хвост" добавляется с разрезанному 3‘-концу.
- •Интроны и прерывистые гены
- •Большинство эукариотических генов содержат интроны. Ген овальбумина кур в основном «молчащий", содержит семь
- •Подавляющее большинство эукариотических генов содержит интроны, есть всего несколько исключений. Экзоны составляют 15%
- •Процессинг (созревание) пре-иРНК играет регуляторную роль в экспрессии генов. К примеру, некоторые интроны
- •Трансляция
- •и-РНК → БЕЛОК
- •Матричный принцип в трансляции – генетический код
- •Участники трансляции Переводчики:
- •Какие молекулы в клетке знают генетический код?
- •Адапторная гипотеза Крика
- •Транспортные РНК
- •Сколько разных т-РНК ?
- •АРСазы
- •Матричная РНК
- •Этапы трансляции
- •Инициация трансляции
- •Инициация
- •Элонгация
- •фМет
- •Терминация
- •Параметры трансляции
- •Структура рибосом
- •Рибосомы прокариот состоит из большой и малой субъединиц. Обе субъединицы состоят из одной
- •Эукариотические рибосомы структурно похожи на прокариотические, состоят из большой и малой субъединиц, каждая
- •Степеь избыточности генов, кодирующих рРНК.
- •Структура тРНК
- •1965 г. – Р. Холли расшифровал последовательность тРНК аланина. Оказалось, что ряд нуклеотидов
- •tRNA нуклеотиды могут содержать азотистые основания, модифицированные после
- •Холли предложил двумерную модель молекулы тРНК в виде клеверного листа – несколько спаренных
- •Молекула тРНК содержит много модифицированных оснований и содержит ряд стеблей и петель, сложенных
- •Анализ структуры других тРНК выявил много общего.
- •Зарядка молекул тРНК
- •«Зарядка» тРНК начинается, когда аминоацил-тРНК-синтетаза катализирует превращение аминокислоты в аминоациладениловую кислоту.
- •Инициация трансляции в E.coli затрагивает рибосомы, мРНК, энергоноситель GTP, несколько факторов инициации (IFs)
- •Инициация трансляции.
- •Элонгация трансляции: шаг 1.
- •Элонгация трансляции: шаг 2.
- •Элонгация трансляции: шаг 3.
- •Элонгация трансляции: шаг 4.
- •Элонгация трансляции: шаг 5.
- •Элонгация трансляции: шаг 6.
- •Терминация синтеза белка сигнализируется появлением стоп-кодона на A site: UAG, UAA, или UGA.
- •Полирибосомы
- •Полисома
- •Трансляция у эукариот
- •Инициация трансляции у эукариот имеет свои особенности. За счет появления на 5’ конце
- •В трансляции участвуют белки, сходные или гомологичные факторам инициации, элонгации и терминации у
Первичная посттранскрипционная модификация эукариот
РНК-транскриптов состоит в присоединении к 5’ концам молекул 7-метилгуанозина или (7mG)-кэпа. Кэп
добавляется еще до полного завершения транскрипции и защищает 5’ конец РНК от действия нуклеаз. Зрелая иРНК с кэпом на 5’ конце выходит в цитоплазму. Кэп образуется за счет присоединения 5’ конца ГТФ к концевому основанию иРНК в 5’ положении. У некоторых эукариот эта структура метилируется
Затем обнаружили, что гяРНК и иРНК имеют на 3’ конце последовательность из 250 А остатков. Эта полиА-последовательность добавляется после присоединения кэпа. Сначала 3’ конец РНК отщепляется ферментами в точке, отстоящей от высококонсервативной последовательности ААУААА на 10-35 нуклеотидов, затем происходит полиаденилирование этого конца. ПолиА-хвост есть почти у всех иРНК разных эукариот, за исключением транскриптов гистоновых генов
Последовательность АААУАА есть не у всех эукариотических РНК- трансриптов, что связано видимо с мутациями, препятствующими полиаденилированию. В отсутствие 3’ конца РНК-транскрипты быстро деградируют под действием ферментов. Таким образом, 5’ кэп и 3’ хвост очень важны для дальнейшего процессинга и транспортировки иРНК в цитоплазму

У эукариот, начальный транскрипт называется гетерогенной ядерной РНК (hnRNA), или пре-мРНК, содержащей некодирующие участки, называемые промежуточными последовательностями (интронами).
«Кэп" добавляется к 5 'концу.
Сегмент нуклеотидов удаляется с 3‘-конца
continue

•Поли-А "хвост" добавляется с разрезанному 3‘-концу.
•Некодирующие интроны удаляются.
•Кодирующие сегменты, называемые экзонами, соединеняются в процессе, называемом сплайсингом.
•Зрелая мРНК, состоящая из сплайсированных экзонов, теперь готова к выходу из ядра.
Интроны и прерывистые гены
В 1977 г. обнаружено, что гены вирусов, инфицирующие животные клетки, содержат внутренние последовательности, которые не обнаруживаются в зрелой иРНК. Они есть в молекулах предшественников иРНК, но удаляются до трансляции зрелых иРНК. Такие последовательности назвали интервентными или интронами, а гены, содержащие интроны, – прерывистыми. Последовательности, которые транскрибируются в зрелые мРНК и с которых транслируются полипептиды, назвали экзонами (от
expressed).
При сплайсинге происходит вырезание интронов и воссоединение экзонов.

Большинство эукариотических генов содержат интроны. Ген овальбумина кур в основном «молчащий", содержит семь интронов, которые вместе в два раза длиннее сегментов экзонов.

Подавляющее большинство эукариотических генов содержит интроны, есть всего несколько исключений. Экзоны составляют 15% длины коллагенового гена, в альбуминовом гене 8%, в гене дистрофине менее 1%. Отсутствие интронов только в гистоновых генах и, видимо, интерфероновых – причина этого не вполне понятна.
Процессинг (созревание) пре-иРНК играет регуляторную роль в экспрессии генов. К примеру, некоторые интроны в молекуле пре-иРНК относятся к одному гену, но могут сплайсироваться разными способами. Это приводит к появлению разных по составу экзонов иРНК. Такой альтернативный сплайсинг
характерен для иРНК, при трансляции которых образуются родственные белки или изоформы. При альтернативном
сплайсинге пре-иРНК образуется несколько близких белков, кодирующихся одним геном
Трансляция
и-РНК → БЕЛОК
•Синтез белка по матрице и-РНК, осуществляемый на рибосомах
•Самый сложный из матричных синтезов
–не просто копирование, а перевод с языка нуклеиновых кислот на язык белков. Словарь – генетический код.